Активность транскрипции генов рРНК у полиплоидных видов пшеницы и их диких сородичей на ранних этапах онтогенеза растений
Метод окрашивания серебром активных ядрышковых организаторов хромосом оказался более информативным для оценки транскрипционной активности отдельных локусов рДНК и позволил детектировать в геномах исследуемых видов пшеницы и эгилопсов определенное количество ядрышек, различающихся как по своему размеру, так и по интенсивности окрашивания, что прямо свидетельствует об имеющей место дифференциальной… Читать ещё >
Содержание
- Глава 1. СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ГЕНОВ РИБОСОМНЫХ РНК ВЫСШИХ РАСТЕНИЙ, ТРАНСКРИБИРУЕМЫХ РНК ПОЛИМЕРАЗОЙI (Обзор литературы)
- 1. 1. Рибосомные РНК растений и структурная организация кодирующих их генов
- 1. 2. Области рДНК, кодирующие 18S, 5,8S и 26S рРНК растений и разделяющие их транскрибируемые спейсеры
- 1. 3. Межгенный спейсер рДНК растений
- 1. 4. Метилирование дитозиновых остатков и транскрипция генов рРНК растений
- 1. 5. Локализация генов рРНК растений и их повторяемость
- Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
- 2. 1. Краткая характеристика объектов исследования
- 2. 2. Определение активности РНК полимеразы I в изолированных ядрах прорастающих зародышей пшеницы
- 2. 3. Приготовление цитологических препаратов
- 2. 4. Выявление ядрышек после их окрашивания серебром
- 2. 5. Выделение и очистка ДНК растений
- 2. 6. Выделение и очистка рекомбинантной плазмидной ДНК
- 2. 7. Расщепление ДНК рестрикционными эндонуклеазами
- 2. 8. Электрофорез фрагментов ДНК в агарозных гелях
- 2. 9. Блот-гибридизация нуклеиновых кислот по Саузерну
- 2. 10. Радиоактивное мечение рекомбинантной плазмидной ДНК
- 2. 11. Денситометрирование
- 2. 12. Статистическая обработка результатов
- 2. 13. Реактивы и материалы
- Глава 3. ТРАНСКРИПЦИОННАЯ АКТИВНОСТЬ ГЕНОВ рРНК У ДИ- И ПОЛИПЛОИДНЫХ ВИДОВ ПШЕНИЦЫ И ИХ ДИКИХ СОРОДИЧЕЙ ЭГИЛОПСОВ (Результаты исследований и их обсуждение)
- 3. 1. Активность РНК полимеразы I у ди~, тетра- и гексаплоидных видов пшениц в системе изолированных ядер
- 3. 2. Активность транскрипции генов рРНК у ди- и полиплоидных видов пшениц и эгилопсов, выявляемая путем окрашивания ядрышек серебром
- 3. 3. Особенности метилирования цитозиновых остатков в рДНК диплоидной пшеницы Triticum urartu и диплоидного эгилопса
- Aegilops umbellulata
Активность транскрипции генов рРНК у полиплоидных видов пшеницы и их диких сородичей на ранних этапах онтогенеза растений (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
Актуальность темы
Пшеница — одна из главных хлебных культур в нашей стране. В связи с проблемой создания новых сортов и искусственных гибридов пшеницы с заданными свойствами необходима детальная оценка геномного материала и определение эффективности его функционирования. Наиболее активно работающей генетической системой можно считать мультигенное семейство, кодирующее рибосомные РНК. Известно, что рРНК может составлять свыше 85% от всей РНК, присутствующей в растительной клетке. Для поддержания такого высокого содержания молекул рРНК требуется большое количество повторов кодирующих их генов и интенсивный процесс транскрипции, регуляция которого осуществляется разными способами. Существование близкородственных растений, сильно различающихся между собой по числу повторов рДНК, заставляет предполагать, что для нормального функционирования клетки достаточно лишь какой-то их части. Таким образом, значительный интерес представляет определение у растений пшеницы доли транскрибирующихся генов рРНК и выяснение соответствующих механизмов, лежащих в основе перевода этих генов в функциональное состояние. Особый интерес эта проблема приобретает в связи с изучением амфидиплоидных и аллополиплоидных растений, состоящих из двух и более разнокачественных геномов, поскольку у них наблюдается дифференциальная экспрессия генов рРНК, приводящая к известному и широко распространенному среди растений эффекту ядрышкового доминирования, молекулярно-генетическая и физиологическая природа которого до сих пор не ясна.
То, что ядрышковые организаторы у мягкой гексаплоидной пшеницы локализованы на 1А, IB, 6 В и 5D хромосомах, известно уже давно (Crosby, 1957). Однако на хромосомах 1А и 5D их часто вообще не удается детектировать (Flavell, Smith, 1974; Miller et al., 1980; Leitch et al., 1992). Причины этого кроются в особенностях организации повторов рДНК, локализованных на данных хромосомах и привнесенных диплоидными видами пшеницы и эгилопсов. Считается, что одним из механизмов регуляции работы данных генов у мягкой пшеницы является метилирование цитозиновых остатков (Flavell, Thompson, 1983). Так, в целом ряде работ показана взаимосвязь уровня транскрипционной активности рДНК растений и степени метилирования цитозиновых остатков в ней (Савельев и др., 1990; Sardana et al., 1993; Houchins et al., 1997). Однако, изучение рДНК только мягкой гексаплоидной пшеницы без сравнительного анализа активности транскрипции у диплоидных видов пшениц и эгилопсов не способно пролить свет на особенности процесса интеграции разнокачественных геномов при формировании аллополиплоидных организмов, где все гены функционируют сбалансированно. Поэтому выбор в качестве объектов исследования ряда видов ди-, тетраи гексаплоидных пшениц и их диких сородичейэгилопсов, в том числе и доноров геномов культурных полиплоидных форм, позволяет вплотную подойти к решению проблемы феномена ядрышкового доминирования.
Цель и задачи исследования
Цель нашего исследования заключалась в выявлении основных закономерностей изменения функционального состояния генов рРНК в полиплоидном ряду пшениц и эгилопсов. В задачи исследования входило: 1) изучение транскрипционной активности РНК полимеразы I в системе in vitro у полиплоидного ряда пшениц- 2) определение активности рибосомных генов в формирующихся ядрышках в интерфазных ядрах у полиплоидного ряда пшениц и эгилопсов- 3) сравнительный анализ степени метилирования цитозиновых остатков в рДНК диплоидной пшеницы Triticum urartu и диплоидного эгилопса Aegilops umbellulata.
Научная новизна и практическая ценность. Впервые показано, что у диплоидного эгилопса Ае. итЪеИиШа более 95% повторов рДНК оказываются метилированными, тогда как у диплоидной пшеницы Т. игаПи на долю таких повторов приходится менее 65% всей рДНК.
Впервые показано, что в рДНК диплоидной пшеницы Т. игаПи и диплоидного эгилопса Ае. итЪеИиШа цитозиновые остатки метилированы, главным образом, в положениях Св. Однако, если у Ае. итЪеЫиШа преимущественное метилирование происходит по СО-типу, то у Т. игаПи СО-тип метилирования лишь незначительно превышает СЫО-тип.
Обнаружено, что у тетраи гексаплоидных видов пшеницы по сравнению с диплоидными отмечается заметное снижение отношения активности транскрипции к числу генов рРНК, которое свидетельствует о том, что у полиплоидных видов пшениц, в отличие от диплоидных, несколько большая доля повторов рДНК находится в неактивном состоянии. У пшениц и эгилопсов происходит заметное уменьшение числа активно транскрибирующихся генов рРНК при переходе с диплоидного на тетраплоидный уровень, тогда как при сравнении тетраплоидов и гексаплоидов между собой эта разница не так существенна.
Полученные в ходе данной работы результаты углубляют представление об особенностях функционирования генов рРНК у близкородственных видов пшениц и эгилопсов разного уровня плоидности на ранней стадии онтогенеза.
Практическая значимость данной работы заключается в оценке функционального состояния генов рРНК у различных видов трибы пшеницевых, являющихся донорами и потенциальными донорами пшеничных геномов, на молекулярно-генетическом и биохимическом уровнях, что может способствовать прогнозированию взаимодействия геномов и функционального состояния генов рРНК при формировании новых искусственных видов полиплоидных пшениц с ценными хозяйственно-полезными признаками.
Положения, выносимые на защиту. У амфидиплоидных и аллополиплоидных видов пшениц и эгилопсов происходит заметное уменьшение пропорции между долей функционально активных повторов рДНК и их общим количеством, тогда как тетраплоидные и гексаплоидные пшеницы различаются по этому признаку не так существенно.
Транскрипционная активность отдельной повторяющейся единицы рДНК у Ае. итЪе11и1Ша значительно выше, чем у Т.игагШ. Апробация работы. Материалы диссертации были представлены на V съезде Всесоюзного общества генетиков и селекционеров (Москва, 1987), VI Всесоюзном совещании «Структура и функции хромосом» (Пущино, 1988), V конференции ученых социалистических стран по биоорганической химии (Пущино, 1988), II Всесоюзном съезде физиологов растений (Москва, 1990) и некоторых других конференциях. Публикации. По теме диссертации опубликовано 10 печатных работ, список которых приводится в автореферате.
Структура и объем работы. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов и их обсуждения, заключения, выводов и списка цитированной литературы, включающего 199 работ отечественных и зарубежных авторов. Работа изложена на 132 страницах и содержит 7 таблиц и 14 рисунков.
выводы.
1. У диплоидных видов пшеницы на раннем этапе онтогенеза синтез рРНК обеспечивается транскрипцией только определенной доли повторов рДНК от находящихся в геноме.
2. При переходе к полиплоидным формам пшениц и эгилопсов отмечается заметное снижение пропорции между долей функционально активных повторов рДНК и их общим количеством.
3. При переходе с диплоидного на тетраплоидный уровень у пшениц и эгилопсов происходит значительное уменьшение доли транскрибирующихся генов рРНК, тогда как разница между тетраплоидами и гексаплоидами по этому показателю не столь существенна.
4. Для рДНК диплоидной пшеницы Т. игагШ и диплоидного эгилопса Ае. итЪеИиШа характерным является метилирование цитозиновых остатков, главным образом, по СО-типу, однако, степень такого метилирования у них заметно различается. Если для Т. игагШ Св-тип метилирования лишь незначительно превышает CNG-тип, то для Ае. итЪеИиШа преимущественное метилирование по Св-типу выражено весьма сильно.
5. У диплоидного эгилопса Ае. итЪеИиШа более 95% повторов рДНК оказываются метилированными, тогда как у диплоидной пшеницы Т. игагШ на долю таких повторов приходится менее 65% всей рДНК.
6. Транскрипционная активность отдельной повторяющейся единицы рДНК у Ае. итЪеИиШа значительно выше, чем у Т.игагШ.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
.
Как уже отмечалось выше, мягкая гексаплоидная пшеница является одной из главных хлебных культур в нашей стране. В то же время ее полиплоидный статус рождает целый ряд нерешенных вопросов по взаимодействию геномов ее составляющих. Весьма важной задачей можно считать выяснение особенностей взаимодействия многокопийных генов рРНК при интеграции разнокачественных геномов в единый организм, поскольку данная генетическая система функционирует наиболее активно и обеспечивает достаточное для жизнедеятельности растения количество молекул рРНК в клетке, доходящее по некоторым оценкам до 85%. Особое значение этот вопрос приобретает в связи с проблемой создания новых сортов и искусственных гибридов пшеницы с заданными свойствами, где необходима детальная оценка геномного материала и определение эффективности его функционирования. Значительный интерес представляет определение у различных видов пшениц и их диких сородичей пропорции эффективно транскрибирующихся генов рРНК и выяснение соответствующих механизмов, лежащих в основе перевода этих генов в функциональное состояние.
Использование при выполнении данной работы разнообразных методических приемов, призванных решить поставленные нами задачи по выявлению основных закономерностей изменения функционального состояния генов рРНК в полиплоидном ряду пшениц и эгилопсов, позволило обнаружить различия в функциональной активности повторов рДНК, а также установить особенности их регуляции в геномах ди-, тетра-и гексаплоидных видов. Так, важной составляющей в регуляции транскрипции генов рРНК является функциональная активность РНК полимеразы I. Интенсивность включения радиоактивной метки в системе изолированных ядер показала, что пропорции транскрипционно активных генов рРНК у дии полиплоидных видов пшеницы варьируют в зависимости от уровня их плоидности, причем при переходе с диплоидного на полиплоидный (уже на тетраплоидный) уровень отмечается заметное снижение отношения транскрибирующихся повторов рДНК к их общему числу. Однако применение данного методического подхода не позволило установить принадлежность таких функциональных повторов рДНК к конкретным ядрышковым организаторам и, соответственно, к тем или иным геномам в полиплоидных формах пшениц.
Метод окрашивания серебром активных ядрышковых организаторов хромосом оказался более информативным для оценки транскрипционной активности отдельных локусов рДНК и позволил детектировать в геномах исследуемых видов пшеницы и эгилопсов определенное количество ядрышек, различающихся как по своему размеру, так и по интенсивности окрашивания, что прямо свидетельствует об имеющей место дифференциальной экспрессии генов рРНК. Так, полученные данные подтверждают вывод, сделанный на основе определения транскрипционной активности РНК полимеразы I, о нахождении части генов рРНК у пшениц и эгилопсов в неактивном состоянии. Причем, полиплоидные формы характеризуются меньшей долей функционально активных повторов рДНК от их общего числа в геноме. В то же время использование данного метода не дало возможности установить причины разной транскрипционной активности повторов рДНК разных видов пшениц и их диких сородичей, где одна из главных ролей отводится метилированию цитозиновых остатков.
Использование набора рестрикционных эндонуклеаз, отличающихся разной чувствительностью к метилированию цитозиновых остатков, позволило проследить степень метилирования рДНК и участие этого механизма в регуляции транскрипционной активности генов рРНК у двух видов, контрастных по активности ядрышковых организаторов хромосом — диплоидной пшеницы Т. игагШ и диплоидного эгилопса Ае.итЪеИиШа. Выбор данных видов в качестве объектов исследования для выявления статуса метилирования цитозиновых остатков в их рДНК обусловлен, как результатами, полученными в ходе выполнения этой работы с помощью других методов, так и данными литературы. Так, диплоидный эгилопс Ae.umbellula.ta характеризуется наиболее сильными ядрышковыми организаторами хромосом среди других видов трибы пшеницевых, тогда как диплоидная пшеница Т. игагШ имеет крайне слабые ядрышковые организаторы, что выражается в исключительно редкой детекции ядрышек на 1А и 5А хромосомах у полиплоидных форм пшеницы, причем данный вид вызывает у исследователей значительный интерес еще и как предполагаемый донор генома, А полиплоидных пшениц ряда Шг&с1ит-аеБИуит. Как показали наши исследования, несмотря на то, что для обоих этих видов характерно преимущественное метилирование по СО-типу, они все же различаются степенью метилирования цитозиновых остатков в их рДНК, при этом у Т. игагШ, обладающей более слабым ядрышковым организатором, доля метилированного цитозина существенно ниже, чем таковая у Ае.итЪеИиШа. Особенностью данных видов является также различное количественное содержание повторов рДНК, однако проведенный анализ показал, что доля функционально активных генов у Ае. итЪеИиШа значительно ниже, чем у Т.игагШ.
Все это позволяет прийти к заключению, что меньшее число гипометилированных (транскрипционно активных?) повторов рДНК у диплоидного эгилопса Ае. итЪеИиШа, по сравнению с рДНК диплоидной пшеницы Т. игагШ, обеспечивает необходимый уровень синтеза рРНК за счет большей эффективности этого процесса. Или другими словами, отдельная транскрипционная единица рДНК у Ае. итЪеИиШа по своей активности значительно превосходит таковую у Т. игагШ, что заставляет этот вид пшеницы поддерживать в функционально активном (деметилированном) состоянии большую часть своих генов рРНК. Причинами такой разной транскрипционной активности повторов рДНК у этих видов растений могут быть отличия в структурной организации их спейсерных областей и находящихся в них регуляторных элементов.
Необходимо отметить, что познание тонких механизмов регуляции транскрипции полиплоидного генома и, в том числе, такой его важной части, как рДНК, может позволить в будущем, используя эти сведения, рационально подбирать доноры пшениц и эгилопсов для создания новых видов с наиболее полезными для народного хозяйства признаками.
Список литературы
- Власова Т.И., Кирнос М. Д., Демиденко З. Н., Ванюшин Б. Ф. Модуляция фитогормонами in vitro метилирования ядерной пшеничной ДНК цитозиновой ДНК-метилтрансферазой пшеницы // Биохим. 1994. — Т.59. С. 1872−1881.
- Джохадзе Д.И., Балашвили М. И. Сравнительное изучение эндогенной РНК-полимеразной активности клеточных ядер и хлоропластов листьев гороха//Биохимия. 1976. — Т.41. — С. 161−166.
- Мазин A.JI. О роли энзиматического метилирования регуляторных элементов в контроле активности генов разных групп организмов // Молекуляр. биол. 1994 — Т. 26. — С. 244 — 263.
- Муратова E.H. Ядрышкообразующие районы хромосом в эволюции сем. сосновых. Проблемы микроэволюции. М., — 198 8.-С. 111−112.
- Плохинский H.A. Биометрия М, — 1970. — 367С.
- Савельев C.B., Ашапкин В. В., Ванюшин В. Ф. Рибосомная ДНК гексаплоидной пшеницы: характер метилирования и временная организация репликации в развивающихся проростках // Молекуляр. биолог. 1990а. — Т. 24. С. 1042−1056.
- Селиванкина С.Ю., Романко Е. Г., Новикова Г. В., Кулаева О. Н. Регуляция цитокинином протеинкиназы, связанной с хроматином и РНКполимеразой I из листьев ячменя // Докл. АН СССР. 1987. — Т. 292. — С. 766−768.
- Чемерис А.В., Вахитов В. А. Молекулярное клонирование генов рибосомных РНК диплоидной пшеницы Triticum urartu Thum. ex Gandil. I I Молекуляр. биол. 1987. — Т. 21. — С. 1092−1098.
- Чемерис А.В., Вахитов В. А. Первичная структура гена 5,8S рРНК и внутренних транскрибируемых спейсеров рДНК у диплоидной пшеницы Triticum urartu Thum. ex Gandil. // Молекуляр. биология. 1989. — Т. 23. С. 320−326.
- Appels R., Gerlach W.L., Dennis E.S., Swift., Peacock W.J. Molecular and chromosomal organization of DNA sequences coding for the ribosomal RNAs in cereals // Chromosoma. 1980. — V. 78. — P. 293−311.
- Appels R., Moran L.B., Gustafson J.P. The structure of DNA from rye (Secale cereale) NOR R1 locus and behavior in wheat background // Can. J. Genet. Cytol. 1986 — V. 28. — P. 673- 685.
- Ashapkin V.V., Antoniv T.T., Vanyushin B.F. Multiple nuclear protein binding to 135 bp subrepeat element of wheat ribosomal DNA intergenic spacer // Biochem. Mol. Biol. Int. 1993. — V. 30. — P. 755−761.
- Badaeva E.D., Friebe B., Zoshchuk S.A., Zelenin A.V., Gill B.S. Molecular cytogenetic analysis of tetraploid and hexaploid Aegilops crassa II Chromosome Res. 1998. — V. 6. — P. 629−637.
- Bedbrook J., Gerlach W., Thompson R.D., Jones J., Flavell R. Molecular cloning of higher plant DNA // Genetic Improvment in Crops. Academic Press- New York. 1978. — P. 93−114.
- Beech R.N., Strobeck C. Structure of the intergenic spacer region from the ribosomal RNA gene family of white spruce {Picea glauca) // Plant Mol. Biol. -1993.-V. 22.-P. 887−892.
- Bloom S.E. Goodpaster C. An improved technique for selective silver staining of NOR’s in human chromosomes // Human Genet. 1976. — V. 34. — P. 199 206.
- Blundy K. S, Cullis C. A, Hepburn A.G. Ribosomal DNA methylation in flax genotrph and a crown gall tumour // Plant Mol. Biol. 1987. — V. 8. — P. 217 225.
- Borisjuk N, Borisjuk L, Petjuch G, Hemleben V. Comparison of nuclear ribosomal RNA genes among Solanum species and other Solanaceae II Genome. 1994. — V. 37. — P. 271−279.
- Borisjuk N.V., Davidjuk Y.M., Kostishin S.S., Miroshnichenco G.P., Velasco R., Hemleben V. Structural analysis of rDNA in the genus Nicotiana II Plant Mol. Biol. 1997. — V. 35. — P. 655−660.
- Brauner S., Crawford D.J., Stuessy T.F. Ribosomal DNA and RAPD variation in the rare plant family Lactoridiaceae II Amer J. Bot. 1992. — V. 79. — P. 1436−1439.
- Castilho A., Queiroz A., Neves N., Barao A., Silva M., Viegas W. The developmental stage of inactivation of rye origin rRNA genes in the embryo and endosperm of wheat x rye F1 hybrids // Chromosome Res. 1995. — V. 3. P. 169−174.
- Chatterton N.J., Hsiao C., Asay K.H., Wang R. R-C., Jensen K.B. Nucleotide sequence of the internal transcribed spacer region of the rDNA in wheat,
- Triticum aestivum L. (Gramineae) // Plant Mol. Biol. 1992. — V. 20. — P. 159 160.
- Chen Z.J., Pikaard C.S. Transcriptional analysis of nucleolar dominance in polyploid plants: biased expression/silencing of progenitor rRNA genes is developmentally regulated in Brassica // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. -V. 94. — P. 3442−3447.
- Cordesse F., Cooke R., Tremousaygue D., Grellet F., Delseny M. Fine structure and evolution of the rDNA intergenic spacer in rice and other cereals // J. Mol. Evol. 1993. — V. 36. — P. 369−379.
- Cullis C., Davies D.R. Ribosomal RNA cistron number in a polyploid series of plants // Chromosoma. 1974. — V. 46. — P. 23−28.
- Delseny M., Laroche M., Penon P. Methylation pattern of radish (Raphanus sativus) nuclear ribosomal RNA genes // Plant Physiol. 1984. — V. 76. — P. 627−632.
- Dvorak J., Appels R. Chromosome and nucleotide seguence differentiation in genomes of polyploid Triticum species // Theor. Appl. Genet. 1982. — V. 63. P. 349−360.
- Echeverria M., Penon P., Delseny M. Plant ribosomal DNA external spacer binding factors: a novel protein binds specifically to a sequence close to the primary pre-rRNA processing site // Mol. Gen. Genet. 1994. — V. 243. — P. 442−452.
- Eckenrode V.K., Arnold J., Meagher R.B. Comparison of the nucleotide sequences of Glycine max and other small-subunit rRNAs // J.Mol. Evol. 1985. 21. P.259−269.
- Ellis T.H.N., Delseny M., Lee D., Burcham K.W.G. Methylated and undermethylated rDNA repeats are interspersed at random in two higher plant species // Plant Mol. Biol. 1989. — V. 14. — P. 73−80.
- Gerbi S.A., Gourse R.L., Clark C.G. Conserved regions within ribosomal DNA: location and some possible functions // In: The Cell Nucleus. Acad. Press- New York, 1982. — V. 10. — P. 351−386.
- Gerbi S.A. The evolution of eukaryotic ribosomal DNA // BioSystems. 1986. — V. 19. — P. 247−258.
- Gill B.S., Appels R. Relationships between Nor-loci from different Triticeae species // Plant Syst. Evol. 1988. — V. 160. — P. 77−89.
- Grierson D. RNA processing and other post-transcriptional modification // In: Nucleic Acids and proteins in plants.- Springer- Berlin. 1982. — V.2. — P. 192 223
- Griess E.A., Grasser K.D., Feix G. Repeat units from a maize rDNA external spacer region exhibit DNA curvature and interact with high-mobility-group proteins // Planta. 1993. — V. 191. — P.524−531.
- Finnegan E.J., Genger R.K., Peacock W.J., Dennis E.S. DNA methylation in plants // Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 1998. — V.49. — P .223 247.
- Flavell R.B. Repeated sequences and genome change // In: Genetic Flux in
- Plants. Springer- Wien, New York. 1985. — P. 139−156.
- Flavell R.B., Smith D.B. The role of homoeologous group 1 chromosomes inthe control of rRNA genes in wheat // Biochem. Genet. 1974. — V. 12. — P.271.279.
- Flavell R.B., O’Dell M. Ribosomal RNA genes on homoeologous chromosomes of group 5 and 6 in hexaploid wheat // Heredity. 1976. — V. 37. -P. 377−385.
- Flavell R.B., O’Dell M. The genetic control of nucleolus formation in wheat // Chromosoma. 1979. -V. 71. — P. 135−152.
- Flavell R.B., Thompson W.F. Cytosine methylation and the activity of ribosomal RNA genes in wheat // Carnegie Inst. Year Book. 1982−1983. — P. 12−15.
- Harding K. The methylation status of DNA derived from potato plants recovered from slow growth // Plant Cell Tiss. Organ Cult. 1994. — V.37. — P. 31−38.
- Hsiao C, Chatterton N. J, Asay K. H, Jensen K.B. Molecular phylogeny of the Pooideae (Poaceae) based on nuclear rDNA (ITS) sequences // Theor. Appl. Genet. 1995. — V. 90. — P. 389−398.
- Houchins K, O’Dell M, Flavell R. B, Gustafson J.P. Cytosine methylation and nucleolar dominance in cereal hybrids // Mol. Gen. Genet. 1997. — Y.255. — P. 294−301.
- Hutchinson J, Miller T.E. The nucleolar organizers of tetraploid and hexaploid wheats revealed by in situ hybridisation // Theor. Appl. Genet. 1982. — V. 61. P. 285−288.
- Jackson S. D, Flavell R.B. Protein-binding to reiterated motifs within the wheat rRNA gene promoter and upstream repeats // Plant Mol. Biol. 1992. — V. 20. -P. 911−919.
- Jorgensen R.A.Cuellar R. E, Thompson W. F, Kavanagh T.A. Structure and variation in ribosomal genes of pea // Plant Mol.Biol. 1987. V. 8, N 1. — P. 353−361.
- Karagiannis C.S., Pappelis AJ. Effect of abscisic acid, gibberellic acid, indoleacetic acid, and kinetin on selective ribosomal cistron regulation in quiescent and senescent onion leaf base tissue // Mech. Ageing Dev. 1994. -V. 76.-P. 145−155.
- Karagiannis C.S., Pappelis A.J., Yopp J.H. Brassinolide is a selective ribosomal cistron regulator in onion leaf base tissue // Mech. Ageing Dev. 1995. — V. 80. -P. 35−42.
- Karvonen P., Karjalainen M., Savolainen O. Ribosomal RNA genes in Scots pine {Pinus sylvestris L.): chromosomal organization and structure // Genetika. 1993.-V. 88.-P. 59−68.
- Kato A., Yakura K., Tanifuji S. Organization of ribosomal DNA in the carrot // Plant Cell Physiol. 1982. — V. 23. — P. 151−154.
- Kato A., Yakura K., Tanifuji S. Repeated DNA sequences found in the large spacer of Vicia faba rDNA // Biochim. Biophys. Acta. 1985. — V. 825. — P. 411−415.
- Kavanagh T.A., Timmis J.N. Heterogeneity in cucumber ribosomal DNA // Theor Appl Genet. 1986. — V. 72. — P. 337−345.
- Kovarik A., Matyasek R., Leitch A., Gardova B., Fulnecek J., Bezdek M. Variability in CpNpG methylation in higher plant genomes // Gene. 1997. — V. 204.-P. 25−33.
- Kuhrova V., Bezdek M., Kaukalova B., Yyskot B. Methylation state of rDNA in some species of the family Brassicaceae studied with the method of RELP // Biol. Plant. 1992. — V. 34. — Suppl. — P. 566.
- Martini G., O’Dell M., Flavell R.B. Partial inactivation of wheat nucleolus organizer by the nucleolus organizers chromosomes from Aegilops umbellulata //Chromosoma. 1982. — V. 84. — P. 687−700.
- May C.E., Appels R. Variability and genetics of spacer DNA sequences between the ribosomal-RNA genes of hexaploid wheat (Triticum aestivum) // Theor. Appl. Genet. 1987. — V. 74. — P. 617−624.
- May C.E. Selection for ribosomal-RNA gene numbers in commercial wheats // In: Proceedings of the 9th International Wheat Genetics Symposium. 1998. Saskatoon, Canada. — P. 95−98.
- McGrath J.M., Helgeson J.P. Differential behavior of Solanum brevidens ribosomal DNA loci in a somatic hybrid and its progeny with potato // Genome. 1998.-V. 41. -P. 435−439.
- Mclntyre C.L., Clarke B.C., Appels R. DNA sequence analyses of the ribosomal spacer regions in the Triticeae II Plant Syst. Evol. 1988. — V. 160. -P. 91−104.
- McMullenM.D., Hunter B., Phillips R.L., Rubinstein I. The structure of maize ribosomal DNA spacer region // Nucleic Acids Res. 1986. — V. 14. — P. 49 534 968.
- McMurphy L.M., Rayburn A.L. Cytological evidence for nucleolar competitionin a maize hybrid // J.Heredit. 1994. — V. 85. — P. 407−410.
- Meinkoth J., Wahl G. Hybridization of nucleic acids immobilized on solidsupports //Anal. Biochem. 1984. — V. 138. — P. 267−284.
- Messing J., Carlson J., Hagen G., Rubinstein I., Oleson A. Cloning andsequencing of the ribosomal RNA genes in maize: The 17S region // DNA. 1984. -V. 3. P. 31−40.
- Miller T. E, Gerlach W. L, Flavell R.B. Nucleolus organizer variation in wheat and rye revealed by in situ hybridisation // Heredity. 1980. — V. 45. — P. 377 382.
- Molnar S. J, Fedak G. Polymorphism in ribosomal DNA repeat units of 12
- Hordeum species // Genome. 1989. -V. 32. — P. 1124−1127.
- Nelson M, McClelland M. The effect of site-specific methylation onrestriction-modification enzymes // Nucl. Acids Res. 1987. — V. 15. — Suppl.1. P. r219-r230.
- Neves N, Silva M, Heslop-Harrison J. S, Viegas W. Nucleolar dominance in triticales: control by unlinked genes // Chromosome Res. 1997. — V. 5. — P. 125−131.
- Olmedilla A, Delcasso D, Delseny M. Methylation pattern of nuclear ribosomal RNA genes from rice (Oryza sativa) // Plant Sci. Lett. 1984. — V. 37.-P. 123−127.
- Olszewska M J, Sakowicz T, Kazmierczak J, Luchniak P. Enhanced nucleolar parameters in Vicia faba L. induced by 5-azacytidine may be only partly attributed to DNA demethylation // Folia Histochem. Cytobiol. 1997. — V. 35. -P. 185−192.
- Oono K, Sugiura M. Heterogeneity of the ribosomal RNA gene clusters in rice // Chromosoma. 1980. — V. 76. — P. 85−89.
- Paldi E, Devay M. Relationship between the cold-induced rRNA synthesis and the rRNA cistron number in wheat cultivars with varying degrees of frost hardiness // Plant Sci. Lett. 1983. — V. 30. — P. 61−67.
- Pruitt R.E., Meyerowitz E.M. Characterization of the genome of Arabidopsis thaliana II J. Mol. Biol. 1986. — V. 187. — P. 169−183.
- Rafalski J.A., Wiewiorowski M., Soll D. Organization of ribosomal DNA in yellow lupine (Lupinus luteus) and sequence of 5,8S ribosomal RNA genes // FEBS Lett. 1983. — V.152. — P.241−246.
- Reeder R.H., Roan J.G. The mechanism of nuclear dominance in Xenopus hybrids //Cell. 1984. — V. 38. — P. 39−44.
- Saghai-Maroof M.A., Soliman K.M., Jorgensen R.A., Allard R.W. Ribosomal DNA spacer-length polymorphism in barley: Mendelian inheritance, chromosomal location, and population dynamic // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. -1984. -V. 81. P. 8014−8018.
- Sardana R., Flavell R. Molecular cloning and characterization of an unusually large intergenic spacer from the Nor-B2 locus of hexaploid wheat // Genome. -1996.-V. 39.-P. 288−292.
- Sardana R., O’Dell M., Flavell R. Correlation between the size of the intergenic regulatory region, the status of cytosine methylation of the rRNA genes and nucleolar expression in wheat // Mol. Gen. Genet. 1993. — V. 236. — P. 155 162.
- Schiebel K., von Waldburg G., Gerstner J., Hemleben V. Termination of transcription of ribosomal RNA genes of mung bea occurs within a 175 bp repetitive element of the spacer region // Mol. Gen. Genet. 1989. — V. 218. — P. 302−307.
- Scott N.S., Kavanagh T.A., Timmis J.N. Methylation of rRNA genes in some higher plants // Plant Sci. Lett. 1984. — V. 35. — P. 213−217. Siegel A., Kolacz K. Heterogeneity of pumpkin ribosomal DNA. // Plant Physiol. — 1983. — V. 72. — P. 166−171.
- Siegel A., Lightfoot D., Keener S. DNA complementary to ribosomal RNA: relation between genomic proportion and ploidy // Science. 1973. — V. 179. P. 682−683.
- Tucci G.F., De Dominies R.I., Ficca A.G., Celi M., Gregori C. Nucleoli, rRNA genes and ITS region in Posidonia oceanica (L.) Delile // Hereditas. 1998. -V. 129.-P. 59−65.
- Unfried I., Stocker U., Gruendler P. Nucleotide sequence of the 18S rRNA gene from Arabidopsis thaliana Co 10 // Nucl. Acids Res. 1989. — V. 17. — P. 7513.
- Waalwijk C., Flavell R.A. Mspl, an isoschizomer of Hpall which cleaves both unmethylated and methylated Hpall sites // Nucl. Acids Res. 1978. — V. 5. -P. 3231−3236.
- Walker T.A., Pace N.R. 5.8S ribosomal RNA // Cell. 1983. — V. 33. — P. 320 322.
- Watson J.C. Kaufman L.S., Thompson W.F. Development regulation of cytozine methylation in the nuclear ribosomal RNA genes of Pisum sativum // J. Mol. Biol. 1987. — V. 193. — P. 15−26.
- Zentgraf U., Hemleben V. Nuclear proteins interact with RNA polymerase I promoter and repeated elements of the 5' external transcribed spacer of the rDNA of cucumber in a single-stranded stage // Plant Mol. Biol. 1993. — V. 22. — P. 1153−1156.
- Zimmer E.A., Jupe E.R. Walbot V. Ribosomal gene structure, variation and inheritance in maize and its ancestors // Genetics. 1988. — V. 120. — P. 11 251 136.