ДНК-гибридизация. 
Молекулярно-биологические методы диагностики в вирусологической практике

• · Двухцепочечную ДНК разогревают в соответствующем буфере. Из-за изменения внешних условий водородные связи между комплементарными азотистыми основаниями становятся термодинамически невыгодными и цепочки расходятся.
• · Препарат денатурированных ДНК смешивают с другой денатурированной ДНК.
• · Препараты медленно охлаждают, при этом одноцепочечные ДНК гибридизуются друг на друга (образуются водородные связи между комплементарными основаниями), при этом образуется «гибридная» молекула ДНК.

Анализ скорости отжига (= гибридизации) одноцепочечных ДНК позволяет оценивать сходства и различия в последовательностях ДНК между видами или особями одного вида.

Биочипы

Точнее всего биочипы описывает английское название DNA-microarrays, т. е. это организованное размещение молекул ДНК на специальном носителе в специальных ячейках. Профессионалы называют этот носитель «платформой». Платформа — это чаще всего пластинка из стекла или пластика (иногда используют и другие материалы, например кремний), на которую наносится ДНК, способные избирательно связывать вещества, содержащиеся в анализируемом растворе.

Характерные размеры ячеек современных микрочипов лежат в пределах ~50−200 микрон, общее число ячеек на чипе составляет 103−105, а линейные размеры чипа ~1см.

Смысл метода. Иммобилизируемая ДНК наносится на поверхность через игольчатые растры (пины) механического робота или с помощью технологии струйного принтера. Контроль качества нанесения осуществляется с помощью специализированной оптики и компьютерного анализа изображения. На биочипе, в дальнейшем, гибридизуют молекулы ДНК, меченые красителем. Гибридизуемая ДНК в растворе метится с помощью флуоресцентной или радиоактивной метки. Интенсивность флуоресценции в ячейках измеряют с помощью сканера или люминесцентного микроскопа, передающего сигнал на прибор с зарядовой связью. Данные о характере гибридизации также можно получить также с помощью масс-спектрометрии, атомной силовой микроскопии и др.