Дипломы, курсовые, рефераты, контрольные...
Срочная помощь в учёбе

Изучение растительных объектов в культуре in vitro методом ЯМР релаксации

РефератПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Анализируя данные, можно сделать вывод, что наличие в питательной среде фитогормонов влияет на формирование меристематических очагов у анализируемых образцов. Это объясняется тем, что уменьшение времени спин-спиновой релаксации Т2 говорит о снижении подвижности протонов в исследуемых образцах, что в свою очередь может свидетельствовать о формировании меристематических очагов в растительной ткани… Читать ещё >

Изучение растительных объектов в культуре in vitro методом ЯМР релаксации (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

В садоводстве, важное значение имеет раздел, связанный с разработкой и внедрением новых экономически эффективных методов размножения ценных сортов декоративных растений. Одним из таких способов является получение корнесобственных саженцев путем микроклонального размножения [1]. Он позволяет повысить коэффициент размножения и освобождает растения от вирусных болезней. Многие сорта роз возможно успешно и активно размножать посредством микроразмножения [2]. Однако существуют сложности в изучении и размножении особо ценных генотипов растений, ввиду отсутствия эффективных методов оценки роста и развития растительных клеток в культуре in vitro [3]. Ядерный магнитный резонанс — неразрушающая и неинвазивная методика, у которой есть большое количество анатомических и физиологических приложений к растительным клеткам, органам растения и живым растениям [4,5,6,7,8]. 1Н ЯМР долго использовался для исследования физического состояния воды в растительной ткани и для неразрушающего измерения молекулярного смещения, такого как поток и диффузия в растениях [9].

Содержание воды и гидравлическая удельная электропроводность, включающая транспорт внутри клеток, по мембранам, между клетками, и дальний транспорт ксилемы и флоэмы, сильно зависит от дефицита воды в растении. Благодаря возможности измерить эти процессы транспорта неинвазивно, в неповрежденном растении относительно его клеток и тканей, можно исследовать и многие физиологические аспекты вегетирующего растения.

Одним из основных факторов создания эффективной биотехнологической системы является подбор оптимальной питательной среды, максимально полно обеспечивающей потребности растущей клеточной культуры продуцента в растительных регуляторах роста, макрои микроэлементах минерального питания, факторов регуляции процессов клеточного деления и дифференциации, необходимых для высокого биосинтеза целевого продукта.

Современные методы исследования интенсивности роста растений можно разделить на физические и химические. Из них большинство методов являются разрушающими [10], то есть, при анализе объекта его экспериментальный образец либо подвергается участию в химической реакции (химические методы), и по количественному составу продуктов последней судят об изучаемом объекте, либо образец должен пройти серию физико-химических превращений для пригодности исследования соответствующим методом (например, методы исследования коэффициентов преломления раствора, методы электронной микроскопии, рентгеновской дифракции и т. п.).

К неразрушающим образец методам относятся, в основном, спектроскопические, такие как методы диэлектрической спектроскопии (ДС и ВДС), электронный парамагнитный резонанс (ЭПР), электронный спиновый резонанс (ЭСР), ядерный магнитный резонанс (ЯМР) и некоторые другие.

Ядерный магнитный резонанс является неразрушающим материал экспресс методом, дающим информацию о различных морфологических и физиологических параметрах растительного объекта, например, о размерах вакуолей в клетках растений, проницаемости клеточной мембраны, содержании воды в клетках [12], скорости и объеме потока веществ в ксилеме и флоэме [13].

Цель работы — изучить возможность применения метода ЯМР релаксации для оценки пролиферативной активности и определения оптимальных параметров развития эксплантов растений в культуре in vitro на основе водных потоков в меристематических очагах.

Материалы, методы и объекты исследований. Объектом для исследований являлись растительные ткани образцов Rosa hybryda, культивируемые in vitro.

ЯМР в настоящее время является одним из самых популярных методов исследования микроструктуры соединений природного происхождения. Ядерная магнитная релаксация — это процесс установления термодинамического равновесия внутри спиновой системы с характерным временем T2, и в системе спины-решетка с общим временем релаксации T1 [14]. Спин-спиновая (поперечная) релаксация происходит в плоскости xy и сопровождается излучением фотонов, т. е. является наблюдаемой величиной. Продольная спин-решеточная релаксация не вызывает излучательных переходов в спин-системе и наблюдается косвенно [15,16]. Следует отметить, что время Т2 непосредственно зависит от подвижности протонов и если протоны подвижны, то Т2 длиннее. Этот параметр мы использовали для оценки интенсивности роста растительных объектов в культуре in vitro.

Чтобы характеризовать подвижность сегментов макромолекул и функциональных групп, в работе использовалось время спин-спиновой релаксации Т2, которое возрастает с уменьшением времени корреляции движений 11H в изучаемом образце. На основе измерений амплитуды ССИ определялось количество протонов водорода в образце, так как эти величины связаны линейно. Для определения времени ядерной магнитной релаксации Т2 и амплитуды сигнала ЯМР исследуемых образцов использовались импульсные последовательности Карра — Перселла — Мейбума — Гилла (КПМГ) [17,18], спада свободной индукции (ССИ) и спинового эха Хана. Время спин-решеточной релаксации (Т1) определялось путем снятия кривой восстановления продольной намагниченности (импульсная последовательность 900 — - 900).

Все измерения проводились на ЯМР-анализаторе «Spin Track», зарегистрированном в Государственном реестре средств измерений Российской Федерации под номером 32 677 — 06 [19], поддерживающем все возможные приложения ЯМР низкого разрешения. Процедура подготовки образца в большинстве приложений сводится лишь к помещению анализируемого вещества в пробирку и установке ее в датчик прибора. Основные параметры ЯМР-анализатора «Spin Track» приведены в таблице 1.

Таблица 1 — Основные характеристики ЯМР-анализатора «Spin Track».

Параметр

Значение.

Постоянное магнитное поле B0 (в зависимости от типа магнита).

0,1.1,5 T.

Диапазон рабочих частот спектрометра.

2−60 МГц.

Программируемый фазовый сдвиг РЧ импульсов.

00, 900, 1800, 2700

Время восстановления чувствительности (для датчика с ампулой на 10 мм, 0.47T).

7 мкс.

Разрешение по времени в последовательности.

0.1 мкс.

Импульсная последовательность.

Полностью программируемая.

Коэффициент усиления приемного тракта.

70. 95 дБ.

Шаг дискретизации АЦП.

Программируемый.

Минимальный шаг дискретизации АЦП.

0,2 мкс.

Число разрядов АЦП.

Операционная система управляющих программ.

Windows 9x, NT, Me, 2000, XP.

Связь с компьютером.

Full Speed USB 2.0.

Программная совместимость данных.

ASCII, Microsoft Excel®.

Область чувствительности датчика с ампулой на 10 мм (высота заполнения пробирок образцом).

10 мм.

Теоретические расчеты, моделирование и аппроксимация экспериментальных данных проводились с использованием современного программного обеспечения Origin 6.1 и MATHCAD 2001 Professional. Построение графиков и обработка данных осуществлялась при помощи пакета программ Microcal Origin 6.1.

Для экспериментов по исследованию интенсивности роста и динамики формирования меристематических очагов в культуре растительных тканей были взяты культуры Rosa hybrida сортов `Парцелайн' и `Ле руж э ле нуар'. Все образцы культивировались на среде по прописи MS [20] с различной концентрацией 6-бензиламинупирина в пробирках Видаля. Данные с образцов собирались в различные периоды культивирования (через 2, 3 и 4 недели). Измерения магнитно-релаксационных параметров проводились на ЯМР релаксометре «Spin Track» с частотой резонанса 19 МГц [17]. Времена спин-спиновой релаксации Т2 измерялись при помощи импульсной последовательности Карра-Парселла-Мейбума-Гилла. Времена спин-решеточной релаксации Т1 были получены в эксперименте с импульсной последовательностью 90—90. Результаты проведенных экспериментов по ЯМР-релаксации во временной области для Rosa hybrida сорта `Парцелайн' представлен в таблице 2.

Таблица 2 — Экспериментальные данные ЯМР-релаксации образцов Rosa hybrida сорта `Парцелайн' в зависимости от продолжительности культивирования.

Концентрация 6-БАП, мг/л.

Время Т2 в зависимости от продолжительности культивирования, мкс.

Наличие меристематических очагов.

2 недели.

3 недели.

4 недели.

нет.

0,5.

есть.

есть.

есть.

есть.

Анализируя данные, можно сделать вывод, что наличие в питательной среде фитогормонов влияет на формирование меристематических очагов у анализируемых образцов. Это объясняется тем, что уменьшение времени спин-спиновой релаксации Т2 говорит о снижении подвижности протонов в исследуемых образцах, что в свою очередь может свидетельствовать о формировании меристематических очагов в растительной ткани, которое сопровождается увеличением числа клеток и протонной плотности. Так, на питательной среде без содержания фитогормонов время спин-спиновой релаксации Т2 через 2 недели культивирования составило 6100 мкс, через 3 недели — 6437 мкс, через 4 недели 9083 мкс. Увеличение времени Т2 в процессе культивирования свидетельствует об отсутствии формирования меристематических очагов у анализируемых образцов.

На средах с добавлением 6-БАП в концентрации 0,5 мг/л, 2 мг/л, 5 мг/л и 7 мг/л время спин-спиновой релаксации с течением времени уменьшается, что свидетельствует процессе формирования меристематических очагов.

На рисунке 1 показана зависимость формирования меристематических очагов культуры Rosa hybrida сорта `Парцелайн' от концентрации 6-БАП в питательной среде. растение садоводство биотехнологический Рисунок 1 — Зависимость формирования меристематических очагов Rosa hybrida сорта `Парцелайн' от концентрации 6-БАП в питательной среде У образцов Rosa hybrida сорта `Парцелайн' наиболее интенсивное формирование меристематических очагов наблюдали на среде с добавлением 6-БАП в концентрациях 0,5 мг/л и 2 мг/л. Дальнейшее увеличение концентрации 6-БАП снижает интенсивность формирования меристематических очагов. Результаты проведенных экспериментов по ЯМР-релаксации во временной области для Rosa hybrida сорта `Ле руж э ле нуар' представлены в таблице 3.

Таблица 3 — Экспериментальные данные ЯМР-релаксации образцов Rosa hybrida сорта `Ле руж э ле нуар' в зависимости от продолжительности культивирования.

Концентрация фитогормона, мг/л.

Время Т2 в зависимости от продолжительности культивирования, мкс.

Наличие меристематических очагов.

2 недели.

3 недели.

4 недели.

нет.

0,5.

есть.

есть.

есть.

есть.

Данные показывают, что наличие в питательной среде фитогормонов влияет на формирование меристематических очагов у анализируемых образцов. Так, на питательной среде без содержания фитогормонов время спин-спиновой релаксации Т2 через 2 недели культивирования составило 111 мкс, а через 4 недели — 123 мкс. Увеличение времени Т2 свидетельствует об отсутствии формирования меристематических очагов у анализируемых образцов.

На средах с добавлением 6-БАП в концентрации 0,5 мг/л, 2 мг/л, 5 мг/л и 7 мг/л время спин-спиновой релаксации с течением времени уменьшается, что свидетельствует о процессе формирования меристематических очагов.

На рисунке 2 показана зависимость формирования меристематических очагов культуры Rosa hybrida сорта `Ле руж э ле нуар' от концентрации 6_БАП в питательной среде.

Рисунок 2 — Зависимость формирования меристематических очагов культуры Rosa hybrida сорта `Ле руж э ле нуар' от концентрации 6-БАП в питательной среде Таким образом, у образцов Rosa hybrida сорта `Ле руж э ле нуар' уменьшение времени спин-спиновой релаксации Т2, а, следовательно, и наиболее интенсивное формирование меристематических очагов наблюдается на питательной среде с добавлением фитогормона в концентрации 0,5 мг/л.

На следующих рисунках приведены графики спада поперечной намагниченности у образца Rosa hybrida сорта `Ле руж э ле нуар', культивируемого на среде с добавлением 0,5 мг/л 6-БАП через 2 (рис. 3) и 4 недели (рис. 4) культивирования.

Рисунок 3 — Спад поперечной намагниченности у образца Rosa hybrida сорта `Ле руж э ле нуар', культивируемого на среде с добавлением 0,5 мг/л 6-БАП через 2 недели культивирования Рисунок 4 — Спад поперечной намагниченности у образца Rosa hybrida сорта `Ле руж э ле нуар', культивируемого на среде с добавлением 0,5 мг/л 6-БАП через 4 недели культивирования На следующих рисунках приведены графики спада поперечной намагниченности у образца Rosa hybrida сорта `Парцелайн', культивируемого на среде с добавлением 0,5 мг/л 6-БАП через 2 (рис. 5) и 4 недели (рис. 6) культивирования.

Рисунок 5 — Спад поперечной намагниченности у образца Rosa hybrida сорта `Парцелайн', культивируемого на среде с добавлением 0,5 мг/л 6_БАП через 2 недели культивирования Рисунок 6 — Спад поперечной намагниченности у образца Rosa hybrida сорта `Парцелайн', культивируемого на среде с добавлением 0,5 мг/л 6-БАП через 4 недели культивирования Применение магнитнорезонансной релаксации в изучении пролиферативной активности клеток растений позволит своевременно оценить и при необходимости изменить условия культивирования эксплантов на различных этапах онтогенеза, а также существенно увеличить эффективность подбора компонентов питательных сред и как следствие ускорить процесс размножения растений.

  • 1. Поздняков, И. А. Особенности микроклонального размножения шиповника и декоративных сортов рода Rosa L.: автореф. дис. канд. с-х. наук / И. А. Поздняков. — М., 2007. — 25 с.
  • 2. Arnold, N.P. A study of the effect of growth regulators and time of plantlet harvest on the in vitro multiplication rate of hardy and hybrid tea roses / N.P. Arnold, M.R. Binns, N.N. Barthakur, D.C. Cloutier // Journal of Horticultural Science 67. — 1992. — N. 6. — P. 727−735.
  • 3. Сергеев, Р. В. Выращивание декоративных цветочных растений в культуре in vitro с использованием субстратов из органических отходов / Е. М. Романов, Д. И. Мухортов, А. Д. Средин, Р. В. Сергеев, А. И. Шургин // Вестник МарГТУ. № 3(13)., 2011. — С. 72−81.
  • 4. Walter, L. Studies of plant systems by in vivo NMR spectroscopy / L. Walter, R. Callies, R. Altenburger // In: de Certaines JD, Boveґe WMMJ, Podo F, eds. Magnetic resonance spectroscopy in biology and medicine. Oxford: Pergamon Press. — 1992. — P. 573−610.
  • 5. Ratcliffe, R.G. In vivo NMR studies of higher plants and algae / R.G. Ratcliffe // Advances in Botanical Research. — 1994. — Vol. 20. — P. 42−123.
  • 6. Shachar-Hill, Y. Nuclear magnetic resonance in plant biology / Y. Shachar-Hill, P.E. Pfeffer // Rockville: American Society of Plant Physiologists. — 1996.
  • 7. Chudek, J.A. Magnetic resonance imaging of plants / Y. Shachar-Hill, P.E. Pfeffer // Progress in Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy. — 1997. — Vol. 31. — P. 43−62.
  • 8. Ishida, N. The NMR microscope, a unique and promising tool for plant science / N. Ishida, M. Koizumi, H. Kano // Annals of Botany. — 2000. — Vol. — 86. — P. 259−278.
  • 9. MacFall, J.J. Magnetic resonance imaging of plants / MacFall J. J, As. H. Van // The American Society of Plant Physiologists.-.1996. — P. 33−76.
  • 10. Современные физические методы исследования полимеров / Под. ред. Г. Л. Слонимского. — М.: Химия, 1982.
  • 11. Рот, Г. К. Радиоспектроскопия полимеров / Г. К. Рот, Ф. Келлер, Х. Шнайдер — М.: Мир, 1987.
  • 12. Scheenen, T.W.J. Quantification of water transport in plants with NMR imaging / T.W.J. Scheenen, D. van Dusschoten, P.A. de Jager, H. Van As // J. Exp. Bot. 2000. — 51(351). — P. 1751−1759.
  • 13. Windt, C.W. MRI of long-distance water transport: a comparison of the phloem and xylem flow characteristics and dynamics in poplar, castor bean, tomato and tobacco / C.W. Windt, E. Gerkema, J. Oosterkamp, H. Van As // Plant Cell Envir. — 2006. — 29(9). — P. 1715−1729.
  • 14. Чижик, В. И. Ядерная магнитная релаксация. / В. И. Чижик //- Ленинград., изд-во Ленинградского университета, 1991.
  • 15. Фаррар, Т. Импульсная и фурье-спектроскопия ЯМР / Т. мФаррар, Э. Беккер. — М: Мир, 1973.
  • 16. Эмсли, Дж. Спектроскопия ядерного магнитного резонанса высокого разрешения / Дж. Эмсли, Дж. Финей, Л. Сатклифф. — М.: Мир, 1968.
  • 17. http://www.nmr-design.com/ru/
  • 18. Грунин, Ю. Б Импульсный метод ЯМР для определения термодинамических характеристик адсорбционных процессов в биополимерах / Ю. Б. Грунин, Л. Ю. Грунин, Е. А. Никольская // Журн. физ. химии. — 2007. — Т.81, № 7. — С. 1165−1170.
  • 19. Carr, H.Y. Purcell E.M. Physical Review В 94 (35), p. 630 — 638, 1954.
  • 20. Meiboom, S., Gill D. The Review of Scientific Instruments B 29 (45).
  • 21. Грунин, Л. Ю. Протонная магнитная релаксационная спектроскопия природных полимеров: дис. … канд. хим. наук: 02.00.04: защищена 21.12.98: утв. 14.05.99 / Грунин Леонид Юрьевич. — Йошкар-Ола, 1998.
  • 22. Murashige, T. A revised medium for rapid growth and bio assays with tobacco tissue cultures / T. Murashige, F. Skoog // Physiologia Plantarum. — 1962. — Vol. 15. — P. 473 — 497.
Показать весь текст
Заполнить форму текущей работой