Молекулярно-генетическая причина остеопетроза в Чувашии
В фуппе больных аутосомно рецессивным остеопетрозом из Чувашии выявлено полное неравновесие по сцеплению по 4 м полиморфным маркерам тесно сцеплен ным с геном TCIRGI При этом ассоциация с заболеванием оказалась статистически достоверной для 3 х из маркеров СА повтор из клона АС34 259 dbSNP 884 826 и D11S987 У всех б01ьных обнаружен один гаплотип в гомозиготном состоянии Эти данные подтверждают… Читать ещё >
Содержание
- Список сокращений
- ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫИ Классификация, общая характеристика остеопетроза
- Этиопатогенез. Молекулярные основы остеопетроза
- Ген ТСПЮI (ген Т-клеточного иммунного регулятора 1)
- Ген СЬСЫ7 (хлорного канала 7)
- Другие гены, ответственные за развитие остеопетроза
- Эпидемиология остеопетроза
- Остеопетроз в Чувашии
- Неравновесие по сцеплению
- Тонкое генетическое картирование наследственных заболеваний
- МА ТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ Объекты исследования
- Выделение геномной ДНК
- Культивирование кожных фибробластов
- Выделение тотальной РНК и обратная транскрипция
- Генетические маркерыввСР-анализ и автоматическое секвенирование
- Анализ мутации807+5С>А в гене ТСПИИ Неравновесие по сцеплению
- Расчет возраста мутации
- РЕЗУЛЬТАТЫ Картирование гена
- Идентификация мутации
- Анализ последствий мутации807+5С>А в гене ТСШС1^
- Исследование уровня экспрессии мутантной мРНК
- Последствия других мутаций в гене ТСГОС
- Разработка и практическое применение систем идентификации мутации с.807+50А в гене ТСИНИ Популяционные исследования частоты мутации807+5С>А в гене ТСИКИ Неравновесие по сцеплению
- Возраст" мутации
Молекулярно-генетическая причина остеопетроза в Чувашии (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
1 В фуппе больных аутосомно рецессивным остеопетрозом из Чувашии выявлено полное неравновесие по сцеплению по 4 м полиморфным маркерам тесно сцеплен ным с геном TCIRGI При этом ассоциация с заболеванием оказалась статистически достоверной для 3 х из маркеров СА повтор из клона АС34 259 dbSNP 884 826 и D11S987 У всех б01ьных обнаружен один гаплотип в гомозиготном состоянии Эти данные подтверждают влияние эффекта основателя на накопление остеопетроза в Чувашии и позволяют картировать локус заболевания в области гена TCIRGI 2 У всех больных остеопетрозом из Чувашии в гене TCIRGI обнаружено единственное изменение нуклеотиднои последовательности ранее не описанная мутаиия с 807+5G>A (lVS8+5g->a) в гомозиготном состоянии 3 Исследование экспрессии мутантной мРНК показало что замена с 807+5G>A приво дит к нарушению процесса сплайсинга в интроне 8 гена TCIRGI и образованию нон сенс-транскрипта при этом уровень его снижен по сравнению с уровнем нормально го транскрипта в клетках гетерозиготного носителя мутации 4 Разработана система молекулярно генетических методов для простой и быстрой идентификации вьшвленной мутации в целях диагностики заболевания, а также скрининговая тест-система на основе метода real time PCR для выявления гетерози готного носительсгва мутации с 807+5G>A 5 Установлена популяционная частота 1юсителеи патологической мутации среди ly вашей Частота мутации оказалась оавной 1 68% а расчетная частота заболевания 1 3500 новорожденных Эти результаты хорошо соотносятся с данными генетико эпидемиологического исследования где встречаемость остеопетроза оказалась рав НОИ 1 3900 новорожденных, а расчетная частота гетерозиготных носителей 3 15% Обнаружена высокая частота мутации с 807+5G>A и в марийской народности Час тога мутации оказалась равной О 84% а расчетная частота заболевания 1 14 000 новорождениьг< В популяционных выборках удмуртов и башкир мутация с 807+5G>A не вьшвлена 6 У 1увашеЙ и марийцев выявлен общий гаплотип хромосом несуших с 807+5G>A что говорит об общем происхождении данной мутации для обеих популяции и под тверждает историческую общность указанных народностей 7 На основе анализа гаплотипов хромосом несущих мутантныи аллель произведена оценка возраста> мутации в чувашской популяции которая составила 880 + 260 лет что не противоречит историческим данным список ПУБЛИКАЦИЙ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИОННОЙ РАБОТЫ, А V Genetic mapping of autosomal recessive Chuvash osteopetrosis Human ge nome meeiing 2004, Berlin, Germany, 4−7 April 2004 P275 Genet 2005 V 13. supp! 1 P 279 4 Близнец Е. А, Гинтер В К, Кириллов, А Г, Зинченко Р, А, Тверская С М, По ляков, А В Молекулярно-генетическое исследование аутосомно-рецессивного остеопетроза в Чувашии V съезд Российского общества медицинских генети ков, Уфа, 2005 5 Близнец Е. Л Тверская С М, Зинченко Р, А, Абрукова, А В, Г интер Е К Поляков, А В (2006) «Экспрессионный анализ мутации с 807+5g>a в гене TCIRG1, ответственной за остеопетроз в Чувашии «Медицинская генетика 22- 6 Близнец Е. А, Зинченко Р, А, Тверская С М, Никулин М В, Кириллов, А Г, Гинтер Е К, Поляков, А В (2006) «Популяционная частота и возраст мутации в c807+5G>A, являющейся причиной аутосомно-рецессивного остеопетроза в Чув2ипкк"^Медицинская генетика 2006, т 5, № 9(51), с 9−14 7 Е Bliznetz, RZinchenko, S Tverskaya, А Polyakov Estimating the gene frequency of malignant autosomal recessive osteopetrosis in Volga-Ural region populations of Russia and dating the mutation in Chuvashiya European Journal of Human Genet;
ics, y 14 Supp I May 6−9, 2006 Амстердам, P 0226, p 149 8 Близнец Е. А, Вассерман Н Н, Поляков, А В (2006) «Молекулярные методы диагностики распространенных наследственных чувашских болезней» Меди цинская генетика 2006, т5, Приложение 1, с 10−13 9 Зинченко Р Л Ельчинова Г И, Тимковская С Е, Петрова И В, Шокарев Р, А, Близнец Е. А, Тверская С М, Поляков, А В Дифференциация этнических групп России по генам наследственных болезней Медицинская генетика 2005, т 4, № 4, с 190 10 Кириллов, А Г, Близнец Е. А., Поляков, А В, Гинтер Е К «Аутосомно рецессивный остеопетроз» гл в коллективной монографии «Генетическая структура и наследственные болезни Чувашской популяции» под редакцией Гинтера Е К и Зинченко Р, А Издательский дом «Пегас», Чебоксары 2006, 232;