Исследование геномного разнообразия популяций человека методом мультилокусного ДНК-фингерпринтинга
Исследование генофонда современного коренного населения бывшего Советского Союза широко проводится в настоящее время с использованием генетических маркеров различных типов. Признано, что для получения несмещенных оценок генетических расстояний между популяциями необходима информация по многим полиморфным локусам. В этом смысле мультилокусный ДНК-фингерпринтинг с использованием ДНК фага М13… Читать ещё >
Содержание
- СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
- I. ВВЕДЕНИЕ
- 1. 1. ) Актуальность проблемы
- 1. 2. ) Цель и задачи исследования
- 1. 3. ) Научная новизна
- 1. 4. ) Практическая значимость работы
- 1. 5. ) Основные положения, выносимые на защиту
- II. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 11. 1. ) Структурные компоненты популяционной системы и критерии оценки межпопуляционного разнообразия
- 11. 2. ) Системы генетических маркеров
- И.З) Характеристика минисателлитных локусов. Механизмы нестабильности минисателлитов
- 11. 4. ) Использование минисателлитов в популяционных исследованиях человека
- 11. 5. ) Мультилокусный ДНК-фингерпринтинг на основе минисателлитов М13 в исследованиях геномного разнообразия
- III. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
- 111. 1. ) ПОПУЛЯЦИОННЫЕ ВЫБОРКИ
- 111. 2. ) ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ МЕТОДЫ
- 111. 2. 1. ) Выделение ДНК из образцов крови человека
- 111. 2. 1. 1. ) Осаждение ядерной фракции лейкоцитов
- 111. 2. 1. 2. ) Экстракция смесью фенол-хлороформ
- 111. 2. 1. 3. ) Контроль качества ДНК с помощью гель-электрофореза
- 111. 2. 2. ) Рестрикция
- 111. 2. 3. ) Получение ДНК фага М
- 111. 2. 3. 1. ) Получение компетентных клеток
- 111. 2. 3. 2. ) Трансформация компетентных клеток
- 111. 2. 1. ) Выделение ДНК из образцов крови человека
- 111. 2. 4. ) Получение меченного маркера молекулярных масс
- 111. 3. 2. 1. ) Кластерный анализ
- 111. 3. 2. 2. ) Многомерное шкалирование
- 111. 3. 2. 3. ) Анализ соответствий
Исследование геномного разнообразия популяций человека методом мультилокусного ДНК-фингерпринтинга (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
1.1) Актуальность проблемы.
Одно из современных направлений фундаментальных исследований популяционной генетики — использование полиморфизма геномной ДНК для изучения структуры и эволюции популяций человека. Полиморфизм геномной последовательности не случаен и является следствием многочисленных мутационных изменений, накопленных в ходе биологических, исторических и экологических процессов. В настоящее время изучение полиморфизма ДНК проводится на многих популяциях мира, при этом в исследования включаются как диаллельные, так и гипервариабельные локусспецифические последовательности ДНК ядерного и митохондриального генома. Популяционные различия в распределении частот аллелей установлены для многих полиморфных системоднако показано, что гипервариабельные локусы ДНК в силу своей большей гетерозиготности в популяциях, являются наиболее информативными маркерами при изучении структуры популяций. Одним из методов, использующих гипервариабельность минисателлитных локусов, является мультилокусный ДНК-фингерпринтинг, который визуализирует множественный полиморфизм длины рестрикционных фрагментов, что позволяет достаточно быстро выявлять генетическую вариабельность на внутрии межпопуляционном уровнях. Метод разработан A.J. Jeffreys [Jeffreys et al, 1985] и получил свое название вследствие крайней специфичности индивидуальных паттернов гибридизации. Результаты ДНК-фингерпринтинга являются чувствительным индикатором геномного полиморфизма, так как вследствие высокой вариабельности картин гибридизации мала вероятность совпадения паттернов у случайных индивидуумов. Метод нашел широкое применение в криминалистике, генеалогических исследованиях, близнецовом анализе и исследованиях мутационных процессов. Результаты использования метода в популяционных исследованиях позволяют сделать вывод о его высокой эффективности для описания как популяционной структуры большой подразделенной популяции, принадлежащей к одному этносу, так и генетической структуры различных в этническом отношении популяций. Тем не менее, в настоящее время мультилокусный ДНК-фингерпринтинг не получил широкого применения в популяционных исследованиях из-за ряда методических проблем и проблем, связанных со статистической обработкой результатов. Значительным недостатком метода является отсутствие генетической интерпретации происхождения фрагментов гибридизации, что не позволяет использовать традиционные статистические методы популяционно-генетического анализа результатов. Другой серьезной проблемой является сопоставление результатов, полученных в различных лабораториях, даже при условии использования одного гибридизационного зонда. В настоящее время известно значительное количество последовательностей, при гибридизации которых с ДНК человека получается картина фингерпринтинга, одной из них является 15-ти нуклеотидный тандемный повтор в последовательности бактериофага М13 [Джинчарадзе и др., 1987; Vassart et al, 1987]. Первые работы по исследованию популяций человека, выполненные методом мультилокусного ДНК-фингерпринтинга на основе ДНК фага М13, показали широкие возможности метода и проблемы, связанные с анализом полученных данных. Поэтому представляет определенный интерес детальная разработка мультилокусного ДНК-фингерпринтинга, как метода, позволяющего достаточно быстро и адекватно сопоставлять генетические структуры близких и отдаленных в этническом отношении популяций человека.
Территория Северной Евразии является зоной контакта монголоидной и европеоидной рас, поэтому исследования генофонда современного коренного населения представляют особый интерес для популяционной генетики и широко проводятся в настоящее время. Накоплен огромный материал популяционно-генетических исследований народонаселения различных регионов Северной Евразии, в том числе по популяциям из России и Белоруссии, которые были изучены в представленной работе [Микулич, 1989; Рафиков и др., 1981, 1987, 1992; Шнейдер и др., 1989, 1995; Хуснутдинова, 1999; Хуснутдинова и др., 1999а, 19 996]. Исследования, выполненные методом мультилокусного.
ДНК-фингерпринтинга, могут внести значительный вклад в изучение генетической структуры народонаселения Восточно-Европейского региона.
выводы.
1) Оптимизированы условия мультилокусного ДНК-фингерпринтинга и разработаны способы первичной обработки данных, что позволило добиться необходимой воспроизводимости результатов и провести исследование группы популяций из России и Белоруссии.
2) Предложены варианты статистической обработки данных и способы их использования для анализа результатов мультилокусного ДНК-фингерпринтинга, которые позволяют охарактеризовать исследуемую систему популяций и оценить уровень генетической дифференциации в группах, формируемых на разных уровнях организации популяционной структуры.
3) По результатам многомерного статистического анализа данных мультилокусного ДНК-фингерпринтинга выявлено, что исследованная система популяций разделяется на три мажорных кластера, которые формируют треугольник в условном пространстве 1 и 2 размерности. Ось первой размерности разделяет группы славянских и уральских популяций, ось второй размерности отделяет группу популяций с наибольшим содержанием монголоидного компонента.
4) Показано, что славянские популяции образуют наиболее компактную и гомогенную группу, которая характеризуется наименьшим уровнем межпопуляционного разнообразия (Gsr = 0.030 (0.033)) и наиболее существенными отличиями от остальных групп.
5) Обнаружены различия в уровнях популяционной подразделенности в пределах одного этноса: высокая гетерогенность группы башкирских популяций и значительное сходство белорусских популяций из различных регионов.
6) Показана устойчивость картины дифференциации популяций, полученной различными методами многомерного статистического анализа, что свидетельствует об адекватности результатов и эффективности использования метода мультилокусного ДНК-фингерпринтинга для исследований популяций человека.
Выражаю глубокую благодарность Светлане Андреевне Лимборской за предоставление темы, терпение и руководство;
Василию Евгеньевичу Дерябину за консультации по вопросам многомерной статистики.
Также благодарю всех сотрудников Отдела молекулярных основ генетики человека за благожелательное отношение и помощь при обсуждении полученных результатов.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
.
Исследование генофонда современного коренного населения бывшего Советского Союза широко проводится в настоящее время с использованием генетических маркеров различных типов. Признано, что для получения несмещенных оценок генетических расстояний между популяциями необходима информация по многим полиморфным локусам. В этом смысле мультилокусный ДНК-фингерпринтинг с использованием ДНК фага М13 в качестве зонда представляет значительный интерес, так как позволяет выявлять множество гипервариабельных локусов, которые равномерно распределены по всей геномной последовательности и имеют менделевский тип наследования.
Тем не менее, в настоящее время мультилокусный ДНК-фингерпринтинг не получил широкого применения в популяционных исследованиях из-за ряда методических проблем и проблем, связанных со статистической обработкой результатов.
При постановке экспериментов, был выработан ряд дополнительных рекомендаций к стандартной методике фингерпринтинга, которые позволили добиться необходимого качества и воспроизводимости результатов эксперимента:
• для ДНК-фингерпринтинга необходимо использовать только хорошо очищенные высокомолекулярные образцы ДНК.
• особое внимание необходимо уделять качеству используемых реактивов, особенно, агарозы, формамида и ТРИС.
• при использовании буфера ТАЕ для проведения электрофореза, помимо ежедневной смены буфера, для повышения буферной емкости можно увеличить его концентрацию до 1.5х.
• при проведении электрофореза при комнатной температуре, оптимальным напряжением является 50 — 55 В (1.8 — 2.0 В/см) — проблема диффузионного размывания полос полностью снимается при проведении электрофореза при низкой температуре (+4 С): полосы хорошо сфокусированы даже при более низком напряжении (35−40 В).
• точность идентификации позиций фрагментов гибридизации на радиоавтографах в значительной степени определяется качеством используемого маркера молекулярных масс: маркер должен иметь достаточное количество реперных фрагментов во всей исследуемой области.
• постановка гибридизации в малом объеме, использование качественного формамида и 1% SDS в гибридизационном буфере значительно улучшают гибридизационную картину.
• из разных типов фильтров, использованных в работе, наиболее подходящими оказались Hybond С extra.
В представленной работе также были разработаны принципы первичной обработки картин блот-гибридизации, которые позволяют достаточно точно идентифицировать фрагменты гибридизации на радиоавтографах и, следовательно, сопоставлять данные разных экспериментов. В рамках представленной работы была получена матрица размеров фрагментов, выявляемых при гибридизации с ДНК фага М13, в наиболее разрешаемой и информативной области фингерпринтинга (10 -1.8 тпн). Матрица размеров фрагментов может быть использована для анализа аналогичных данных по другим популяциям.
Получены распределения частот фрагментов гибридизации для изученных популяций и рассчитаны различные параметры геномной вариабельности. Предложены два варианта расчета критериев генетической дифференциации: через показатели сходства и гетерозиготность. Первый вариант, несмотря на большую сложность расчета, оказался более приемлемым для анализа подобных данных, так как позволяет работать с малыми выборками и дает более сопоставимые результаты с результатами, полученными другими методами анализа.
Результаты первичной обработки картин ДНК-фингерпринтинга, представленные в виде бинарной матрицы, были сопоставлены с аналогичными данными для популяций Волго-Уральского региона [Хидиятова, 1993; Хуснутдинова, 1997]. Выполнен совместный статистический анализ данных мультилокусного ДНК-фингерпринтинга для 13 популяций, который выявил следующее:
Исследованная система популяций разделяется на три мажорных кластера: 'Славянский', кластер 'Башкиры' - 'Якуты' и 'Уральскую группу'. Не наблюдается абсолютного соответствия между полученным подразделением популяций Волго-Уральского региона и общепринятой лингвистической классификацией: популяции 'Татары' и 'Чуваши', которые принадлежат к Алтайской лингвистической семье, формируют третий кластер с популяциями Уральской лингвистической семьи. Исследованная нами якутская популяция примкнула к группе башкирских популяций, которые, по разным оценкам [Хуснутдинова, 1999], характеризуются наибольшим содержанием монголоидного компонента.
Кластеры формируют треугольник в условном пространстве 1 и 2 размерности. Популяции с наибольшим содержанием монголоидного компонента (якутская и башкирские популяции) отделяются от всех остальных популяций по оси 2 размерности, при этом наиболее монголоидная якутская популяция, в большинстве случаев, показывает максимальные различия по координате. Ось 1 размерности разделяет славянские популяции и 'Уральскую группу', второй кластер занимает промежуточное положение.
Славянские популяции образуют наиболее компактную и гомогенную группу, которая характеризуется наименьшим уровнем межпопуляционного разнообразия (Gsr'Cnae = 0.030 (0.033)) и наиболее существенными различиями от остальных групп.
Белорусские популяции не показали региональных различий в отличие от группы башкирских популяций. Популяция юго-западных башкир ('Башкиры4') значительно выделяется из группы остальных башкирских популяций и занимает промежуточное положение между кластером 'Башкиры' - 'Якуты' и смешанным кластером остальных популяций Волго-Уральского региона.
Наблюдаются значительные внутрикластерные (межпопуляционные) различия для кластеров, сформированных популяциями Волго.
• Максимальный уровень межпопуляционного разнообразия выявлен для тюркской лингвистической группы (Gsr'7Vop/c=0.081(0.096)) по сравнению с межпопуляционным разнообразием для других лингвистических групп, сформированных в соответствие с лингвистической классификацией.
В работе представлен, вероятно, наиболее полный на сегодняшний день набор различных вариантов статистического анализа данных мультилокусного ДНК-фингерпринтинга. Сопоставление полученных результатов позволяет рекомендовать многомерное шкалирование, как оптимальный с точки зрения информативности и простоты необходимых для выполнения анализа расчетов, метод для получения представления об анализируемой системе популяций.
Анализ данных мультилокусного ДНК-фингерпринтинга различными статистическими методам, в целом, дал идентичные и адекватные результаты. Исследование гетерогенной группы популяций человека выявило сходство между территориально удаленными популяциями, принадлежащими одному этносу и значительные различия между популяциями разных этносов. Результаты работы позволяют сделать вывод о целесообразности использования метода для исследования генетической структуры, оценки генетической вариабельности и генетического родства в сложных группах различных в этническом отношении популяций. Доступность компьютерных программ, в частности, пакета статистических программ STAJISTICA, дают возможность применения различных методов многомерного статистического анализа, которые позволяют наглядно представлять полученные результаты, выявлять взаимосвязи и внутреннюю структуру в исследуемой группе популяций.
Расчет показателей сходства и критериев генетической дифференциации позволяет оценить вариабельность на внутрии межпопуляционных уровнях и сравнить полученные результаты с данными по другим ДНК и биохимическим маркерам.
Список литературы
- Amarger V., Gauguier D., Yerle M., Apiou F., Pinton P., Giraudeau F. t Monfouilloux S., Lathrop M., et al. Analysis of the human, pig, and rat genomes supports a universal telomeric origin of minisatellite sequences // Genomics. 1998. V. 52. P. 62 71.
- Appelgren H., Cederberg H., and Rannug U. Meiotic interallelic conversion at the human minisatellite MS32 in yeast triggers recombination in several chromatids // Gene. 1999. V. 239. P. 29 38.
- Appelgren H., Cederberg H., and Rannug U. Mutations at the human minisatellite MS32 integrated in yeast occur with high frequency in meiosis and involve complex recombination events // Mol. Gen. Genet. 1997. V. 256. P. 7−17.
- Armour J. A. L, Povey S., Jeremiax S., and Jeffreys A. J. Systematic cloning of human minisatellites from ordered array charomid libraries // Genomics. 1990. V. 8. P. 501 512.
- Ashley T. Mammalian meiotic recombination: a reexamination // Hum. Genet. 1994. V. 94. P. 587 593.
- Baker C.S., Gilbert D.A., Weinrich M.T., Lambertsen R., Calambokidis J., McArdle В., Chambers G.K., and O’Brien S.J. Population Characteristics of DNA Fingerprints in Humpback Whales (Megaptera novaeangliae) И J. Hered. 1993. V. 84. P. 281 290.
- Bellamy R.J., Inglehearn C.F., Jalili I.K., Jeffreys A.J., and Bhattacharya S.S. Increased band sharing in DNA fingerprints of an inbred human population // Hum. Genet. 1991. V. 87. P. 341 347.
- Benson G. Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences // Nucleic Acid. Res. 1999. V. 27. P. 573 580.
- Boan F., Rodriguez J. M., and Gomez-Marquez J. A non-hypervariable human minisatellite strongly stimulated in vitro intramolecular homologous recombination // J. Mol. Biol. 1998. V. 278. P. 499 505.
- H.Bo/'s P., Stead J. В., Bakshi S., Williamson J., Neumann R., Moghadaszadeh В., and Jeffreys A. J. Isolation and characterization of mouse minisatellites // Genomics. 1998. V. 50. № 3. P. 317 330.
- Botstein D., White R.L., Skolnick M., Davis R.W., 1980. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms //Am. J. Hum Genet. V. 32. P. 314 331.
- Brusco A., Saviozzi S. t Cinque F., Bottaro A., and DeMarchi M. A recurrent breakpoint in the most common deletion of the Ig heavy chain locus (del A1-GP-G2-G4-E) // J. Immunol. 1999. V. 163. P. 4392−4398.
- Buard J. and Vergnaud G. Complex recombination events at the hypermutable minisatellite CEB1 (D2S90) // EMBO J. 1994. V. 13. P. 3203 -3210.
- Buard J., Collick A., Brown J., and Jeffreys A. J. Somatic versus germline mutation processes at minsatellite CEB1 (D2S90) in humans and transgenic mice // Genomics. 2000. V. 65. P. 95 103.
- Burke Т., and Bruford M.W. DNA fingerprinting in birds // Nature. 1987. V. 327. P. 149−152.
- Chaillet J. R., BaderD. S., and Leder P. Regulation of genomic imprinting by gametic and embryonic processes // Genes Dev. 1995. V. 9. P. 1177 — 1187.
- W.Chakravarti A. Population genetics making sense out of sequence // Nature genetics supplement. 1999. V. 21. P. 56 — 60.
- Christmann A., Lagoda P. J. L, Zang K. D. Non-radioactive in situ hybridization pattern of the M13 minisatellite sequences on human metaphase chromosomes // Human Genetics. 1991. V.86. P.487−490.
- Greenacre M. J. Theory and applications of correspondence analysis / New York: Academic Press. 1984.
- Huey B. and Hall J. Hypervariable DNA Fingerprinting in Escherichia coii: Minisatellite Probe from Bacteriophage M13 //J. Bacteriol. 1989. V. 171. № 5. P. 2528 2532.
- Jeffreys A. J. and Neumann R. Somatic mutation processes at a human minisatellite // Hum. Mol. Genet. 1997. V. 6. P. 129 136.
- Jeffreys A. J., Neil D., and Neumann R. Repeat instability at human minisatellites arising from meiotic recombination // EMBO J. 1998. V. 17. P. 4147−4157.
- Jeffreys A.J. Spontaneous and induced minisatellite instability in human genome // Clinical Science. 1997. V. 93. № 5. P. 383 390.
- Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Hypervariable «minisatellite» regions in human DNA // Nature. 1985. V. 314. P. 67 73.
- Jeffreys AJ, Murray J, Neumann R. High-resolution mapping of crossovers in human sperm defines a minisatellite-associated recombination hotspot II Mol. Cel. 1998. V. 2. № 2. P. 267 73.
- Kennedy G. C., German M. S.$ and Rutter W. J. The minisatellite in the diabetes susceptibility locus IDDM2 regulates insulin transcription // Nat. Genet. 1995. V. 9. P. 293 298.
- Lebart L, Morineau A., Warwick K.M. Multivariate Descriptive Statistical Analysis. Correspondence Analysis and Related Techniques for Large Matrices / New York. Chichester: J Wiley & Sons. 1984. P. 231.
- Lewin R. DNA Fingerprints in Health and Diseases // Science. 1986. V. 233. P. 521 522.
- Lichtenstein A.V., Moiseev V.L., Zaboikin M.M. A procedure for DNA and RNA transfer to membrane filters avoiding weight-induced gel flattening // Anal. Biochem. 1990. V. 15. № 1. P. 187 191.
- Livshits G., Nei M. Relationships between intrapopulational and interpopulational genetic diversity in man // Ann. Hum. Bio. l 1990. V. 17. P. 501−513.
- Lynch M. Analysis of population genetic structure by DNA fingerprinting // EXC. 1991. V. 58. P. 113−126.
- Lynch. M. The similarity index and DNA fingerprinting // Mol. Biol. Evol. 1990. V. 7. P. 478−484.
- M13 cloning and sequencing handbook II SPL, Blenheim Crescent, London. Amersham UK. 1984. Amersham International pic.
- Mathew C.G.P. The isolation of high molecular weight eukaryotic DNA. In: Methods in Molecular Biology / Humana Press (ed Walker JM). 1984. V. 2. P. 31 34.
- Monckton D.J., Neumann R., Guram Т., Fretwell N., Tamaki K., MacLeod A., and Jeffrey A.J. Minisatellite mutation rate variation associated with a flanking DNA sequence polymorphism // Nat. Genet. 1994. V. 8. P. 162 -170.
- Murray J., Buard J., Neil D.L., Yeramian E., Tamaki K., Hollies C., and Jeffreys A.J. Comparative Sequence Analysis of Human Minisatellites Showing Meiotic Repeat Instability // Genome Res. 1999. V. 9. P. 130 136.
- Nakamura Y., Leppert M., O’Connell P., Wolff R., Holm Т., Culver M., Martin C., Fujimoto E. Variable number of tandem repeat (VNTR) markers for human gene mapping // Science. 1987. V. 235. P. 1616 1622.
- Nei M. Analysis of gene diversity in subdivided populations // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1973. V. 70. P. 3321 3323.
- Nei M. Definition and estimation of fixation indices // Evolution. 1986. V. 40. P. 643 645.
- Nei M. Molecular Population Genetics and Evolution // North-Holland Publishing Company. Amsterdam. 1975. P. 290.
- Neumann В., Kubicka P., and Barlow D. P. Characteristics of imprinted genes // Nat. Genet. 1995. V. 9. P. 12 13.
- O’Brien S.J., Wildt D.E., Goldman D., Merril C.R., and Bush M. The cheetah is depauperate in genetic variation // Science. 1983. V. 221. P. 459 462.
- Reeve H.K., Westneat D.F., Noon W.A., Sharman P.A., Aquadro C.F. DNA «fingerprinting» reveals high levels of inbreeding in colonies of the eusocial naked mole-rat // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. V. 87. P. 2496 2500.
- Ryskov A.P., Jincharadze A.G., Prosnyak M. L, Ivanov P. L, and Limborska S.A. M13 phage DNA as a universal marker for DNA fingerprinting of animals, plants and microorganisms // FEB. 1988. V. 233. P. 388 392.
- Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. Molecular Cloning // Cold Spring Harbor, Laboratory Press. USA. 1989.
- Satoh C. and Kodaira M. Effect of radiation on children // Nature. 1996. V. 383. P. 226.
- Smith E.G., Summers M.D. The Bidirectional Transfer of DNA and RNA to Nitrocellulose or Diazobenzyloxymethyl-Paper // Texas A @ M University. 1980. V.109. P. 123−129.
- Sneath P.H.A., and Sokal R.R. Numerical taxonomy / San Francisco: W. H. Freeman & Co. 1973.
- Stead J.D. and Jeffreys A.J. Allele diversity and germline mutation at the insulin minisatellite // Hum. Mol. Genet. 2000. V. 20. № 5. P. 713 723.
- Stephens J.C., Gilbert D.A., Yuhki N., O’Brien S.J. Estimation of heterozygosity for single-probe multilocus DNA fingerprints // Mol. Biol. Evol. 1992. V. 9. P. 729−743.
- Sutherland G. R., Baker ?., and Richards R. I. Fragile sites still breaking // Trends Genet. 1998. V. 14. P. 501 506.
- Sybenga J. What makes homologous chromosomes find each other in meiosis? A review and an hypothesis // Chromosoma. 1999. V. 108. P. 209 -219.
- Te/ca/a F. t Yeramian E., Dujon B. Amino acid composition of genomes, lifestyles of organisms, and evolutionary trends: a global picture with correspondence analysis // Gene. 2002. V. 297. P. 51 60.
- Tishkoff D.X., Filosi N., Gaida G.M., and Kolodner R.D. A novel mutation avoidance mechanism dependent on S. cerevisiae RAD27 is distinct from DNA mismatch repair // Cell. 1997. V. 88. P. 253 263.
- Tokarskaya O.N., Kalnin V.V., Panchenko V.G., Ryskov A.P. Genetic differentiation in a captive population of endangered Siberian crane (Grus leucogeranus Pall) // Mol. Gen. Genet. 1994. V. 245. P. 658 660.
- Turn M. G., Cuin K. A., and Porter A. C. Characterization of a novel minisatellite that provides multiple splice donor sites in an interferon induced transcript // Nucleic Acids Res. 1995. V. 23. P. 1854 1861.
- Vassart G., Georges M., Monsieur R., Brocas H., Lequarre A.S., Christophe D. A sequence in M13 phage detects hypervariable minisatellites in human and animal DNA // Science. 1987. V. 235. P. 683 684.
- Vergnaud G. and Denoeud F. Minisatellites: Mutability and Genome Architecture II Genome Research. 2000. V. 10. P. 899 907.
- Vergnaud G. Polymers of random short oligonucleotides detect polymorphic loci in the human genome // Nucleic Acids Res. 1989. V.17. P. 7623 7630.
- Vergnaud G., Mariat D., Apiou F., Aurias A., Lathrop M., and Lauthier V. The use of synthetic tandem repeats to isolate new VNTR loci: cloning of a human hypermutable sequence // Genomics. V. 11. P. 135 -144.
- Vogel F. ABO blood groups and diseases // Amer. J. Hum. Genet. 1970. V. 22. P. 464.
- Wahls W. P. and Moore P. D. Recombination hotspot activity of hypervariable minisatellite DNA requires minisatellite DNA binding proteins // Somat. Cell Mol. Genet. 1998. V. 24. P. 41−51.
- Ward J.H. Hierarchical grouping to optimize an objective function // Journal of the American Statistical Association. 1963. V. 58. P. 236.
- Wetton J.H., Carter R.E., Parkin D.T., Walters D. Demographic study of a wild house sparrow population by DNA fingerprinting // Nature. 1987. V. 327. P. 147−149.
- Wildt D.E., Bush M., Goodrowe K.L., Packer C., Pusey A.E., Brown J.L., Joslin P., and O’Brien S.J. Reproductive and genetic consequences of founding isolated lion populations // Nature. 1987. V. 329. P. 328 331.
- Williamson R., Bowcock A., Kidd K. et al. Report of the DNA committee and catalogues of cloned and mapped genes and DNA polymorphisms // Cytogenet. Cell. Genet. 1990. V. 55. P. 457 778.
- Wong Z., Wilson V., Patel I., Poiey S. t Jeffreys A.J. Characterisation of a panel of highly variable minisatellites cloned from human DNA // Am. J. Hum. Genet. 1987. V. 31. P. 269 288.
- Wright S. The genetical structure of populations // Ann. Eugen. 1951. V. 15. P. 323 354.
- Wyman A. R. and White R. A highly polymorphic locus in human DNA // Proc. Natl. Acad. Sci. 1980. V. 77. P. 6754−6758.
- Барышева Е.В., Букина A.M., Петрова Н. В., Лимборская С. А., Гинтер Е. К. Использование полиморфизма ДНК, выявляемого с помощью ДНК фага М13, в популяционных исследованиях // Генетика. 1991. Т. 27. № 3. С. 399 403.
- Бунак В.В. Геногеографические зоны Восточной Европы, выделяемые по факторам крови АВО // Вопр. антропологии. 1969. Вып. 32. С. 6.
- Дерябин В.Е. Современные восточнославянские народы. Восточные славяне. Антропология и этническая история / М: Научный мир. 1999а. С. 30 — 59.
- Дерябин В.Е. Многомерное количественное антропологическое изучение современных народов Кавказа. Часть I // Вестник антропологии. 19 996. Вып.6. С. 39 58.
- Дерябин В.Е. Многомерное количественное антропологическое изучение современных народов Кавказа. Часть II // Вестник антропологии. 1999 В. вып.6. С. 59 -78.
- Дерябин В.Е. Многомерные биометрические методы для антропологов // Рукопись, депонированная в ВИНИТИ. 2001. № 37-В2001.
- Иванов П.Л., Семиохина А. Ф., Рысков А. П. Геномная дактилоскопия крыс Rattus Norvegicus: новый подход к генетическому маркированию // Генетика. 1989. Т. 25. № 2. С.238 249.
- Кайданов Л.З. Генетика популяций / Москва: Высшая школа. 1996. С. 319.
- Кимура М. Молекулярная эволюция: теория нейтральности / М: «Мир». 1985. С. 398.
- Лебедева И.А. Генофонд народонаселения России и сопредельных стран по данным молекулярной гибридизации ДНК. В книге Рычкова
- Люблинский А. В. Результаты произведенных в Кронштадте в последние 5 лет исследований зрения у нижних чинов: Из медицинских прибавлений к Морскому сборнику / СПб. 1885. С. 23.
- Малюта С. С., Дыбков М. В., Телегеев Г. Д. Изучение полиморфизма ДНК жителей Украины, выявляемого зондом на основе фага М13 // Цитология и генетика. 1996. Т. 30. № 1. С. 31 35.
- Микулич А.И. Геногеография сельского населения Белоруссии // Минск: Наука и техника. 1989. С. 181.
- Пасеков В.П. Генетические расстояния // Итоги науки и техники. Общая генетика. М. ВИНИТИ. 1983. Т. 8. С. 4 75.
- Рафиков Х.С., Белова И. Ю., Юмагужина Н. Х., Кузеев Р. Г. Структура популяции башкир в регионе среднего Поволжья и Урала // В сб.: Популяционно-генетические исследования народов Южного Урала. Уфа: БФ АН СССР, 1981. С. 3−36.
- Рафиков Х.С., Хуснутдинова Э. К., Долматова И. Ю. с соав. Структура и генетическая близость башкир к народам Волго-Уральского региона и Сибири // В сб.: Антропология и популяционная генетика башкир. Уфа. 1987. С. 60−76.
- Рафиков Х.С., Хуснутдинова Э. К., Хидиятова И. М. Особенности формирования генетической структуры башкир // Материалы к антропологии уральской расы. Уфа. 1992. С. 60−70.
- Рысков А.П. Мультилокусный ДНК-фингерпринтинг в генетико-популяционных исследованиях биоразнообразия // Молекулярная биология. 1999. Т. 33. № 6. С. 997−1011.
- Рысков А.П., Токарская О. Н., Вербовая Л. В. Джинчарадзе А.Г., Гинсбург А. Л. Геномная «дактилоскопия» микроорганизмов: использование в качестве гибридизационного зонда ДНК фага М13 // Генетика. 1988. Т. 24. № 7. С. 1310 1313.
- Рысков А.П., Фаизов Т. Х., Алимов A.M., Романова Е. А. Геномная «дактилоскопия»: новые возможности в определении видовой принадлежности бруцелл // Генетика. 1990. Т. 26. № 1. С. 130−134.
- Рычков Ю.Г. Система древних изолятов человека в Северной Азии в свете проблем стабильности и эволюции популяций. Поиски и решения на путях популяционной генетики // Вопросы антропологии. 1973. Вып. 44. С. 3 22.
- Рычков Ю.Г., Жукова О. В., Шереметьева В. А. и др. Генофонд и геногеография народонаселения / ред. Рычков Ю. Г. и Алтухов Ю. П. 2000. Санкт-Петербург: Наука. Т. I. С. 611.
- Рычков Ю.Г., Ящук Е. В. Генетика и этногенез // Вопросы антропологии 1980. Вып. 64 С. 23 39 .
- Рычков Ю.Г., Ящук Е. В. Генетика и этногенез. Состояние и тенденции генетического процесса в связи с особенностями развития народонаселения Европы (зарубежной) // Вопросы антропологии. 1983. Вып. 72. С. 3−17.
- Рычков Ю.Г., Ящук Е. В., Веселовская Е. В. Генетика и этногенез. О генетической прапамяти систем коренного населения Северной Азии и Америки // Вопросы антропологии. 1982. Вып. 69.
- Семина (Барышева) Е.В., Букина A.M., Гинтер Е. К., Лимборская С. А. Семейный анализ «фингерпринтов» человека, полученный с помощью зонда ДНК фага М13 // Генетика. 1993а. Т. 29. № 10. С. 1608 -1611.
- Спицын В. А. Биохимический полиморфизм человека / М. 1985. С. 214.
- Токарская О.Н., Зуев А. В., Сорокин А. Г., Панченко В. Г., Рысков А. П. Геномная дактилоскопия журавлей: новый подход для генотипирования видов // Генетика. 1990. Т. 26. № 4. С. 599−605.
- Хидиятова И.М. Использование рестрикционного полиморфизма ДНК в популяционно-генетических исследованиях // Дисс. канд. биол. наук. М. 1993.
- Хуснутдинова Э.К. Молекулярная этногенетика народов Волго-Уральского региона //Уфа: Гилем. 1999. С. 237.
- Хуснутдинова Э.К. Молекулярно-генетическая характеристика популяций башкир и других народов Вол го-Уральского региона // Дисс. докт. биол. наук. М. 1997. С. 343.
- Шнейдер Ю.В., Тихомирова Е. В., Шильникова И. Н. Генетический полиморфизм и геногеография коренного населения Уральского региона. 1. Генетическая структура народов Волго-Уральского региона И Генетика. 1995. Т. 31. № 4. С. 560−572.