Дипломы, курсовые, рефераты, контрольные...
Срочная помощь в учёбе

Полигостальность условно-патогенных энтеробактерий на модели их взаимодействия с растениями

Диссертация: Полигостальность условно-патогенных энтеробактерий на модели их взаимодействия с растениями
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

В ответ на колонизацию энтеробактериями, условно-патогенными для человека, растение-хозяин отвечает активацией паттерн-индуцированного иммунитета (РТ1) уже в первые минуты после инфицирования. Отсутствие специфических факторов патогенности, аналогичных таковым для фитопатогенов, приводит к тому, что контаминированное растение, как правило, не проявляет симптомов поражения и не способно быстро… Читать ещё >

Содержание

  • ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Эндофиты
    • 1. 2. Выделение патогенных для человека бактерий из эндосферы и 19 филлосферы растительных тканей
    • 1. 3. Проникновение патогенных и условно-патогенных бактерий в 23 растение
    • 1. 4. Ответ растений при взаимодействии с патогенными и 27 непатогенными микроорганизмами
      • 1. 4. 1. Ответ растений при взаимодействии с фитопатогенами
      • 1. 4. 2. Ответ растений при взаимодействии с непатогенными 42 эндофитами
      • 1. 4. 3. Ответ растений при взаимодействии с бактериями, 47 патогенными для человека
    • 1. 5. Универсальные факторы патогенности бактерий
    • 1. 6. Случаи заболеваний, вызванные растениями, 58 контаминированными патогенными и условно-патогенными микроорганизмами
  • ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
  • ГЛАВА 3. АДАПТАЦИЯ УСЛОВНО-ПАТОГЕННЫХ И
  • ПАТОГЕННЫХ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ К УСЛОВИЯМ ВНЕШНЕЙ СРЕДЫ
  • ГЛАВА 4. БИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ, ОБУСЛОВЛИВАЮЩИЕ ИХ СПОСОБНОСТЬ ВЫЖИВАТЬ В ОРГАНИЗМЕ РАСТЕНИЙ
    • 4. 1. Влияние условий культивирования на образование биопленок 99 условно-патогенными и патогенными энтеробактериями
    • 4. 2. Определение антагонизма менаду патогенными и условно- 110 патогенными для человека энтеробактериями и эндофитом
  • Bacillus subtilis 26D и фитопатогеном Pectobacterium carotovorum В
    • 4. 3. Экзоферменты энтеробактерий, необходимые для выживания в растительных тканях
    • 4. 4. Синтез индолилуксусной кислоты условно-патогенными и патогенными энтеробактериями
  • ГЛАВА 5. ВЛИЯНИЕ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ РАЗНЫХ ВИДОВ НА ш РОСТ И РАЗВИТИЕ РАСТЕНИЙ
    • 5. 1. Влияние Escherichia coli (штамм XL-1 Blue) на всхожесть и ^^ развитие проростков разных видов сельскохозяйственных растений
    • 5. 2. Сравнение влияния разных видов энтеробактерий на всхожесть и развитие редиса сорта Жара
    • 5. 3. Влияние энтеробактерий на растения картофеля in vitro ^д
    • 5. 4. Выживаемость суспензионных культур табака при jg^ кокультивировании с Escherichia col
    • 5. 5. Фитотоксичность супернатанта среды культивирования ^^ энтеробактерий разных видов
  • ГЛАВА 6. ИЗУЧЕНИЕ СКОРОСТИ РАСПРОСТРАНЕНИЯ И НАКОПЛЕНИЯ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ В РАСТЕНИИ
    • 6. 1. Колонизация растений in vitro условно-патогенными ^^ энтеробактериями
    • 6. 2. Сохранение заражения условно-патогенными бактериями в растениях при их пассировании
    • 6. 3. Сохранение энтеробактериями генов, отвечающих за ^^ вирулентность при пассировании их через растение
  • ГЛАВА 7. ОТВЕТНЫЕ РЕАКЦИИ РАСТЕНИЯ ПРИ
  • ВЗАИМОДЕЙСТВИИ С ЭНТЕРОБАКТЕРИЯМИ, ПАТОГЕННЫМИ ДЛЯ ЧЕЛОВЕКА
    • 7. 1. Определение активных форм кислорода в суспензионной 167 культуре клеток при заражении патогенной для человека
  • Escherichia coli (штамм XLl-Blue) и фитопатогенной Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus (вирулентный штамм CsR14)
    • 7. 2. Определение АФК в корнях растений картофеля {Solanum 171 tuberosum) и редиса (Rhaphanus sativus L.) в ответ на внесение Escherichia coli (XLl-Blue)
    • 7. 3. Динамика внеклеточных АФК из корней редиса (Rhaphanus 173 sativus L.) сорта Жара при обработке E. coli XLl-Blue и
  • Pectobacterium carotovorum В
    • 7. 4. Динамика пероксидазной активности в растении редиса 177 (Rhaphanus sativus L.) сорта Жара при инокуляции E. coli (XLl
  • Blue)

7.5. Активность пероксидазы в тканях растений картофеля in vitro 181 при инокулировании патогенной для человека Escherichia coli штамм XLl-Blue) и фитопатогенной С. michiganensis ssp. sepedonicus (вирулентный штамм CsR14)

7.6. Развитие СЧ реакции растениями табака (Nicotiana tabacum) in vitro при инокуляции энтеробактериями разных видов

ГЛАВА 8. ВЫДЕЛЕНИЕ ПАТОГЕННЫХ ДЛЯ ЧЕЛОВЕКА ш

БАКТЕРИЙ ИЗ РИЗО-, ФИЛЛО- И ЭНДОСФЕРЫ РАСТИТЕЛЬНЫХ ТКАНЕЙ

ГЛАВА 9. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ

ВЫВОДЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

Полигостальность условно-патогенных энтеробактерий на модели их взаимодействия с растениями (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Условно-патогенные энтеробактерии в настоящее время приобретают все большее медицинское значение. Такие представители семейства Enterobacteriaceae как Escherichia coli, Serracia marcescens, Enterobacter, Citrobacter, Proteus вызывают до 50% поражений мочевыводящих путей, 35% госпитальных пневмоний, 57% бактериемий, 4% менингитов (Поздеев O.K., Федоров Р. В., 2007).

В связи с высокой экологической пластичностью и широким распространением этой группы микроорганизмов, большое значение имеет выявление их связей с другими живыми организмами, что в конечном итоге будет способствовать определению новых резервуаров их обитания. Это является необходимым этапом в разработке мероприятий по прерыванию путей передачи от источника инфекции до восприимчивого организма.

В настоящее время появились исследования по проблеме так называемых cross-kingdom инфекций. Этиологические агенты этих инфекций способны поражать различные группы хозяев, вплоть до относящихся к разным царствам жизни (растения и животные), так называемое явление полигостальности (Литвин В. Ю. и др., 1997). Самые изученные представители: Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia, Enterococcus faecalis, Salmonella enterica, E. coli, причем с каждым годом в эту группу попадает все больше видов бактерий и грибов. Появляются данные, свидетельствующие о медицинской значимости фитопатогенов — Agrobacterium tumefaciens, Erwinia sp. и др. Полным ходом идет сравнительное изучение факторов патогенности фитопатогенов и патогенов животных, а также сравнительный анализ иммунного ответа растений и животных. Исследованиями последних лет выявлено значительное сходство в патологическом процессе у тех и других групп живых организмов, что позволило предположить, что основные этапы взаимодействия высших организмов с бактериями развились на ранних стадиях эволюции до разделения на царства жизни.

Установлено, что некоторые виды условно-патогенных бактерий Klebsiella pneumoniae (lniguez A. L. et al., 2004), Enterobacter cloacae, Enterobacter aerogenes (Zinniel D. K. et al., 2002), S. marcescens (Gyaneshwar P. et al., 2001), разные виды Pseudomonas (Rahme L. G. et al., 1997) обитают в растительных тканях как эндофиты. Исследованиями последних лет доказано присутствие в растительных тканях и бактерий, патогенных для человека — Listeria monocytogenes (Gorski L. et al., 2003), Campylobacter jejuni (Brandl M. T. et al., 2004), S. enterica (Franz E. et al., 2007), E. coli (Bernstein N. et al., 2007; Wachtel M. R. et al., 2002). Здесь следует отметить, что локализация в глубине растительных тканей — межклетниках, проводящей системе и др. делает эти микроорганизмы недоступными для действия большинства дезинфектантов.

Все это определяет актуальность проблемы изучения сосуществования бактерий семейства Enterobacteriaceae с растениями, как в теоретическом, общебиологическом аспекте для изучения механизмов полигостальности и транспатогенеза, так и в прикладном медицинском для установления резервуара обитания этих микроорганизмов.

Цель работы обосновать механизмы полигостальности условно-патогенных энтеробактерий на основе изучения биологических свойств этих микроорганизмов и особенностей их взаимодействия с растениями.

ЗАДАЧИ:

1. Определить влияние условий культивирования (среда, температура) на кинетику роста патогенных и условно-патогенных энтеробактерий (Sh. sonnei, Sh. ?exneri, E. cloacae, E. aerogenes, C. freundii, K. pneumoniae, P. mirabilis).

2. Выявить продукцию биологически активных соединений у исследуемых видов энтеробактерий, способствующих их выживанию в тканях и органах растений.

3. Оценить влияние условий культивирования на формирование биопленок исследуемыми видами патогенных и условно-патогенных энтеробактерий.

4. Провести сравнительный анализ воздействия условно-патогенных и патогенных энтеробактерий на рост и развитие растений.

5. Определить скорость контаминации растительных тканей энтеробактериями.

6. Изучить развитие ответных реакций растения на заражение энтеробактериями.

7. Оценить контаминацию энтеробактериями растительных объектов (дикорастущие и культурные растения, в том числе, приобретенные в розничной продаже).

НАУЧНАЯ НОВИЗНА.

Впервые показано, что недостаток пищевых субстратов в среде культивирования способствует большей устойчивости патогенных и условно-патогенных энтеробактерий к условиям низких температур. Впервые у энтеробактерий, выделенных от больных людей, выявлены ферменты и биологически активные соединения, способствующие их персистенции в организме растения. Установлена зависимость формирования биопленки от условий культивирования.

Выявлено специфическое взаимодействие между условно-патогенными энтеробактериями и растениями, о чем свидетельствует их различное влияние на рост и развитие растений, зависимое от температуры. Впервые в модельной системе «растение картофеля in vitro — Е. coli», показано, что полная колонизация растительных тканей энтеробактериями происходит на вторые-третьи сутки после инокуляции, при этом растение-хозяин распознает присутствие энтеробактерий в ризои эндосфере и отвечает активацией иммунного ответа уже в первые минуты после заражения.

ПРАКТИЧЕСКАЯ И ТЕОРЕТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ.

Разработан метод определения контаминации внутренних тканей овощей и фруктов патогенными и условно-патогенными микроорганизмами, что позволяет оценить потенциальную опасность этих продуктов питания для здоровья человека.

Показано, что заражение растений условно-патогенными бактериями, как правило, не вызывает внешних симптомов повреждения растительного организма. Следовательно, контаминированные продукты питания растительного происхождения могут использоваться в качестве источников питания и способствовать последующему инфицированию человека.

Выявлено, что УПЭ, возбудители ОКИ человека, при попадании во внешнюю среду могут использовать растительные ткани как резервуар обитания, способствующий их сохранению вне организма человека.

ВНЕДРЕНИЯ.

Материалы исследований использованы для подготовки методических рекомендаций для студентов ИГУ «Микробиологический мониторинг окружающей среды», утверждена научно-методическим советом ИГУ (2000 г.), врачей «Определение ферментативной активности условно-патогенных бактерий», утверждена Методическим советом ГБОУ ДПО ИГМАПО (2013 г.). Полученные результаты используются при проведении лекционных занятий на кафедре микробиологии ИГМУ, кафедре эпидемиологии и микробиологии ИГМАПО, кафедре микробиологии биолого-почвенного факультета ИГУ.

ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ.

1. Недостаток питательных элементов способствует развитию устойчивости условно-патогенных и патогенных энтеробактерий человека к широкому диапазону температур (от 4 до 37 °С), что, в конечном итоге, обусловливает их выживаемость во внешней среде.

2. Условно-патогенные энтеробактерии, выделенные от больных ОКИ, обладают набором специфических экзоферментов и биологически активных соединений, способствующих, при попадании во внешнюю среду, созданию активных взаимоотношений с растительным организмом.

3. В ответ на колонизацию энтеробактериями, условно-патогенными для человека, растение-хозяин отвечает активацией паттерн-индуцированного иммунитета (РТ1) уже в первые минуты после инфицирования. Отсутствие специфических факторов патогенности, аналогичных таковым для фитопатогенов, приводит к тому, что контаминированное растение, как правило, не проявляет симптомов поражения и не способно быстро элиминировать из тканей эти микроорганизмы.

4. Условно-патогенные энтеробактерии при попадании во внешнюю среду персистируют в растительных тканях, что позволяет считать растения одним из резервуаров, способствующих сохранению этих микроорганизмов во внешней среде.

АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ.

Результаты исследований были представлены: на Всероссийской научной конференции, «Стрессовые белки растений», Иркутск, 2004; Межрегиональной научно-практической конференции «Биология микроорганизмов и их научно-практическое использование», Иркутск, 2004; Региональной научно-практической конференции «Пищевые технологии, качество и безопасность продуктов питания», Иркутск, 2006; семинаре врачей-эпидемиологов «Эпидемиология кишечных инфекций», Иркутск, 2006; Научно-практической конференции, посвященной 50-летию Иркутского НИИСХ «Роль сельскохозяйственной науки в развитии АПК Приангарья», Иркутск, 2007; Всероссийской научной конференции «Устойчивость растений к неблагоприятным факторам внешней среды», Иркутск, СИФИБР, 2007; Всероссийской молодежной научно-практической конференции «Пищевые технологии, качество и безопасность продуктов питания», Иркутск, ИрГТУ, 2007; Международной научно-практической конференции «Актуальные проблемы Права, Экономики и Управления», СИПЭУ, Иркутск, 2008; 2-м межрегиональном семинаре «Организация санитарно-эпидемиологического мониторинга за острыми кишечными инфекциями», Иркутск, 2008; II Всероссийской научно-практической конференции «Развитие физико-химической биологии и биотехнологии на современном этапе», Иркутск, 2008; Всероссийской научной конференции «Устойчивость растений к неблагоприятным факторам внешней среды», Иркутск, 2009; V Всероссийской конференции молодых ученых «Стратегия взаимодействия микроорганизмов и растений с окружающей средой», Саратов, 2010; Международной научной конференции «Проблемы экологии: чтения памяти М. М. Кожова», Иркутск, 2010; VII Съезде Общества физиологов растений России «Физиология растений — фундаментальная основа экологии и инновационных биотехнологий», Нижний Новгород, 2011; II Международной научно-практической конференции «Особенности формирования здорового образа жизни: факторы и условия», Улан-Удэ, 2012; научной конференции с международным участием «Фундаментальные и прикладные аспекты инфекционной патологии», посвященной 100-летнему юбилею ИЭМ ФГБУ «НЦ ПЗСРЧ» СО РАМН, Иркутск, 2012.

ЛИЧНЫЙ ВКЛАД АВТОРА.

Автору принадлежит ведущая роль в выборе направления исследования, подборе методов исследования и анализе полученных результатов. Все результаты, представленные в работе, получены при личном участии автора.

ПУБЛИКАЦИИ.

По теме диссертации опубликовано 52 работы, из них 16 в журналах, рекомендованных ВАК для публикации материалов докторских диссертаций и 2 -монографии.

СТРУКТУРА И ОБЪЕМ РАБОТЫ.

Диссертационная работа изложена на 291 странице машинописного текста, состоит из введения, обзора литературы, методической части, результатов исследования и их обсуждения, заключения, выводов и списка цитируемой литературы. Работа включает 21 таблицу и 74 рисунка.

Список литературы

состоит из 377 источников, в том числе 304 зарубежных.

ВЫВОДЫ.

1. Условия, лимитированные по пищевым субстратам способствуют лучшей адаптации энтеробактерий к неблагоприятным температурам, что обусловливает выживание этой группы микроорганизмов во внешней среде.

2. Процесс образования биопленок разными видами условно-патогенных и патогенных энтеробактерий в голодной среде, зависит от температурных условий в большей степени, чем в полной среде.

3. Условно-патогенные энтеробактерии, возбудители острых кишечных инфекций человека, синтезируют экзоферменты (целлюлазы, пектиназы, амилазы, Мп-пероксидазы и др.) и биологически активные вещества (индолилуксусная кислота), способствующие их персистенции в организме растений.

4. Условно-патогенные и патогенные энтеробактерии оказывают разнонаправленное влияние на рост и развитие растений, свидетельствуя о видоспецифических реакциях, возникающих в результате этого взаимодействия. В отличие от патологического действия фитопатогена, реакция растений на контакт с условно-патогенными и патогенными энтеробактериями зависит от температурных условий.

5. Контакт корневой системы с условно-патогенными энтеробактериями приводит к проникновению микроорганизмов в растительные ткани и полной колонизации растения в течение двух-трех суток.

6. Растения реагируют на присутствие энтеробактерий, патогенных для человека уже в первые минуты взаимодействия, что вызывает стремительное увеличение уровня АФК — «окислительный взрыв».

7. Условно-патогенные энтеробактерии, этиологические агенты ОКИ человека, при попадании во внешнюю среду обладают набором биологических свойств, позволяющих проникать и персистировать в организме растений, что свидетельствует о полигостальности этой группы микроорганизмов. Контаминированные растения при употреблении в пищу в необработанном виде, являются фактором риска, способствуя возникновению острых кишечных инфекций человека.

АГЛ.

АФК.

АЦК.

ИСУ.

ИУК.

КАА.

КОЕ.

КС.

ЛПС.

МАМР.

МП А.

НАДО.

ОКИ.

СПУ.

СЧ.

ТА.

УПМ.

УПЭ эпс.

ВАК1 В1К1 сья.

СМ8 БСБ ЕзрР.

Показать весь текст

Список литературы

  1. Е. В. Анализ заболеваемости острыми кишечными инфекциями населения Иркутской области / Е. В. Анганова, А. В. Духанина, Е. Л. Кичигина // Сибирский медицинский журнал. 2011. — № 6. — С. 230 — 232.
  2. Е. В. Биологические свойства условно-патогенных бактерий водных экосистем / Е. В. Анганова // Гигиена и санитария. 2010. — № 5. -С. 67−68.
  3. И. А. Общие стрессорные белки у бактерий / И. А. Баснакьян // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2002. — № 5. — С. 92−97.
  4. В. Д. Саморегуляция паразитарных систем и механизм развития эпидемического процесса / В. Д. Беляков // Вестн. АМН СССР. 1983. — № 5.-С. 57−65.
  5. В. М. Роль условно-патогенных бактерий при хронических воспалительных процессах различной локализации / Бондаренко В. М. -Тверь: Триада, 2011. 88 с.
  6. А. Н. Быстрый метод определения активности пероксидазы / А. Н. Бояркин // Биохимия. 1951. — Т.16, вып. 4. — С. 352 — 355.
  7. Н. И. Глобализация и эпидемический процесс / Н. И. Брико, В. И. Покровский // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2010. — № 4. — С. 4−10.
  8. Р. Г. Культура изолированных тканей и физиология морфогенеза растений / Р. Г. Бутенко. М.: Наука, 1964. — 212 с.
  9. О. В. Ассоциативный симбиоз / О. В. Бухарин, Е. С. Лобакова, Н. В. Немцева и др. Екатеринбург: УрО РАН, 2007. — 264 с.
  10. О. В. Патогенные бактерии в природных экосистемах / О. В. Бухарин, В. Ю. Литвин. Екатеринбург, 1997. — 277 с.
  11. Т. Н. Механизмы низкотемпературной регуляции метаболизма у бактерий. / Т. Н. Варвашевич, Л. С. Никифорова, А. Ф. Траценко, Т. Ф. Богомазова // Психрофильность патогенных микроорганизмов. Новосибирск, 1986. — С. 7 — 14.
  12. Ю. М. Микрофлора растений и урожай / Ю. М. Возняковская. Л.: Колос, 1969. — 238 с.
  13. В. В. Ассоциативные азотфиксирующие микроорганизмы / В. В. Волкогон // Микробиологический журнал. 2000. — Т. 62, № 2. — С. 51 -68.
  14. А. Л. «Quorum sensing» или социальное поведение бактерий / А. Л. Гинцбург, Т. С. Ильина, Ю. М. Романова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2003. — № 5. — С. 86 — 93.
  15. С. Медико-биологическая статистика / С. Гланц. Пер. с англ. — М, Практика, 1998. — 459 с.
  16. Т. А. Растительная клетка как динамическая система / Т. А. Горшкова. М.: Наука, 2007. — 429 с.
  17. , Л. И. Слюсарь и др. // Вестник гигиены и эпидемиологии. 2000. — Т. 4, № 2. — С. 219 — 223.
  18. А. П. Сигнальные молекулы растений / А. П. Дмитриев // Физиология растений. 2003. — Т.50, № 3. — С. 465 — 474.
  19. Ю.Т. На пути к общей теории иммунитета / Ю. Т. Дьяков // Журнал общей биологии. 2005. — Т. 66, № 6. — С. 451 — 458.
  20. Е. В. Молекулярные аспекты адаптации прокариот / Е. В. Ермилова. СПб.: Изд-во С.-Петерб. ун-та, 2007. — 299 с.
  21. Р. А. Фитопатогенные микроорганизмы: Учеб. метод, комплекс для студентов биол. фак. спец .в — 31 01 01 «Биология» / Р. А. Желдакова, В. Е. Мямин. — Мн.: БГУ, 2006. — 116 с.
  22. Е. И. Молекулярная генетика ассоциативного взаимодействия бактерий и растений: состояние и перспективы исследований / Е. И. Кацы. -М.: Наука, 2007. 86 с.
  23. В. Н. Очерки о врожденном иммунитете / В. Н. Кокряков. -СПб.: Наука, 2006.-261 с
  24. Е. Р. Применение ударных доз бифидумбактерина для лечения больных острыми кишечными инфекциями / Е. Р. Коровякова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2006. — № 6. -С. 58−61.
  25. Кочемасова 3. Н. Санитарная микробиология и вирусология / 3. Н. Кочемасова, С. А. Ефремова, А. М. Рыбакова. М.: Медицина, 1987. — 352 с.
  26. JI. В. Роль триптофана в корневых экзометаболитах для фитостимулирующей активности ризобактерий / JI. В. Кравченко, Т. С. Азарова, Н. М. Макарова, И. А. Тихонович // Микробиология. 2004. — том 73, № 2. — С. 195 — 198.
  27. Г. П. Экологическая концепция паразитизма / Г. П. Краснощекое // Журнал общей биологии. 1995. — Т. 59, № 1. — С. 18−32.
  28. К. А. Иммунология образраспознающих рецепторов (интегральная иммунология) / К. А. Лебедев, И. Д. Понякина М.: Книжный дом «Либроком», 2009. -256 с.
  29. В. Ю. Эпидемиологические аспекты экологии бактерий / В. Ю. Литвин, А. Л. Гинцбург, В. И. Пушкарёва и др. изд-во «ФармарусПринт», 1998.-256 с.
  30. Ю. М. Выявление липазы у Vibrio cholerae OI серогруппы в реакции объемной агломерации / Ю. М. Ломов, В. В. Агафонова, Н. Р.
  31. Телесманич и др. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2007. — № 1. — С.74−77.
  32. А. Р. «Острова» патогенности условно-патогенных энтеробактерий / А. Р. Мавзютов, С. В. Фиалкина, В. М. Бондаренко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2002. — № 6. -С. 5 — 9.
  33. И. В. Про-/антиоксидантная система и устойчивость растений к патогенам / И. В. Максимов, Е. А. Черепанова // Успехи совр. биологии. 2006. — Т. 126, № 3. — С. 250−261.
  34. С. С. Кальциевая сигнальная система растений / С. С. Медведев // Физиология растений. 2005. — Т. 52, № 1. — С. 1 — 24.
  35. А. И. Аэробные и спорообразующие бактерии Bacillus Cohn в агроэкосистемах / А. И. Мелентьев. Ин-т биологии УфимНЦ РАН. — М.: Наука, 2007. — 147 с.
  36. Методы определения фитогормонов и фенолов в семенах / Под ред. М. Г. Николаевой. Л.: Наука, 1979. — 78 с.
  37. В. В. Участие протеолитических ферментов и их ингибиторов в защите растений / В. В. Мосолов, Л. И. Григорьева, Т. А. Валуева // Журнал прикладной биохимии и микробиологии. 2001.-Т.37, № 2. — С. 131 — 140.
  38. А. Е. Проблемы эпидемической безопасности питьевого водопользования населения России / А. Е. Недачин, Т. 3. Артемова, Р. А. Дмитриева и др. // Гигиена и Санитария. 2005. — № 6. — Р. 14−19.
  39. Ю. А. Биопленка «город микробов» или аналог многоклеточного организма? / Ю. А. Николаев, В. К. Плакунов // Микробиология. — 2007. — Т. 76, № 2. — С. 149 — 163.
  40. Ю. Экология Т. 1. / Ю. Одум. -М.:Мир, 1986.-328 с.
  41. Ю. В. Ответные реакции растений и культуры клеток табака на заражение Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus / Ю. В. Омеличкина, Т. Н. Шафикова, А. Л. Алексеенко и др. // В мире научных открытий. 2010. — № 1 (07), часть 4. — С. 87 — 92.
  42. О. К. Энтеробактерии: руководство для врачей / О. К. Поздеев, Р. В. Федоров. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2007. — 720 с.
  43. В. И. Инфекционные болезни и эпидемиология / В. И. Покровский, С. Г. Пак, Н. И. Брико и др. М. «ГЭОТАР-Медиа», 2007. -816 с.
  44. О. Г. Растительная клетка и активные формы кислорода / О. Г. Полесская. М.: КДУ, 2007. — 140 с.
  45. Практикум по микробиологии: учеб. пособие для студ. ВУЗов / под ред. А. И. Нетрусова. М.: Издательский центр «Академия», 2005. — 602 с.
  46. Н. А. Коэволюция партнеров и целостность симбиотических систем / Н. А. Проворов, Н. И. Воробьев // Журнал общей биологии. 2012. — № 1.-С. 21−36.
  47. Н. А. Макро- и микроэволюция бактерий в системах симбиоз / Н. А. Проворов, Н. И. Воробьев, Е. Е. Андронов // Генетика. 2008. — Т. 44, № 1.-С. 12−28.
  48. А. А. Системы «токсин-антитоксин» у бактерий: инструмент апоптоза или модуляторы метаболизма? / А. А. Прозоров, В. Н. Даниленко // Микробиология. 2010. — Т. 79, № 2. — С. 147 — 159.
  49. M.JI. Структура и механизм действия целлюлолитических ферментов / М. JI. Рабинович, М. С. Мельник, М. С. Болобова // Биохимия. 2002. Т. 67, № 8. — С. 1026−1050.
  50. В. А. Паразитизм как форма симбиотических отношений / В. А. Ройтман, С. А. Беэр. М.: Товарищество научных изданий КМК, 2008. -310 с.
  51. П. Ф. Биологическая статистика / П. Ф. Рокицкий. Минск, «Вышэйш. Школа», 1973. — 320 с.
  52. JI. И. Метаболическая реакция сеянцев лиственницы сибирской на затопление корней / JI. И. Романова // Лесоведение. 2004. -№ 1. — С. 31−37.
  53. Е. Д. Условно-патогенные микроорганизмы в водных экосистемах Восточной Сибири и их роль в оценке качества вод / Е. Д. Савилов, Л. М. Мамонтова, Е. В. Анганова, В. А. Астафьев // Бюллетень СО РАМН. 2008. — № 1.-Р. 47−51.
  54. Е. Д. Эволюция эпидемического процесса в современных условиях / Е. Д. Савилов // Вестник Российской Академии Медицинских Наук. 2011. — № 3. — С. 14−48.
  55. Е. Д. Эпидемиологический анализ: Методы статистической обработки материала / Е. Д. Савилов, В. А. Астафьев, С. Н. Жданова, Е. А. Заруднев. Новосибирск: Наука-Центр, 2011.-156 с.
  56. В. П. Инфекционные болезни на рубеже веков: осознание биологической угрозы. / В. П. Сергиев, Н. Н. Филатов. М.: Наука, 2006. -572 с.
  57. А. П. Методы изучения и свойства целлюлолитических ферментов / А. П. Синицын, А. П. Гусаков, В. М. Черноглазов / Итоги науки и техники. М. Сер. биотехн. 1990. — Т. 25. — 150 с
  58. Г. П. Современные представления о сапронозах и сапрозоонозах / Г. П. Сомов // Ветеринарная патология. 2004. — № 3. — С. 31−35.
  59. И.А. Сигнальные системы клеток растений / И. А. Тарчевский. М.: Наука, 2002. — 294 с.
  60. Тец В. В. Пангеном / В. В. Тец // Цитология. 2003. — Т. 45, № 5. — С. 526−531.
  61. . Я. Взаимодействие бактерий и эритроцитов / Б. Я. Усвяцов, Е. А. Ханина, О. В. Бухарин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2005. — № 4. — С.89−95.
  62. Е. А. Микроорганизмы продуценты стимуляторов роста растений и их практическое применение (обзор) / Е. А. Цавкелова, С. Ю. Климова, Т. А. Чердынцева и др. // Прикладная биохимия и микробиология. — 2006. — Т. 42, № 2. — С. 133 — 143.
  63. . Л. Инфекционные и паразитарные болезни человека / Б. Л. Черкасский. М, 1994. — 477 с.
  64. М.И. Новый ассоциативный диазотроф Agrobacterium radiobacter из гистосферы пшеницы / М. И. Чумаков, В. В. Горбань, JI. Е. Ковлер и др. // Микробиология. 1992. — Т. 61, № 1. — С. 92 -102.
  65. Ю. JI. Микроорганизмы и человек, некоторые особенности их взаимососуществования на современном этапе / Ю. JI. Шевченко, Г. Г. Онищенко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. -2001.-№ 2.-С. 94- 104.
  66. И. А. Псевдотуберкулез / И. А. Шурыгина, М. В. Чеснокова, В. Т. Климов. Новосибирск: Наука, 2003. — 320 с.
  67. С. В. Краткий справочник по антимикробной химиотерапии / С. В. Яковлев, В. П. Яковлев. М.: Центр по биотехнологии, медицине и фармации, 2002. — 127 с.
  68. Abbott D. W. Structural Biology of Pectin Degradation by Enterobacteriaceae / D. W. Abbott, A. B. Boraston // Microbiology And Molecular Biology Reviews. 2008. — V. 72, № 2. — P. 301−316.
  69. Abd H. Pseudomonas aeruginosa Utilises Its Type III Secretion System to Kill the Free-Living Amoeba Acanthamoeba castellanii / H. Abd, B. Wretlind, A. Saeed et al. // Journal of Eukaryotic Microbiology. 2008. — V. 55, № 3. — P. 235−243.
  70. Achouak W. Phenotypic Variation of Pseudomonas brassicacearum as a Plant Root-Colonization Strategy / W. Achouak, S. Conrod, V. Cohen, T. Heulin // MPMI. 2004. — V.17, № 8. -P. 872−879.
  71. Ahmad F. Screening of free-living rhizospheric bacteria for their multiple plant growth promoting activities / F. Ahmad, I. Ahmad, M.S. Khan // Microbiological Research. 2008. — V. 163. — P. 173—181.
  72. Alvarez M. E. Epigenetic control of plant immunity / M. E. Alvarez, F. Nota, D. A. Cambiagno // Mol. Plant Pathol. 2010. — № 11. — P. 563−576.
  73. An C. Salicylic Acid and its Function in Plant Immunity / C. An, Z. Mou // Journal of Integrative Plant Biology. 2011. — V. 53, № 6. — P. 412−428.
  74. Arpigny J. L. Bacterial lipolytic enzymes: classification and properties / J. L. Arpigny, K.-E. Jaeger // Biochem. J. 1999. — V. 343. — P. 177−183.
  75. Arthurson V. Persistence and spread of Salmonella enterica serovar Weltevreden in soil and on spinach plants / V. Arthurson, A. Sessitsch, L. Jaderlund // FEMS Microbiology Letters. 2011. — V. 314, № 1. — P. 67−74.
  76. Alsam S. Escherichia coli interactions with Acanthamoeba: a symbiosis with environmental and clinical implications / S. Alsam, S. R. Jeong, J. Sissons et al. // J. Med. Microbiol. 2006. — V. 55 № 6. — P. 689 — 694.
  77. Andreote F. D. Endophytic population of Pantoea agglomerans in citrus plants and development of a cloning vector for endophytes / F. D. Andreote, P. B. Rossetto, L. C. Souza et al. // J. Basic Microbiol. 2008. — V 48. — P. 338−346.
  78. Arthurson V. Persistence and spread of Salmonella enterica serovar Weltevreden in soil and on spinach plants / V. Arthurson, A. Sessitsch, L. Jaderlund // FEMS Microbiology Letters. 2011. — V. 314, № 1. — P. 67−74.
  79. Aruscavage D. Interactions affecting the proliferation and control of human pathogens on edible plants / D. Aruscavage, K. Lee, S. Miller, J. T. LeJeune // Journal of Food Science. 2006. — V 71. — P. 89−99.
  80. Asplund K. The growth of salmonellae in tomatoes / K. Asplund, E. Nurmi // Int. J. Food Microbiol. 1991. — V. 13. — P. 177−182.
  81. Austin M. J. Regulatory Role ofSGTl in Early R Gene-Mediated Plant Defenses / M. J. Austin, P. Muskett, K. Kahn et al. // Science. 2002. — V. 295, № 5562.-P. 2077−2080.
  82. Ausubel F. M. Are innate immune signaling pathways in plants and animals conserved? / F. M. Ausubel // Nat. Immunol. 2005. — V.6. — P. 973 979.
  83. Azevedo C. The RAR1 interactor SGTl, an essential component of R gene-triggered disease resistance / C. Azevedo, A. Sadanandom, K. Kitagawa et al. // Science. 2002. — V. 295. — P. 2073−2076.
  84. Baarlen P. Molecular mechanisms of pathogenity: how do pathogenic microorganisms develop cross-kingdom host jumps? / P. Baarlen, A. Belkum, R. Summerbell et al. // FEMS Microbiology Reviews. 2007. — V. 31, № 3. — P. 239−277.
  85. Babic I. Changes in microbial populations on fresh cut spinach / I. Babic, S. Roy, A. E. Watada, W. P. Wergin // Int. J. Food Microbiol. 1996. -V.31.-P. 107−119.
  86. Bacteria Associated with Foodborne Diseases Scientific Status Summary. Institute Of Food Technologists AUGUST. 2004.
  87. Bandara W. M. Interactions Among Endophytic Bacteria And Fungi: Effects And Potentials / W. M. Bandara, G. Seneviratne, S. A. Kulasooriya // J. Biosci. -2006. V. 31, № 5. — P. 645 — 650.
  88. Barak J.D. Differences in attachment of Salmonella enterica serovars and Escherichia coli 0157: H7 to alfalfa sprouts / J. D. Barak, L. C. Whitehand, A. O. Charkowski // Applied and environmental microbiology. 2002. — V. 68, № 10. -P. 758−763.
  89. Barak J. D. Salmonella enterica virulence genes are required for bacterial attachment to plant tissue / J. D. Barak, L. Gorski, P. Naraghi-Arani, A. O. Charkowski // Appl. Environ. Microbiol. 2005. — V. 71. — P. 5685−5691.
  90. Barak J. D. The Role of Cellulose and O-Antigen Capsule in the Colonization of Plants by Salmonella enteric / J. D. Barak, C. E. Jahn, D. L. Gibson, A. O. Charkowski // MPMI. 2007. — V. 20, № 9. — P. 1083 — 1091.
  91. Bavaro M. F. E. coli 0157. H7 and Other Toxigenic Strains: The Curse of Global Food Distribution / M. F. Bavaro // Curr Gastroenterol Rep. 2012. — V. 14, № 4.-P. 317 — 323.
  92. Beattie G. A. E. Bacterial colonization of leaves: a spectrum of strategies / G. A. Beattie, S. E. Lindow // Phytopathology. 1999. — V. 89. — P. 353−359.
  93. Beckers G. J. M. Mitogen-activated protein kinases 3 and 6 are required for full priming of stress responses in Arabidopsis thaliana / G. J. M. Beckers, M. Jaskiewicza, Y. Liu et al. // Plant Cell. 2009. — V. 21. — P. 944−953.
  94. Beneden C. A. Multinational outbreak of Salmonella enterica serotype Newport infections due to contaminated alfalfa sprouts / C. A. Beneden, W. E. Keene, R. A. Strang // Journal of the American Medical Association. 1999. -V.281, № 2. — P.158−162.
  95. Bent A. F. Elisitors, Effectors and R Genes: The New Paradigm and a Lifetime Supply of Questions / A. F. Bent, D. Mackey // Annu. Rev. Phytopathol. 2007. — V. 45.-P. 399−436.
  96. Berendsen R. L. The rhizosphere microbiome and plant health / R. L. Berendsen, C. M. J. Pieterse, P. A. H. M. Bakker // Trends in Plant Science. -2012. V. 17, № 8. — P. 478 — 486.
  97. Berg G. The rhizosphere as a reservoir for opportunistic human pathogenic bacteria / G. Berg, L. Eberl, A. Hartmann // Environ Microbiol. -2005. V.7, № 11. -P.1673−1685.
  98. Berger C. N. Salmonella enterica strains belonging to O serogroup 1,3,19 induce chlorosis and wilting of Arabidopsis thaliana leaves / C. N. Berger, D. J. Brown, R. K. Shaw // Environmental Microbiology. 2011. — V. 13, № 5. -P. 1299−1308.
  99. Berk S. G. Packaging of Live Legionella pneumophila into Pellets Expelled by Tetrahymena spp. Does Not Require Bacterial Replication and Depends on a Dot/Icm-Mediated Survival Mechanism / S. G. Berk, G. Faulkner,
  100. E. Garduno et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2008. — V. 74, № 7. — P. 2187−2199.
  101. Bernstein N. Evidence for internalization of Escherichia coli into the aerial parts of maize via the root system / N. Bernstein, S. Sela, R. Pinto, M. Ioffe // J. Food Prot. 2007. — V. 70. — P. 471−475.
  102. Bianco C. Indole-3-acetic acid regulates the central metabolic pathways in Escherichia coli / C. Bianco, E. Imperlini, R. Calogero et al. // Microbiology. -2006.-V 152, № 8.-P. 2421−2431.
  103. Bieri S. RAR1 positively controls steady-state levels of barley MLA resistance proteins and enables sufficient MLA6 accumulation for effective resistance / S. Bieri, S. Mauch, Q. H. Shen et al. // The Plant Cell. 2004. -V.16.-P. 3480−3495.
  104. Bindschedler L.V. Early signaling events in the apoplastic oxidative burst in-1−0suspension cultured French bean cells involve cAMP and Ca / L. V. Bindschedler, F. Minibaeva, S. L. Gardner // New Phytologist. 2001. — V. 151. -P.185−194.
  105. Boiler T. Renaissance of Elicitors: Perception of Microbe-Associated Molecular Patterns and Danger Signals by Pattern-Recognition Receptors / T.
  106. Boiler, G. A. Felix // Annual Review of Plant Biology. 2009. — V. 60. — P. 379−406.
  107. Brandl M. T. Fitness of Salmonella enterica serovar Thompson in the cilantro phyllosphere / M. T. Brandl, R. E. Mandrell // Appl. Environ. Microbiol. 2002. — V.68, № 7. — P.3614−3621.
  108. Brandl M. T. Fitness of human enteric pathogens on plants and implications for food safety / M. T. Brandl // Annual Rev. Phytopathol. 2006. -V.16, № 3 — P.67−92.
  109. Buchholz U. German Outbreak of Escherichia coli 0104: H4 Associated with Sprouts / U. Buchholz, H. Bernard, D. Werber et al. // N. Engl. J. Med. -2011. V. 365, № 10. — P. 1763 — 1770.
  110. Buttner D. Who comes first? How plant pathogenic bacteria orchestrate type III secretion / D. Buttner, U. Bonas // Curr. Opin. Microbiol. -2006.-V. 9.-P. 193−200.
  111. Castro-Rosas J. Presence of faecal coliforms, Escherichia coli and diarrheagenic E. coli pathotypes in ready-to / J. Castro-Rosas, J. F. Cerna-Cortes, E. Mendez-Reyes et al. // Int J Food Microbiol. 2012. — V. 156, № 2. — P. 176 180.
  112. Cankar K. Bacterial endophytes from seeds of Norway spruce (Picea abies L. Karst) / K. Cankar, H. Kraigher, M. Ravnikar, M. Rupnik // FEMS Microbiol Lett. 2005. — V. 244. — P. 341−345.
  113. Celloto V.R. Biosynthesis of Indole-3-Acetic Acid by New Klebsiella oxytoca Free and Immobilized Cells on Inorganic Matrices / V.R. Celloto, A. J. B. Oliveira, J. E. Goncalves // The Scientific World Journal. 2012. — Article IB 495 970.- 7 pages
  114. Chelius, M.K. Immunolocalization of dinitrogenase reductase produced by Klebsiella pneumoniae in association with Zea mays L. / M. K. Chelius, E. W. Triplett // Appl. Environ. Microbiol. 2000. — V. 66. — P.783−787.
  115. Cleary P. A foodborne outbreak of Salmonella Bareilly in the United Kingdom, 2010 / P. Cleary, L. Browning, J. Coia et al. // Eur. Surveill. -2010.-V. 15, № 48. -P. 8−11.
  116. Cody S. H. An outbreak of Escherichia coli 0157: H7 infection from unpasteurized commercial apple juice / S. H. Cody, M. K. Glynn, J. A. Farrar et al. // Ann. Intern. Med. 1999. — V.130, № 3. — P.202−209.
  117. Cook K.A. Outbreak of Salmonella serotype Hartford infections associated with unpasteurized orange juice / K. A. Cook, T. E. Dobbs, W. G. Hlady et al. // JAMA. 1998. — V.280, № 17. — P. 1504−1509.
  118. Conn V. M. Endophytic Actinobacteria Induce Defense Pathways in Arabidopsis thaliana / V. M. Conn, A. R. Walker, C. M. Franco // MPMI. -2008. V. 21, № 2. — P. 208−218.
  119. Corby R. Outbreaks of Salmonella infections associated with eating Roma tomatoes United States and Canada / R. Corby, V. Lanni, B. County et al. // Morb. Mortal. Wkly. Rep. — 2005. — V. 54, № 13. — p. 325 — 328.
  120. Da Cunha L. Innate immunity in plants: a continuum of layered defenses / L. Da Cunha, A. J. McFall, D. Mackey // Microbes Infect. 2006. -V. 8.-P. 1372- 1381.
  121. Dangl J. L. Plant pathogens and integrated defense responses to infection / J. L. Dangl, J. D. G Jones // Nature. 2001. — V. 411. — P. 826−833.
  122. Danhorn T. Phosphorus limitation enhances biofilm formation of the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens through the PhoR-PhoB regulatory system / T. Danhorn, M. Hentzer, M. Givskov et al. // J. Bacteriol. 2004. — V 186.-P. 4492−4501.
  123. Danhorn T. Biofilm Formation by Plant-Associated Bacteria / T. Danhorn, C. Fuqua // Annual Review of Microbiology. V 61. — P 401−422.
  124. Davidson C. J. Individuality in Bacteria / C. J. Davidson, M. G. Surette // Annual Review of Genetics. 2008. — V. 42. — P. 253−268.
  125. Daudi A. The Apoplastic Oxidative Burst Peroxidase in Arabidopsis Is a Major Component of Pattern-Triggered Immunity / A. Daudi, Z. Cheng, J. A. O’Brien et al. // Plant Cell. 2012. — V. 24, № 1. — P. 275−287.
  126. Dodds P. N. Plant immunity: towards an integrated view of plant-pathogen interactions / P. N. Dodds, J. P. Rathjen // Nature Reviews. Genetics. -2010.-V.il.-P. 539−548.
  127. Dong Y. M. Quantitative assessments of the host range and strain specificity of endophytic colonization by Klebsiella pneumoniae / Y. M. Dong, A. L. Iniguez, E. W. Triplett // Plant Soil. 2003. — V.25, № 7. — P.49−59.
  128. Dong Y. M. Quorum sensing and quorum-quenching enzymes / Y. M. Dong, L. H. Zhang // J. Microbiol. 2005. — V. 43. — P. 101−109.
  129. Doornbos R. F. Impact of root exudates and plant defense signaling on bacterial communities in the rhizosphere. A review / R. F. Doornbos, L. C. van Loon, P. A. Bakker // Agronomy for Sustainable Development January. 2012. — V 32, № l.-P. 227−243.
  130. Doyle M. P. Opportunities for mitigating pathogen contamination during on-farm food production. / M. P. Doyle, M. C. Erickson // Int. J. Food Microbiol. -2012. V. 152, № 3. — P. 54−74.
  131. Durrant W. E. Systemic Acquired Resistance / W. E. Durrant, X. Dong // Annual Review of Phytopathology. 2004. — V. 42. — P. 185−209.
  132. Eblen B. S. Potential for internalization, growth, and survival of Salmonella and Escherichia coli 0157: H7 in oranges / B. S. Eblen, M. O. Walderhaug, S. Edelson-Mammel et al. // J. Food Prot. 2004. — V.67. — P. 1578−1584.
  133. Eberl L. Biofilms on plant surfaces / L. Eberl, S. B. von Bodman, C. Fuqua. The Biofilm Mode of Life: Mechanisms and Adaptations. — 2007. — P. 215−234.
  134. Eichenlaub R. The Clavibacter michiganensis Subspecies: Molecular Investigation of Gram-Positive Bacterial Plant Pathogens / R. Eichenlaub, K. H. Gartemann // Annual Review of Phytopathology. 2011. — V. 49. — P. 445 — 464.
  135. Emberland K. E. Outbreak of Salmonella Weltevreden infections in Norway, Denmark and Finland associated with alfalfa sprouts, July-October 2007 / K. E. Emberland, S. Ethelberg, M. Kuusi et al. // Euro Surveill. 2007. -V 12.-P. 3321.
  136. Engelberg-Kulka H. Bacterial Programmed Cell Death and Multicellular Behavior in Bacteria / H. Engelberg-Kulka, S. Amitai, I. Kolodkin-Gal, R. Hazan //PLoS Genet. 2006. — V 2, № 10. — el35. doi:10.1371/journal.pgen.20 135.
  137. Erickson M.C. Food as a vehicle for transmission of Shiga toxin-producing Escherichia coli / M. C. Erickson, M. P. Doyle // J. Food Prot. -2007. V 70. — P. 2426−2449.
  138. Erickson M. C. Internalization of fresh produce by foodborne pathogens / M. C. Erickson // Annu. Rev. Food Sei. Technol. 2012. — V.3. — P.283−310.
  139. Fatica M. K. Salmonella and produce: Survival in the plant environment and implications in food safety / M. K. Fatica, K. R. Schneider // Virulence. -2011.-V 2, № 6.-P. 573−579.
  140. Faulkner G. Passage through Tetrahymena tropicalis Triggers a Rapid Morphological Differentiation in Legionella pneumophila / G. Faulkner, S. G. Berk, E. Garduno et al. II J. Bacteriol. 2008. — V 190, № 23. — P. 7728−7738.
  141. Flor H. H. Inheritance of pathogenicity in Melampsora lini /H. H. Flor //Phytopathology 1942. — V.32. — P. 653−669.
  142. Francis G. A. Factors affecting quality and safety of fresh-cut produce / G. A. Francis, A. Gallone, G. J. Nychas et al. // Crit. Rev. Food Sei. Nutr. 2012. — V 52, № 7.-P. 595 -610.
  143. Franz E. Quantification of contamination of lettuce by GFP-expressing Escherichia coli 0157: H7 and Salmonella enterica serovar Typhimurium / E. Franz, A. A. Visser, A. D. Van Diepeningen et al. // Food Microbiol. 2007. — V.24. — P. 106−112.
  144. Franz E. Manure-amended soil characteristics affecting the survival of E. coli 0157: H7 in 36 Dutch soils / E. Franz, A. V. Semenov, A. J. Termorshuizen et al. // Environmental Microbiology. 2008. — V 10, № 2. — P. 313−327.
  145. Galan J. E. Protein delivery into eukaryotic cells by type III secretion machines / J. E. Galan, H. Wolf-Watz // Nature. 2006. — V.444. — P. 567−573.
  146. Glazebrook J. Contrasting mechanisms Of Defense Against Biotrophic And Necrotrophic Pathogens / J. Glazebrook // Annu. Rev. Phytopathol. 2005. -V. 43.-P. 205−207.
  147. Glick B. R. Promotion of plant growth by ACC deaminase-producing soil bacteria / B. R. Glick, Z. Cheng, J. Czarny, J. Duan // European Journal of Plant Pathology. 2007. — V 119, № 3. — P. 329−339.
  148. Golberg D. Salmonella Typhimurium internalization is variable in leafy vegetables and fresh herbs / D. Golberg, Y. Kroupitskia, E. Belausovb et al. // International Journal of Food Microbiology. 2011. — V 145, № 1. — P. 250−257.
  149. Gonzalez J. E. Messing with bacterial quorum sensing / J. E. Gonzalez, N. D. Keshavan // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2006. — V 70. — P. 859−875.
  150. Gorski L. Attachment of Listeria monocytogenes to Radish Tissue Is Dependent upon Temperature and Flagellar Motility / L. Gorski, J. D. Palumbo, R. E. Mandrell // Appl Environ Microbiol. 2003. — V. 69, № 1. — P. 258−266.
  151. Gourabathini P. Interactions between Food-Borne Pathogens and Protozoa Isolated from Lettuce and Spinach / P. Gourabathini, M. T. Brandl, K.
  152. S. Redding et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2008. — V. 74 № 8. — P. 2518−2525.
  153. Grant S. R. Subterfuge and manipulation: type III effector proteins of phytopathogenic bacteria / S. R. Grant, E. J. Fisher, J. H. Chang et al. // Annu. Rev. Microbiol. 2006. — V.60. — P. 425−449.
  154. Gyaneshwar P. Endophytic Colonization of Rice by a Diazotrophic Strain of Serratia Marcescens / P. Gyaneshwar, E. K. James, N. Mathan et al. // Journal of Bacteriology. 2001. — V.3, № 8. — P.2634−2645.
  155. Hallmann J. Bacterial endophytes in agricultural crops / J. Hallmann, A. Quadt-Hallmann, W. F. Mahaffee et al. // Can. J. Microbiol. 1997. — V.43. -P.895−914.
  156. He F. Shigellosis Outbreak Associated with Contaminated Well Water in a Rural Elementary School: Sichuan Province, China, June 7−16, 2009. / F. He, K. Han, L. Liu et al. // PLoS ONE. 2012. — V. 7, № 10. — e47239. doi: 10.137 l/journal.pone.47 239
  157. Hirneisen K. A. Human enteric pathogen internalization by root uptake into food crops / K. A. Hirneisen, M. Sharma, K. E. Kniel // Foodborne Pathog Dis. 2012. — V. 9, № 5. — P. 396−405.
  158. Hirano S. S. Bacteria in the Leaf Ecosystem with Emphasis on Pseudomonas syringae—a Pathogen, Ice Nucleus, and Epiphyte / S. S. Hirano, C. D. Upper // Microbiology And Molecular Biology Reviews. 2000. — V. 64, № 3. -P. 624−653.
  159. Hubalek Z. Microbial zoonoses and sapronoses / Z. Hubalek, I. Rudolf -Springer, Dordrecht-Heidelberg-London-New York, 2011. —457 p.
  160. Huckelhoven R. Cell Wall-Associated Mechanisms of Disease Resistance and Susceptibility / R. Huckelhoven // Annu. Rev. Phytopathol. -2007.-V.45.-P. 101−127.
  161. Hundt M. J. Interaction of Pasteurella multocida with Free-Living Amoebae / M. J. Hundt, C. G. Ruffolo // Appl. Environ. Microbiol. 2005. — V. 71, № 9.-P. 5458−5464.
  162. Iniguez A. L. Nitrogen Fixation in Wheat Provided by Klebsiella pneumoniae 342 / A. L. Iniguez, Y. Dong, E. W. Triplett // MPMI. 2004. — V 17, № 10. — P. 1078−1085.
  163. Iniguez A. L. Regulation of Enteric Endophytic Bacterial Colonization by Plant Defenses / A. L. Iniguez, Y. Dong, H. D. Carter et al. // MPMI. 2005. — V 18, № 2.-P. 169−178.
  164. Itoh Y. Enterohemorrhagic Escherichia coli 0157: H7 present in radish spouts / Y. Itoh, Y. Sugita-Konishi, F. Kasuga et al. // Appl. Environ. Microbiol.- 1998.-V.64.-P.1532 1535.
  165. Iturriaga M. H. Colonization of Tomatoes by Salmonella Montevideo Is Affected by Relative Humidity and Storage Temperature / M. H. Iturriaga, M. L. Tamplin, E. F. Escartin // Journal of Food Protection. 2007. — V. 70, № 1. — P. 30−34.
  166. Jablasone J. Interactions of Escherichia coli 0157: H7, Salmonella Typhimurium, and Listeria monocytogenes in a gnotobiotic system / J. Jablasone, K. Warriner, M. Griffiths // Int. J. Food Microbiol. 2005. — V.99. — P. 7−18.
  167. Jacobs S. Broad-Spectrum Suppression of Innate Immunity Is Required for Colonization of Arabidopsis Roots by the Fungus Piriformospora indica / S. Jacobs, B. Zechmann, A. Molitor et al // Plant Physiology. 2011. — V. 156, № 2.- P. 726−740.
  168. Janes M. E. Transmission electron microscopy study of enterohemorrhagic Escherichia coli 0157: H7 in apple tissue / M. E. Janes, K. S. Kim, M. G. Johnson // J. Food Prot. 2005. — V.68. — P. 216−224.
  169. Janeway C. A. Approaching the asymptote? Evolution and revolution in immunology / C. A. Janeway // Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 1989. — V.54. -P. 1−13.
  170. Jaskiewicz M. Chromatin modification acts as a memory for systemic acquired resistance in the plant stress response / M. Jaskiewicz, U. Conrath, C. Peterhansel // EMBO Rep. 2011. — V. 12. — P. 50−55.
  171. Jennings D. B. Roles for mannitol and mannitol dehydrogenase in active oxygen-mediated plant defense / D. B. Jennings, M. Ehrenshaft, D. M. Pharr, J. D. Williamson//Proc Natl Acad Sci U S A.- 1998.-V 95.-P. 15 129−15 133.
  172. Jha A. K. Enterococcus faecalis mammalian virulence-related factors exhibit potent pathogenicity in the Arabidopsis thaliana plant model / A. K. Jha, H. P. Bais, J. M. Vivanco // Infect. Immun. 2005. — V.73. — P. 464−475.
  173. Johnston-Monje D. Conservation and Diversity of Seed Associated Endophytes in Zea across Boundaries of Evolution, Ethnography and Ecology / D. Johnston-Monje, M. N. Raizada // PLoS ONE. 2011. — V. 6, № 6. — e20396. doi:10.1371/journal.pone.20 396.
  174. Johri B. N. Endophytes to the rescue of plants / B. N. Johri // Curr. Sci. 2006. — № 90.-P. 1315−1316.
  175. Jonas K. Roles of curli, cellulose and BapA in Salmonella biofllm morphology studied by atomic force microscopy / K. Jonas, H. Tomenius, A. Kader et al. // BMC Microbiol. 2007. — V. 24, № 7. — P. 70.
  176. Jones J. D. G. The plant immune system / J. D. G. Jones, J. L. Dangl // Nature. 2006. -V.444. — P. 323−329.
  177. Khare E. Effect of Indole-3- Acetic Acid (IAA) Produced by Pseudomonas aeruginosa in Suppression of Charcoal Rot Disease of Chickpea / E. Khare, N. K. Arora // Curr Microbiol. 2010. — V. 61. — P. 64−68.
  178. Kim Y. C. The Multifactorial Basis for Plant Health Promotion by Plant-Associated Bacteria / Y. C. Kim, J. Leveau, B. B. McSpadden // Appl. Environ. Microbiol. 2011. — V. 77, № 5. — P. 1548−1555.
  179. Kingsley R. A. Host adaptation and the emergence of infectious disease: The Salmonella paradigm. / R. A. Kingsley, A. J. Baumler // Mol. Microbiol. -2000.-V 36.-P. 1006−1014.
  180. Kirzinger M.W.B. Insights into Cross-Kingdom Plant Pathogenic Bacteria / M.W.B. Kirzinger, G. Nadarasah, J. Stavrinides // Genes. 2011. — № 2. — P. 980−997.
  181. Klerks M. M. Differential interaction of Salmonella enterica serovars with lettuce cultivars and plant-microbe factors influencing the colonization efficiency / M. M. Klerks, E. Franz, M. van Gent-Pelzer et al. // ISME 2007. -№ l.-P. 620−631
  182. Kloepper J. W. Induced Systemic Resistance and Promotion of Plant Growth by Bacillus spp. / J. W. Kloepper, C.-M. Ryu, S. Zhang // Phytopathology. 2004. — V 94, № 11. — P. 12 — 59.
  183. Korzeniewska E. Culture-Dependent and Culture-Independent Methods in Evaluation of Emission of Enterobacteriaceae from Sewage to the Air and
  184. Surface Water / E. Korzeniewska, M. Harnisz // Water, Air, & Soil Pollution. 2012. — V. 223, № 7. — P. 4039−4046.
  185. Krtinic G. Salmonellae in food stuffs of plant origin and their implications on human health / G. Krtinic, P. Duric, S. Ilic // European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 2010. — V. 29, № 11. — P. 13 211 325.
  186. Kroupitski Y. Internalization of Salmonella in leaves is induced by light and involves chemotaxis and penetration through open stomata / Y. Kroupitski, D. Goiberg, E. Belausov et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2009. -V75.-P. 6076−6086.
  187. Kutter S. Colonization of barley (Hordeum vulgare) with Salmonella enterica and Listeria spp. / S. Kutter, A. Hartmann, M. Schmid // FEMS Microbiology. 2006. — V 56, № 2. — P. 262−271.
  188. Lacava P. T. Evaluation of endophytic colonization of Citrus sinensis and Catharanthus roseus seedlings by endophytic bacteria / P. T. Lacava, W. L. Araujo, J. L. Azevedo // J. Microbiol. 2007. — V.45. — P. 11−14.
  189. Lemoine R. Sucrose transporters in plants: update on function and structure: a review / R. Lemoine // Biochim. Biophys. Acta. -. 2000. V 1465. -P. 246 — 262.
  190. Li J. ACC Deaminase Minus Mutant of Enterobacter cloacae UW4No Longer Promotes Root Elongation / J. Li, D. H. Ovakim, T. C. Charles et al. // Current Microbiology. 2000. — V. 41, № 2. — P. 101−105.
  191. Lindow S. E. Microbiology of the phyllosphere / S. E. Lindow, M. T. Brandl // Appl. Environ. Microbiol. 2003. — V 69. — P. 1875−1883.
  192. Liu S. Role of sdhA and pfkA and catabolism of reduced carbon during colonization of cucumber roots by Enterobacter cloacae / S. Liu, X. Hu, S. M. Lohrke et al. // Microbiology. 2007. — V 153. — P. 3196−3209.
  193. Long H. H. Native Bacterial Endophytes Promote Host Growth in a Species-Specific Manner- Phytohormone Manipulations Do Not Result in Common Growth Responses / H. H. Long, D. D. Schmidt, I. T. Baldwin // PLoS ONE. 2008. — V. 3, № 7.
  194. Lugtenberg B. J. Molecular determinants of rhizosphere colonization by Pseudomonas / B. J. Lugtenberg, L. C. Dekkers, G. V. Bloemberg // Annu. Rev. Phytopathol. 2002. — V 39. — P. 461 — 490.
  195. Lugtenberg B. Plant-growth-promoting rhizobacteria / B. Lugtenberg, F. Kamilova // Annu. Rev. Microbiol. 2009. — V 63. — P. 541- 556.
  196. Mahajan-Miklos S. Molecular Mechanisms of Bacterial Virulence Elucidated Using a Pseudomonas aeruginosa Caenorhabditis elegans Pathogenesis Model / S. Mahajan-Miklos, M.-W. Tan, L. G. Rahme, F. M. Ausubel // Cell. — 1999. — V 96, № 1. — P. 47−56.
  197. Mackey D. RIN4 interacts with Pseudomonas syringae type III effector molecules and is required for RPM1-mediated resistance in Arabidopsis / D. Mackey, B. F. Holt, A. Wiig, J. L. Dangl // Cell. 2002. — 108. — P. 743−754.
  198. Magliozzo R. S. The Role of Mn (Il)-Peroxidase Activity of Mycobacterial Catalase-Peroxidase in Activation of the Antibiotic Isoniazid / R. S. Magliozzo, J. A. Marcinkeviciene // The Journal of Biological Chemistry. -1997. V 272. — P. 8867−8870.
  199. Magnuson R. D. Hypothetical functions of toxin-antitoxin systems / R. D. Magnuson // J Bacteriol. 2007. — V 189, № 17. — P. 6089−6092.
  200. Maldonado A. M. A putative lipid transfer protein involved in systemic resistance signalling in Arabidopsis / A. M. Maldonado, P. Doerner, R. A. Dixon et al. // Nature. -2002. V 419. — P. 399−403.
  201. Malpica J. M. Association and Host Selectivity in Multi-Host Pathogens / J. M. Malpica, S. Sacrista, A. Fraile, F. Garcia-Arenal // PLoS ONE. 2006. -№ l.-P. 1 -8.
  202. Mavrodi D. V. Structural and functional analysis of the type III secretion system from Pseudomonas fluorescens Q8rl-96 / D. V. Mavrodi, A. Joe, O. V. Mavrodi et al. // J. Bacteriol. 2011. — V 193. — P. 177−189.
  203. Mazurier S. Distribution and diversity of type III secretion systemlike genes in saprophytic and phytopathogenic fluorescent pseudomonads / S. Mazurier, M. Lemunier, S. Siblot et al. // FEMS Microbiol. Ecol. 2004. — V 49. -P. 455 -467.
  204. McHale L. Plant NBS-LRR proteins: adaptable guards / L. McHale, X. Tan, P. Koehl, R W. Michelmore // Genome Biol. 2006. — № 7. — P. 212.
  205. Melech-Bonfil S. Tomato MAPKKKe is a positive regulator of cell-death signaling networks associated with plant immunity / S. Melech-Bonfil, G. Sessa//The Plant Journal.-2010.-№ 64.- P. 379−391.
  206. Melotto M. Plant Stomata Function in Innate Immunity against Bacterial Invasion / M. Melotto, W. Underwood, J. Koczan et al. // Cell. 2006.- V 126.-P. 969−980.
  207. Melotto M. Role of Stomata in Plant Innate Immunity and Foliar Bacterial Diseases / M. Melotto, W. Underwood, S. Y. He // Annu Rev Phytopathol. -2008. V 46. — P. 101−122.
  208. Mendes R. Deciphering the Rhizosphere Microbiome for Disease-Suppressive Bacteria / R. Mendes, M. Kruijt, I. de Bruijn et al. // Science. 2011.- V. 332, № 27. P. 1097−1100.
  209. Mercier J. Role of leaf surface sugars in colonization of plants by bacterial epiphytes / J. Mercier, S. E. Lindow // Appl. Environ. Microbiol. -2000. -V.66. P.369−374.
  210. Meyers B. C. Genome-wide analysis of NBS-LRR-encoding genes in Arabidopsis / B. C. Meyers, A. Kozik, A. Griego et al. // Plant Cell. 2003. — 15. — P. 809−34
  211. Miche L. Upregulation of Jasmonate-Inducible Defense Proteins and Differential Colonization of Roots of Oryza sativa Cultivars with the Endophyte Azoarcus sp. / L. Miche, F. Battistoni, S. Gemmer et al. // MPMI. 2006. — V 19, № 5.-P. 502−511.
  212. Millet Y. A. Innate immune responses activated in Arabidopsis roots by microbe-associated molecular patterns / Y. A. Millet, C. H. Danna, N. K. Clay et al. // Plant Cell. 2010. — V 22. — P. 973−990.
  213. Mittler R. Reactive oxygen gene network of plants / R. Mittler, S. Vanderauwera, M. Gollerya, F. Van Breusegem // Trends in Plant Science. -2004. V. 9, № 10. — P. 490−498.
  214. Mobley H. L. Virulence determinants of uropathogenic Escherichia coli and Proteus mirabilis / H. L. Mobley, M. D. Island, G. Massad // Kidney Int. Suppl. 1994. — V 47. — P. 129−136.
  215. Mohle-Boetani J. C. Investigation Team. Escherichia coli Ol57 and Salmonella infections associated with sprouts in California, 1996−1998. / J. C. Mohle-Boetani, J. A. Farrar, S. B. Werner et al. // Ann Intern Med. 2001. — V 135, № 4.-P. 239−247.
  216. Molin S. Gene transfer occurs with enhanced efficiency in biofilms and induces enhanced stabilisation of the biofilm structure / S. Molin, T. Tolker-Nielsen // Current Opinion in Biotechnology. 2003. — V 14, № 3. — P. 255−261.
  217. Monds R. D. Expression of the Pho regulon negatively regulates biofilm formation by Pseudomonas aureofaciens PA147−2 / R. D. Monds, M. W. Silby, H. K. Mahanty // Mol. Microbiol. 2001. — V 42. — P. 415−426.
  218. Monier J.-M. Frequency, Size, and Localization of Bacterial Aggregates on Bean Leaf Surfaces / J.-M. Monier, S. E. Lindow // Appl. Environ. Microbiol. January. 2004. — V 70, № 1. — P. 346−355.
  219. Monier J. M. Aggregates of resident bacteria facilitate survival of immigrant bacteria on leaf surfaces / J. -M. Monier, S. E. Lindow // Microb. Ecol. 2005. — № 49. — P. 343−352.
  220. Mukhtar M. S. Independently Evolved Virulence Effectors Converge onto Hubs in a Plant Immune System Network / M. S. Mukhtar et al. // Science. -2011.-V. 333.-P. 596−601.
  221. Newman K. L. Virulence of Plant Pathogenic Bacteria Attenuated by Degradation of Fatty Acid Cell-to-Cell Signaling Factors / K. L. Newman, S. Chatterjee, K. A. Ho, S. E. Lindow // MPMI. 2008. — V. 21, № 3. — P. 326 334.
  222. Nakamura T. Biotransformation of pentachlorophenol by Chinese chive and a recombinant derivative of its rhizosphere-competent microorganism,
  223. Pseudomonas gladioli M-2196 / T. Nakamura, T. Motoyama, Y. Suzuki, I. Yamaguchi // Soil Biology and Biochemistry. 2004. — V 36, № 5. — P. 787−795.
  224. Neto J. R. Comparative Rflp-Its Analysis Between Enterobacter Cloacae Strains Isolated From Plants And Clinical Origin / J. R. Neto, T. Yano, L.O.S. Beriam et al. // Arq. Inst. Biol. 2003. — V70, № 3. — P. 367−372.
  225. O’Brien J. A. Peroxidase-Dependent Apoplastic Oxidative Burst in Cultured Arabidopsis Cells Functions in MAMP-Elicited Defence / J. A. O’Brien, A. Daudi, P. Finch et al. // Plant Physiology Preview. 2012. — V. 158. -P. 2013−2027.
  226. Ogbo F. Some Characteristics of a Plant Growth Promoting Enterobacter sp. Isolated from the Roots of Maize / F. Ogbo, J. Okonkwo // Advances in Microbiology. 2012. — V 2. — P. 368−374.
  227. A. M. M. Bergaminia, E. C. P. De Martinis // Food Control. 2011. — V 22, № 8.-P. 1400−1403.
  228. Omari S. The Study Of Bacterial Contamination Of Drinking Water Sources: A Case Study Of Mpraeso, Ghana / S. Omari, D. Yeboah-Manu // The Internet Journal of Microbiology. 2012. — V. 10, № 1
  229. Ona O. Growth and indole-3-acetic acid biosynthesis of Azospirillum brasilense Sp245 is environmentally controlled / O. Ona, J. Van Impe, E. Prinsen, J. Vanderleyden // FEMS Microbiol Lett. 2005. — V. 246. — P. 125 132.
  230. Park S.-W. Methyl salicylate is a critical mobile signal for plant systemic acquired resistance / S.-W. Park, E. Kaimoyo, D. Kumar et al. // Science. 2007. -V 318. — P. 113−116.
  231. Parke J. L. Diversity of the Burkholderia Cepacia complex and implications for risk assessment of biological control strains / J. L. Parke, D. Gurian-Sherman // Annual Review of Phytopathology. 2001. — V 39. — P. 225 258.
  232. Passardi F. Prokaryotic origins of the non-animal peroxidase superfamily and organelle-mediated transmission to eukaryotes / F. Passardia, N. Bakalovica, F. K. Teixeirab et al. // Genomics. 2007. — V 89, № 5. — P. 567 579.
  233. Patel J. Differences in attachment of Salmonella enterica serovars to cabbage and lettuce leaves / J. Patel, M. Sharma // International Journal of Food Microbiology. 2010. — V 139, № 1. — P. 41−47.
  234. Patel J. Effect of curli expression and hydrophobicity of Escherichia coli 0157: H7 on attachment to fresh produce surfaces / J. Patel, M. Sharma, S. Ravishakar // Journal of Applied Microbiology. 2011. — V 110, № 3. — P. 737 745.
  235. Plotnikova J. M. Pathogenesis of the human opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa PAH in Arabidopsis / J. M. Plotnikova, L. G. Rahme, F. M. Ausubel // Plant Physiol. 2000. — V. 124, № 4. — P. 1766 — 1774.
  236. Pieterse C. M. J. Networking by small-molecule hormones in plant immunity / C. M. J. Pieterse, A. Leon-Reyes, S. Van der Ent et al. // Nat. Chem. Biol. -2009. -№ 5.-P. 308−316.
  237. Pineda A. Helping plants to deal with insects: The role of beneficial soilborne microbes / Pineda A, Zheng S.-J, Van Loon J. J. A. et al. // Trends Plant Sci. -2010. V 15.-P. 507−514.
  238. Portnoy D. A. Role of plasmid in the pathogenicity of Yersinia species / D. A. Portnoy // Curr. Topics Microbiol. Immunol. 1985. — V 118. — P. 29−51.
  239. Preston G. M. Type III secretion in plant growth-promoting Pseudomonas fluorescens SBW25 / G. M. Preston, N. Bertrand, P. B. Rainey // Mol. Microbiol. 2001. -V 41. — P. 999 — 1014.
  240. Qing-Chunj H. Physiological characters of the resistant mutant of Xanthomonas citri to amicarthiazol / H. Qing-Chunj, Z. Ming-Guoj, Zh.Y. Ye // Acta Phytopathologica Sinica. 2003. — V. 33, No. 1.
  241. Quilliam R. S. Lettuce cultivar mediates both phyllosphere and rhizosphere activity of Escherichia coli 0157: H7 / R. S. Quilliam, A. P. Williams, D. L. Jones // PLoS One. 2012. — V 7, № 3. — e33842. doi: 10.1371/journal.pone.33 842.
  242. Rahman M. Z. Recovery and Characterization of Environmental Variants of Shigella flexneri from Surface Water in Bangladesh / M. Z. Rahman, N. Azmuda, M. J. Hossain et al. // Current Microbiology. 2011. — V. 63, № 4. — P. 372−376.
  243. Rahme L. G. Common virulence factors for bacterial pathogenicity in plants and animals / L. G. Rahme, E. J. Stevens, S. F. Wolfort et al. // Science. -1995. V 268. — P. 1899−1902.
  244. Rahme L.G. Use of model plant hosts to identify Pseudomonas aeruginosa virulence factors / L. G. Rahme, M. W. Tan, L. Le et al. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1997. — V.94, № 24. — P. 13 245−13 250.
  245. Rahme L.G. Plants and animals share functionally common bacterial virulence factors / L. G. Rahme, F. M. Ausubel, H. Cao et al. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 2000. — V. 97, № 16. — P.8815−8821.
  246. Rainey P. B. Adaptation of Pseudomonas fluorescens to the plant rhizosphere / P. B. Rainey // Environ. Microbiol. 1999. — № 1. — P. 243−257.
  247. Reinhold-Hurek B. Living inside plants: bacterial endophytes / B. Reinhold-Hurek, T. Hurek // Current Opinion in Plant Biology. 2011. — V. 14, № 4.-P. 435−443.
  248. Reinhold-Hurek B. Life in grasses: diazotrophic endophytes / B. Reinhold-Hurek, T. Hurek // Trends in Microbiology. 1998. — V. 6, № 4. — P. 139−144.
  249. Rivas-San Vicente M. Salicylic acid beyond defence: its role in plant growth and development / M. Rivas-San Vicente, J. Plasencia // J. Exp. Bot. -2011. V. 62, № 10. — P. 3321−3338.
  250. Roberts D. P. Mutation of a degS Homologue in Enterobacter cloacae Decreases Colonization and Biological Control of Damping-Off on Cucumber / D. P. Roberts, S. M. Lohrke, L. McKenna et al. // Phytopathology. 2011. — V. 101, № 2.-P. 271−280.
  251. Rosenblueth M. Bacterial Endophytes and Their Interactions with Hosts / M. Rosenblueth, E. Martinez-Romero // MPMI. 2006. — V 19, № 8. — P. 827 837.
  252. Ross A. F. Localized acquired resistance to plant virus infection in hypersensitive hosts / A. F. Ross // Virology. 1961. — V. 14, № 3. — P. 329−339.
  253. Saeed A. Acanthamoeba castellanii an environmental host for Shigella dysenteriae and Shigella sonnei / A. Saeed, H. Abd, B. Edvinsson, G. Sandstrom // Archives of Microbiology. 2009. — V. 191, № 1. — p. 83−88.
  254. Saldana Z. Surface structures involved in plant stomata and leaf colonization by Shiga-toxigenic Escherichia coli 0157: H7 / Z. Saldana, E. Sanchez, J. Xicohtencatl-Cortes et al. II Frontiers in Microbiology. 2011. — V 2. -P. 1 -9.
  255. Salto A. Microbial Community Analysis of the Phytosphere Using Culture-Independent Methodologies / A. Salto, S. Ikeda, H. Ezura et al. // Microbes Inviron. 2007. — V.22, № 2. — P.93−105.
  256. Santos J. M. The gene bolA regulates dacA (PBP5), dacC (PBP6) and ampC (AmpC), promoting normal morphology in Escherichia coli / J. M. Santos, M. Lobo, A. P. Matos et al. II Mol Microbiol. 2002. — V. 45, № 6. — P. 1729- 1740.
  257. Scavia G. Similarity of Shiga Toxin-producing Escherichia coli 0104: H4 Strains from Italy and Germany / G. Scavia, S. Morabito, R. Tozzoli et al.//Emerg. Infect. Dis. 2011. — V. 17, № 10.-P. 1957−1958.
  258. Schikora A. Conservation of Salmonella Infection Mechanisms in Plants and Animals / A. Schikora, I. Virlogeux-Payant, E. Bueso et al. // PLoS ONE. 2011. — V 6, № 9. — e24112. doi: l0.1371/journal.pone.24 112.
  259. Shipp G. M. The Establishment of Enterobacteriaceae and Salmonella London in a New Dairy Farm Environment / G. M. Shipp, J. S. Dickson // Foodborne Pathogens and Disease. 2011. — V. 8, № 3. — P. 411 — 420.
  260. Shirron N. Active Suppression of Early Immune Response in Tobacco by the Human Pathogen Salmonella Typhimurium / N. Shirron, S. Yaron // PLoS ONE. 2011. — V 6, № 4. — el8855. doi:10.1371/journal.pone.18 855.
  261. Seghers D. Impact of agricultural practices on the Zea mays L. endophytic community / D. Seghers, L. Wittebolle, E. M. Top et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2004. — V. 70. — P. 1475 — 1482.
  262. Shao F. Cleavage of Arabidopsis PBS1 by a bacterial type III effector / F. Shao, C. Golstein, J. Ade et al. // Science. 2003. — 301. — P. 1230−1233.
  263. Shi X. Microbial population profiles of the microflora associated with pre- and postharvest tomatoes contaminated with Salmonella typhimurium or
  264. Salmonella Montevideo / X. Shi, Z. Wu, A. Namvar et al. // Journal of Applied Microbiology. 2009. — V. 107, № 1. — P. 329−338.
  265. Siddiqui I. A. Rhizobacteria mediated Induction of Systemic Resistance (ISR) in Tomato against Meloidogyne javanica / I. A. Siddiqui, S. S. Shaukat // Journal of Phytopathology. 2002. — V 150, № 8−9. — P. 469−473.
  266. Singh B. R. Pathogenic effects of Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhimurium on sprouting and growth of maize / B. R. Singh, R. Agarwal, M. Chandra // Indian Journal of Experimental Biology. 2004. — V 42, № 11.-P. 1100−1106.
  267. Sirrenberg A. Piriformospora indica affects plant growth by auxin production / A. Sirrenberg, C. Goebel, S. Grond et al. // Physiol. Plant. 2007. -V 131.-P. 581−589.
  268. S0rensen S. J. Studying plasmid horizontal transfer in situ: a critical review / S. J. S0rensen, M. Bailey, L. H. Hansen, N. Kroer // Nature Reviews Microbiology. 2005. — № 3. — P. 700−710.
  269. Spaepen S. Indole-3-acetic acid in microbial h microorganism-plant signaling / S. Spaepen, J. Vanderleyden, R. Remans // FEMS Microbiology Reviews. 2007. — V. 31, № 4. — P. 425 — 448
  270. Spoel S. H. How do plants achieve immunity? Defence without specialized immune cells / S. H. Spoel, X. Dong // Nature Reviews Immunology. -2012. V. 12.-P. 89- 100.
  271. Stavrinides J. Origin and Evolution of Phytopathogenic Bacteria / In Plant Pathogenic Bacteria: Genomics and Molecular Biology. Jackson R. W, Ed.- Caister Academic Press: Norfolk, UK, 2009. — 330 c.
  272. Steinert M. Mycobacterium avium Bacilli Grow Saprozoically in Coculture with Acanthamoeba polyphaga and Survive within Cyst Walls / M. Steinert, K. Birkness, E. White et al. // Appl. Environ. Microbiol. 1998. — V. 64, № 6.-P. 2256−2261.
  273. Sturz A. V. Endophytic bacterial communities in the periderm of potato tubers and their potential to improve resistance to soil-borne plant pathogens / A. V. Sturz, B. R. Christie, B. G. Matheson et al. // Plant Pathol. 1999. — V. 48. -P. 360−369.
  274. Taban M. B. Do leafy green vegetables and their ready-to-eat RTE. salads carry a risk of foodborne pathogens? / M. B. Taban, A. K. Halkman // Anaerobe. 2011. — V. 17, № 6. — P. 286 — 287.
  275. Taechowisan T. Secondary metabolites from endophytic Streptomyces aureofaciens CMUAcl30 and their antifungal activity / T. Taechowisan, L. U. Chunhua, Y. Shen, S. Lumyong 11 Microbiology. 2005. — V. 151. — P. 1691 -1695.
  276. Taghavi S. Genome survey and characterization of endophytic bacteria exhibiting a beneficial effect on growth and development of poplar trees / S. Taghavi, C. Garafola, S. Monchy et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2009. — V. 75.-P. 748−757.
  277. Taghavi S. Genome Sequence of the Plant Growth Promoting Endophytic Bacterium Enterobacter sp. 638 / S. Taghavi, D. van der Lelie, A. Hoffman et al. // PLoS Genetics. 2010. — V 6, № 5. — el000943. doi: 10.1371/journal.pgen. 1 000 943.
  278. Takahashi A. HSP90 interacts with RAR1 and SGT1 and is essential for RPS2- mediated disease resistance in Arabidopsis / A. Takahashi, C. Casais, K. Ichimura, K. Shirasu // PNAS. 2003. — V. 100. — P. 1 177 711 782.
  279. Takeuchi K. Quantitative determination of the role of lettuce leaf structures in protecting Escherichia coli 0157: H7 from chlorine disinfection / K. Takeuchi, J. F. Frank // J. Food Prot. 2001. — V. 64, № 2. — P. 147−151.
  280. Thaller M. C. Characterization and sequence of PhoC, the principal phosphate-irrepressible acid phosphatase of Morganella morganii / M. C. Thaller, F. Berlutti, S. Schippa et al. // Microbiology. 1994. — V. 140. — P. 1341−1350.
  281. Tanaka A. Reactive oxygen species play a role in regulating a fungus-perennial ryegrass mutualistic interaction / A. Tanaka, M. J. Christensen, D. Takemoto et al. // Plant Cell. 2006. — V 18. — P. 1052 — 1066.
  282. Thomma B. P. The complexity of disease signaling in Arabidopsis / B. P. Thomma, I. A. Penninckx, W. F. Broekaert, B. P. A. Cammue // Curr Opin Immunol.-2001.-V. 13.-P. 63−68.
  283. Thomma B. P. Plant defensins / B. P. Thomma, B. P. Cammue, K. Thevissen // Planta. 2002. — 216. — P. 193−202
  284. Todd E. C. Epidemiology of foodborne diseases: a worldwide review / E. C. Todd // World Health Stat Quarterly. 1997. — V. 50, № 1−2. — P. 30 — 50.
  285. Ton J. The Arabidopsis ISR1 locus is required for rhizobacteria-mediated induced systemic resistance against different pathogens / J. Ton, J. A. Van Pelt, L. C. Van Loon, C. M. J. Pieterse // Plant Biol. 2002. — № 4. — P. 224 -227.
  286. Troxler J. Conjugative Transfer of Chromosomal Genes between Fluorescent Pseudomonads in the Rhizosphere of Wheat / J. Troxler, P. Azelvandre, M. Zala et al. // Appl Environ Microbiol. 1997. — V. 63, № 1. — P. 213−219.
  287. Trujillo M. Ubiquitination in plant immunity / M. Trujillo, K. Shirasu // Current Opinion in Plant Biology. 2010. — V. 13. — P. 402−408.
  288. Tsolis R. M. Comparative genome analysis of the y-proteobacteria: Relationships between plant and animal pathogens and host specificity / R. M. Tsolis // PNAS. 2002. — V. 99, № 20. — P. 12 503−12 505.
  289. Tsuda K. Comparing signaling mechanisms engaged in pattern-triggered and effector-triggered immunity / K. Tsuda, F. Katagiri // Current Opinion in Plant Biology. 2010. — V 13. — P. 459−465.
  290. Tyler H. L. Plants as a Habitat for Beneficial and/or Human Pathogenic Bacterium / H. L. Tyler, E. W. Triplett // Annu. Rev. Phytopathol. 2008. — V. 46.-P. 53−73.
  291. Van den Broek D. The role of phenotypic variation in rhizosphere Pseudomonas bacteria / D. Van den Broek, G. V. Bloemberg, B. Lugtenberg // Environ. Microbiol. 2005. — V 7. — P. 1686−1697.
  292. Van der Ent S. Jasmonate signaling in plant interactions with resistance-inducing beneficial microbes / S. Van der Enta, S. C. M. Van Weesa, C. M. J. Pietersea // Phytochemistry. 2009. — V. 70, № 13. — P. 1581−1588.
  293. Van der Riet F. Diseases of plants transmissible between plants and man (Phytonoses) exist follow-up paper / F. Van der Riet // Medical Hypotheses. -2000.-V. 54, № 2.-P. 310−311.
  294. Van der Woude M. W. Phase and antigenic variation in bacteria / M. W. Van der Woude, A. J. Baumler // Clin. Microbiol. Rev. 2004. — V. 17. — P. 581 611.
  295. Van Elsas J. D. Microbial diversity determines the invasion of soil by a bacterial pathogen / J. D. Van Elsasa, M. Chiurazzia, C. A. Mallona et al. // PNAS. 2012. — V. 109, № 4. — P. l 159−1164.
  296. Van Loon L. C. Systemic resistance induced by rhizosphere bacteria / L. C. Van Loon, P. A. Bakker, C. M. J. Pieterse // Annu. Rev. Phytopathol. 1998. -V 36. — P.453−483.
  297. Van Loon L. C. Early responses of tobacco suspension cells to rhizobacterial elicitors of induced systemic resistance / L. C. Van Loon, P. A. Bakker, H. M. Van der Heijdt et al. // Mol. Plant-Microbe Interact. 2008. — V 21.-P. 1609−1621.
  298. Van Wees S. С. M. Plant immune responses triggered by beneficial microbes / S. С. M. Van Wees, S. Van der Ent, С. M. J. Pieterse // Curr. Opin. Plant Biol. 2008. — № 11. — P. 443−448.
  299. Venisse J.-S. Evidence for участие of an oxidative stress in the initiation infection of Pear by Erwinia amylovora / J.-S. Venisse, G. Gullner, M.-N. Brissel // Plant Physiology. 2001. — V. 125. — P. 2164 — 2172.
  300. Verhage A. Plant immunity: It’s the hormones talking, but what do they say? / A. Verhage, S. С. M. van Wees, С. M. J. Pieterse // Plant Physiol. 2010. -V. 154.-P. 536−540.
  301. Verhagen B. W. M. The transcriptome of rhizobacteriainduced systemic resistance in Arabidopsis / B. W. M. Verhagen, J. Glazebrook, T. Zhu et al. // Mol. Plant-Microbe Interact. 2004. — V. 17. — P. 895−908.
  302. Vierstra R. D. The ubiquitin/26S proteasome pathway, the complex last chapter in the life of many plant proteins / R. D. Vierstra // Trends in Plant Science. 2003. — № 8. — P. 135−142.
  303. Vinatzer B. A. The type III effector repertoire of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a and its role in survival and disease on host and nonhost plants / B. A. Vinatzer, G. M. Teitzel, M. W. Lee et al. // Mol. Microbiol.- 2006. V. 62. — P. 26−44.
  304. Vlot A. C. Salicylic acid, a multifaceted hormone to combat disease / A. C. Vlot, D. M. A. Dempsey // Annual review of of Phytopathology. 2009. — V. 47.-P. 177−206.
  305. Walker T. S. Pseudomonas aeruginosa-plant root interactions. Pathogenicity, biofilm formation, and root exudation / T. S. Walker, H. P. Bais, E. Deziel et al. // Plant Physiol. 2004. — V. 134. — P. 320−331.
  306. Wachtel M. R. Association of Escherichia coli 0157: H7 with preharvest leaf lettuce upon exposure to contaminated irrigation water / M. R. Wachtel, L. C. Whitehand, R. E. Mandrell // J. Food Prot. 2002. — V. 65. — P. 18−25.
  307. Warriner K. Internalization of bioluminescent Escherichia coli and Salmonella Montevideo in growing bean sprouts / K. Warriner, S. Spaniolas, M. Dickinson et al. // J. Appl. Microbiol. 2003. — V 95. — P. 719−727.
  308. Watanabe Y. Factory outbreak of Escherichia coli 0157: H7 infection in Japan / Y. Watanabe, K. Ozasa, J. H. Mermin et al. // Emerg. Infect. Dis. 1999.- V.5, № 3. P.424−428.
  309. Wells S. J. Fecal shedding of Salmonella spp. by dairy cows on farm and at cull cow markets / S. J. Wells, P. J. Fedorka-Cray, D. A. Dargatz et al. // J. Food Prot.-2001.-V. 64, № 1.-P.3−11.
  310. Werner S. Outbreak of Salmonella Stanley in Sweden associated with alfalfa sprouts, July-August 2007/ S. Werner, K. Boman, I. Einemo et al. // Euro. Surveill. -2007. № 12.-P. 3291.
  311. Whitham S. The product of the tobacco mosaic virus resistance gene N: similarity to toll and the interleukin-1 receptor / S. Whitham, S. P. Dinesh-Kumar, D. Choi et al. // Cell. 1994. — V 78. — P. 1101−1115.
  312. Whipps J. M. Microbial interactions and biocontrol in the rhizosphere / J. M. Whipps // Journal of Experimental Botany. 2001. — V. 52. — P. 487−511.
  313. Wisniewski-Dye F. Phase and antigenic variation mediated by genome modifications / F. Wisniewski-Dye, L. Vial // Anton. Leeuw. Int. J. G. 2008. -V. 94.-P. 493−515.
  314. Yang D. Multiple roles of antimicrobial defensins, cathelicidins, and eosinophil-derived neurotoxin in host defense / D. Yang, A. Biragyn, D. M. Hoover, J. Lubkowski, J. J. Oppenheim // Annu. Rev. Immunol. 2004. — V. 22. -P. 181−215.
  315. Yoo J. S. Molecular cloning and characterization of CMCase gene (celC) from Salmonella typhimurium UR. / J. S. Yoo, Y. J. Jung, S. Y. Chung et al. // J. Microbiol. 2004. — V. 42, № 3. — P. 205−210.
  316. Zamioudis C. Modulation of Host Immunity by Beneficial Microbes / C. Zamioudis, C. M. J. Pieterse // MPMI. 2012. — V. 25, № 2. — P. 139−150.
  317. Zhang H. The role of G-proteins in plant immunity / H. Zhang, Z. Gao, X. Zheng, Z. Zhang // Plant Signaling & Behavior. 2012. — V.7, № 10. — P. 1284−1288.
  318. Zhang W. The plant innate immunity response in stomatal guard cells invokes G-protein-dependent ion channel regulation / W. Zhang, S. Y. He, S. M. Assmann // Plant J. 2008. — V. 56, № 6. — P. 984−996.
  319. Zeier J. Genetic elucidation of nitric oxide signaling in incompatible plant-pathogen interactions / J. Zeier, M. Delledonne, T. Mishina et al. // Plant Physiology. 2004. — V. 136. — P. 2875−2886.i)
  320. Ziennel D. K. Isolation and Characterization of Endophytic Colonizing Bacteria from Agronomic Crops and Prairie Plants / D. K. Zinniel, P. Lambrecht, N. B. Harris et al. // Applied And Environmental Microbiology. -2002. V. 68, № 5. — P. 2198−2208.
  321. Zhuang R.Y. Fate of Salmonella montevideo on and in raw tomatoes as affected by temperature and treatment with chlorine / R. Y. Zhuang, L. R. Beuchat, F. J. Angulo // Appl. Environ. Microbiol. 1995. — V. 61, № 6. -P.2127−2131.
Заполнить форму текущей работой

Заказал и сдал!