Генетическая гетерогенность популяций кур, определяемая ДНК-фингерпринтингом и RAPD-анализом
Домашняя курица давно является привлекательным генетическим объектом, однако организация генома кур исследована пока недостаточно. Особенно следует отметить, что практически отсутствуют сведения о генетических особенностях малочисленных пород и экспериментальных популяций. Такая ситуация зачастую приводит к тому, что генетическое разнообразие в этих популяциях оказывается далеко не оптимальным… Читать ещё >
Содержание
- ВВЕДЕНИЕ
- ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 1. 1. Некоторые особенности структуры ДНК животных и птиц
- 1. 2. Полиморфные ДНК-маркеры
- 1. 2. 1. Полиморфизм длин рестриктныъх фрагментов
- 1. 2. 2. Мини — и микросателлиты. ДНК-фингерпринтинг
- 1. 2. 3. Зонды, используемые в ДНК-фингерпринтинге животных и птиц
- 1. 2. 4. ДНК-фингерпринтинг в изучении популяций
- 1. 3. Полимеразная цепная реакция со случайными праймерами (RAPD-PCR)
- 1. 3. 1. Методические особенности RAPD-PCR
- 1. 3. 2. Использование RAPD-PCR для изучения популяций животных и птиц
- 1. 4. Другие полиморфные маркеры
- ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
- 2. 1. Объект исследования
- 4. 2. 2. Выделение ДНК
- 2. 3. ДНК-фингерпринтинг
- 2. 3. 1. Рестрикция образцов ДНК
- 2. 3. 2. Электрофорез гидролизованных фрагментов ДНК
- 2. 3. 3. Перенос ДНК с агарозного геля на фильтр
- 2. 3. 4. Прегибридизация и гибридизация ДНК
- 2. 3. 5. Детекция дезоксигенина на фильтрах
- 2. 4. Полимеразная цепная реакция со случайными прайм ерами
- 2. 5. Обработка результатов исследования
- ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
- 3. 1. Анализ полиморфизма ДНК у различных пород кур с помощью случайных праймеров
- 3. 2. Анализ геномного полиморфизма в линиях кур экспериментальной популяции Русская белоснежная с помощью случайных праймеров
- 3. 3. Анализ полиморфизма ДНК кур на основе использования фингерпринтинга. ф
- 3. 4. Анализ результатов переноса амплифицированных ДНКфрагментов на фильтр
- ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
- ВЫВОДЫ
- ПРЕДЛОЖЕНИЯ ПРОИЗВОДСТВУ
Генетическая гетерогенность популяций кур, определяемая ДНК-фингерпринтингом и RAPD-анализом (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
Актуальность темы
Домашняя курица давно является привлекательным генетическим объектом, однако организация генома кур исследована пока недостаточно. Особенно следует отметить, что практически отсутствуют сведения о генетических особенностях малочисленных пород и экспериментальных популяций. Такая ситуация зачастую приводит к тому, что генетическое разнообразие в этих популяциях оказывается далеко не оптимальным. Слишком низкая вариабельность может вызвать повышение коэффициента инбридинга, вследствие чего возникает инбредная депрессия. Высокий уровень генетического разнообразия в популяции может привести к потере уникальных свойств или признаков, характерных для этой популяции. Селекция в таких группах птицы не дает ожидаемого эффекта. Поэтому контроль генетического разнообразия является существенным фактором в селекции.
В значительной мере решить проблему изучения генома домашней курицы позволяют методы, основанные на анализе полиморфизма ДНК. К ним, в частности, относятся полимеразная цепная реакция со случайными праймерами и мультилокусный ДНК-фингерпринтинг. Совместное использование этих методов особенно перспективно, поскольку позволяет сочетать их достоинства и сводить к минимуму недостатки.
Цель и задачи исследований. Основной целью нашей работы является оценка генетического разнообразия в породах и экспериментальных популяциях кур с помощью полиморфных ДНК-маркеров.
В конкретные задачи работы входило:
• провести подбор оптимальных праймеров, способных выявлять при помощи полимеразной цепной реакции (RAPD-PCR) различия по полиморфизму между породами и экспериментальными популяциями кур;
• определить возможность использования RAPD-PCR для обнаружения различий между линиями кур;
• выявить возможности молекулярного зонда (ГТГ)5 для обнаружения маркерных рестрикционных фрагментов ДНК у кур отдельных пород и экспериментальных популяций;
• сравнить значения основных генетических параметров, полученные с помощью RAPD-PCR и с помощью фингерпринтинга;
• определить наличие (ГТГ) — повторов в структуре ДНК-фрагментов, синтезирующихся в ходе RAPD-PCR.
Научная новизна. Впервые с помощью полимеразной цепной реакции со случайными праймерами обнаружены последовательности ДНК, характерные для кур, подвергшихся селекции к пониженным температурам и неоплазмам.
Проведен сравнительный анализ генетических параметров, рассчитанных на основе ДНК-фингерпринтинга и RAPD-PCR в ряде пород и экспериментальных популяциях кур. Показан высокий уровень сходства между курами популяции Русская белоснежная и курами породы Белый леггорн (BS=0,91), а так же между курами экспериментальной популяции Русская белоснежная и курами породы Русская белая (BS=0,92).
Показано, что в ходе полимеразной цепной реакции со случайными праймерами амплифицируются нуютеотидные повторы (ГТГ)5.
Сравнительный анализ генетических параметров, рассчитанных на основе использования ДНК-фингерпринтинга и RAPD-PCR, в ряде пород и экспериментальных популяциях кур показал их полное совпадение. Отмечено существенное повышение достоверности показателей при одновременном использовании двух методов.
Теоретическая и практическая значимость работы. Показано, что в геноме кур могут быть выявлены последовательности ДНК, характерные для популяций, подвергшихся направленному отбору. Результаты исследований свидетельствуют об эффективности использования RAPD-PCR анализа для поиска маркерных нуклеотидных последовательностей для пород и отдельных популяций птиц. Совместное использование RAPD-PCR и ДНК-фингерпринтинга можно рекомендовать для контроля над генетическими процессами в популяциях малочисленных пород, а так же в популяциях, селектируемых на определенные признаки.
Апробация работы. Основные положения диссертационной работы представлены в материалах 3-ей Международной конференции «Молекулярно-генетические маркеры животных» (Киев, 1999), 2-ой Международной научной конференции «Биотехнология сельскохозяйственных животных» (Подольск, 2002), а так же докладывались и получили положительную оценку на аспирантских сессиях и отчетах лаборатории.
Положения, выносимые на защиту: возможность и степень обнаружения различий между породами и популяциями кур, выявленные с помощью RAPD-PCRразличия между линиями кур, выявленные с помощью RAPD-PCR, сопоставление основных генетических параметров, рассчитанных на основе RAPD-PCR и методом ДНК-фингерпринтингаособенности структуры фрагментов ДНК, получаемых в ходе нолимеразной цепной реакции со случайными праймерами.
ВЫВОДЫ.
1. При помощи RAPD-анализа у кур экспериментальной популяции Русская белоснежная (порода Русская белая), селектируемой в нескольких поколениях на резистентность к низким температурам и неоплазмам, обнаружен маркерный фрагмент ДНК размером 950 пн. Отмечена разница в частотах встречаемости ряда фрагментов ДНК у кур 10 и 16 линий этой популяции, различающихся по селекционируемым признакам. Наблюдается так же низкий коэффициент сходства между этими линиями (BS=0,86).
2. Методом ДНК-фингерпринтинга выявлен маркерный фрагмент ДНК размером 24 000 пн у кур экспериментальной популяции «Аврора», селектируемой в нескольких поколениях на высокий уровень потенциальных резервов надпочечников.
3. Методом RAPD-PCR показан высокий уровень сходства между курами популяции Русская белоснежная и курами породы Белый леггорн (BS=0,91), а так же между курами экспериментальной популяции Русская белоснежная и курами породы Русская белая (BS=0,92).
4. Куры Андалузской голубой породы и экспериментальной популяции «Аврора» по данным RAPD-анализа генетически наиболее удалены друг от друга (BS=0,82), несмотря на то, что обладают схожей голубой окраской оперения.
5. Наиболее высокое внутрипопуляционное генетическое разнообразие, рассчитанное по данным RAPD-анализа, установлено у кур породы Полосатый плимутрок (HR=0,122). Наименьшее геннетическое разнообразие отмечено у кур экспериментальной популяции Русская белоснежная (HR=0,050).
6. Большинство фрагментов ДНК, амплифицирующихся в ходе RAPD-PCR, содержат повторяющийся элемент (ГТГ).
7. Основные генетические параметры, рассчитанные на основе RAPD-анализа, подтверждают результаты, получаемые с помощью геномного фингерпринтинга. Поэтому особенно перспективным представляется совместное использование двух этих методов.
ПРЕДЛОЖЕНИЯ ПРОИЗВОДСТВУ.
Рекомендуется использовать технологию ДНК-фингерпринтинга в сочетании с RAPD-анализом в программах по разведению и сохранению пород кур. С помощью этих методов можно следить за генетическим разнообразием в популяциях, что позволит предотвратить инбридинг.
Список литературы
- Айала Ф., Кайгер Дж. Современная генетика.-М :Мир, 1988.-335с.
- Алтухов Ю.П. Внутривидовое генетическое разнообразие: мониторинг и принципы сохранения // Генетика.-1995.-Т.31.-С.1333−1357
- Алтухов Ю.П., Корочкин Л. И., Рычков Ю. Г. Наследственное биохимическое разнообразие в процессах эволюции и индивидуального развития // Генетика.-1996.-Т.32.-С. 1450−1473
- Алтухов Ю.П., Сальменкова Е. А. Полиморфизм ДНК в популяционной генетике // Генетика.-2002.-Т.38.-С.
- Банникова А.А., Матвеев В. А. Крамеров Д.А. Опыт использования HHTep-SINE-ПЦР в изучении филогенеза млекопитающих. II Генетика,-2002.-Т.38.-С. 853−864.
- Босак Н.П., Колесник О. В., Смарагдов М. Г., Смирнов А. Ф. Использование полиморфных минисателлитных и RAPD-маркеров у кур // Селекционно-генетические методы повышения продуктивности сельхозживотных: Сб. науч. тр. / ВНИИГРЖ.-С-Пб.,-1999.-С.243−246.
- Булат С.А., Мироненко Н. В. Идентификация грибов и анализ их генетической изменчивости методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с геноспецифичными и неспецифичными праймерами // Генетика.-1996.-Т.32.-С.165−183.
- Васильев В.А., Стекленев Е. П., Морозова Е. В., Семенова С. К. ДНК-фингерпринтинг представителей отдельных видов, межродовых и межвидовых гибридов родов Bos и Bison подсемейства Bovinae // Генетика. -2002.-Т.4.-С.515−520.
- Гинатулин А. А. Структура, организация и эволюция генома позвоночных.-М. .Наука, 1984.-294 с.
- Ю.Глазко В. И., Дунин И. М., Глазко Г. В., Калашникова JI.A. Введение в ДНК-технологии, — М: ФГНУ Росинформагротех, 2001.-436с.
- Глазко В.И. Проблемы использования ДНК-технологий у животных // С.-х. биология. -1998а.-№ 4.-С.33−42.
- Глазко В.И., Зеленая Л. Б. Дифференциация домашней лошади и лошади Пржевальского по различным последовательностям ДНК // Генетика.-1998 В.-Т.34.-С.996−999.
- Горбачева Н. Сохранить генофонд кур // Птицеводство.-1991 .-Т.11 -С.6−8
- Горбачева Н. Породы кур и их содержание в приусадебном хозяйстве.-М: Изд-во «Искусство и мода», 1993.-143с.
- Гречко В.В. Молекулярные маркеры ДНК в изучении филогении и систематики // Генетика.-2002.-Т.38.-С.1013−1033.
- Далмацио С., Каммарата М., Каррильо Д. и др. Молекулярные характеристики вариабельной тандемно повторяющейся последовательности, выявленной в ходе RAPD-анализа островной иприбрежной популяции Posidonia oceanica // Генетика.-2002.-Т.38,-С.820−827.
- П.Дементьева Н. В. Оценка полиморфизма минисателлитных ДНК у коров, кур и осетровых рыб: Автореф. дис.канд. биол. наук.-СПб-Пушкин, 1996.-14с.
- Дмитриев В.Б. Гормональный фактор в микроэволюционном процессе и селекции животных// С.-х. биология.-2001.-Т.2.-С.18−30
- Дмитриев В.Б., Чуркина И. В., Смирнов А. Ф., Николаева Е. К. Дестабилизирующий эффект отбора кур по функциональным резервам надпочечников. // Генетика.-2001.-Т.37.-С.517−523.
- Долматова И.Ю., Саитбаталов Т. Ф., Гареев Ф.Т. RAPD-анализ генетического полиморфизма уток. Межпородные различия // Генетика.-2000.-Т.36.-С.682−687.
- Долматова И.Ю., Саитбаталов Т. Ф., Гареев Ф.Т. RAPD-анализ генетического полиморфизма уток. Межлинейные различия пекинской породы // Генетика.-2000.-Т.36.-С.805−812.
- Захаров Е.В. Доказательство естественной гибридизации двух видов парусников методом RAPD-PCR // Генетика.-2001.-Т.37.-С.475−484.23.3авертяев Б. П. Краткий словарь селекционно-генетических терминов в животноводстве.-М.: Россельхозиздат, 1983.-108 с.
- Иванов П.Л., Гуртовая С. В., Плаксин В. О. и др. Геномная «дактилоскопия» с использованием в качестве зонда бактериофага М13экспертиза вещественных доказательств и идентификация личности) // Суд. мед. эксп.-1989.-Т.4.-С.39−42
- Игнатов А.Н., Кугуники Я., Супрунова Т. П. и др. RAPD-маркеры, сцепленные с локусом устойчивости к расе 4 возбудителя сосудистого бактериоза у Brassika rapa L // Генетика.-2000.-Т.36.-С.357−360.
- Инге-Вечтомов С. Г. Генетика с основами селекции.-М.: Высшая школа, 1989.-591 с.
- Колесник О.В., Смарагдов М. Г., Босак Н. П., Николаева Е. К., Дмитриев В. Б., Смирнов А. Ф. Использование RAPD-маркеров для оценки дивергенции геномов у кур при разнонаправленной селекции // Сборник научных трудов ВНИИГРЖ.-2001.-С.173−176
- Конарев А.В. Использование молекулярныъх маркеров в работе с генетическими ресурсами растений // С.-х. биология.-1998.-Т.5.-С.3−24.
- Костюченко М.В., Удина ИМ.Г., Зайцев A.M., Храброва J1.A. и др. Днк-технологии для оценки генетического разнообразия пород лошадей отечественной селекции// С.-х. биология.2001.-№ 6.-С.29−34.
- Кочиева Е.З., Рыжова Н. Н., Храпалова И. А., Пухалъский В. А. Использование метода RAPD-анализа в определении генетического полиморфизма и филогенетических связей у представителей рода Lycopersicon (Tourn.) Mill. // Генетика.-2002.-Т.38.-С. 1298−1303.
- Кривенко А.А., Филипенко M.J1., Адаричев В. А. и др. Анализ косегрегации полиморфных ДНК-маркеров с величиной артериальногодавления у крыс гипертензивной линии НИСАГ // Генетика.-1999.-Т.35.-С.164−169.
- Куликова И.В., Челомина Г. Н., Журавлев Ю.Н. RAPD-PCR анализ генетического разнообразия маньчжурского фазаана // Генетика.-2002, — ^ Т.38.-С.836−841.
- Мартиросян И.А., Рысков А. П., Петросян В. Г., Аракелян М. С. и др. Изменчивость мини- и микросателлитных маркеров ДНК в популяциях партеногенетической скальной ящерицы Darevskia rostombekovi. // Генетика.-2002.-Т.38.-С. 828−835.
- Мартиросян И.А., Кан Н.Г., Петросян В. Г., Малышева Д. Н. и др. Фингерпринтный анализ выриабельности мини- и микросателлитных повторов ДНК у партеногенетических ящериц Darevskia armeniakai. // Генетика.-2003.-Т. 39.-С.215−222.
- Мельникова М.Н., Гречко В. В., Медников Б. М. Исследование полиморфизма и дивергенции геномной ДНК на видовом и популяционном уровнях (на примере ДНК пород домашних овец и диких баранов) // Генетика.-1995.-Т.31.-С.1180−1131.
- Моисеева И.Г., Банникова JI.B., Алтухов Ю. П. Состояние птицеводства в России: генетический мониторинг // Междунар. С.-х. журн.-1993.-Т.5−6.-С.66−69
- Моисеева И.Г. Генетические ресурсы куроводства в России Птицеводство.-1995.-Т. 5.-С. 12−15
- Моисеева И.Г. и Лисичкина М.Г. Происхождение и эволюция домашних кур // Природа.-1996.-Т.5.-С.88−96
- Моисеева И.Г., Лисичкина М. Г., Никифоров А. А. История куроводства в России // Природа.-1997а.-Т. 1 .-С.71 -80
- Моисеева И.Г. и Лисичкина М.Г. Домашние куры: мифология, традиции, обычаи, народное творчество // Друг.-1997 В.-Т. 1 -С.22−25
- Морозова Е.В., Рысков А. П., Семенова С.К. RAPD-изменчивость двух видов трематод из популяции крупного рогатого скота. // Генетика,-2002.-Т.38.-С.1155−1162.
- Никифоров А.А., Моисеева И. Г., Захаров И. А. Место русских пород кур в разнообразии пород Евразии // Генетика.-1998.-Т.34.-С.850−851
- Петросян В.Г., Токарская О. Н., Кашенцева Т. А., Корочкина Л. И. и др. Оценка подразделенности популяций на основе данных ДНК-фингерпринтинга и модифицированной Fgt-статистики Райта. // Генетика.-2003.-Т.39.-С.229−235.
- Петухов В.Л., Эрнст Л. К., Гудилин И. И. и др. Генетические основы селекции животных.-М.:Агропромиздат, 1989.-273с.
- Потапов С.Г., Токарская О. Н., Семенова С. К., Данилкин А. А., Марков Г. Г., Рысков А. П. Диагностические возможности мультилокусных маркеров ДНК в систематике диких копытных животных (Artiodactyla) // Генетика.-1997.-Т.33.-С.961−966
- Рысков А.П. Мультилокусный ДНК-фингерпринтинг в генетико-популяционных исследованиях биоразнообразия // Молекулярная биология. 1999.-Т.ЗЗ.-С.997−1011.
- Рудых И.А., Гречко В. В., Чобану Д. Г. и др. Вариабельность сайтов рестрикции сателлитной ДНК как молекулярная основа метода таксонопринта (на примере скальной ящерицы Кавказа) // Генетика. -2002.-Т.38.-С.1110−1114.
- Рябинина H.JI., Гречко В. В., Даревский И. С. Полиморфизм ДНК популяций ящериц семейства Lacertidae, определяемый методом RAPD // Генетика.-1998.-Т.34.-С. 1661−1667.
- Сайки А. Анализ генома. М.- Мир. 1992.
- Сахарова С.А. Совершенствование методов сохранения генофонда малочисленных пород кур в условиях коллекционария «Канд. дисс., СПб-Пушкин.-1992.-124с.
- Семёнова С.К., Филенко А. Л., Васильев В. А., Просняк М. И., Севастьянов А. А., Рысков А. П. Использование полиморфных маркеров ДНК для идентификации пород кур различного происхождения П Генетика.-1996.-Т.32.-С.795−803.
- Семенова С.К., Илларионова Н. А., Васильев В. А. и др. Генетический анализ и оценка генетического разнообразия восточноевропейских пород борзых собак (Canis familiaris L.) по данным RAPD-маркирования генома // Генетика.-2002а.-Т.38.-С.842−852.
- Семенова С.К., Моисеева И. Г., Васильев В. А. и др. Генетический полиморфизм русских, европейских и азиатских пород кур, выявляемыйс помощью ДНК и белковых маркеров // Генетика.-2002 В.-Т.38.-С.1304−1308.
- Серебровский А.С. Генетика кур.
- Сиволап Ю.М., Календарь Р. Н., Чеботарь С. В. Исследование генетического полиморфизма злаковых растений при помощи ПЦР с произвольными праймерами // Цитология и генетика.-1994.-Т.28.-С.54−61.
- Сидоренко А.П., Березовская О. П., Созинов А. А. Оценка генетического полиморфизма в популяции колорадского жука по RAPD-маркерам // Генетика.-2000.-Т.36.-С.651−656.
- Соколова А.Н. Генетико-селекционные методы создания популяции кур с повышенной устойчивостью к неоплазмам: Автореф. дис.докт. с.-х. наук.-СПб-Пушкин, 1999.-56с.
- Сулимова Г. Е., Удина И. Г., Шайхаев Г. О., Захаров И. А. Полиморфизм ДНК в гене BoLA-DRB3 у крупного рогатого скота в связи с устойчивостью и чувствительностью к лейкозу // Генетика.-1995.-Т.31 .-С.1294−1299
- Сулимова Г. Е. ДНК-маркеры в оценке молочной продуктивности и резистентности крупного рогатого скота // Материалы III Международной конференции «Актуальные проблемы биологии в животноводстве». -Боровск.-2000.-С.29
- Суходолец Популяционные волны как условие для повышения экологической устойчивости организмов в процессе вертикальной эволюции // Генетика.-2002.-Т.38.-С.881−893.
- Терлецкий В.П. Молекулярно-генетические методы анализа генетической изменчивости в популяциях животных // Международный Аграрный Журнал, — 1998.-Т.4.-С.38−40.
- Токарская О.Н., Зуев А. В., Сорокин Ф. Г. и др. Геномная дактилоскопия журавлей: новый подход для генотипирования видов // Генетика,-1990,-Т.26.-С.599−606
- Тыщенко В.И. Анализ генетического разнообразия в породах и экспериментальных популяциях кур методом ДНК-фингерпринтинга. Дис.канд. биол. наук. Санкт-Петербург.-2002.
- Тыщенко В.И., Дементьева Н. В., Терлецкий В. П. и др. Оценка генетического разнообразия кур на основе геномной дактилоскопии // С.-х. биология.-2002.-№ 6.-С.43−47.
- Удина И.Г., Туркова С. О., Костюченко М. В., Лебедева JI.A., Сулимова Г. Е. Полиморфизм гена пролактина (микросателлиты, ПЦР-ПДРФ) у крупного рогатого скота // Генетика.-2001.-Т.37.-С.511−516
- Фёдоров А.Н., Гречко В. В., Слобянюк СЛ., Фёдорова JI.B., Тимохина Г. И. Таксономический анализ повторяющихся последовательностей ДНК // Мол. Биол.-1992.-Т.26.-С.464−469
- Челомина Г. Н., Спиридонова JI.H., Козыренко М. М. и др. Использование ПП-ПЦР анализа клеточной ДНК для оценки генетического полиморфизма и подвидовой диагностики дальневосточного леопарда. // Генетика.-1999.-Т.35.-С.681−687.
- Чуркина И.В. Полиморфизм ТГ-обогащенной микросателлитной ДНК домашней курицы (Gallus domesticus): Диссертация.канд. биол. наук, СПб-Пушкин, 1999а.-137с.
- Шаброва Е.В., Тарская Л. А., Микулич А. И., Аболмасов Н И. и др. Дифференциация близкородственных и отдаленных популяций человека на основе данных мультилокусного ДНК-фингерпринтинга. // Генетика.-2003.-Т.39.-С.236−243.
- Щинов М.Ю. и Букаров Н.Г. Молекулярно-генетические аспекты выявления QTL маркеров на 6 хромосоме крупного рогатого скота // Материалы III Международной конференции «Актуальные проблемы биологии в животноводстве». -Боровск.-2000.-С.29
- Эрнст Л.К., Дмитриев Н. Г., Паронян И. А. и др. Генетические ресурсы сельскохозяйственных животных в России и сопредельных странах.-СПб.: ФАО/ЮНЕП и РАСХН, 1994.-472
- Botstein D., White R.L., Skolnick M. et al. Construkction off genetic map m using restriction fragment polymorphism // Am. J. Hum. Genet.-1980.-V.32,-P.314−331.
- Bruford M.W., Burke T. Hypervariable DNA markers and their applications in the chicken// In: DNA fingerprinting approaches and applications.-Basel, 1991,-Birkhouser Verlag.- P.230−240
- Bednarczyk M., Siwek M., Vazanowski A., Czekalski P. DNA polymorphism in various goose by RAPD-PCR // Theor. Appl. Genetics.-2002.-V.5.-P.234−237.
- Carlson J.E., Tulsieram L.K., Glaubitz J.C. et al. Segregation of random amplified DNA markers in F1 progeny of conifers // Theor. Appl. Genetics. -1991.-V.83.-P. 194−200.
- Cepica S., Wolf J., Hojny J., Vackova I., Schroffel J Jr. Relations between genetic distance of parental pig breeds and heterozygosity of their F1 crosses measured by genetic markers // Anim. Genet.-1995.-V.26.-P. 135−140
- Caetano-Anolles G., Bassam B.J., Gresshoff P.M. DNA amplification fingerprinting using very short arbitrary oligonucleotide primers // Bio Technology.-199 l.-V.9.-P. 553−557.
- Ellegren H., Chowdhary В., Johansson M. et al. A primary linkage map of the porcine genome reveals a low rate of genetic recombination // Genetics.-1994.-V.137.-P.1089
- Fang D.Q., Roose M.L. Identification of closely related citrus cultivars with inter-simple sequense repeats markers // Theor. Appl. Genet.-1997.-V.95,-P.408−417.
- Gavora J.S., Fairfull R.W., Benkel B.F. DNA fingerprints as predictors of heterosis //Proceedings 42nd National breeders Rountable, St.Louis.-1993,-P.62−76
- Gavora J.S., Fairfull R.W., Benkel B.F., Cantwell W.J., Chambers J.R. Prediction of heterosis from DNA fingerprints in chickens // Genetics.-1996,-V. 144.-P.777−784
- Gillet E.M. GSED Genetic Structures from Electroforesis Date. User’s Manual. Version 1.0, Gottingen, 1994. 49 p.
- Gregorius H.-R. A diversity-independent measure of evenness // Amer. Natur.-1990.-V.136.-P.701−711.
- Goldstein D.B., Linares A.R., Cavelli-Sforsa L.L. An evaluation of genetic distanses for use with mikrosatellite loci // Genetics.-1995.-V.139.-P.463−471.
- Howlet R. DNA forensics and the FBI (news) //Nature.-1989.-V.341.-P.182−183.
- Haberfeld A., Dunnington E.A., Siegel P.B., Hillel J. Heterosis and DNA fingerprinting in chickens II Poultry Science.- 1996.-V.75.-P.951 -953
- Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Hypervariable minisatellite region in human DNA // Nature.-1985a.-V.314.-P.67−73
- Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Individual-specific «fingerprints» of human DNA // Nature.-1985b.-V.316.-P.76−78
- Jin L., Chakraborty R. Estimation of genetic distance and coefficient of gene diversity from single-probe multilocus DNA fingerprinting data // Mol. Biol. Evol.-1994.-V. 11.-P. 120−127
- Jones C.J., Edwards K.J., Castiglione S. et al. Reproducibility testing of RAPD, AFLP and SSR markers in plants by a network of European laboratories // Mol. Breeding.-1997
- Kashi Y., Lipkin E., Darvasi A., Nave A., Gruenbaum Y., Beckmann J. S., Soller M. Parentage identification in the bovine using DNA fingerprints // Dairy Sci.-1990.-V.73.-P.3306−3311
- Khandka D.K., Tuna M., Tal M., Nejidat A., Golan-Goldhirsh A. Variability in the pattern of random amplified polymorphic DNA // Electrophoresis.-1997.-V.18.-P.2852−2856
- Kuhnlein U., Dawe Y., Zadvorny D., Gavora J.S. DNA fingerprinting: a tool for determining genetic distances between strains of poultry // Theor. Appl. Genet.-1989.-V.77.-P.669−672
- Kuhnlein U., Zadvorny D., Gavora J.S. Faithful identification of markers associated with quantitative trait loci in chickens by DNA fingerprinting // In: DNA fingerprinting approaches and applications.-Basel, 1991,-Birkhouser Verlag.- P.274−282
- Lagoda P. J. L, Seitz G., Epplen L.T. et al. Increased detectability of somatic chenges in the DNA from homan tumors after probing with «synthetic» and genome-derived hypervariable multilocus probes // Human Genetics.-1989.-V.84.-P. 35−40.
- Levin I., Crittenden L.B., Dodgson J.B. Mapping DNA polymorphisms using PCR primers derived from the sequence of an avian CRI element // J.Heredity.-1994b.-V.85.-P.73−78.
- Lynch M., Milligan B.G. Analysis of population structure with RAPD markers //Mol. Ecjl.-1994.-V.3.-P.91−99.
- Lynch M. Analysis of population genetic structure by DNA fingerprinting // In: «DNA fingerprinting: approaches and applications"-Basel, 1991-Birkhauser Verlag.-P. 113−126
- Mathur P.K., Ponsuksili S., Groen A.F., Horst P. Estimation of genetic variability within and between populations using DNA fingerprints !! Proceedings 5th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production.-Guelph.-l 994.-P.528−531
- Meng A., Gong G., Chen D., Zhang H., Qi S., Tang H., Gao Z. DNA fingerprint variability within and among parental lines and its correlation with performance of F-l laying hens // Theor. Appl. Genetics.-1996.-V.92,-P.769−776
- Nakamura Y., Leppert M., O’Connel P. Variable number of tandem repeat (VNTR) markers for human gene mapping // Science.-1987.-V.135,-P.1616−1622
- Okada N., Hamada M., Ogiwara I., Ohshima K. SINEs and LINEs share common 3' sequences: a review // Gene.- 1997.-V.205.-P.229−243
- Plotsky Y., Kaiser M. G., Lamont S.J. Genetic characterization of highly inbred chicken lines by two DNA methods: DNA fingerprinting and polymerase chain reaction using arbitrary primers //
- Ponsuksili S., Wimmers K., Horst. Evaluation of variation within and between different chicken lines by DNA fingerprinting // Journal of heredity.-1998.-V.89.-P. 17−23.
- Rogstad S.H., Pelican S. GELSTATS: a computer program for population genetics analysis using VNTR multilocus probe data // BioTechniques.-1996.-V.-21.-P.1128−1131
- Sharma D., Appa Rao K.B., Singh R.V., Totey S.M. Genetic diversity among chicken breeds estimated through randomly amplified polymorphic DNA// Anim. Biotechnol.-2001.-V.2.-P.l 11−120
- Singh R.V., Sharma D. Within- and betweenstrain genetic variability in White Leghorn population detected through RAPD markers // Br Poult. Sci-V.43.-P.33−37.
- Smith E.J., Jones C.P., Bartlett J., Nestor K.E. Use of randomly amplified polymorfic DNA markers for the genetic analysis of relatednes and diversity in chickens and turkeys // Poult. Sci.-1996.-V.75.-P.579−584
- Sreekumar G.P., Smyth J.R.Jr., Ponce de Leon F.A. Molecular characterization of the Smyth chicken sublines and their parental controls by RFLP and DNA fingerprint analysis // Poult.Sci.-2000.-V.l .-P. 1−5
- Stephens J.C., Gilbert D.A., Yuhki N., O’Brien S.J. Estimation of heterozygosity for single-probe multilocus DNA fingerprints // Mol. Biol. Evol.-1992.-V.9.-P.729−743
- Tautz D. Hypervariability of simple sequense as a general sourse for polymorfic DNA markers // Nucl. Acids Res.-1989.-V.17.-P.6463−6471.
- Washio K., Misawa S., Ueda S. Probe walking: development of novel probes for DNA fingerprinting // Hum. Genet.-1989.-V.83.-P.223−226.
- Wei R., Dentine M.R., Bitgood JJ. Random ampliefied polymorphic DNA markers in crosses between inbred lines of Rhode Island red and White Leghorn chikens // Anim. Genet.-1997.-V.28.-P.291−294.
- Wells R.A., Wonke В., Thein S. L/ Prediction of consanguinity using human DNA fingerprints // J. of Mtd. Genet.-1988.-V.25.-P.660−662.
- Welsh J. and McCleland G.M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers // Nucl. Acids Res.-1990.-V.18.-P.7213−7218
- Williams J.G.K., Kubelik A.R., Livak K.J., Rafalski J.A., Tingey S.V. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers //Nucl. AcidRes.-1990.-V.18.-P.6531−6535
- Wu K.-S., Jones R., Danneberger L. et al. Detection of microsatellite polymorphism without cloning // Nukl. Acids Res.-1994.-V.22.-P.3257−3258.
- Yeh F.C., Yang R.-C., Boyle T. PORGENE. Quick User Guide. version 1.0., 1997.1−27.
- Ye X., Zhu J., Velleman S.G., Nestor K.E. Genetic diversity of commercial turkey primary breeding lines as estimated by DNA fingerprinting // Poult. Sci.-1998a.-V.77.-P.802−807
- Ye X., Zhu J., Velleman S.G., Bacon W.L., Nestor K.E. Measurement of genetic variation within and between Japanese quail lines using DNA fingerprinting // Poult. Sci.-1998b.-V.77.-P.1755−1758
- Zhu J., Nestor K.E., Moritsu Y. Relationship between band sharing levels of DNA fingerprints and inbreeding coefficients and estimation of true inbreeding in turkey lines // Poult. Sci.-1996.-V.75.-P.25−28
- Zhivotovsky L. A., Feldman M.W. Microsatellite variability and genetic distance//Proc. Natl. Acad. Sci.-1995.-V.92.-P.l 1549−11 552.
- Zhang X., McDaniel G.R., Gismbrone J.J. Random amplified polymorphic DNA comparisons among broiler lines selekted for incidense of tibial dyschondroplasia // Poul. Sci.-1995.-V.74.-P.1253−1258
- Zhang X., Leung F.C., Chan D.K., Chen Y., Wu C. Comparative analysis of allosyme, random amplified polymorphic DNA and microsatellite polymorphism on Chinese native chickens // Poult. Sci.-2002a.~V.81,-P.1093−1098.
- Zhang X., Leung F.C., Chan D.K., Yang G, Wu C. Genetic diversity of Chinese native chicken breeds based on protein polymorphism, random amplified polymorphic DNA and microsatellite polymorphism // Poult. Sci.-2002a.-V.81.-P. 1463−1472.
- Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification // Genetics.-1994.-V.20.-P. 176−183.