Микробная биомасса и моделирование цикла азота в почве
В качестве завершающего шага во всех разделах работы мы старались выстроить концептуальную схему, объясняющую механизмы процессов и взаимодействий, и, если это было возможно, разработать математическую модель для количественного описания и прогноза явлений. Нами была разработана новая модель (№Са), описывающая рост микроорганизмов в почве, минерализацию органического вещества и внутрипочвенный… Читать ещё >
Содержание
- 1. ОБЗОР СОВРЕМЕННЫХ МЕТОДОВ ОПРЕДЕЛЕНИЯ МИКРОБНОЙ БИОМАССЫ В ПОЧВЕ И
- 1. 1. Определение микробной биомассы в почве путем прямого экстрагирования
- 1. 2. Методы определения микробной биомассы, основанные на оценке численности микроорганизмов в почве
- 1. 3. Биохимические методы определения микробной биомассы в почве
- 1. 3. 1. Метод фумигации-инкубации (ФИ): принцип лежащий в основе и трудности применения
- 1. 3. 2. Метод фумигации-экстракции (ФЭ): принцип лежащий в основе и трудности применения
- 1. 3. 3. Определение биомассы грибов по содержанию эргостерола в почве
- 1. 4. Физиологические методы определения микробной биомассы в почве
- 1. 4. 1. Физиологический метод определения микробной биомассы (метод субстрат-индуцированного дыхания или SIR)
- 1. 4. 2. Кинетический метод определения общей и активной микробной биомассы (SIGR метод)
- 1. 4. 3. Соотношение между величинами микробной биомассы, определяемой физиологическим и кинетическим методами
- 2. 1. Почвы и аналитические методы
- 2. 2. Регидратационный метод определения углерода микробной биомассы в почве
- 2. 3. Определение азота микробной биомассы в почве регидратационным методом
- 2. 4. Эффективность и избирательность фумигационного и регидратационного методов определения азота микробной биомассы в почве
- 3. 1. Современные представления о роли микробной биомассы в иммобилизационно-минерализационных превращениях азота в почве
- 3. 2. Скорость оборачиваемости микробной биомассы в почве в зависимости от доз азотного удобрения
- 3. 3. Микробиологическая иммобилизация и реминерализация азота и поступление его в растения: расчет и сравнительная оценка скоростей процессов
- 3. 3. 1. Динамика распределения азота удобрений между пулом минерального азота, микробной биомассой и растениями
- 3. 3. 2. Скорости иммобилизации, минерализации и потребления азота растениями
- 4. 1. Действие минеральных соединений азота на эффективность использования глюкозы микроорганизмами и реутилизацию микробной биомассы
- 4. 2. Изменение эффективности роста микроорганизмов после обогащения почвы субстратами разной степени доступности
- 4. 3. Расчет эффективности роста микроорганизмов в почве с использованием математического моделирования
- 5. 1. Формулировка модели NICA
- 5. 1. 1. Общие положения и переменная физиологического состояния
- 5. 1. 2. Массовый баланс углерода
- 5. 1. 3. Массовый баланс соединений азота
- 5. 2. Анализ модели NICA
- 5. 2. 1. Однократное внесение субстрата
- 5. 2. 2. Непрерывное поступление субстрата
- 5. 3. Сравнение предложенных решений с существующими подходами
- 5. 3. 1. Неоднородность микробной биомассы и моделирование ее активности
- 5. 3. 2. Отношение N: C в биомассе и иммобилизационно-минерализационное равновесие
- 5. 3. 3. Отмирание микроорганизмов и реутилизация микробной биомассы
- 5. 4. Калибровка модели NICA на основе экспериментальных данных, полученных в лабораторном эксперменте
- 5. 4. 1. Экспериментальные методы, использованные в калибровочном эксперименте
- 5. 4. 2. Применение модели для описания результатов эксперимента
- 5. 4. 3. Результаты калибровки модели и сопоставление найденных значений параметров с литературными данными
- 5. 4. 4. Азот микробной биомассы: иммобилизация 15N и определение коэффициента экстрагируемости
- 6. 1. Роль гетеротрофной нитрификации в образовании оксидов азота: состояние вопроса и нерешенные проблемы
- 6. 2. Культивирование микроорганизмов
- 6. 3. Аналитические методы
- 6. 4. Результаты экспериментов: влияние колебаний в уровне кислорода на продуцирование окиси и закиси азота культурой А. /аесаИя виЬзр. рага/аесаИ$
- 6. 5. Скорости продуцирования N0 и N20 культурой А./аесаШ виЬвр. рага/аесаШ: сравнение с данными, имеющимися в литературе
- 6. 6. Моделирование ускоренного образования N0 и N20 культурой гетеротрофных нитрификаторов в переходном режиме снабжения кислородом
- 6. 7. Гетеротрофная нитрификация -взаимосвязь между аэробным метаболизмом и денитрификацией
- 7. 1. Главные постулаты и общая структура модели
- 7. 2. Круговорот углерода и рост гетеротрофных микроорганизмов
- 7. 3. Разложение растительных остатков и почвенного гумуса
- 7. 4. Внутрипочвенный цикл азота
- 7. 5. Денитрификация — расчет скоростей процессов и активности ферментов
- 7. 6. Автотрофная нитрификация: рост микроорганизмов и скорости трансформации азота
- 7. 7. Динамика подвижных соединений и потери азота из почвы
- 7. 8. Программирование, требование модели к входным данным и переменные, получаемые на выходе
- 7. 9. Верификация модели
- 7. 10. Обсуждение результатов моделирования
- 7. 10. 1. Рост микроорганизмов в почве и разложение органического вещества
- 7. 10. 2. Круговорот азота в почве и описание денитрификации в модели 1УПС№Т
- 7. 10. 3. Образование оксидов азота при нитрификаци
Микробная биомасса и моделирование цикла азота в почве (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
Актуальность темы
.
Почвенные микроорганизмы контролируют потоки углерода и азота в биосфере, осуществляя такие ключевые процессы, как деструкция и минерализация органического вещества почвы, иммобилизация азота, нитрификация, денитрификация и азотфиксация [Кудеяров, 1989; Умаров и др., 2007]. Понимание фундаментальных основ этих процессов становится в последнее время особенно актуальным из-за глобальных изменений природной среды и климата, вызванных деятельностью человека. Согласно концепции предельных изменений биосферы [Яоск^гот е1 а1., 2009], пороговые значения трех из девяти взаимосвязанных условий, необходимых для поступательного развития человеческой цивилизации, уже нарушены (Рис.1). Самая критическая ситуация (наряду с изменением климата и уменьшением биоразнообразия) сложилась в связи с влиянием человека на глобальный цикл азота. Скорость, с которой инертная форма азота (N2) удаляется из атмосферы и переводится посредством химических реакций в промышленности в т.н. реакционноспособные формы, используемые для нужд человека, выросла до 120 млн т в год. Эта величина превышает суммарные скорости всех природных процессов на суше и почти в 4 раза выше величины, критической для устойчивого функционирования экосистем планеты (35 млн т в год). Азот в виде нитритов, нитратов, мочевины и в органической форме приводит к эвтрофикации и загрязнению наземных и водных экосистем, а в форме газообразных оксидов и аммиака загрязняет атмосферу и усиливает парниковый эффект.
Для смягчения и предотвращения негативных последствий нарушения цикла азота необходимо точное описание микробиологических процессов превращения соединений азота. Количественная характеристика цикла азота в почве особенно важна при рассмотрении наземных экосистем.
Аэрозольное загрязнение атмосферы.
Уменьшение биоразнообразия.
Изменение землепользования.
Химическое загрязнение «.
Изменение климата.
Подкисление океана.
Уменьшение озона в стратосфере.
Цикл азота (нарушение биогеохимических потоков).
Запасы пресной I воды.
Цикл фосфора (нарушение биогеохимических потоков).
Рис. 1. Превышение пороговых значений: внутреннее зеленое кольцо представляет собой предполагаемое безопасное пространство для функционирования 9 планетарных систем, Красные и зеленые сектора отражают текущее состояние для каждого показателя.
Химически связанный азот атмосферы поступает в почву в виде минеральных азотных удобрений, которые, помимо потребления растениями, закрепляются в органической форме в почве, вымываются за пределы почвенного профиля и улетучиваются в атмосферу в виде газообразных соединений азота. Относительные пропорции этих потоков определяются особенностями и интенсивностью внутрипочвенного цикла азота для конкретных почвенных условий. Почвы являются основным источником N2O, который составляет около 60−70% от глобального бюджета атмосферного N2O [Conrad,.
2002]. Таким образом, в основном почвенная эмиссия ответственна за увеличение концентрации этого парникового газа в атмосфере.
Накопленные научные сведения позволяют говорить о смене парадигмы о полной зависимости растений от доступности минерального азота в почве [Schimel, Bennett, 8.
2004] и требуют точного количественного описания скоростей иммобилизации и минерализации азота в почве с учетом конкуренции микроорганизмов и растений за органический и минеральный азот.
Количественная характеристика превращений азота и раскрытие механизмов взаимодействия азотного и углеродного циклов, которые тесно сопряжены в почве, невозможны без использования математического моделирования. Такой подход необходим как для описания процессов на локальном уровне, так и для перехода от локальных к региональным и глобальным оценкам. Требования Киотского протокола, к которому присоединилась Российская Федерация, включают ежегодную инвентаризацию источников парниковых газов с территории России, которая может быть выполнена лишь на основе моделирования процессов образования и эмиссии этих газов и последующих уточнений расчетов согласно экспериментальным измерениям.
Огромное разнообразие микроорганизмов, ответственных за осуществление азотного цикла в природе, а также сложность и многообразие бихимических превращений в микробных клетках затрудняют разработку моделей, согласованно описывающих активность микроорганизмов и круговорот макроэлементов в почве. Поэтому модели динамики почвенного органического вещества обычно не учитывают особенности микробного метаболизма в почве или рассматривают микробную биомассу как пассивный пул органического вещества. Однако для точного и надежного описания обмена парниковых газов между почвой и атмосферой необходимо использовать процессно-ориентированные модели, в явном виде описывающие динамику микробной биомассы в почве.
Цель работы.
Усовершенствование системы методов оценки микробной биомассы и ее активности в почве и разработка модели круговорота азота и углерода в почве, описывающей динамику микробной биомассы и пригодной для расчета экосистемных.
ПОТОКОВ СОг и N20 из почвы.
Задачи исследования.
— Разработка и усовершенствование методов определения азота и углерода микробной биомассы, применимых для ее количественного описания при моделировании.
— Определение скоростей оборачиваемости С и N микробной биомассы и эффективности роста микроорганизмов в почве в зависимости от доступности азота и углерода и присутствия растений.
— Оценка использования растениями реминерализованного азота почвенной микробной биомассы по динамике распределения меченого азота между пулом минерального азота, микробной биомассой и растениями.
— Разработка модели внутрипочвенного цикла азота, учитывающей физиологическое состояние микроорганизмов.
— Количественное описание круговорота азота и углерода в почве и эмиссии парниковых газов (СОг и N20) в зависимости от климатических и экологических факторов с помощью разработанной новой модели встроенной в мультимодульную экосистемную модель МоЕНЬЕ.
Выводы.
Микробная биомасса почвы играет исключительно важную роль в превращениях азота во внутрипочвенном цикле и в экосистеме. Она является не только и не столько пассивным резервуаром, содержащим некоторое количество углерода и азота, но в первую очередь движущей силой процессов разложения и минерализации высокомолекулярных органических соединений, а также процессов азотного цикла, ответственных, в частности, за потери этого элемента из почвы. Именно в таком качестве микробная биомасса должна рассматриваться при создании математических моделей, предназначенных для описания динамики органического вещества почвы и эмиссии парниковых газов. Точное определение содержания азота в микробной биомассе может быть выполнено на основе установленной гиперболической зависимости между отношением в вытяжке после биоцидной обработки почвы и величиной пересчетного коэффициента кн, характеризующего эффективность этой биоцидной обработки.
Установлено, что значительная часть азота удобрений, прежде чем поступить в растения, проходит через циклы микробной иммобилизации-минерализации. Размеры микробной иммобилизации азота удобрений могут достигать 4/5 от внесенного в почву количества в течение первой недели. Измеренная в вегетационных и полевых экспериментах скорость поступления минерального азота в растения в 3−6 раз ниже максимально возможной скорости микробной иммобилизации азота.
4. Интенсивность продуцирования СО2 почвенными микроорганизмами после внесения субстратов различной доступности непосредственно в почву зависит от эффективности роста микроорганизмов, которая, в свою очередь, определяется доступностью азота. При эпизодическом поступлении ростового субстрата в почву наблюдается его интенсивное потребление без окисления до СО2.
5. Эспериментальные исследования и расчеты с помощью математической модели роста микроорганизмов №Са показали взаимозависмость микробных превращений соединений азота и углерода в почве: скорость минерализации органического азота зависит от доступности углерода и энергии для микроорганизмов, также как доступность азота определяет скорость и эффективность роста микроорганизмов. Для условий лабораторного эксперимента были определены функциональные зависимости скоростей роста микроорганизмов и минерализации органического вещества почвы от наличия доступного азота.
6. Включение пула микробной биомассы, активность которой может изменяться в зависимости от доступности ростовых субстратов (С и Ы), в модель круговорота азота и углерода в почве позволяет количественно описывать и предсказывать величину затравочного эффекта — ускорения или замедления скорости минерализации гумуса при поступлении в почву растворимых соединений азота и углерода.
7. Максимальное количество N20 и N0 в хемостатных культурах гетеротрофных бактерий, способных к нитрификации, образуется в переходном режиме роста, когда резко меняется содержание кислорода в среде. Эти результаты позволяют понять биологический механизм кратковременного увеличения эмиссии N20 из почвы после интенсивных осадков.
8. Разработанная модель МЮ№Т детально описывает рост микроорганизмов, минерализацию органического вещества, все ступени денитрификации, автотрофную и гетеротрофную нитрификацию и диффузию газов в профиле почвы. С помощью МЮЫГГ было показано, что интенсивность использования микроорганизмами кислорода контролирует долю анаэробных зон в почве и определяет интенсивность денитрификации, нитрификации и минерализации органического вещества почвы. Соотношение N0, N20 и N2 в потоке эмиссии также зависит от динамики концентрации кислорода в почве. Предложенная модель позволяет предсказывать поток закиси азота и углекислого газа в зависимости от физико-химических условий (влажности, температуры, рН) и интенсивности биологических процессов в почве в сезонной и многолетней динамике.
Заключение
.
В диссертационной работе изложены авторские исследования роли и значения микробной биомассы в круговороте азота в почве и продуцировании парниковых газов (С02 и N20). В своих исследованиях превращений азота в экспериментах разного масштаба: от лабораторной культуры микроорганизмов до однородного участка почвенного покрова мы опирались на несколько основопологающих принципов, которые позволили добиться успешных результатов. Так как большинство процессов превращения азота в почве имеют биологическую природу, мы опирались в своих экспериментах и теоретических построениях на знании количественных закономерностей роста и метаболизма микроорганизмов, работатя на стыке микробиологии и почвоведения. Использование математического моделирования для анализа обнаруженных зависимостей, раскрытия механизмов процессов круговорота азота и углерода в почве и прогноза изменений, вызванных внешними биогенными и физико-химическими факторами позволило прийти к конкретным выводам и определить достоверность полученных результатов.
Основой для экспериментальных исследований и верификации предложенных моделей послужила разработка новых методических подходов. В диссертации доказана целесообразность применения регидратационного метода определения азота микробной биомассы для количественных исследований роли микроорганизмов в азотном питании растений. Предложенная модификация фумигационного и регидратационного методов определения азота микробной биомассы в почве, основанная на измерении отношения С: И в почвенных экстрактах после фумигации или регидратации позволяет получать более точные и надежные данные, необходимые для проверки новых концепций.
Успех в исследованиях был достигнут во многом за счет комплексного подхода, рассматривающего циклы азота и углерода в почве с учетом их взаимозависимости. Так, впервые была определена зависимость изменения скорости оборачиваемости микробной биомассы от доступности азота и углерода в почве. Установлено, что поток азота и углерода через микробную биомассу меняется при наличии растений и в зависимости от количества вносимых удобрений. Было обнаружено, что внесение азота может подавлять или стимулировать дыхание почвы в зависимости от наличия доступного источника углерода и энергии.
В качестве завершающего шага во всех разделах работы мы старались выстроить концептуальную схему, объясняющую механизмы процессов и взаимодействий, и, если это было возможно, разработать математическую модель для количественного описания и прогноза явлений. Нами была разработана новая модель (№Са), описывающая рост микроорганизмов в почве, минерализацию органического вещества и внутрипочвенный цикл азота. Использованный подход основан на классических уравнениях микробного роста с включением переменной физиологического состояния, которая характеризует микробную активность. Новая модель способна описывать такие особенности микробного роста в почве, как 1) переход популяции микроорганизмов из активного в покоящееся состояние при лимитировании роста углеродом или азотом- 2) «затравочный эффект», т. е. изменение скорости разложения нерастворимого органического вещества почвы при росте микроорганизмов на легкодоступном субстрате- 3) уменьшение эффективности микробного биосинтеза при дефиците азота.
Развитие этих модельных построений было сделано в ходе раработки модели МЮМТ. В ней впервые на основе современных научных представлений были одновременно смоделированы следующие почвенные процессы: разложение и минерализация растительных остатков и почвенного гумусадинамика микробной биомассы (С и 14) — денитрификация с описанием образования и потребления интермедиатовавтотрофная нитрификация с описанием роста нитрификаторов и процесса денитрификации у нитрификаторовгетеротрофная нитрификация, хемоденитрификация и азотфиксация. Динамическое изменение соотношения между аэробной и анаэробной частями почвы и транспорт газов и растворимых субстратов между этими зонами и по профилю почвы завершает систему уравнений в новой модели М1С№Т, которая была встроена в мультимодульную экосистемную модель МоВШЕ и может использоваться для расчета интенсивности эмиссии парниковых газов (СОг, N20, N0) разными почвами, а в перспективе — и для оценки и инвентаризации потоков парниковых газов в региональном и глобальном масштабах.
Список литературы
- Благодатский С.А., Паников Н. С. Количественная оценка размеров биологической иммобилизации азота в почвенных микроорганизмах // Биологические науки. 1989. № 8. С. 96−102.
- Kudeyarov V.N., Blagodatsky S.A., Kuznetsova T.V., Larionova A.A. Carbon compensation of «extra-nitrogen» appeared after nitrogen fertilization. / In: Poda aprodukcia agroekosystemov. Sbornic 1.1990. Bratislava: DK OH 22−25, pp. 140−148.
- Кудеяров B.H., Благодатский C.A., Ларионова A.A. Изменение внутрипочвенных потоков азота при внесении азотных удобрений // Агрохимия. 1990. № 11. С. 47−53.
- Ананьева Н.Д., Демкина Т. С., Благодатский С. А., Самаркин В. А., Ривкина Е. М., Цыганков А. А., Гоготов И. Н., Якунин А. Ф. Микробиологические объекты в экологической системе. Экспериментальная экология. Москва: Наука- 1991. с. 48−103.
- Евдокимов И.В., Благодатский С. А., Ларионова А. А., Розонова Л. Н., Орлинский Д. Б., Кудеяров В. Н. Скорость оборачиваемости микробной биомассы в почве в зависимости от доз азотного удобрения // Агрохимия. 1991. № 12. С. 49−56.
- Panikov N.S., Blagodatsky S.A., Blagodatskaya J.V., Glagolev M.V. Determination of microbial mineralization activity in soil by modified Wright and Hobby method //Biology and Fertility of Soils. 1992. V. 14. P. 280−287.
- Благодатский C.A., Ларионова A.A., Евдокимов И. В. Действие минеральных соединений азота на интенсивность дыхания и эффективность роста микроорганизмов в почве // Почвоведение. 1992. V. № 9. Р. 88−96.
- Евдокимов И.В., Благодатский C.A., Кудеяров В. Н. Микробиологическая иммобилизация, реминерализация и поступление в растения азота удобрений // Почвоведение. 1993. № 4. С. 57−64.
- Yevdokimov I.V., Blagodatsky S.A. Nitrogen Immobilization and Remineralization by Microorganisms and Nitrogen Uptake by Plants: Interactions and Rate Calculations // Geomicrobiology Journal. 1994. V. 11. № 3−4. P. 185−193.
- Благодатский C.A., Благодатская E.B., Розанова Л. Н. Кинетика и стратегии роста микроорганизмов в черноземной почве после длительного применения различных систем удобрений // Микробиология. 1994. Т. 63. № 2. С. 298−307.
- Жирным шрифтом выделены издания, рекомендуемые ВАК России для публикации результатов диссертационных работ
- Blagodatsky S.A., Richter J. Assessment of nitrogen immobilization as depend on input of available carbon by simulation of microbial growth in soil. Braunshweig- 1996. pp. 197−200.
- Blagodatsky S.A., Yevdokimov I.V. Extractability of microbial N as influenced by C: N ratio in the flush after drying or fumigation. Braunshweig- 1996. pp. 23−26.
- Благодатский C.A., Благодатская E.B. Динамика микробной биомассы и соотношение эукариотных и прокариотных микроорганизмов в серой лесной почве//Почвоведение. 1996. № 12. С. 1485−1490.
- Harden Т., Blagodatsky S., Nieder R., Richter J. Modellierung der zeitlichen Dynamik von mikrobieller Boimasse und Nmin waehrend einer Langzeitinkubation mit Stroh // Mitteilungen der Deutschen Bodenkundlichen Gesellschaft. 1997. V. 25. P. 501−504.
- Благодатский С.А., Евдокимов И. В., де Люка Т.Х. Эффективность и избирательность двух методов определения азота микробной биомассы в почве // Почвоведение. 1997. № 9. С. 1138−1147.
- Blagodatsky S.A., Richter О. Microbial growth in soil and nitrogen turnover: a theoretical model considering the activity state of microorganisms // Soil Biology and Biochemistry. 1998. V. 30. № 13. P. 1743−1755.
- Blagodatsky S.A., Yevdokimov I.V. Extractability of microbial N as influenced by C: N ratio in the flush after drying or fumigation // Biology and Fertility of Soils. 1998. V. 28. № l.P. 5−11.
- Blagodatsky S.A., Yevdokimov I.V., Larionova A.A., Richter J. Microbial growth in soil and nitrogen turnover: model calibration with laboratory data // Soil Biology and Biochemistry. 1998. V. 30. № 13. P. 1757−1764.
- Blagodatsky S.A., Heinemeyer O., Richter J, Estimating the active and total soil microbial biomass by kinetic respiration analysis // Biology and Fertility of Soils. 2000. V. 32. № l. p. 73−81.
- Благодатская E.B., Богомолова И. Н., Благодатский C.A. Изменение экологической стратегии микробного сообщества почвы, инициированное внесением глюкозы // Почвоведение. 2001. № 5. Р. 600−608.
- Blagodatsky S.A., Blagodatskaya E.V., Anderson Т.Н. Kinetic respiration analysis as a tool for monitoring of soil microbial communities under environmental impact // Mitteilungen der Deutsche Bodenkundlichen Gesellschaft. 2002. V. 99. P. 145−146.
- Kudeyarov V.N., Ponizovskii A.A., Bil K.Y., et al. Soil in the intensive forestry biome at the Biosphere 2 station, Columbia university (Arizona, United States) // Eurasian Soil Science. 2002. V. 35. № Suppl. 1. P. S34-S45.
- Благодатский C.A., Демьянова Е. Г., Кобзева Е. И., Кудеяров В. Н. Изменение эффектиности роста микроорганизмов после обогащения почвы легкодоступными субстратами // Почвоведение. 2002. № 8. С. 985−992.
- Благодатская Е.В., Благодатский С. А., Андерсон Т. Х. Количественная экстракция микробной ДНК из разных типов почв природных и агроценозов // Микробиология. 2003. Т. 72. № 6. С. 840−846.
- Благодатская Е.В., Хохлова О. С., Андерсон Т. Х., Благодатский С.А.
- Пул экстрагируемой микробной ДНК и микробиологическая активность палеопочв Южного Приуралья // Микробиология. 2003. V. 72. № 6. Р. 847−853.
- Понизовский А.А., Кудеяров В. Н., Благодатский С. А., Алексеев А. О., Биль К. Я., Марфи Р. Почва как компонент «Биосферы-2″ // Природа. 2003. V. № 7. Р. 46−52.
- Blagodatskii S.A., Kesik М., Papen Н., Butterbach-Bahl К. Nitrogen oxide and nitrous oxide production by the Alcaligenes faecalisparafaecalis culture: the influence of pH and aeration // Eurasian Soil Science. 2004. V. 37. № Suppl 1. P. S107-S110.
- Благодатский C.A., Кесик M., Папен X., Буттербах-Баль К. Продуцирование N2O и NO культурой Alcaligenes faecalis parafaecalis: влияние величины pH и аэрации. Эмиссия и сток парниковых газов на территории Северной Евразии. Пущино- 2004. с. 206−211.
- Kuzyakov Y., Blagodatsky S. Approaches for priming effect modelling. 5th European Conference on Ecological Modelling. Pushchino, Russia- 2005. pp. 112 113.
- Евдокимов И.В., Саха С., Благодатский С. А., Кудеяров В. Н. Иммобилизация азота почвенными микроорганизмами в зависимости от доз его внесения // Почвоведение. 2005. № 5. С. 581−589.
- Blagodatsky S.A., Kesik М., Papen Н., Butterbach-Bahl К. Production of NO and N2O by the heterotrophic nitrifier Alcaligenes faecalis parafaecalis under varying conditions of oxygen saturation // Geomicrobiology Journal. 2006. V. 23. № 3.P. 165−176.
- Kesik M., Blagodatsky S.A., Papen H., Butterbach-Bahl K. Effect of pH, temperature and substrate on N2O, NO and CO2 production by Alcaligenes faecalis p //Journal of Applied Microbiology. 2006. V. 101. P. 655−667.
- Kudeyarov V.N., Biel K., Blagodatsky S.A., Semenov V.M., Dem’yanova E.G., Dorodnikov M.V. Fertilizing Effect of the Increasing CO2 Concentration in the Atmosphere // Eurasian Soil Science. 2006. V. 39. № Suppl. 1. P. S6-S14.
- Благодатский С.А., Благодатская Е. В., Андерсон Т. Х., Вайгель Х. Й. Кинетика дыхательного отклика микробных сообществ почвы и ризосферы в полевом опыте с повышенной концентрацией атмосферного СОг // Почвоведение. 2006. № 3. С. 325−333.
- Blagodatskaya E.V., Blagodatsky S.A., Anderson Т.Н., Kuzyakov Y. Priming effects in Chernozem induced by glucose and N in relation to microbial growth strategies // Applied Soil Ecology. 2007. V. 37. № 1−2. P. 95−105.
- Кудеяров B.H., Заварзин Г. А., Благодатский C.A., и др. Пулы и потоки углерода в наземных экосистемах России. Наука. 2007. Москва.
- Blagodatskiy S.A., Avksent’ev А.А., Davydova М.А., Blagodatskaya E.V., Kurakov A.V. Nitrous Oxide Production in Soils and the Ratio of the Fungal to Bacterial Biomass // Eurasian Soil Science. 2008. V. 41. № 13. P. 1448−1455.
- Благодатский C.A., Богомолова И. Н., Благодатская E.B. Микробная биомасса и кинетика роста микроорганизмов в черноземах при различном сельскохозяйственном использовании // Микробиология. 2008. Т. 77. № 1. С. 113−120.
- Якушев A.B., Благодатский C.A., Вызов Б. А. Действие дождевых червей на физиологическое состояние микробного сообщества при вермикомпостировании // Микробиология. 2009. Т. 78. № 4. С. 565−574.
- Dorodnikov М., Blagodatskaya Е., Blagodatsky S., Fangmeier А., Kuzyakov Y. Stimulation of r- vs. K- selected microorganisms by elevated atmospheric C02 depends on soil aggregate size // FEMS Microbiology Ecology. 2009. V. 69. P. 43−52.
- Dorodnikov M., Blagodatskaya E., Blagodatsky S., Marhan S., Fangmeier A., Kuzyakov Y. Stimulation of microbial extracellular enzyme activities by elevated CO2 depends on soil aggregate size // Global Change Biology. 2009. V. 15. № 6. P. 1603−1614.
- Blagodatskaya E., Blagodatsky S., Dorodnikov M., Kuzyakov Y. Elevated atmospheric CO2 increases microbial growth rates in soil: results of three C02enrichment experiments // Global Change Biology. 2010. V. 16. № 2. P. 836−848.
- Blagodatsky S., Blagodatskaya E., Yuyukina T., Kuzyakov Y. Model of apparent and real priming effects: Linking microbial activity with soil organic matter decomposition // Soil Biology and Biochemistry. 2010. V. 42. № 8. P. 1275−1283.
- Blagodatskaya E., Yuyukina T., Blagodatsky S., Kuzyakov Y. Three-source-partitioning of microbial biomass and of CO2 efflux from soil to evaluate mechanisms of priming effects // Soil Biology and Biochemistry. 2011. V. 43. № 4. P. 778−786.
- Аристовская T.B. Теоретические аспекты проблемы численности, биомассы и продуктивности микроорганизмов. / Вопросы численности, биомассы и продуктивности почвенных микроорганизмов. Наука. 1972. Ленинград, с. 7−20.
- Абу-Эль-Нага С.А., Паников Н. С., Звягинцев Д. Г. Кинетический анализ кривых дыхания почв // Вестник МГУ сер 17 почвоведение. 1983. № 4. С. 40−48.
- Благодатская Е.В., Хомутова Т. Э., Демьянова Е. Г. Влияние высушивания и термической обработки на доминирующую экологическую стратегию микробного сообщества почвы под сеяным лугом // Агрохимия. 2002. № 7. С. 61−66.
- Благодатская Е.В., Хохлова О. С., Андерсон Т. Х., Благодатский С. А. Пул экстрагируемой микробной ДНК и микробиологическая активность палеопочв Южного Приуралья // Микробиология. 2003. Т. 72. № 6. С. 847−853.
- Благодатский С.А., Благодатская Е. В. Динамика микробной биомассы и соотношение эукариотных и прокариотных микроорганизмов в серой лесной почве//Почвоведение. 1996. № 12. С. 1485−1490.
- Благодатский С.А., Благодатская Е. В., Горбенко А. Ю., Паников Н. С. Регидратационный метод определения микробной биомассы в почве // Почвоведение. 1987. № 4. С. 64−71.
- Благодатский С.А., Благодатская Е. В., Розанова JT.H. Кинетика и стратегии роста микроорганизмов в черноземной почве после длительного применения различных систем удобрений // Микробиология. 1994. Т. 63. № 2. С. 298−307.
- Благодатский С.А., Богомолова И. Н., Благодатская Е. В. Микробная биомасса и кинетика роста микроорганизмов в черноземах при различном сельскохозяйственном использовании // Микробиология. 2008. Т. 77. № 1 С.113−120.
- Благодатский С.А., Евдокимов И. В., де Люка Т.Х. Эффективность и избирательность двух методов определния азота микробной биомассы в почве//Почвоведение. 1997. № 9. С. 1138−1147.
- Благодатский С.А., Ларионова A.A., Евдокимов И. В. Действие минеральных соединений азота на интенсивность дыхания и эффективность роста микроорганизмов в почве // Почвоведение. 1992. № 9. С. 88−96.
- Благодатский С.А., Паников Н. С., Самойлов Т. И. Влияние агротехнических приемов на динамику запасов микробного азота в серой лесной почве // Почвоведение. 1989. № 2. С. 52−60.
- Бочкарев А.Н., Кудеяров В. Н. Определение нитратов в почве, воде и растениях // Химия в сельском хозяйстве. 1982. Т. 20. № 4. С. 49−51.
- Горбенко А.Ю., Паников Н. С. Количественное описание динамики роста гетеротрофных микроорганизмов в почве в связи с первичным продукционным процессом в биогеоценозе // Журнал общей биологии. 1989. Т. L. № 1.С. 38−59.
- Гузев B.C., Бондаренко Н. Г., Вызов Б. А., Мирчинк Т. Г., Звягинцев Д. Г. Структура инициированного микробного сообщества как интегральный метод оценки микробиологического состояния почвы // Микробиология. 1980. Т. 49. № 1.С. 134−140.
- Демкина Т.С., Мирчинк Т. Г. Определение грибной биомассы методом мембранных фильтров // Микология и фитопатология. 1983. Т. 17. № 6. С. 517−520.
- Дорофеев А.Г., Паников Н. С. Количественное описание роста микроорганизмов в периодической культуре в зависимости от состояния инокулята// Микробиология. 1991. Т. 60. № 4. С. 652−660.
- Еремеев Н.Л., Карякин A.A., Казанская Н. Ф. Кинетика растворения твердых белковых субстратов протеиназами: выбор механизма реакции // Биохимия. 1989. Т. 54. С. 503−510.
- Звягинцев Д.Г. Почва и микроорганизмы 1987. М.: МГУ.
- Звягинцев Д.Г. (Ред.) Методы почвенной микробиологии и биохимии. 1991. Москва: МГУ.
- Звягинцев Д.Г., Дмитриев Е. А., Кожевин П. А. О люминесцентно-микроскопическом изучении почвенных микроорганизмов // Микробиология. 1978. Т. 47. С. 1091−1096.
- Костычев П.А. Избранные труды по физиологии и биохимии микроорганизмов. Vol 2. 1956. M.: Изд-во АН СССР.
- Кураков A.B., Попов А. И., Евдокимов И. В. Гетеротрофная нитрификация в почве // Почвоведение. 2001. № 10. С. 1250−1260.
- Кураков A.B., Попов А. И., Евдокимов И. В., Култышева Е. М. Нитрифицирующая активность почвенных микроскопических грибов на питательных средах и в стерильной почве // Вестник МГУ сер 17 почвоведение. 1995. № 1. С. 54−62.
- Кудеяров В.Н. Колометрическое определение аммонийного азота в почвах и растениях феноловым методом // Агрохимия. 1965. № 6. С. 146 150.
- Кудеяров В.Н. К методике определения общего азота в почвах и растениях//Агрохимия. 1972. № 11. С. 129−132.
- Кудеяров В.Н. Цикл азота в почве и эффективность удобрений. 1989. М.: Наука.
- Кудеяров В.Н., Егорова Е. Ф. Метод подготовки образцов для масс-спректрометрического определения различных форм азота в почве // Агрохимия. 1974. № 11. С. 129−132.
- Ларионова A.A., Розонова Л. Н., Самойлов Т. Н. Динамика газообмена в профиле серой лесной почвы // Почвоведение. 1988. № 11. С. 68−74.
- Ларионова A.A., Розонова Л. Н., Стрекозова В. И., Самойлов Т. Н. Влияние различных агроприемов на скорость газообмена серой лесной почвы // Агрохимия. 1988. № 9. С. 75−87.
- Мирчинк Т.Г., Паников Н. С. Современные подходы к оценке биомассы и продуктивности грибов и бактерий в почве // Успехи микробиологии. 1985. Т. 20. С. 198−226.
- Мунблит В.Я., Тальрозе B.JL, Трофимов В. И. Термоинактивация микроорганизмов. 1985. М.
- Наниташвили А.П., Конниц В. А., Черников В. А. Термографическая характеристика гумусовых кислот коричневых почв Грузии // Изв ТСХА. 1975. № 6. С. 113−126.
- Орлов Д.С., Гришина JI.A. Практикум по химии гумуса. 1981. Москва: Изд-во МГУ.
- Паников Н.С. Кинетика роста микроорганизмов: общие закономерности и экологические приложения. 1992. Москва: Наука.
- Паников Н.С., Палеева М. В., Дедыш С. Н., Дорофеев А. Г. Кинетические методы определения биомассы и активности различных групп почвенных микроорганизмов // Почвоведение. 1991. № 8. С. 109−120.
- Паников Н.С., Палеева М. В., Куличевская И. С., Глаголев М. В. Вклад бактерий и грибов в эмиссию СОг из почвы. / Г. А. Заварзин, Дыхание почвы.1993. Пущино, с. 33−51.
- Перт Д. Основы культивирования микроорганизмов и клеток. 1978. Москва: Мир.
- Тарвис Т.Б. Использование поглощенного микроорганизмами азота удобрений растениями в зависимости от их биологических особенностей. / In: Круговорот и баланс азота в системе: почва удобрение — растение -вода. 1979. Москва: Наука, с. 199−201.
- Тарвис Т.В. О мобилизации в почве азота, поглощенного микроорганизмами. / Вопросы численности, биомассы и продуктивности почвенных микроорганизмов. Наука.1972. JL, с. 117−192.
- Тарвис Т.В. Использование растениями азота удобрений, поглощенного микроорганизмами. / Азот в земледелии нечерноземной полосы. Колос.1973. Ленинград, с. 181−212.
- Умаров М.М., Кураков А. В., Степанов А. Л. Микробиологическая трансформация азота в почве. Изд-во Геос. 2007. М.
- Филипас Н.А. Трансформация иммобилизованного азота удобрения в дерново-подзолистых почвах // Агрохимия. 1985. № 6. С. 27−34.
- Хмельницкий Р.А., Лукашенко И. М., Калинкевич Р. А., Кончиц В. А., Бродский Е. С. Исследование кинетики термического разложения высокомолекулярных соединений методом пиролитической масс-спектрометрии // Изв ТСХА. 1975. № 6. С. 170−174.
- Хомутова Т.Э., Демкина Т. С., Демкин В. А. Оценка суммарной и активной микробной биомассы разновозрастных подкурганных палеопочв // Микробиология. 2004. Т. 73. № 2. С. 241−247.
- Adams Т.М., Laughlin R.J. The effects of agronomy on the carbon and nitrogen contained in the soil biomass //J Agric Sci. 1981. V. 97. № 2. P. 319 327.
- Akimenko V.K., Trutko S.M., Medentsev A.G., Korobov V.P. Distribution of cyanide-resistant respiration among yeasts and bacteria and its relation to oversynthesis of metabolites // Archives of Microbiology. 1983. V. 136. № 3. P. 234−241.
- Almeida J.S., Reis M.A.M., Carrondo M.J.T. A unifying kinetic model of denitrification // Journal of Theoretical Biology. 1997. V. 186. P. 241−249.
- Amato M., Ladd J.N. Assay for microbial biomass based on ninhydrin-reactive nitrogen in extracts of fumigated soils // Soil Biology and Biochemistry. 1988. V. 20. № 1. P. 107−114.
- Anderson J.P.E., Domsch K.H. Mineralization of bacteria and fungi in chloroform fumigated soils // Soil Biology and Biochemistry. 1978. V. 10. № 3.P. 207−213.
- Anderson J.P.E., Domsch K.H. A physiological method for the quantative measurement of microbial biomass in soils // Soil Biology and Biochemistry. 1978. V. 10. № 3. P. 215−221.
- Anderson J.P.E., Domsch K.H. Quantity of plant nutrients in the microbial biomass of selected soils // Soil Science. 1980. V. 130. P. 211−216.
- Anderson T.H., Domsch K.H. Maintenance carbon requirements of actively metabolizing microbial populations under in situ conditions // Soil Biology and Biochemistry. 1985. V. 17. № 2. P. 197−203.
- Anderson T.H., Joergensen R. Relationship between SIR and FE estimates of microbial biomass C in deciduous forest soils at different pH // Soil Biology and Biochemistry. 1997. V. 29. № 7. P. 1033−1042.
- Arah J.R.M., Smith K.A. Steady-state denitrification in aggregated soils: a mathematical model // J Soil Sci. 1989. V. 40. P. 139−149.
- Arah J.R.M., Vinten A.J.A. Simplified models of anoxia and denitrification in aggregated and simple-structured soils // European Journal of Soil Science. 1995. V. 46. № 4. P. 507−517.
- Arneth A., Sitch S., Bondeau A., et al. From biota to chemistry and climate: towards a comprehensive description of trace gas exchange between the biosphere and atmosphere // Biogeosciences. 2010. V. 7. № 1. P. 121−149.
- Arts P.A.M., Robertson L.A., Kuenen J.G. Nitrification and denitrification by Thiosphaera pantotropha in aerobic chemostat cultures // FEMS Microbiology Ecology. 1995. V. 18. № 4. P. 305−315.
- Ayanaba A., Tuckwell S.B., Jenkinson D.S. The effects of clearing and cropping on the organic reserves and biomass of tropical forest soils // Soil Biology and Biochemistry. 1976. V. 8. № 6. P. 519−527.
- Azam F., Malik K.A., Hussain F. Microbial biomass and mineralization-immobilization of nitrogen in some agricultural soils // Biology and Fertility of Soils. 1986. V. 2. № 3. P. 157−163.
- Azam F., Mulvaney R.L., Stevenson F.J. Synthesis of 15N-labelled microbial biomass in soil in situ and extraction of biomass N // Biology and Fertility of Soils. 1989. V. 7. № 2. P. 180−185.
- Azam F., Stevenson F.J., Mulvaney R.L. Chemical extraction of newly immobilized 15N and native soil N as influenced by substrate addition rate and soil treatments // Soil Biology and Biochemistry. 1989. V. 21. № 5. P. 715−722.
- Baath E. Thymidine incorporation into macromolecules of bacteria extracted from soil by homogenization-centrifugation // Soil Biology and Biochemistry. 1992. V. 24. № 11. P. 1157−1165.
- Baath E. Measurement of protein synthesis by soil bacterial assemblages with the leucine incorporation technique // Biology and Fertility of Soils. 1994. V. 17. P. 147−153.
- Badalucco L., De Cesare F., Grego S., Landi L., Nannipieri P. Do physical properties of soil affect chloroform efficiency in lysing microbial biomass? //
- Soil Biology and Biochemistry. 1997. V. 29. № 7. P. 1135−1142.
- Badalucco L., Nannipieri P., Grego S., Ciardi C. Microbial biomass and anthrone-reactive carbon in soils with different organic matter contents // Soil Biology and Biochemistry. 1990. V. 22. № 7. P. 899−904.
- Bakken L.R. Separation and purification of soil bacteria by density gradient centrifugation // 1985. V. 49. P. 1482−1487.
- Bakken L.R., Olsen R.A. Buoyant densities and dry-matter contents of microorganisms: conversion of a mesuared biovolume into biomass // Appl Environ Microbiol. 1983. V. P.
- Bashkin V.N., Kudeyarov V.N., Kuznetzova T.V. Technique of soil sample pretreatment for analysis of 15N:14N ratio // Communs Soil Sci Plant Anal. 1986. V. 17. № l.P. 115−123.
- Baumann B., Snozzi M., Zehnder A.J., Van Der Meer J.R. Dynamics of denitrification activity of Paracoccus denitrificans in continuous culture during aerobic-anaerobic changes //J. Bacteriol. 1996. V. 178. № 15. P. 4367−4374.
- Baumgartner M., Koschorreck M., Conrad R. Oxidative consumption of nitric oxide by heterotrophic bacteria in soil // FEMS Microbiology Ecology. 1996. V. 19. № 3. P. 165−170.
- Bazin M.J., T. S.P., I. P.J. Models of microbial interaction in soil // Critical Rev Microbiology. 1976. V. 5. P. 463−498.
- Betlach M.R., Tiedje J.M. Kinetic explanation for accumulation of nitrite, nitric oxide, and nitrous oxide during bacterial denitrification // Applied and Environmental Microbiology. 1981. V. 42. № 6. P. 1074−1084.
- Biederbeck V.O., Janzen H.H., Campbell C.A., Zentner R.P. Labile soil organic matter as influenced by cropping practices in an arid environment // Soil Biology and Biochemistry. 1994. V. 26. № 12. P. 1647−1656.
- Birch H.F. Further observations on humus decomposition and denitrification // Plant and Soil. 1959. V. 11. P. 262−287.
- Birch H.F. Nitrification in soils after different periods of dryness // Plant and Soil. 1960. V. 12. P. 81−97.
- Bjarnason S. Calculation of gross nitrogen immobilization and mineralization in soil // J Soil Sci. 1988. V. 39. № 3. P. 393−406.
- Blagodatsky S.A., Heinemeyer O., Richter J. Estimating the active and total soil microbial biomass by kinetic respiration analysis // Biology and Fertility of Soils. 2000. V. 32. № 1. P. 73−81.
- Blagodatsky S.A., Kesik M., Papen H., Butterbach-Bahl K. Production of NO and N20 by the heterotrophic nitrifier Alcaligenes faecal is parafaecalis under varying conditions of oxygen saturation // Geomicrobiology J. 2006. V. 23. № 3.P. 165−176.
- Blagodatsky S.A., Richter O. Microbial growth in soil and nitrogen turnover: a theoretical model considering the activity state of microorganisms // Soil Biology and Biochemistry. 1998. V. 30. № 13. P. 1743−1755.
- Blagodatsky S.A., Yevdokimov I.V. Extractability of microbial N as influenced by C: N ratio in the flush after drying or fumigation // Biology and Fertility of Soils. 1998. V. 28. № l.P. 5−11.
- Blagodatsky S.A., Yevdokimov I.V., Larionova A.A., Richter J. Microbial growth in soil and nitrogen turnover: model calibration with laboratory data // Soil Biology and Biochemistry. 1998. V. 30. № 13. p. 1757−1764.
- Bloem J., Veninga M., Shepherd J. Fully automatic determination of soil bacterial numbers, cell volumes, and frequencies of dividing cells by confocallaser scanning microscopy and image analysis // Appl Environ Microbiol. 1995. V. 61. P. 926−936.
- Bollmann A., Conrad R. Influence of O2 availability on NO and N2O release by nitrification and denitrification in soils // Global Change Biology. 1998. V. 4. № 4. P. 387−396.
- Bonde T.A., Schnuerer J., Rosswall T. Microbial biomass as a fraction of potentially mineralizable nitrogen in soils from long-term field experiments // Soil Biology and Biochemistry. 1988. V. 20. № 4. P. 447−452.
- Bosatta E., Agren G.I. Theoretical analysis of carbon and nitrogen interactions in soil under energy-limited conditions // Soil Sci Soc Am J. 1991. V. 55. № 3. P. 728−733.
- Bosatta E., Agren G.I. Theoretical analysis of microbial biomass dynamics in soil // Soil Biology and Biochemistry. 1994. V. 26. № 1. P. 143−148.
- Bothe H., Jost G., Schloter M., Ward B.B., Witzel K.P. Molecular analysis of ammonia oxidation and denitrification in natural environments // FEMS Microbiology Reviews. 2000. V. 24. № 5. P. 673−690.
- Bremer E., Kuikman P. Microbial utilisation of 14CU. glucose in soil is affected by the amount and timing of glucose additions // Soil Biology and Biochemistry. 1994. V. 26. P. 511−517.
- Bremer E., van Kessel C. Appraisal of the nitrogen-15 natural abundance method for quantifying dinitrogen fixation // Soil Sci Soc Am J. 1990. V. 54. № 2. P. 404−411.
- Bremer E., Van Kessel C. Extractability of microbial 14C and 15N following addition of variable rates of labelled glucose and (NH4)2S04 to soil // Soil Biology and Biochemistry. 1990. V. 22. № 5. P. 707−713.
- Bristow A.W., Ryden J.C., Whitehead D.C. The fate at several time intervals of 15N-labelled ammonium nitrate applied to established grass sward // J Soil Sci. 1987. V. 38. № 2. P. 245−254.
- Brookes P.C., Kragt J.F., Powlson D.S., Jenkinson D.S. Chloroform fumigation and the release of soil nitrogen: the effects of fumigation time and temperature // Soil Biology and Biochemistry. 1985. V. 17. № 6. P. 831−837.
- Brookes P.C., Landman A., Pruden G., Jenkinson D.S. Chloroform fumigation and release of soil nitrogen: a rapid direct extraction method to measure microbial biomass nitrogen in soil // Soil Biology and Biochemistry. 1985. V. 17. № 6. P. 837−843.
- Butterbach-Bahl K., Berger U., Brrjggemann N., Duyzer J. Profiles of C- and N-trace gas production in N-saturated forest soils // Biogeosciences Discuss. 2005. V. 2. № 4. P. 1127−1157.
- Butterbach-Bahl K., Gasche R., Breuer L» Papen H. Fluxes of NO and N20 from temperate forest soils: impact of forest type, N deposition and of liming on the NO and N2O emissions // Nutrient Cycling in Agroecosystems. 1997. V. 48. P. 79−90.
- Butterbach-Bahl K., Gasche R., Willibald G., Papen H. Exchange of N-gases at the Hitglwald forest a summary // Plant and Soil. 2002. V. 240. P. 117 123.
- Carter M.R., Rennie D.A. Changes in soil quality under zero tillage farmingsystems: distribution of microbial biomass and mineralizable C and N potentials // Can J Soil Sci. 1982. V. 62. P. 587−597.
- Carter M.R., Rennie D. A, Dynamics of soil microbial biomass N under zero and shallow tillage for spring wheat using lsN urea // Plant and Soil. 1984. V. 76. № 157−164. P.
- Cataldo D.A., Haroon M., Schrader L.E., Youngs V.L. Rapid colorimetic determination of nitrate in plant tissue by nitration of salicylic acid // Communnications in Soil Science and Plant Analysis. 1975. V, 6. P. 71−80.
- Chapman S.J., Gray T.R.G. Importance of cryptic growth, yield factors and maintenance energy in models of microbial growth in soil // Soil Biology and Biochemistry. 1986. V. 18. № 1. P. 1−4.
- Chapuis-Lardy L., Wrage N., Metay A., Chotte J.-L., Bernoux M. Soils, a sink forN2O? A review// Global Change Biology. 2007. V. 13. № 1. P. 1−17.
- Chen D., Li Y., Grace P., Mosier A. N20 emissions from agricultural lands: a synthesis of simulation approaches // Plant and Soil. 2008. V. 309. № I. P. 169−189.
- Cheng W., Virginia R.A. Measurement of microbial biomass in arctic tundra soils using fumigation-extraction and substrate-induced respiration procedures //Soil Biology and Biochemistry. 1993. V. 25. № l.P. 135−141.
- Cho C.M., Mills J.G. KINETIC FORMULATION OF THE DENITRIFICATION PROCESS IN SOIL// Canadian Journal of Soil Science. 1979. V. 59. P. 249−257.
- Chotte J.L., Ladd J.N., Amato M. Measurement of biomass C, N, and 14C of a soil at different water contents using a fumigation-extraction assay // Soil Biology and Biochemistry. 1998. V. 30. № 8/9. P. 1221−1224.
- Clarholm M, Interactions of bacteria, protozoa and plants leading to mineralization of soil nitrogen // Soil Biology and Biochemistry. 1985. V. 17. P. 181−187.
- Colores G.M., Schmidt S.K., Fisk M.C. Estimating the biomass of microbial functional groups using rates of growth-related soil respiration // Soil Biology and Biochemistry. 1996. V. 28. № 12. P. 1569−1577.
- Conrad R. Microbiological and biochemical background of production and consumption of NO and N20 in soil. / In: R. Gasche, H. Papen, H. Rennenberg, editors. Trace gas exchange in forest ecosystems.2002. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, pp. 3−33.
- Coody P.N., Sommers L.E., Nelson D. W, Kinetics of glucose uptake by soil microorganisms // Soil Biology and Biochemistry. 1986. V. 18. № 3. P. 283 289.
- Darrah P.R. Models of the rhizosphere. I. Microbial population dynamics around a root releasing soluble and insoluble carbon // Plant and Soil. 1991. V. 133. P. 187−199.
- Dassonville F., Renault P., Valles V. A model describing the interactions between anaerobic microbiology and geochemistry in a soil amended with glucose and nitrate // European Journal of Soil Science. 2004. V. 55. № 1. P. 29−45.
- Daum M., Zimmer W., Papen H., Kloos K., Nawrath K., Bothe H.
- Physiological and molecular biological characterization of ammonia oxidation of the heteotrophic nitrifier Pseudomonas putida // Current Microbiology. 1998. V. 37. P. 281−288.
- Davidson E.A., Eckert R.W., Hart S.C., Firestone M.K. Direct extraction of microbial biomass nitrogen from forest and grassland soils of California // Soil Biology and Biochemistry. 1989. V. 21. № 6. P. 773−778.
- De Wit C.T., Van Keulen H. Modelling Production of Field Crops and its Requirements // Geoderma. 1987. V. 40. № 3,4. P. 253 265.
- Del Grosso S.J., Ogle S.M., Parton W.J., Breidt F.J. Estimating uncertainty in N20 emissions from US cropland soils // Global Biogeochemical Cycles. 2010. V. 24. P.
- Dendooven L., Anderson J.M. Use of a «least square» optimization procedure to estimate enzyme characteristics and substrate affinities in the denitrification reactions in soil // Soil Biology and Biochemistry. 1995. V. 27. № 10. P. 12 611 270.
- Dendooven L., Splatt P., Anderson J.M., Scholefield D. Kinetics of the denitrification process in a soil under permanent pasture // Soil Biology and Biochemistry. 1994. V. 26. № 3. P. 361−370.
- Dictor M.C., Tessier L., Soulas G. Reassessment of the kEC coefficient of the fumigation-extraction method in a soil profile // Soil Biology and Biochemistry. 1998. V. 30. № 2. P. 119−127.
- Fang C., Smith P., Smith J.U., Moncrieff J.B. Incorporating microorganisms as decomposers into models to simulate soil organic matter decomposition // Geoderma. 2005. V. 129. P. 139−146.
- Fog K. The effect of added nitrogen on the rate of decomposition of organic matter//Biological Reviews. 1988. V. 63. № 3. P. 433−462.
- Fry J.C. Direct methods and biomass estimation // Methods in microbiology. 1990. V. 22. P. 41−85.
- Gamble T.N., Betlach M.R., Tiedje J.M. Numerically dominant denitrifying133.134.135.136.137.138,139,140,141,142,143,144,145,146 147,148bacteria from world soils // Applied and Environmental Micobiology. 1977. V. 33. P. 926−939.
- Grant R.F. A review of the Canadian ecosystem model ecosys. / In: M. G. Shaffer, M. Liwang, S. Hansen, editors. Modelling carbon and nitrogen dynamics for soil management. Vol CRC Press.2001. Boca Raton, pp. 175 264.
- Grant R.F., Pattey E. Mathematical modeling of nitrous oxide emissions from an agricultural field during spring thaw// Global Biogeochemical Cycles. 1999. V. 13. № 2. P. 679−694.
- Grant R.F., Pattey E. Modelling variability in N20 emissions from fertilized agricultural fields // Soil Biology and Biochemistry. 2003. V. 35. № 2. P. 225 243.
- Grant W.D., West A.W. Measurement of ergosterol, diaminopimelic acid and glucosamine in soil: evaluation as indicators of microbial biomass // J Microbiol Meth. 1986. V. 6. P. 47−53.
- Greenfield L.G. Release of microbial cell N during chloroform fumigation // 1995. V. 27. P. 1235−1236.
- Grote R., Kiese R., Griinwald T., Ourcival J.-M., Granier A. Modelling forest carbon balances considering tree mortality and removal // Agricultural and Forest Meteorology. 2011. V. 151, No2. P.179−190.
- Hadas A.J., Molina J.A.E., Feigenbaum S., Clapp C.E. Simulation of nitrogen-15 immobilization by the model NC SOIL // Soil Sci Soc Am J. 1987. V. 51. P. 102−106.
- Hanssen J.F., Thingstad T.F., Goksoyr J. Evaluation of hyphal lengths and fungal biomass in soil by membrane filter technique // Oikos. 1974. V. 25. P. 102−107.
- Harris D., Voroney R.P., Paul E.A. Measurement of microbial biomass N: C by chloroform fumigation-incubation // Can J Soil Sci. 1997. V. 77. P. 507−514.
- Harrison M.J., Wright R.R., Morita R.Y. Method for measuring mineralization in lake sediments // Applied Microbiology. 1971. V. 21. P. 698−702.
- Haubensak K.A., Hart S.C., Stark J.M. Influences of chloroform exposure time and soil water content on C and N release in forest soils // Soil Biology and Biochemistry. 2002. V. 34. P. 1549−1562.
- He X.T., Stevenson F J. Revised formulas for calculating extractability ratios of immobilized N in soils// Soil Biology and Biochemistry. 1989. V. 21. № 3. P.463−467.
- Heinemeyer O., Insam H., Kaiser E.A., Walenzik G. Soil microbial biomass and respiration measurements: an automated technique based on infra-red gas analysis Plant Soil 116:191−195//Plant and Soil. 1989. V. 116. P. 191−195.
- Heinen M. Simplified denitrification models: Overview and properties // Geoderma. 2006. V. 133. № 3−4. P. 444−463.
- Henault C., Germon J.C. NEMIS, a predictive model of denitrification on the field scale // European Journal of Soil Science. 2000. V. 51. № 2. P. 257−270.
- Herbert D., Phipps P., Strange R. Chemical analysis of microbial cells. Vol 5B. 1971.
- Hobbie J.E., Daley R.J., Jasper S. Use of Nucleopore filters for counting bacteria by fluorescence microscopy // Appl Environ Microbiol. 1977. V. 33. P. 1225−1228.
- Hopkins D.W., Macnaughton S.J., O’Donnell A.G. A dispersion and differential centrifugation technique for representatively sampling microorganisms from soil // Soil Biology and Biochemistry. 1991. V. 23. № 3. P. 217−225.
- Horwath W.R., Paul E.A., Harris D., Norton J., Jagger L., Horton K. Defining a realistic control for the chloroform fumigation-incubation method using microscopic counting and 14C-substrates // Can J Soil Sci. 1996. V. 76. P. 459−467.
- Hu S., Van Bruggen A.H.C. Efficiences of chloroform fumigation in soil: effects of physiological states of bacteria// Soil Biology and Biochemistry. 1998. V. 30. № 13. P. 1841−1844.
- Ingham E.R., Horton E.A. Bacterial, fungal and protozoan responses tochloroform fumigation in stored soils // Soil Biology and Biochemistry. 1987.1. V. 19. P. 545−550.
- Jackson L., Schimel J., Firestone M. Short-term partitioning of ammonium and nitrate between plants and microbes in an annual grassland // Soil Biology and Biochemistry. 1989. V. 21. № 3. P. 409−415.
- Jenkinson D.S. Studies on the decomposition of plant material in soil. II Partial sterilization of soil and soil biomass // J Soil Sci. 1966. V. 17. P. 280 302.
- Jenkinson D.S. The effect of biocidal treatments on metabolism in soil. IV. The decomposition of fumigated microorganisms in soil // Soil Biology and Biochemistry. 1976. V. 8. № 3. P. 203−208.
- Jenkinson D.S. Determination of microbial biomass carbon and nitrogen in soil. / In- Advances in Nitrogen Cycling in Agriculture Ecosystems. Vol C.A.B. International.1988. Wallingford: J.R.Wilson, pp. 368−386.
- Jenkinson D.S., Ladd J.N., Paul E.A., Ladd J.N. Microbial biomass in soil: measurement and turnover. / In: Soil Biochemistry. 1981. N Y: Marcel Dekker, pp. 415−471.
- Jenkinson D.S., Oades J.M. A method for measuring adenosine triphosphate in in soil // Soil Biology and Biochemistry. 1979. V. 11. P. 193−199.
- Jenkinson D.S., Parry L.C. The nitrogen cycle in the Broadbalk Wheat Experiment: a model for the turnover of nitrogen through the soil microbial biomass // Soil Biology and Biochemistry. 1989. V. 21. № 4. P. 535−541.
- Jenkinson D.S., Powlson D.S. The effects of biocidal treatments on metabolism in soil. I Fumigation with chloroform // Soil Biology and Biochemistry. 1976. V. 8. № 3. P. 167−177.
- Jenkinson D.S., Powlson D.S. The effects of biocidal treatments on metabolism in soil. V. A method for measuring soil biomass // Soil Biology and Biochemistry. 1976. V. 8. № 3. P. 209−213.
- Jetten M.S.M., Logemann S., Muyzer G., Robertson L.A., De Vries S., van Loosdrecht M.C.M., Kuenen J.G. Novel principles in the microbial conversion of nitrogen compounds // Antonie van Leeuwenhoek. 1997. V. 71. P. 75−93.
- The State of Greenhouse Gases in the Atmosphere Based on Global Observations through 2009 // WMO Greenhouse Gas Bulletin. 2010. V. № 6.
- Joergensen R.G. The fumigation-extraction method to estimate soil microbial biomass: calibration of the kEC value // Soil Biology and Biochemistry. 1996. V. 28. № l.P. 25−31.
- Joergensen R.G., Mueller T. The fumigation-extraction method to estimate soil microbial biomass: calibration of the kEN value // Soil Biology and Biochemistry. 1996. V. 28. P. 33−37.
- Jones P.C.T., Mollison J.E. A technique for the quantitative estimation of soil microorganisms // J Gen Microbiol. 1948. V. 2. P. 54−69.
- Juma N.G., Paul E.A. Mineralizable soil nitrogen: amounts and extractability ratios // Soil Sci Soc Am J. 1984. V. 48. P. 76−80.
- Kaiser E.A., Mueller T., Joergensen R.G., Insam H., Heinemeyer O. Evaluation of methods to estimate the soil microbial biomass and the relationship with soil texture and organic matter // Soil Biology and Biochemistry. 1992. V. 24. P. 675−683.
- Kelley K.R., Stevenson F.J. Characterization and extractability of immobilized 15N from the soil microbial biomass // Soil Biology and Biochemistry. 1985. V. 17. № 4. P. 517−523.
- Kersebaum K.C., Richter J. Modelling nitrogen dynamics in a plant-soil system with a simple model for advisory purposes // Fertilizer Res. 1990. V. 27. P. 273−291.
- Kersebaum K.C., Richter O. A model approach to simulate C and N transformations through microbial biomass. / In: J. J. Neeteson, J. Hassink, editors. Nitrogen mineralization in agricultural soils. 1994. Haren, The Netherlands, pp. 221−230.
- Kesik M" Blagodatsky S.A., Papen H., Butterbach-Bahl K. Effect of pH, temperature and substrate on N20, NO and CO2 production by Alcaligenes faecalis p // Journal of Applied Microbiology. 2006. V. 101. P. 655−667.
- Kester R.A., de Boer W., Laanbroek H.J. Production of NO and N20 by Pure Cultures of Nitrifying and Denitrifying Bacteria during Changes in Aeration // Applied and Environmental Microbiology. 1997. V. 63. № 10. P. 3872−3877.
- Kieft T.L., Soroker E., Firestone M.K. Microbial biomass response to a rapid increase in water potential when dry soil is wetted // Soil Biology and Biochemistry. 1987. V. 19. P. 119−126.
- Killham K. Nitrification in coniferous forest soils // Plant & Soil. 1990. V. 128. P. 31−44.
- Kirkham D., Bartolomew W.V. Equations for following nutrient transformations in soil utilizing tracer data I // Proceedings of Soil Science Society of America. 1954. V. 18. P. 33−34.
- Knapp E.B., Elliott L.F., Campbell G.S. Carbon, nitrogen and microbial biomass interrelationships during the decomposition of wheat straw: a mechanistic simulation model // Soil Biology and Biochemistry. 1983. V. 15. № 4. P. 456−463.
- Koike I., Hattori A. Growth yield of a denitrifying bacterium, Pseudomonas denitri? cans, under aerobic and denitrifying conditions // Journal of General Microbiology. 1975. V. 88. P. 1−10.
- Korner H., Zumft W.G. Expression of denitrification enzymes in response to the dissolved oxygen level and respiratory substrate in continuous culture of Pseudomonas stutzeri // Applied and Environmental Microbiology. 1989. V. 55. № 7. P. 1670−1676.
- Kreutzer K., Butterbach-Bahl K., Rennenberg H., Papen H. The complete nitrogen cycle of an N-saturated spruce forest ecosystem // Plant biology (Stuttgart, Germany). 2009. V. 11. № 5. P. 643−649.
- Kuenen J.G., Robertson L.A. Combined nitrification-denitrification processes //FEMS Microbiology Reviews. 1994. V. 15. P. 109−117.
- Kuikman P.J., Jansen A.G., Van Veen J.A., Zehnder A.J.B. Protozoan predation and the turnover of soil organic carbon and nitrogen in the presentsof plants // Biology and Fertility of Soils. 1990. V. 10. № 1. P. 22−28.
- Langeveld C.A., Leffelaar P.A. Modelling belowground processes to explain field-scale emissions of nitrous oxide // Ecological Modelling. 2002. V. 149. № 1−2. P. 97−112.
- Leffelaar P.A. Dynamics of partial anaerobiosis, denitrification, and water in a soil aggregate: simulation // Soil Science. 1988. V. 146. № 6. P. 427−444.
- Leffelaar P.A., Wessel W.W. Denitrification in a homogeneous, closed system: experiment and simulation // Soil Science. 1988. V. 146. № 5. P. 335 349.
- Legg J.O., Chichester F.W., Standford G., DeMar W.H. Incorporation of 15N-tagged mineral nitrogen into stable forms of soil organic nitrogen // Soil Sci SocAm Proc. 1971. V. 35. P. 273−276.
- Lethbridge G., Davidson M.S. Microbial biomass as a source of nitrogen for cereals // Soil Biology and Biochemistry. 1983. V. 15. № 3. P. 375−376.
- Li C. Modelling trace gas emission from agricultural ecosystems // Nutrient Cycles in Agroecosystems. 2000. V. 58. P. 259−276.
- Li C., Aber J.D., Stange F., Butterbach-Bahl K., Papen H. A process-oriented model ofN20 and NO emissions from forest soils: 1. model development// Journal of Geophysical Research. 2000. V. 105. № D4. P. 4369−4384.
- Li C., Frolking S., Frolking T.A. A model of nitrous oxide evvolution from soil driven by rainfall events: 1. model structure and sensitivity // Journal of Geophysical Research-Atmospheres. 1992. V. 97. № D9. P. 9759−9776.
- Lin Q., Brookes P.C. Comparison of methods to measure microbial biomass in unamended, ryegrass-amended and fumigated soils // Soil Biology and Biochemistry. 1996. V. 28. № 7. P. 933−939.
- Lynch J.M., Painting L.M. Variations in the size of the soil biomass // Soil Biology and Biochemistry. 1980. V. 12. № 6. P. 547−551.
- Lynch J.M., Painting L.M. Effects of season, cultivation and nitrogen fertilizer on the size of the soil microbial biomass // J Sci Food Agric. 1982. V. 33. P. 249−252.
- Lynch J.M., Poole N.J. Microbial ecology. A conceptual approach. 1979. London etc: Blackwell Scientific Publications
- Majadon J. Use of radiorespirometry in soil microbiology and biochemistry. / In: A. D. McLaren, J. Skujins, editors. Soil Biochemistry. Vol 2.1971. New York: Marcell Dekker, pp. 202−256.
- Manzoni S., Porporato A. A theoretical analysis of nonlinearities and feedbacks in soil carbon and nitrogen cycles // Soil Biology and Biochemistry. 2007. V. 39. № 7. P. 1542−1556.
- Manzoni S., Porporato A. Soil carbon and nitrogen mineralization: Theory and models across scales // Soil Biology and Biochemistry. 2009. V. 41. № 7. P. 1355−1379.
- Martens R. Limitations in the application of the fumigation technique for biomass estimations in amended soils // Soil Biology and Biochemistry. 1985. V. 17. № 1. P. 57−65.
- Martens R. Current methods for measuring microbial biomass C in soil: Potentials and limitations // Biology and Fertility of Soils. 1995. V. 19. № 1.1. P. 87−99.
- Martin N.J., MacDonald R.M. Separation of nonfilamentous microorganisms from soil by density gradient centrifugation in Percoll // Journal of Applied Bacteriology. 1981. V. 51. P. 243−251.
- Marumoto T., Anderson J.P.E., Domsch K.H. Mineralization of nutrients from soil microbial biomass // Soil Biology and Biochemistry. 1982. V. 14. P. 469 475.
- McGill W.B. The Physiology and Biochemistry of Microorganisms. / In: E. A. Paul, editor. Soil Microbiology, Ecology, and Biochemistry
- Vol Academic Press.2007. Amsterdam, Boston, pp. 231−256.
- McGill W.B., Cannon K.R., Robertson J.A., Cook F.D. Dynamics of soil microbial biomass and water-soluble organic C in Breton L after 50 years of cropping to two rotations // Can J Soil Sci. 1986. V. 66. P. 1−19.
- McGill W.B., Hunt H.W., Woodmansee R.G., O. R.J. Phoenix, a model of the dynamics of carbon and nitrogen in grassland soils. / In: F. E. Clark, T. Rosswall, editors. Terrestrial nitrogen cycles.1981. Stockholm, pp. 49−115.
- McKenney D.J., Drury C.F., Findlay W.I., Mutus B., McDonnell T., Gajda C. Kinetics of denitriflcation by Pseudomonas fluorescens: Oxygen effects // Soil Biology and Biochemistry. 1994. V. 26. № 7. P. 901−908.
- McKenney D.J., Drury C.F., Wang S.W. Effects of Oxygen on Denitriflcation Inhibition, Repression, and Derepression in Soil Columns // Soil Science Society of America Journal. 2001. V. 65. № 1. P. 126−132.
- Merckx R., Dijkstra A., Den Hartog A., Van Veen J.A. Production of root-derived material and associated microbial growth at different nutrient levels // Biology and Fertility of Soils. 1987. V. 5. P. 126−132.
- Merckx R., van der Linden A.M.A. The extraction of microbial biomass components from soils. In: D. S. Jenkinson, K. A. Smith, editors. London New-York: Elsevier applied science- 1988. pp. 327−339.
- Millar N., Baggs E.M. Chemical composition, or quality, of agroforestry residues influences N20 emissions after their addition to soil // Soil Biology and Biochemistry. 2004. V. 36. № 6. P. 935−943.
- Molina J.A.E., Clapp C.E., Shaffer M.J., Chichester F.W., Larson W.E. NCSOIL, a model of nitrogen and carbon transformations in the soil: Decomposition, calibration and behavior// Soil Sci Soc Am J. 1983. V. 47. P. 85−91.
- Monod J. Recherches sur la croissanse des cultures bacteriennes. 1942. Paris: Hermann.
- Montgomery H.J., Monreal C.M., Young J.C., Seifert K.A. Determination of soil fungal biomass from soil ergosterol analyses // Soil Biology and Biochemistry. 2000. V. 32. P. 1207−1217.
- Moorhead D.L., Sinsabaugh R.L. A THEORETICAL MODEL OF LITTER DECAY AND MICROBIAL INTERACTION // Ecological Monographs. 2006. V. 76. № 2. P. 151−174.
- Biochemistry. 1991. V. 23. № 7. P. 609−616.
- Muller C., Sherlock R.R., Williams P.H. Mechanistic model for nitrous oxide emission via nitrification and denitrification // Biology and Fertility of Soils. 1997. V. 24. № 2. P. 231−238.
- Muller C., Stevens R.J., Laughlin R.J. Evidence of carbon stimulated N transformations in grassland soil after slurry application // Soil Biology and Biochemistry. 2003. V. 35. № 2. P. 285−293.
- Muller C., Stevens R.J., Laughlin R.J. A 15N tracing model to analyse N transformations in old grassland soil // Soil Biology and Biochemistry. 2004. V. 36. № 4. P. 619−632.
- Nicolardot B., Chaussod R., Catroux G. Decomposition de corps microbiens dans des sols fumiges au chloroforme: effects du type de sol et de microorganisme// Soil Biology and Biochemistry. 1984. V. 16. № 5. P. 453 458.
- Nunan N., Ritz K.A., Crabb D., Harris K., Wu K., Crawford J.W., Young I.M. Quantification of the in situ distribution of soil bacteria by large-scale imaging of thin sections of undisturbed soil // FEMS Microbiology Ecology. 2001. V. 37.№ l.P. 67−77.
- Otte S., Grobben N.G., Robertson L.A., Jetten M.S.M., Kuenen J.G. Nitrous Oxide Production by Alcaligenes faecalis under Transient and Dynamic Aerobic and Anaerobic Conditions // Applied and Environmental Microbiology. 1996. V. 62. № 7. P. 2421−2426.
- Panikov N.S., Blagodatsky S.A., Blagodatskaya J.V., Glagolev M.V. Determination of microbial mineralization activity in soil by modified Wright and Hobby method // Biology and Fertility of Soils. 1992. V. 14. P. 280−287.
- Panikov N.S., Sizova M.V. A kinetic method for estimating the biomass of microbial functional groups in soil // Journal of microbiological methods. 1996. V. 24. P. 219−230.
- Pansu M., Bottner P., Sarmiento L., Metselaar K. Comparison of five soil organic matter decomposition models using data from a 14C and 15N labelling field experiment // Global Biogeochemical Cycles. 2004. V. 18. P.
- Papen H., Berg R. A most probable number method (MPN) for the estimation of cell numbers of heterotrophic nitrifying bacteria in soil // Plant and Soil. 1998. V. 199. P. 123−130.
- Papen H., Berg R., Hinkel I., Thoene B., Rennenberg H. Heterotrophic nitrification by Alcaligenes faecalis: NO2-, NO3-, N2O, and NO production in exponentially growing cultures // Applied and Environmental Microbiology. 1989. V. 55. № 8. P. 2068−2072.
- Parkinson D., Coleman D.C. Microbial communities, activitiy and biomass // Agric Ecosyst Environ. 1991. V. 34. P. 3−33.
- Parnas H.A. Model for decomposition of organic material by microorganisms // Soil Biology and Biochemistry. 1975. V. 7. P. 161−169.
- Parsons L.L., Smith M.S. Microbial utilization of carbon-14-glucose in aerobic vs. anaerobic denitrifying soils // Soil Sci Soc Am J. 1989. V. 53. № 4. P. 1082−1085.
- Parton W.J., Holland E.A., Del Grosso S.J., Hartman M.D., Martin R.E., Mosier A.R., Ojima D.S., Schimel D.S. Generalized model for NOx and N20 emissions from soils // J. Geophysical Research. 2001. V. 106. № D15. P. 17,40317, 420.
- Parton W.J., Mosier A., Ojima D.S., Valentine D., Schimel D., Weier K.L., Kulmala A.E. Generalized model for N2 and N2O production from nitrification and denitrification // Global Biogeochemical Cycles. 1996. V. 10. № 3. P. 401−412.
- Parton W.J., Schimel D.S., Cole C.V., Ojima D.S. Analysis of factors controlling soil organic matter levels in great plains grasslands // Soil Sci Soc Am J. 1987. V. 51. № 5. P. 1173−1179.
- Patureau D., Zumstein E., Delgenes J.P., Moletta R. Aerobic denitrifiers isolated from natural and managed ecosystems // Microbial Ecology. 2000. V. 39. P.145−152.
- Paul E.A., Clark F.E. Soil microbiology and biochemistry. / In. Vol Academic Press. 1989. San Diego, California.
- Paustian K., Parton W.J., Persson J. Modeling soil organic matter in organic-amended and nitrogen-fertilized long-term plots // Soil Sci Soc Am J. 1992. V. 56. № 2. P. 476−488.
- Paustian K., Schnuerer J. Fungal growth response to carbon and nitrogen limitation: a theoretical model // Soil Biology and Biochemistry. 1987. V. 19. № 5. P. 613−620.
- Payne J.W. Energy yields and growth of heterotrophs // Annual Review of Microbiology. 1970. V. 24. P. 17−52.
- Pennington P.I., Ellis R.C. Autotrophic and heterotrophic nitrification in acidic forest and native grassland soils // Soil Biology and Biochemistry. 1993. V. 25. № 10. P. 1399−1408.
- Poth M., Focht D.D. 15N kinetic analysis of N2O production by Nitrosomonas europaea: an examination of nitrifier denitrification. // Applied and Environmental Microbiology. 1985. V. 49. P. 1134−1141.
- Powell E.O. The growth rate of microorganisms as a function of substrate concentration. / In: E. O. Powell, editor. Continuous cultivation of microorganisms. 1967. Salisbury: H.M. Stationery Office, pp. 34−55.
- Powlson D.S., Jenkinson D.S. The effects of biocidal treatments on metabolism in soil. II Gamma-irradiation, autoclaving, air-drying and fumigation // Soil Biology and Biochemistry. 1976. V. 8. № 3. P. 179−188.
- Prosser J.I. Autotrophic nitrification in bacteria // Advances in Microbial Physiology. 1989. V. 30. P. 125−181.
- Remde A., Conrad R. Production of nitric oxide in Nitrosomonas europea by reduction of nitrite // Arch Microbiol. 1990. V. 154. P. 187−191.
- Renault P., Sierra J. Modeling oxygen diffusion in aggregated soils: II. Anaerobiosis in topsoil layers // Soil Sci.Soc.Am.J. 1994. V. № 58. P. 10 231 030.
- Renault P., Stengel P. Modeling Oxygen Diffusion in Aggregated Soils: I. Anaerobiosis inside the Aggregates // Soil Science Society of. America Journal. 1994. V. № 58. P. 1017−1023.
- Richter O., Diekkriiger B., Nortersheuser P. Environmental fate modelling of pesticides. 1996. Weinheim, FRG: VCH.
- Riis V., Lorbeer H., Babel W. Extraction of microorganisms from soil: evaluation of the efficiency by counting methods and activity measurements // Soil Biology and Biochemistry. 1998. V. 30. № 12. P. 1573−1581.
- Ritz K., Robinson D. Temporal variations in soil microbial biomass C and N under a spring barley crop // Soil Biology and Biochemistry. 1988. V. 20. № 5. P. 625−630.
- Robertson L.A., Cornelisse R., de Vos P., Hadioetomo R., Kuenen R. Aerobic denitrification in various heterotrophic nitrifiers // Antonie van Leeuwenhoek. 1989. V. 56. P. 289−299.
- Robertson L.A., Kuenen J.G. Combined heterotrophic nitrification and aerobic denitrification in Thiosphera panthotropha and other bacteria // Antonie van Leeuwenhoek. 1990. V. 57. P. 139−152.
- Robinson J.A. Determining microbial kinetic parameters using nonlinear regression analysis: advantages and limitations in microbial ecology // Advances in Microbial Ecology. 1984. V. 7. P. 61−114.
- Rockstrom J., Steffen W., Noone K., et al. A safe operating space for humanity//Nature. 2009. V. 461. № 7263. P. 472−475.
- Roever M., Heinemeyer O., Kaiser E.A. Microbial induced nitrous oxide emissions from an arable soil during winter // Soil Biology and Biochemistry. 1998. V. 30. № 14. P. 1859−1865.
- Rosenkranz P., Brueggemann N., Papen H., Xu Z., Seufert G., Butterbach-Bahl K. N20, NO and CH4 exchange, and microbial N turnover over a Mediterranean pine forest soil // Biogeosciences. 2006. V. 3. P. 1−13.
- Ross D.J. Estimation of soil microbial C by a fumigation-extraction method: influence of seasons, soils and calibration with the fumigation-incubation procedure // Soil Biology and Biochemistry. 1990a. V. 22. № 3. P. 295−300.
- Ross D.J. Measurements of microbial biomass C and N in grasssland soils by fumigation-incubation procedures: influence of inoculum size and the control // Soil Biology and Biochemistry. 1990b. V. 22. № 3. P. 289−294.
- Ross D.J. Microbial biomass in a stored soil: a comparaison of different estimation procedures // Soil Biology and Biochemistry. 1991. V. 23. № 10. P. 1005−1007.
- Ross D.J., Sparling G.P., West A.W. Influence of Fusarium oxysporum age on proportion of C, N, and P mineralized after chloroform fumigation in soil // Austral Journal of Soil Research. 1987. V. 25. № 4. P. 563−566.
- Ross D.J., Tate K.R., Cairns A., Meyrick K.F. Influence of storage on soil microbial biomass estimated by three biochemical procedures // Soil Biology and Biochemistry. 1980. V. 12. № 4. P. 369−374.
- Rutting T., Muller C. N-15 tracing models with a Monte Carlo optimization procedure provide new insights on gross N transformations in soils // Soil Biology and Biochemistry. 2007. V. 39. № 9. P. 2351−2361.
- Saggar S., Parshotam A., Hedley C., Salt G. 14C-Iabelled glucose turnover in New Zealand soils // Soil Biology and Biochemistry. 1999. V. 31. P. 20 252 037.
- Schimel J.P., Bennett J. Nitrogen mineralization: challenges of a changing paradigm // Ecology. 2004. V. 85. № 3. P. 591−602.
- Schimel J.P., Jackson L.E., Firestone M.K. Spatial and temporal effects on plant-microbial competition for inorganic nitrogen in California annual grassland // Soil Biology and Biochemistry. 1989. V. 21. № 8. P. 1059−1066.
- Schimel J.P., Weintraub M.N. The implications of exoenzyme activity on microbial carbon and nitrogen limitation in soil: a theoretical model // Soil Biology and Biochemistry. 2003. V. 35. № 4. P. 549−563.
- Schmidt S.K. A substrate-induced growth-response method for estimating the biomass of microbial functional groups in soil and aquatic systems // FEMS Microbiology Ecology. 1992. V. 101. № 3. P. 197−206.
- Schnuerer J., Rosswall T. Mineralization of nitrogen from 15N labelled fungi soil microbial biomass and roots and its uptake by barley plants // Plant and
- Soil. 1987. V. 102. P. 71−78.
- Schurgers G., Dorsch P., Bakken L., Leffelaar P., Haugen L.E. Modelling soil anaerobiosis from water retention characteristics and soil respiration // Soil Biology and Biochemistry. 2006. V. 38. № 9. P. 2637−2644.
- Searle P.L. The Berthelot or indophenol reaction and its use in the analytical chemistry of nitrogen. A review // Analyst. 1984. V. 109. P. 549−568.
- Shen S.M., Brookes P.C., Jenkinson D.S. Soil respiration and the measurement of microbial biomass C by the fumigation technique in fresh and air-dried soil // Soil Biology and Biochemistry. 1987. V. 19. № 2. P. 153−158.
- Shen S.M., Hart P.B.S., Powlson D.S., Jenkinson D.S. The nitrogen cycle in the Broadbalk Wheat Experiment: 15N-labelled fertilizer residues in the soil and in the soil microbial biomass // Soil Biology and Biochemistry. 1989. V. 21. № 4. P. 529−533.
- Shields J.A., Paul E.A., Lowe W.E. Factors influencing the stability of labelled microbial materials in soils // Soil Biology and Biochemistry. 1974. V. 6. № LP. 31−37.
- Sikora L.J., Yakovchenko V., Kaufman D.D. Comparison of the rehydration method for biomass determination to fumigation- incubation and substrate-induced respiration method // Soil Biology and Biochemistry. 1994. V. 26. № 10. P. 1443−1445.
- Smith J.L., Halvorson J.J., Bolton H., Jr. Determination and use of a corrected control factor in the chloroform fumigation method of estimating soil microbial biomass // Biology and Fertility of Soils. 1995. V. 19. P. 287−291.
- Smith K.A. A model of the extent of anaerobic zones in aggregated soils and its potential application to estimates of denitrification // Journal of Soil Science. 1980. V. 31. P. 263−277.
- Smith K.A., Ball T., Conen F., Dobbie K.E., Massheder J., Rey A. Exchange of greenhouse gases between soil and atmosphere: interactions of soil physical factors and biological processes // European Journal of Soil Science. 2003. V. 54. P. 779−791.
- Smith M.S., Rice C.W., Paul E.A. Metabolism of labeled organic nitrogen in soil: regulation by inorganic nitrogen // Soil Science Society of. America Journal. 1989. V. 53. № 3. P. 768−773.
- Smith O.L. Soil microbiology: a model of decomposition and nutrient cycling. 1982. Boca Raton, USA: CRC Press.
- Smith P., Andren O., Brussaard L., Dangerfield M., Ekschmitt K., Lavelle P., Tate K. Soil biota and global change at the ecosystem level: describing soil biota in mathematical models // Global Change Biology. 1998. V. 4. P. 773 784.
- Snell F.D., Snell C.T. Colorimetric Methods of Analysis. Vol 3. 1949. New York: VanNoslrand.
- Soderstrem B., Baath E., Lundgren B. Decrease in soil microbial activity and biomass owing to nitrogen amendments // Can Journal of Microbiology. 1983. V. 29. № 11. P. 1500−1506.
- Sorensen L.H. The influence of stress treatments on the microbial biomass and the rate of decomposition of humified matter in soils containing different amounts of clay // Plant and Soil. 1983. V. 75. P. 107−119.
- Stenstrom J., Svensson K., Johansson M. Reversible transition between active and dormant microbial states in soil // FEMS Microbiol Ecol. 2001. V. 36. P. 93−104.
- Stockdale E.A., Rees R.M. Relationships between biomass nitrogen and nitrogen extracted by other nitrogen availability methods // Soil Biology and Biochemistry. 1994. V. 26. № 9. P. 1213−1220.
- Vance E.D., Brookes P.C., Jenkinson D.S. An extraction method for measuring soil microbial biomass C // Soil Biology and Biochemistry. 1987. V. 19. № 6. P. 703−707.
- Vance E.D., Brookes P.C., Jenkinson D.S. Microbial biomass measurements in forest soils: The use of the chloroform-incubation method in strongly acid soils // Soil Biology and Biochemistry. 1987. V. 19. № 6. P. 697−702.
- Voroney R.P., Paul E.A. Determination of Kc and Kn in situ for calibration of the chloroform fumigation-incubation method // Soil Biology and Biochemistry. 1984. V. 16. № 1. P. 9−14.
- Wardle D.A., Ghani A. Why is the strength of relationships between pairs of methods for estimating soil microbial biomass often so variable? // Soil Biology and Biochemistry. 1995. V. 27. № 6. P. 821−828.
- West A.W., Grant W.D., Sparling G.P. Use of ergosterol, diaminopimelic acid and glucosamine contents of soils to monitor changes in microbial populations // Soil Biology and Biochemistry. 1987. V. 19. P. 607−612.
- West A.W., Sparling G.P., Grant W.D. Correlation between four methods to estimate microbial biomass in stored, air-dried and glucose amended soils // Soil Biology and Biochemistry. 1986. V. 18. P. 569−576.
- Whipps J.M. Carbon economy. / In: J. M. Lynch, editor. The rhizosphere.1990. Chichester: John Wiley, pp. 59−97.
- White D., Wright D.A., Glover L.A., Prosser J.I., Atkinson D" Killham K. A partial chloroform fumigation technique to characterize the spatial location of bacteria introduced into soil // Biology and Fertility of Soils. 1994. V. 17. P. 191−195.
- Whitmore A.P. Describing the mineralization of carbon added to soil in crop residues using second-order kinetics // Soil Biology and Biochemistry. 1996. V. № 28. P. 1435−1442.
- Winter J.P., Zhang Z., Tenuta M., Voroney R.P. Measurement of microbial biomass by fumigation-extraction in soil stored frozen // Soil Science Society of. America Journal. 1994. V. 58. P. 1645−1651.
- Wolf B., Chen W., Brueggemann N., Zheng X., Pumpanen J., Butterbach-Bahl
- K. Applicability of the soil gradient method for estimating soil atmosphere CO2, CH4 and N2O fluxes for steppe soils in Inner Mongolia // Journal of Plant Nutrition and Soil Science. 2011. V. 174. № 3. p. 359−372.
- Wood P., Prosser J.I. Nitrification as a bacterial energy source. / In: Nitrification. 1986. Oxford: IRL Press, pp. 39−62.
- Wrage N., Velthof G.L., van Beusichem M.L., Oenema O. Role of nitrifier denitrification in the production of nitrous oxide // Soil Biology and Biochemistry. 2001. V. 33. № 12−13. P. 1723−1732.
- Wu J., Brookes P.C., Jenkinson D.S. Evidence for the use of a control in the fumigation-incubation method for measuring microbial biomass carbon in soil // Soil Biology and Biochemistry. 1996. V. 28. № 4/5. P. 511−518.
- Wu J., Joergensen R.G., Pommerening B., Chaussod R., Brookes P.C. Measurement of soil microbial biomass C by fumigation-extraction an automated procedure // Soil Biology and Biochemistry. 1990. V. 22. № 8. P. 1167−1169.
- Yoshinari T., Hynes R., Knowles R. Acetylene inhibition of nitrous oxide reduction and measurement of denitrification and nitrogen fixation in soil // Soil Biology and Biochemistry. 1977. V. 9. № 3. P. 177−183.
- Zagal E., Persson J. Immobilization and remineralization of nitrate during glucose decomposition at four rates of nitrogen addition // Soil Biology and Biochemistry. 1994. V. 26. № 10. P. 1313−1321.
- Zhao X.R., Lin Q., Brookes P.C. Does soil ergosterol concentration provide a reliable estimate of soil fungal biomass? // Soil Biology and Biochemistry. 2005. V. 37. P. 311−317.
- Zhou Z., Zheng X., Xie B., Han S., Liu C. A Process-based Model of N20 Emission from a Rice-Winter Wheat Rotation Agro-Ecosystem: Structure, Validation and Sensitivity // ADVANCES IN ATMOSPHERIC SCIENCES. 2010. V. 27. № l.P. 137−150.
- Zumft W.G. Cell biology and molecular basis of denitrification // Microbiology and Molecular Biology reviews. 1997. V. 61. № 4. P. 553−616.1. Благодарности