Выделение и структурно-функциональная характеристика металлопротеиназы и сериновой коллагенолитической протеиназы-2 камчатского краба (Paralithodes camtschatica)
Коллагенолитическая активность, обнаруженная у некоторых сериновых протеиназ ракообразных, открывает широкие возможности использования этих ферментов в медицине, биотехнологии и пищевой промышленности. На основе пищеварительных ферментов крабов и креветок созданы медицинские препараты для лечения ран, ожогов и других повреждений кожи. Ферментные препараты из ракообразных способны гидролизовать… Читать ещё >
Содержание
- Список сокращений
- 1. Обзор литературы
- 1. 1. Металлопротеиназы семейства астацина
- 1. 2. Структура, биосинтез и локализация астациновых протеиназ
- 1. 2. 1. Структура генов
- 1. 2. 2. Особенности биосинтеза
- 1. 2. 3. Активация проферментов
- 1. 2. 4. Гликозилирование
- 1. 2. 5. Пространственная структура и доменный состав
- 1. 2. 6. Значение доменной структуры для транспорта и процессинга
- 1. 2. 7. Локализация
- 1. 3. Физико-химические и энзиматические свойства астациновых протеиназ
- 1. 3. 1. Физико-химические свойства
- 1. 3. 2. Особенности гидролиза пептидной связи
- 1. 3. 3. Роль ионов металлов
- 1. 3. 4. Определение активности
- 1. 3. 5. Субстратная специфичность
- 1. 3. 6. Белковые субстраты
- 1. 3. 7. Амидазная активность
- 1. 3. 8. Значение доменной структуры для энзиматических свойств
- 1. 3. 9. Ингибирование
- 1. 4. Получение астациновых протеиназ
- 1. 4. 1. Общая характеристика методик выделения
- 1. 4. 2. Получение рекомбинантных астациновых металлопротеиназ
- 1. 5. Физиологическая роль астациновых металлопротеиназ
- 1. 5. 1. Участие в пищеварении
- 1. 5. 2. Участие в формировании и распаде межклеточного матрикса
- 1. 5. 3. Функции в процессах морфогенеза и развития организма
- 1. 6. Брахиурины — сериновые протеиназы ракообразных
- 1. 6. 1. Общая характеристика
- 1. 6. 2. Структура
- 1. 6. 3. Субстратная специфичность
- 1. 6. 4. Гидролиз коллагена брахиуринами
- 1. 6. 5. Ингибирование брахиуринов
- 1. 6. 6. Физико-химические и энзиматические свойства брахиуринов
- 1. 6. 7. Получение брахиуринов
- 1. 6. 8. Биологические особенности брахиуринов
- 1. 7. Использование протеиназ ракообразных в медицине
- 1. 8. Исследования протеиназ из гепатопанкреаса камчатского краба
- 2. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
- 2. 1. Очистка протеиназ
- 2. 2. Определение частичной аминокислотной последовательности сери-новой коллагенолитической протеиназы
- 2. 3. Физико-химические и энзиматические свойства сериновой коллагенолитической протеиназы
- 2. 4. Ингибирование сериновой коллагенолитической протеиназы
- 2. 5. Субстратная специфичность сериновой коллагенолитической протеиназы
- 2. 6. Исследование первичной структуры металлопротеиназы
- 2. 7. Физико-химические и энзиматические свойства металлопротеиназы
- 2. 8. Ингибирование металлопротеиназы
- 2. 9. Субстратная специфичность металлопротеиназы
- 2. 10. Сравнение аминокислотной последовательности металлопротеиназы краба и других астациновых протеиназ
- 2. 11. Моделирование пространственной структуры металлопротеиназы
- 2. 12. Построение филогенетического древа астациновых протеиназ
- 2. 13. Влияние температуры на кинетические параметры гидролиза субстратов протеиназами краба
- 2. 14. Действие протеиназ краба на коллаген
- 2. 15. Действие протеиназ краба на фибриноген
- 2. 16. Действие протеиназ краба на фибрин, плазминоген и плазму крови
- 3. ЭКСГШРИМЕНТАЛЪНАЯ ЧАСТ
- 3. 1. Материалы
- 3. 1. 1. Синтетические хромогениые субстраты
- 3. 1. 2. Ферменты, белки, пептиды
- 3. 1. 3. Прочие реактивы и сорбенты
- 3. 2. Методы
- 3. 2. 1. Аффинная хроматография на полимиксин-силохроме
- 3. 2. 2. Аффинная хроматография HaNHOH-Bz-ONH-Ala-Ala-силохроме
- 3. 2. 3. Гидрофобная хроматография
- 3. 2. 4. Аффинная хроматография на лейцин-силохроме
- 3. 2. 5. Аффинная хроматография на аргинин-силохроме
- 3. 2. 6. Гель-хроматография на Сефадексе G
- 3. 2. 7. Ионообменная хроматография на DEAE-Toyopearl
- 3. 2. 8. Концентрирование и обессоливание растворов белков
- 3. 2. 9. Определение концентрации белка по методу Бредфорд
- 3. 2. 10. Определение активности по динитрофенилпептидам
- 3. 2. 11. Определение активности по и-нитроанилидам пептидов
- 3. 2. 12. Электрофорез в ПААГ в денатурирующих условиях
- 3. 2. 13. Масс-спектрометрический анализ
- 3. 2. 14,Определение субстратной специфичности металлопротеиназы
- 3. 2. 15. Определение рН-оптимума активности ферментов
- 3. 2. 16. Определение активности протеиназ по азоказеину и азоальбумину
- 3. 2. 17. Определение зависимости активности протеиназ от температуры
- 3. 2. 18. Определение кинетических параметров протеолиза
- 3. 2. 19. Ингибиторный анализ
- 3. 2. 20. Исследование действия протеиназ на коллаген
- 3. 2. 21. Действие протеиназ краба на фибриноген и другие белки
- 3. 2. 22. Действие протеиназ краба на фибриновые пластины
- 3. 2. 23. Действие протеиназ краба на фибриновые сгустки
- 3. 2. 24. Действие протеиназ краба на плазму крови
- 3. 2. 25. Определение содержания цинка в молекуле металло-протеиназы
- 3. 2. 26. Клонирование и секвенирование кДНК металлопротеиназы
- 3. 2. 27. Компьютерный анализ данных и моделирование структуры белков
- 3. 1. Материалы
Выделение и структурно-функциональная характеристика металлопротеиназы и сериновой коллагенолитической протеиназы-2 камчатского краба (Paralithodes camtschatica) (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
Протеолитические ферменты ракообразных обладают рядом необычных свойств и находят широкое применение в медицине и биотехнологии.
Ферменты ракообразных, обитающих в холодных морях, приспособлены к функционированию при низких температурах и поэтому являются перспективными биокатализаторами. Изучение влияния температуры на каталитические свойства таких протеиназ позволяет получить информацию о механизмах холодовой адаптации ферментов. Большинство исследований кинетических характеристик и структурных особенностей психрофильных протеиназ посвящены трипсинам, а протеиназы других семейств изучены менее подробно.
Коллагенолитическая активность, обнаруженная у некоторых сериновых протеиназ ракообразных, открывает широкие возможности использования этих ферментов в медицине, биотехнологии и пищевой промышленности. На основе пищеварительных ферментов крабов и креветок созданы медицинские препараты для лечения ран, ожогов и других повреждений кожи. Ферментные препараты из ракообразных способны гидролизовать фибриноген и фибрин, но действие индивидуальных протеиназ на эти белки практически не изучено, несмотря на важную роль фибрина в заживлении ран. Изучение фибринолитического действия протеиназ краба имеет большое значение для разработки новых тромболитических средств.
Для пищеварительных сериновых протеиназ ракообразных характерно наличие изоформ. Сходство первичной структуры изоформ при заметных различиях в некоторых свойствах делает эти белки привлекательными объектами для изучения структурно-функциональных взаимосвязей.
Для полной характеристики протеиназ камчатского краба, обладающих широкой первичной специфичностью, требуется исследование их взаимодействия с высокомолекулярными субстратами. Данные о влиянии пространственной структуры белковых субстратов на эффективность протеолиза представляют несомненный теоретический интерес и могут быть использованы для разработки методик изучения пространственной структуры белков с помощью ограниченного протеолиза. Расширение набора ферментов, используемых для ограниченного протеолиза, в том числе внедрение высокоактивных и доступных в больших количествах протеиназ ракообразных, безусловно, откроет новые возможности для исследователей.
Настоящая работа посвящена исследованию металлопротеиназы камчатского краба Paralithodes camtschatica, принадлежащей к семейству астацина, и минорной изоформы сериновой коллагенолитической протеиназы камчатского краба (далее СКП-2), принадлежащей к подсемейству брахиурина семейства химотрипсина. Целью работы являлось получение гомогенных препаратов протеиназ, изучение их физико-химических и энзиматических свойств, в том числе действия на фибриноген и фибрин. В работе были поставлены следующие задачи:
1. Получение металлопротеиназы и СКП-2 в электрофоретически гомогенном состоянии.
2. Анализ первичной структуры металлопротеиназы и доказательство её соответствия структуре, определённой по кДНК. Исследование структуры СКП-2 с помощью масс-спектрометрии.
3. Определение энзиматических свойств выделенных протеиназ.
4. Изучение температурной зависимости кинетических констант гидролиза различных субстратов металлопротеиназой и СКП-2.
5. Исследование действия металлопротеиназы и СКП-2 на фибриноген, фибрин, плазминоген и плазму крови, а также на коллаген. Идентификация высокомолекулярных продуктов гидролиза фибриногеиа с помощью масс-спектрометрии.
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
1Л. Металлопротеиназы семейства астацина.
Большинство известных металлопротеаз содержит в активном центре один ион цинка, координированный остатками глутаминовой кислоты и (или) гистидина (рис. 1). Функция этого иона в катализе — поляризация молекулы воды, атакующей расщепляемую пептидную связь [1].
Термолиз iih Астащшы.
Аминопептадазы Серрагашгны.
Адаматшшы/ ADAM Матрикашы (ММР).
Рис. 1. Структура цинк-связывающих мотивов металлопротеаз (по [2]).
Объединение протеиназ в семейства, основанное на сравнении первичной структуры белков, является принципом построения современной классификации MEROPS [3]. Несколько семейств протеаз, характеризующихся сходной вторичной и третичной структурой, образуют клан.
Клан метцинкинов включает астациновые металлопротеиназы, серрали-зииы (ферменты бактерий из родов Serratia, Erwinia и Pseudomonas), тканевые металлопротеиназы (matrix metalloproteinases, ММР), и семейство адама-лизинов/ADAM. В ферментах этого клана цинк координирован тремя остатками гистидина, два из которых входят в состав мотива НЕХХН, и остатком глутаминовой кислоты (через молекулу воды). Общий структурный элемент всех метцинкинов — метиониновый поворот (1,4-р-поворот, включающий консервативный остаток метионина). Семейства астацинов, ММР и серрали-зинов достаточно близки друг к другу по первичной структуре, а семейство адамализинов занимает обособленное положение [4].
Астацин — пищеварительный фермент речного рака Astacus astacus — был впервые описан в 1967 году. Термин «астацины» также обозначает пигменты (производные (З-каротина), обнаруженные у речного рака [5, р. 1219].
Астациновые металлопротеиназы были выделены в самостоятельное семейство в 90-х гг. XX в. С тех пор были получены и исследованы более двадцати представителей этого семейства — ферменты бактерий, беспозвоночных и позвоночных животных. При анализе базы данных NCBI с помощью программы BLAST в 2006 году было обнаружено более 900 последовательностей белков, сходных с онхоастацином — протеиназой паразитического червя Onchocerca volvulus [6, S.50]. Следует отметить, что у растений и вирусов не обнаружено ни ферментов, относящихся к семейству астацина, ни генов, кодирующих такие белки [3].
ВЫВОДЫ:
1. Выделены электрофоретически гомогенные металлопротеиназа и изо-форма СКП-2 сериновой коллагенолитической протеиназы камчатского краба P.camtschatica.
2. Подтверждено соответствие 87% первичной структуры металлопротеиназы структуре, определённой по кДНК. Обнаружено сходство между металлопротеиназой краба и другими астациновыми протеиназами по таким признакам, как характер ингибирования, рН-оптимум активности, содержание цинка в активном центре.
3. Частично определена аминокислотная последовательность СКП-2 (с помощью тандемной масс-спектрометрии). Обнаружено сходство между СКП-2 и другими протеиназами ракообразных по молекулярной массе, температурному и рН-оптимуму активности, интервалу рН-стабильности, характеру ингибирования. Обнаружены различия в субстратной специфичности и характере ингибирования изоформ СКП краба.
4. Установлено, что природа используемого субстрата влияет на характер зависимости кинетических параметров реакций, катализируемых СКП-2, от температуры, а значение КШ-Эфф реакции гидролиза азоказеина металлопротеиназой практически не зависит от температуры.
5. Показано, что обе протеиназы краба расщепляют неспирализованные участки молекул коллагена, а СКП-2 также способна расщеплять трёх-спиральные участки этого белка. Установлено, что обе изученные протеиназы способны расщеплять фибриноген (в том числе в плазме крови) и фибрин, а также активировать плазмииоген. Охарактеризованы высокомолекулярные продукты гидролиза фибриногена быка металлопротеиназой и СКП-2.
Список литературы
- Rawlings N.D., Barrett A.J. // Evolutionary families of metallopeptidases. Meth. Enzymol. 1995. V. 248. P. 183−228.
- Hooper N.M. // Families of zinc metalloproteases. FEBS Lett. 1994. V.354(l). pp. 1−17.
- Rawlings N.D., Tolle D.P., Barrett A.J. // MEROPS: the peptidase database. Nucleic Acids Res. 32 Database issue. 2004. D160-D164.
- Barrett A.J., Rawlings N.D., Woessner J.F. / Handbook of Proteolytic Enzymes. L., Academic Press, 1998.
- Mohrlen F., Hutter H., Zwilling R. // The astacin protein family in Caenorhabdi-tis elegans. Eur. J. Biochem. 2003. V. 270(24). P. 4909−4920.
- Angerer L., Hussain S., Wei Z., Livingston B.T. // Sea urchin metalloproteases: a genomic survey of the BMP-l/tolloid-like, MMP and ADAM families. Dev. Biol. 2006. V.300. P. 267−281.
- Kawaguchi M., Yasumasu S., Hiroi J., Naruse K., Masayuki I., Iuchi I. // Evolution of teleostean hatching enzyme genes and their paralogous genes. Dev. Genes Evol. 2006. V. 216. P. 769−784.
- Geier G., Jacob E., Stocker W., Zwilling R. // Genomic organization of the zinc-endopeptidase astacin. Arch. Biochem. Biophys. 1997. V.337(2). P. 300−307.
- Jiang W., Flannery A.V. // Correlation of the exon/intron organization to the secondary structures of the protease domain of mouse meprin alpha subunit. Gene. 1997. V. 189(1). P. 65−71.
- Lhomond G., Ghiglione C., Lepage Т., Gache C. // Structure of the gene encoding the sea urchin blastula protease 10 (BP 10), a member of the astacin family of Zn2±metalloproteases. Eur. J. Biochem. 1996. V.238(3). P. 744−751.
- Janitz M., Heiser V., Bottcher U., Landt O., Lauster R. // Three alternatively spliced variants of the gene coding for the human bone morphogenetic protein-1. J. Mol. Med. 1998. V.76 (2). P. 141−146.
- Bond J.S., Beynon R.J. // The astacin family of metalloendopeptidases. Protein Sci. 1995. No. 4(7), P. 1247−1261.
- Hung C.H., Huang H.R., Huang C.J., Huang F.L., Chang G.D. // Purification and cloning of carp nephrosin, a secreted zinc endopeptidase of the astacin family. J. Biol. Chem. 1997. V.272(21). P. 13 772−13 778.
- Yan L., Leontovich A., Fei K., Sarras M.P., Jr. // Hydra metalloproteinase 1 (HMP-1): a secreted astacin metalloproteinase whose apical axis expression is differentially regulated during head regeneration. Dev Biol. 2000. V.219(l). P. l 15−128.
- Pan Т., Groger H., Schmid V., Spring J. // A toxin homology domain in an astacin-like metalloproteinase of the jellyfish Podocoryne carnea with a dual role in digestion and development. Dev. Genes Evol. 1998. V.208 (5). P.259−266.
- Geier G., Zwilling R. // Cloning and characterization of a cDNA coding for Astacus embryonic astacin, a member of the astacin family of metalloproteases from the crayfish Astacus astacus. Eur. J. Biochem. 1998. V. 253 (3). P.796−803.
- Ravi Ram K., Sirot L.K., Wolfner M.F. // Predicted seminal astacin-like protease is required for processing of reproductive proteins in Drosophila melanogaster. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006. V. 103(49). P. 18 674−18 679.
- Leighton M., Kadler K.E.// Paired basic/Furin-like proprotein convertase cleavage of Pro-BMP-1 in the trans-Golgi network. J. Biol. Chem. 2003. V.278(20). P. l8478−18 484.
- Becker C., Kruse M.N., Slotty K.A., Kohler D., Harris J.R., Rosmann S., Ster-chi E.E., Stocker W. // Differences in the activation mechanism between the alpha and beta subunits of human meprin. Biol. Chem. 2003. V.384. P.825−831.
- Lippincott-Schwarz J., Yuan L.C., Bonifacino J.S., Klausner R.D. // Rapid redistribution of Golgi proteins into the ER in cells treated with brefeldin A: evidence for membrane cycling from Golgi to ER. Cell. 1989. V. 56(5). P.801−813.
- Yan J., Cheng Q., Li C.-B., Aksoy S. // Molecular characterization of three gut genes from Glossina morsitans morsitans: cathepsin B, zinc-metalloprotease and zinc-carboxypeptidase. Insect Mol. Biol. 2002. No. ll (l). P.57−65.
- De Maere V., Vercauteren I., Geldhof P., Gevaert K., Vercruysse J., Claerebout E. // Molecular analysis of astacin-like metalloproteases of Ostertagia ostertagi. Parasitology. 2005. V.130. Pt.l. P. 89−98.
- Yan L., Fei K., Zhang J., Dexter S., Sarras M.P. // Identification and characterization of hydra metalloproteinase2 (HMP 2): a meprin-like astacin metallo-proteinase that functions in foot morphogenesis. Development. 2000. V.127 (1). P. 129−141.
- Tarentino A.L., Quinones G., Grimwood B.G., Hauer C.R., Plummer T.H.Jr. // Molecular cloning and sequence analysis of flavastacin: An O-glycosylated pro-caiyotic zinc metalloendopeptidase. Arch. Biochem. Biophys. 1995. V.319 (1). P. 281−285.
- Yasumasu S., Katow S., Hamazaki T.S., Iuchi I., Yamagami K. // Two constituent proteases of a teleostean hatching enzyme: concurrent syntheses and packaging in the same secretory granules in discrete arrangement. Dev. Biol. 1992. V.149. P. 349−356.
- Stroupe S.T., Craig S.S., Gorbea C.M., Bond J.S. // Sex-related differences in meprin-A, a membrane-bound mouse kidney proteinase. Am J. Physiol. 1991. V.261(l). P. E354-E361.
- Kadowaki Т., Tsukuba Т., Bertenshaw G.P., Bond J.S. // N-Linked oligosaccharides on the meprin A metalloprotease are important for secretion and enzymatic activity, but not for apical targeting. J. Biol. Chem. 2000. V.275 (33). P. 25 577−25 584.
- Garrigue-Antar L., Hartigan N., Kadler K.E. // Post-translational modification of bone morphogenetic protein-1 is required for secretion and stability of the protein. J. Biol. Chem. 2002. V.277 (45). P. 43 327-^3334.
- Bode W., Gomis-Ruth F.X., Huber R., Zwilling R., Stocker W. // Structure of astacin and implications for activation of astacins and zinc-ligation of colla-genases. Nature. 1992. V.358. P. 164−167.
- Stocker W., Gomis-Ruth F.X., Bode W., Zwilling R. // Implications of the three-dimensional structure of astacin for the structure and function of the astacin family of zinc-endopeptidases. Eur. J. Biochem. 1993. V.214 (1). P. 215−231.
- Gerhartz В., Mac Sweeney A., Bodendorf U., Hommel U. // Crystal structure of the catalytic domain of tolloid-like protease 1 and uses thereof. European Patent № 1 932 907. 2008.
- Hege Т., Baumann U. // Structure-function relationships in serralysins, probed by site-directed mutagenesis and X-ray crystallography. Acta Cryst. 2000. A56 (supplement s.253).
- Yokozawa Y., Tamai H., Tatewaki S., Tajima Т., Tsuchiya Т., Kanzawa N. // Cloning and biochemical characterization of astacin-like squid metalloprotease. J. Biochem. 2002. V.132(5). P.751−758.
- Johnson G.D., Bond J.S. // Activation mechanism of meprins, members of the astacin metalloendopeptidase family. J. Biol. Chem. 1997. V.272(44). P. 28 126−28 132.
- Hengst J.A., Bond J.S. // Transport of meprin subunits through the secretory pathway: role of the transmembrane and cytoplasmic domains and oligomeriza-tion. J. Biol. Chem. 2004. V. 279 (33). P. 34 856−34 864.
- Porter S., Clark I.M., Kevorkian L., Edwards D.R. // The ADAMTS metallo-proteinases. Biochem. J. 2005. V. 386(Pt 1). P. 15−27.
- Mohrlen F., Maniura M., Plickert G., Frohme M., Frank U. // Evolution of astacin-like metalloproteases in animals and their function in development. Evol. Dev. 2006. V. 8(2). P. 223−231.
- Xiong X., Chen L., Li Y., Xie L., Zhang R. // Pf-ALMP, a novel astacin-like metalloproteinase with cysteine arrays, is abundant in hemocytes of pearl oyster Pinctadafucata. Biochim. Biophys. Acta. 2006. V. 1759(11−12). P. 526−534.
- Tsukuba Т., Bond J.S. // Role of the COOH-terminal domains of meprin A in folding, secretion, and activity of the metalloendopeptidase. J. Biol. Chem. 1998. V. 273(52). P. 35 260−35 267.
- Ge G., Greenspan D.S. // Developmental roles of the BMP1/TLD metallopro-teinases. Birth Defects Res. С Embryo Today. 2006. V. 78(1). P.47−68.
- Litovchik L., Chestukhin A., Shaltiel S. // The C-terminal tail of KSMP/meprin P is involved in its intracellular trafficking. J. Biol. Chem. 1998. V.273. P.29 043−29 051.
- Tang J., Bond J.S. // Maturation of secreted meprin alpha during biosynthesis: role of the furin site and identification of the COOH-terminal amino acids of themouse kidney metalloprotease subunit. Arch. Biochem. Biophys. 1998. V. 349(1). P. 192−200.
- Villa J.P., Bertenshaw G.P., Bylander J.E., Bond J.S. // Meprin proteolytic complexes at the cell surface and in extracellular spaces. Biochem. Soc. Symp. 2003. V. 70. P.53−63.
- Ishmael F.T., Norcum M.T., Benkovic S.J., Bond J.S. // Multimeric structure of the secreted meprin A metalloproteinase and characterization of the functional protomer. J. Biol. Chem. 2001. V.276(25). P. 23 207−23 211.
- Bertenshaw G.P., Norcum M.T., Bond J.S. // Structure of homo-and hetero-oligomeric meprin metalloproteases. J. Biol. Chem. 2003. V. 278(4). P. 25 222 532.
- Stocker W., Zwilling R. // Astacin. Meth. Enzymol. 1995. V.248. P.305−325.
- Butler P.E., Mc Kay M.J., Bond J.S. // Characterization of meprin, a membrane-bound metalloendopeptidase from mouse kidney. Biochem. J. 1987. V. 241(1). P. 229−235.
- Yiallouros I., Grosse Berkhoff E., Stocker W. // The roles of Glu 93 and Tyr 149 in astacin-like zinc peptidases. FEBS Lett. 2000. V. 484(3). P. 224−228.
- Garrigue-Antar L., Barker C., Kadler K.E. // Identification of amino acid residues in bone moiphogenetic protein-1 important for procollagen C-proteinase activity. J. Biol. Chem. 2001. V. 276(28). P. 26 237−26 242.
- Doll B.A., Villa J.P., Ishmael F.T., Bond J.S. // Zinc ligands in an astacin family metalloprotease meprin A. Biol. Chem. 2002. V. 383 (7−8). P. 1167−1173.
- Park H.I., Ming L.J. // The mechanistic role of the coordinated tyrosine in astacin. J. Inorg. Biochem. 1998. V. 72. P.57−62.
- Yiallouros I., Vassiliou S., Yiotakis A., Zwilling R., Stocker W., Dive V. // Phosphinic peptides, the first potent inhibitors of astacin, behave as extremely slowly-binding inhibitors. Biochem. J. 1998. V. 331(Pt2). P. 375−379.
- Williams R.J.P., Frausto da Silva J.J.R. // The distribution of elements in cells. Coord. Chem. Rev. 2000. V. 200−202. P. 237−348.
- Vallee B.L., Auld D.S. // Zinc coordination, function and structure of zinc enzymes and other proteins. Biochemistiy. 1990. V. 29(24). P. 5647−5659.
- Soler D., Nomizu Т., Brown W.E., Shibata I., Auld D.S.// Matrilysin: expression, purification, and characterization. J. Protein Chem. 1995. V.14 (7). P. 511−520.
- Garrigue-Antar L., Francis V., Kadler K.E. // Deletion of epidermal growth factor-like domains converts mammalian tolloid into a chordinase and effective procollagen C-proteinase. J. Biol. Chem. 2004. V. 279(48). P.49 835−49 841.
- Hojima Y., Behta В., Romanic A.M., Prockop D.J. // Cadmium ions inhibit procollagen C-proteinase and cupric ions inhibit procollagen N-proteinase. Matrix Biol. 1994. V. 14(2). P. 113−120.
- Shibata I., Iwamatsu Т., Oba Y., Kobayashi D., Tanaka M., Nagahama Y., Suzuki N., Yoshikuni M. // Identification and cDNA cloning of alveolin, an extracellular metalloproteinase, which induces chorion hardening of medaka
- Oryzias latipes) eggs upon fertilization. J. Biol. Chem. 2000. V.275(12). P. 8349−8354.
- Fan T.J., Katagiri C. // Properties of the hatching enzyme from Xenopus laevis. Eur. J. Biochem. 2001. V.268(18). P. 4892−4898.
- Bertenshaw G.P., Villa J.P., Hengst J.A., Bond J.S. // Probing the active sites and mechanisms of rat metalloproteases meprin A and B. Biol. Chem. 2002. V. 383 (7−8). P. 1175−1183.
- Wolz R.L., Bond J.S. // Phe5(4-nitro) bradykinin: a chromogenic substrate for assay and kinetics of the metalloendopeptidase meprin. Anal. Biochem. 1990. V. 191(2). P. 8488−8493.
- Grams F., Zimmerman G. // Pyrimidin-2,4,6-trion derivatives, method for producing the same and medicinal products containing these compounds. USA Patent № 6 242 455. 2001.
- Wagner W., Mohrlen F., Schnetter W. // Characterization of the proteolytic enzymes in the midgut of the European Cockchafer, Melolontha melolontha (Col-eoptera: Scarabaeidae). Insect Biochem. Mol. Biol. 2002. V. 32(7). P. 803−814.
- Harlin-Cognato A., Hoffman E.A., Jones A.G. // Gene cooption without duplication during the evolution of a male-pregnancy gene in pipefish. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006. V. 103(51). P. 19 407−19 412.
- Chestukhin A., Litovchik L., Muradov K., Batkin M., Shaltiel S. // Unveiling the substrate specificity of meprin on the basis of the site in PKA cleaved by the kinase-splitting membranal proteinase. J. Biol. Chem. 1997. V.272(6). P. 3153−3160.
- Medeck R.J., Sosa S., Morris N., Oxford J.T. // BMP-1-mediated proteolytic processing of alternatively spliced isoforms of collagen type XI. Biochem. J. 2003. V. 376(Pt2). P. 361−368.
- Zhang Y., Ge G., Greenspan D.S. // Inhibition of bone morphogenetic protein 1 by native and altered forms of alpha2-macroglobulin J. Biol. Chem. 2006. V. 281(51). P. 39 096−39 104.
- Villa J.P., Bertenshaw G.P., Bond J.S. // Critical amino acids in the active site of meprin metalloproteinases for substrate and peptide bond specificity. J. Biol. Chem. 2003. V. 278(43). P. 42 545−42 550.
- Walker P.D., Kaushal G.P., Shah S.V. // Meprin A, the major matrix degrading enzyme in renal tubules, produces a novel nidogen fragment in vitro and in vivo. Kidney Int. 1998. V. 53(6). P.1673−1680.
- Yasumasu S., Iuchi I., Yamagami K. // Isolation and some properties of low choriolytic enzyme (LCE), a component of the hatching enzyme of the teleost, Oryzias latipes. J. Biochem (Tokyo). V.105, P. 212−218.
- Kanzawa N., Yabuta H., Fujimi T.J., Tsuchiya T. // Solubility properties of a 65-kDa peptide prepared by restricted digestion of myosin with astacin-like squid metalloprotease. Zoolog. Sci. 2004. V.21(2). P. 159−162.
- Reynolds S.D., Zhang D., Puzas J.E., O’Keefe R.J., Rosier R.N., Reynolds P.R. // Cloning of the chick BMPl/Tolloid cDNA and expression in skeletal tissues. Gene. 2000. V. 248 (1−2). P. 233−243.
- Serpe M., Ralston A., Blair S.S., O’Connor M.B. // Matching catalytic activity to developmental function: tolloid-related processes Sog in order to help specify the posterior crossvein in the Drosophila wing. Development. 2005. V.132. P. 2645−2656.
- Stocker W., Sauer В., Zwilling R. // Kinetics of nitroanilide cleavage by astacin. Biol. Chem. Hoppe Seyler. 1991. V. 372 (6). P. 385−392.
- Hartigan N., Garrigue-Antar L., Kadler K.E. // Bone morphogenetic protein-1 (BMP-1). Identification of the minimal domain structure for procollagen C-proteinase activity. J. Biol. Chem. 2003. V. 278(20). P. 18 045−18 049.
- Zwilling R., Dorsam H., Torff H.J., Rodl J. // Low molecular mass protease: evidence for a new family of proteolytic enzymes. FEBS Lett. 1981. V. 127(1). P. 75−78.
- Wolz R.L. // A kinetic comparison of the homologous proteases astacin and meprin A. Arch. Biochem. Biophys. 1994. V. 310(1). P. 144−151. v
- Wolz R.L., Harris R.B., Bond J.S. // Mapping the active site of meprin-A with peptide substrates and inhibitors. Biochemistry. 1991. V. 30(34). P. 8488−8493.
- Hojima Y., van der Rest M., Prockop D.J. // Type I procollagen carboxyl-terminal proteinase from chick embryo tendons. Purification and characterization. J. Biol. Chem. 1985. V.260(29). P.15 996−16 003.
- Lee H. X., Ambrosio A. L., Reversade В., De Robertis E. M. // Embryonic dorsal-ventral signaling: secreted frizzled-related proteins as inhibitors of tolloid proteinases. Cell. 2006. V. 124(1). P. 147−159
- Tsai P.L., Chen C.H., Huang C.J., Chou C.M., Chang G.D. // Purification and cloning of an endogenous protein inhibitor of carp nephrosin, an astacin metalloproteinase. J. Biol. Chem. 2004. V. 279(12). P. 11 146−11 155.
- Hirano M., Ma B. Y., Kawasaki N., Okimura K., Baba M., Nakagawa Т., Miwa K., Kawasaki N., Oka S., Kawasaki T. //Mannan-binding protein blocksthe activation of metalloproteases meprin alpha and beta. J. Immunol. 2005. V.175. P. 3177−3185.
- Tripp C.A., Frank G.R., Grieve R.B. // Anti-parasite astacin metalloendopep-tidase antibodies. USA Patent № 6 673 345. 2004.
- Yasumasu S., Iuchi I., Yamagami K. // Purification and partial characterization of high choriolytic enzyme (HCE), a component of the hatching enzyme of the teleost, Oryzias latipes. J Biochem. (Tokyo). 1989. V. 105(2). P. 204−211.
- Kohler D., Kruse M.N., Sterchi E.E., Stocker W. // Heterologously overex-pressed, affinity-purified human meprin alpha is functionally active and cleaves components of the basement membrane in vitro. FEBS Lett. 2000. V. 465(1). P. 2−7.
- Reyda S., Jacob E., Zwilling R., Stocker W. // cDNA cloning, bacterial expression, in vitro renaturation and affinity purification of the zinc endopepti-dase astacin. Biochem. J. 1999. V.344 (Pt.3). P.851−857.
- Titani K., Torff H.J., Hormel S., Kumar S., Walsh K.A., Rodl J., Neurath H., Zwilling R. // Amino acid sequence of a unique protease from the crayfish Astacus fluviatilis. Biochemistry. 1987. V.26. P. 222−226.
- Prockop D.J., Hojima Y., Li S.-W., Sieron A. // Recombinant C-proteinase and processes, methods and uses thereof. USA Patent № 6 258 584. 2001.
- Foradori M.J., Tillinghast E.K., Smith J.S., Townley M.A., Mooney R.E. // Astacin family metallopeptidases and serine peptidase inhibitors in spider digestive fluid. Сотр. Biochem. Physiol. В Biochem. Mol. Biol. 2006. V. 143(3). P. 257−268.
- Wayne Davis M., Birnie A.J., Chan A.C., Page A.P., Jorgensen E.M. // A conserved metalloprotease mediates ecdysis in Caenorhabditis elegans. Development. 2004. V. 131. P. 6001−6008.
- Lopez В., Gonzalez A., Beaumont J. // Identification of a potential cardiac an-tifibrotic mechanism of torasemide in patients with chronic heart failure. J. Am. Coll. Cardiol. 2007. V. 50. P. 859−867.
- Huguenin M., Miiller E.J., Trachsel-Rosmann S., Oneda В., Ambort D., Sterchi E.E., Lottaz D. // The metalloprotease meprin beta processes E-cadherin and weakens intercellular adhesion. PLoS ONE. 2008. V.3(5). P. e2153.
- Bond J.S., Matters G.L., Banerjee S., Dusheck R.E. // Meprin metalloprotease expression and regulation in kidney, intestine, urinary tract infections and cancer. FEBS Lett. 2005. V. 579 (15). P. 3317−3322.
- Padanilam B.J. // Cell death induced by acute renal injury: a perspective on the contributions of apoptosis and necrosis. Am. J. Physiol. Renal. Physiol. 2003. V.284. P. F608-F627.
- Sarras M.P. Jr, Yan L., Leontovich A., Zhang J.S. // Structure, expression, and developmental function of early divergent forms of metalloproteinases in hydra. Cell Res. 2002. V. 12(3−4). P. 163−176.
- Davis S.W., Smith W.C. // Expression cloning in ascidians: isolation of a novel member of the astacin protease family. Dev Genes Evol. 2002. V. 212(2). P. 81−86.
- Schmitz C., Kinge P., Hutter H. // Axon guidance genes identified in a large-scale RNAi screen using the RNAi-hypersensitive Caenorhabditis elegansstrain nre-l(hd20) lin-15b (hdl26). Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2007. V. 104(3). P.834−839.
- Ge G., Fernandez C.A., Moses M.A., Greenspan D.S. // Bone morphogenetic protein 1 processes prolactin to a 17-kDa antiangiogenic factor Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2007. V. 104(24). P. l0010−10 015.
- Hasilik A. Biosynthese, Modification und Abbau von Proteinen. / Biochemie und Pathobiochemie. Eds. G. Loffler, P. E. Petrides, P. C. Heinrich. Springer-Verlag. Berlin-Heidelberg-New York. 2003. Teil 8. P.318.
- Chau P., Fielding P.E., Fielding C.J. // Bone morphogenetic protein-1 (BMP-1) cleaves human proapolipoprotein A1 and regulates its activation for lipid binding. Biochemistry. 2007. V. 46(28). P. 8445−8450.
- Chestukhin A., Muradov K., Litovchik L., Shaltiel S. // The cleavage of protein kinase A by the kinase-splitting membranal proteinase is reproduced by meprin. J. Biol. Chem. 1996. V. 271. P. 30 272−30 280.
- Beynon R.J., Oliver S., Robertson D.H. // Characterization of the soluble, secreted form of urinary meprin. Biochem. J. 1996. V. 315 (Pt 2). P. 461−465.
- Tamura G., Olson D., Miron J., Clark T.G. // Tolloid-like 1 is negatively regulated by stress and glucocorticoids. Brain Res. Mol. Brain Res. 2005. V. 142(2). P.81−90.
- Takahara K., Brevard R., Hoffman G.G., Suzuki N., Greenspan D.S.// Characterization of a novel gene product (mammalian Tolloid-like) with high sequence similarity to mammalian Tolloid/bone morphogenetic protein-1. Genomics. 1996. V. 34(2). P. 157−165.
- Kristjansdottir S., Gudmundsdottir A. // Propeptide dependent activation of the Antarctic krill euphauserase precursor produced in yeast. Eur. J. Biochem. 2000. V. 267(9). P. 2632−2639.
- Titani К., Sasagawa Т., Woodbury R.G., Ericsson L.H., Dorsam H., Kraemer M., Neurath H., Zwilling R. // Amino acid sequence of crayfish (Astacus Jluvi-atilis) trypsin If. Biochemistry. 1983. V.22(6). P. 1459−1465.
- Gudmundsdottir A. // Cold-adapted and mesophilic brachyurins. Biol Chem. 2002. V. 383(7−8). P. 1125−1131.
- Oh E.-S., Kim D.-S., Kim J.-H., Kim H.-R. // Enzymatic properties of a protease from the hepatopancreas of shrimp, Penaeus orientalis. J. Food Biochem. 2000. V.24.P. 251−264.
- Bornstein P., Traub W. The chemistry and biology of collagen. / The proteins. (Neurath H. and Hill R L, eds.) New York. Academic Press. 1979. Pt. 4. P. 411−632.
- Grant G.A., Sacchettini J.C., Welgus H.G. // A collagenolytic serine protease with trypsin-like specificity from the fiddler crab Uca pugilator. Biochemistry. 1983. V. 22(2). P. 354−358.
- Sainz J.C., Garcia-Carreno F.L., Hemandez-Cortes P. // Penaeus vannamei isotrypsins: purification and characterization. Сотр. Biochem. Physiol. B. 2004. V. 138. P. 155−162.
- Johnston D., Hermans J.M., Yellowlees D. // Isolation and characterization of a trypsin from the slipper lobster, Thenus orientalis (Lund). Arch. Biochem. Biophys. 1995. V. 324(1). P.35−40.
- Климова О.А., Чеботарев В. Ю. // Коллагенолитический комплекс проте-аз из гепатопанкреаса камчатского краба: разделение на индивидуальные компоненты. Бюлл. эксп. биол. мед. 1999. Т. 128. № 9. С. 308−313.
- Лебедев A.T. / Масс-спектрометрия в органической химии. М.:2003.
- Qin J., Chait В.Т. // Collision-induced dissociation of singly charged peptide ions in a matrix-assisted laser desorption ionization ion trap mass spectrometer. Int. J. Mass Spectrom. 1999. V.191. P.313−320.
- Perona J. J., Craik C.S. // Structural basis of substrate specificity in the serine proteinases. Protein Sci. 19. V.4(3). P.337−360.
- Rezaie A.R. // Role of residue 99 at the S2 subsite of factor Xa and activated Protein С in enzyme specificity. J. Biol. Chem. 1996. V. 271. P. 23 807−23 814.
- Leiros H.-K. S., McSweeney S. M., Smalas A. O. // Atomic resolution structures of trypsin provide insight into structural radiation damage. Acta Cryst. (2001). V. D57. P.488−497.
- Климова O.A., Чеботарев В. Ю. // Коллагенолитический комплекс проте-аз из гепатопанкреаса камчатского краба: энзимологические свойства индивидуальных компонентов. Бюлл. эксп. биол. мед. 1999. Т.128(10). С.391−396.
- Wu Z., Jiang G., Xiang P., Yang D., Wang N. // Purification and characterization of trypsin-like enzymes from North Pacific krill (.Euphausia pacifica). Biotechnol. Lett. 2008. V. 30, P.67−72.
- Yamada К., Murakami Н., Tachibana Н., Watanabe Y., Miyake Y., Omura H. // Stimulation by 2-mercaptoethanol and alcohols of protease in antarctic krill, Euphausia superba, at low temperature. Agric. Biol. Chem. 1987. V.51. P. 3363−3368.
- Kimoto K., Yokoi Т., Murakami K. // Purification and characterization of chymotrypsin-like proteinase from Euphausia superba. Agric. Biol. Chem. 1985. V.49. P. 1599−1603.
- Wu Z., Jiang G. // Purification and characterization of trypsin-like enzymes from Neomysis japonica using BApNA as substrate. Int. J. Pept. Res. Ther. 2008. V.2. P.75−80.
- Jeong Y., Wei C.I., Preston J.F., Marshall M.R. // Purification and characterization of proteases from hepatopancreas of crayfish (Procambarus clarkii). J. Food Biochem. 2000. V. 24. P.311−332.
- Hernandez-Cortes P., Whitaker J., Garcia-Carreno F.L. // Purification and characterization of chymotrypsin from Penaeus vannamei (Crustacea: Deca-poda). J. FoodBiochem. 1997. V. 21. P.497−514.
- Roy P., Colas В., Durand P. // Purification, kinetical and molecular characterizations of a serine collagenolytic protease from greenshore crab (Carcinus maenas) digestive gland. Сотр. Biochem. Physiol. В Biochem. Mol. Biol. 1996. V. 115. P. 87−95.
- Eisen A.Z., Henderson K.O., Jeffrey J.J., Bradshaw R.A. // A collagenolytic protease from the hepatopancreas of the fiddler crab, Uca pugilator. Purification and properties. Biochemistry. 1973. V. 12. P. 1814−1822.
- Tsu C.A., Perona J.J., Schellenberger V., Turck C.W., Craik C.S. H The substrate specificity of Uca pugilator collagenolytic serine protease I correlates with the bovine type I collagen cleavage site. J. Biol. Chem. 1994. V. 269(52). P. 19 565−19 572.
- Wohl R.C., Summaria L., Robbins K.C. // Kinetics of activation of human plasminogen by different activator species at pH 7.4 and 37 degrees C. J. Biol. Chem. 1980. V. 255. P. 2005−2013.
- Pozsgay M., Szabo G., Bajusz S., Simonsson R., Gaspar R., Elodi P. // Investigation of the substrate-binding site of trypsin by the aid of tripeptidyl-p-nitroanilide substrates. Eur. J. Biochem. 1981. V. l 15(3). P.497−502.
- Blaber M., Isackson P.J., Marsters J.C., Burnier J.P., Bradshaw R.A. // Substrate specificities of growth factor associated kallikreins of the mouse submandibular gland. Biochemistry. 1989. V. 28. P. 7813−7819.
- Le Bonniec B.F., Esmon C.T. // Glu-192—Gin substitution in thrombin mimics the catalytic switch induced by thrombomodulin. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. V.88. P. 7371−7375.
- Powers J.C., McRae В. J., Tanaka Т., Cho K., Cook R.R. I I Peptide thioesters and 4-nitroanilides as substrates for porcine pancreatic kallikrein. Biochem. J. 1984. V. 220. P. 569−573.
- Гаспарян M. Э., Остапченко В. Г., Долгих Д. А., Кирпичников М. П. // Биохимическая характеристика рекомбинантной лёгкой цепи энтеропеп-тидазы человека. Биохимия. 2006. Т. 71 (2). С. 149−156.
- Jia Y.H., Jin Y., Lu Q.M., Li D.S., Wang W.Y., Xiong Y.L. // Jerdonase, a novel serine protease with kinin-releasing and fibrinogenolytic activity from Trimeresurus jerdonii venom. Acta Biochim. Biophys. Sin. 2003. V. 35. P. 689−694.
- Chagas J. R., Portaro F. С. V, Hirata I. Y., Almeida P. C., Juliano M. A., Juli-ano L., Prado E. S. // Determinants of the unusual cleavage specificity of lysyl-bradykinin-releasing kallikreins. Biochem. J. 1995. V. 306. P. 63−69.
- Паписова А.И., Семенова С. А., Кислицын Ю. А., Руденская Г. Н. // Особенности гидролиза субстратов эндопептидазами из гепатопанкреаса камчатского краба. Биоорг. химия. 2008. Т. 34 (3). С.479−486.
- Rudenskaya G.N., Bogdanova E.A., Revina L.P., Golovkin B.N., Stepanov V.M. // Macluralisin a serine proteinase from fruits of Maclura pomifera (Raf.) Schneid. Planta. 1995. V.196(l). P. 174−179.
- Богачева A.M., Руденская Г. Н., Пройссер А., Чикилева И. О., Дунаевский Я. Е., Головкин Б. Н., Степанов В. М. // Протеиназа из корней одуванчика Taraxacum officinale. Биохимия. 1999. Т.64(9). С. 1224−1232.
- Spungin-Bialik A., Ben-Meira D., Fudima E., Carmeli S., Blumberg S. // Sensitive substrates for neprilysin (neutral endopeptidase) and thermolysin that are highly resistant to serine proteases. FEBS Lett. 1996. V.380(l-2). P. 79−82.
- Asgeirsson В., Bjarnason J.B. // Structural and kinetic properties of chy-motrypsin from atlantic cod (Gadus morhua). Comparison with bovine chy-motrypsin. Сотр. Biochem. Physiol. B. 1991. V. 99B. P.327−335.
- Keil B. / Specificity of proteolysis. Springer-Verlag. Berlin-Heidelberg-NewYork. 1992.
- Monigatti F., Berndt P. // Algorithm for accurate similarity measurements of peptide mass fingerprints and its application. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005. V.16. P. 13−21.
- Степанов В.М./ Молекулярная биология: структура и функции белков. М.: 1997.
- Keil-Dlouha V., Zylber N., Imhoff J.-M., Tong N.-T., Keil B. // Proteolytic activity of pseudotrypsin. FEBS Lett. 1971. V. 16(4). P.291−295.
- Stocker W., Ng M., Auld D.S. // Fluorescent oligopeptide substrates for kinetic characterization of the specificity of Astacus protease. Biochemistry. 1990. V.29(45). P. 10 418−10 425.
- Wu Z., Jiang G., Wang N., Wang J., Chen S., Xu Z. // Relating trypsin enzymatic properties with amino acid composition. Int. J. Pept. Res. Ther. 2007. V.14. P.81−87.
- Schroder Leiros H.K., Willassen N. P., Smalas A. O. // Structural comparison of psychrophilic and mesophilic trypsins. Elucidating the molecular basis of cold-adaptation. Eur. J. Biochem. 2000. V. 267. P. 1039−1049.
- Adekoya O.A., Helland R., Willassen N.P., Sylte I. // Comparative sequence and structure analysis reveal features of cold adaptation of an enzyme in the thermolysin family. Proteins. 2006. V. 62(2). P. 435−449.
- Feller G., Gerday C. // Psychrophilic enzymes: hot topics in cold adaptation. Nat. Rev. Microbiol. 2003. V. 1(3). P. 200−208.
- Schr0der H.K., Willassen N.P., Smalas A.O. // Structure of a non-psychrophilic trypsin from a cold-adapted fish species. Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr. 1998. V. 54 (Pt 5). P.780−798.
- Eyre D.R., Matsui Y., Wu J.-J. // Collagen polymorphisms of the intervertebral disc. Biochem. Soc. Trans. 2002. V. 30. P. 844−848.
- Нурминская M.B. Исследование белков и геномных последовательностей Candida utilis, содержащих элементы гомологии с альфа-цепью коллагена высших эукариот. Дисс. канд. биол. наук. Москва. 1991.
- Dabbous М.К., Roberts A.N., Brinkley S.B. // Collagenase and neutral protease activities in cultures of rabbit VX-2 carcinoma. Cancer Res. 1977. V.37. P. 3537−3544.
- Welgus H.G., Grant G.A., Jeffrey J.J., Eisen A.Z. // Substrate specificity of the collagenolytic serine protease from Uca pugilator. studies with collagenous substrates. Biochemistry. 1982. V.21 (21). P.5183−5189.
- Mainardi C.L., Dixit S.N., Kang A.H. // Degradation of type IV (basement membrane) collagen by a proteinase isolated from human polymorphonuclear leukocyte granules. J Biol. Chem. 1980. V.255(l 1). P.5435−5441.
- Fortney D.Z., Durham D.R. // Composition containing protease produced by Vibrio and method of use in debridement and wound healing. 1997. European patent 0472 011.
- Lim В., Lee E. H., Sotomayor M., Schulten K. // Molecular basis of fibrin clot elasticity. Structure. 2008. V. 16. P. 449−459.
- Wright H, T. // Secondary and conformational specificities of trypsin and chy-motrypsin. Eur. J. Biochem. 1977. V. 73. P. 567−578.
- Tsurupa G., Tsonev L., Medved L. // Structural organization of the fibrinogen) alpha C-domain. Biochemistry. 2002. V. 41(20). P. 6449−6459.
- Markland F. S. // Snake venoms and the hemostatic system. Toxicon. 1998. V. 36(12). P. 1749−1800.
- Kirschbaum N.E., Budzynski A.Z. // A unique proteolytic fragment of human fibrinogen containing the A alpha COOH-terminal domain of the native molecule. J. Biol. Chem. 1990. V. 265(23). P. 13 669−13 676.
- Astrup Т., Mullertz S. // The fibrin plate method for estimating fibrinolytic activity. Arch. Biochem. Biophys. 1952. V. 40(2). P. 346−351.
- Hellgren L., Mohr V., Vincent J., Vincent J., Karlstam B. // Intravasal thrombolysis. European Patent No. W01994SE00550 19 940 607. 1995.
- Leshchinskaya I.B., Shakirov E.V., Itskovitch E.L., Balaban N.P., Mardanova
- A.M., Sharipova M.R., Viryasov M.B., Rudenskaya G.N., Stepanov V.M. // Glutamyl endopeptidase of Bacillus intermedins, strain 3−19. FEBS Lett. 1997. V.404(2−3). P.241—244.
- Bradford M.M. // A rapid and sensitive method of the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye-binding. Anal. Biochem. 1976. V.72. P.248−251.
- Filippova I. Yu., Lysogorskaya E.N., Oksenoit E.S., Rudenskaya G.N., Stepanov V.M. // L-pyroglutamyl-L-phenylalanyl-L-leucine-p-nitroanilide a chromogenic substrate for thiol proteinase assay. Anal. Biochem. 1984. V. 143(2). P.293−297.
- Березин И.В., Клёсов A.A. // Практический курс химической и ферментативной кинетики. М. 1976.
- Frugoni J.A.C. // Tampone universale di Britton e Robinson a forza ionica constante. Gazz. Chem. Ital. 1957. V.87. P. 403−407.
- Шагинян K.A., Изотова Л. С., Иомантас Ю. В., Стронгин А.Я., Степанов
- B.М. // Металлопротеиназа Bacillus snbtilns: «внутриклеточные» и «внеклеточные» ферменты. Биохимия. 1980. Т.45. С. 2083−2095.
- Андреенко Г. В. (ред.) Методы исследования фибринолитической системы крови. Изд-во МГУ, Москва. 1981.
- Matz М., Shagin D., Bogdanova Е., Britanova О., Lukyanov S., Diatchenko L. Chenchik A. // Amplification of cDNA ends based on template-switching-effect and step-out PCR. Nucleic Acids Res. 1999. V. 27. P. 1558−1560.
- Bendtsen J.D., Nielsen H., von Heijne G., Brunak S. // Improved prediction of signal peptides: SignalP 3.0. J. Mol. Biol. 2004. V.340. P.783−795.
- Schwede Т., Kopp J., Guex N., Peitsch M.C. // SWISS-MODEL: an automated protein homology-modeling server. Nucleic Acids Research. 2003. No.31.P. 3381−3385.
- Altschul S.F., Gish W., Miller W., Myers E.W., Lipman D.J. // Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol. 1990. V.215. P.403−410.
- Johnson R.S., Taylor J.A. // Searching sequence databases via De novo peptide sequencing by tandem mass spectrometry. Mol. Biotechnol. 2002. V. 22(3). P.301−315.
- Ma В., Zhang K., Hendrie C., Liang C., Li M., Doherty-Kirby A., Lajoie G. // PEAKS: powerful software for peptide de novo sequencing by tandem mass spectrometry. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2003. V.17. P.2337−2342.