Исследование комплементарно-адресованного алкилирования в комплексах синтетических олигонуклеотидов и их производных
Изучена кинетика внутрикомплексного алкилирования олигонуклеотидов 1−1У реагентом ХУ1. Показано, что во всех случаях реакция алкилирования протекает быстро, а. константы скорости при 0°.составляют (9,9+0,1)' 10″ 3 с" 1 для I, (6,2±I, 7)-I0~3 с" 1 для П, (7,5±0,2). Ю" 3 с" 1 для Ш и (2,7±-0,2)-Ю~5 с" 1 для 1У. Полученные константы на 4- порядка превосходят константу скорости ионизации… Читать ещё >
Содержание
- Принятые сокращения
- Глава II. ервая. Реакции в комплементарных комплексах
- Обзор литературы) ."."
- 1. 1. Образование мекнуклеотидной связи между олигонуклеотидами химическими методами на комплементарный матрицах
- 1. 1. 1. Реакции с непосредственной активацией олигонуклеотидов в комплементарном комплексе
- 1. 1. 2. Реакции конденсации предварительно активированных моно- и олигонуклеотидов
- 1. 2. Некоторые другие реакции, протекающие в комплементарных комплексах «,.*». ?
- 1. 3. Комплементарно-адресованное алкилирование нуклеиновых кислот
- 1. 1. Образование мекнуклеотидной связи между олигонуклеотидами химическими методами на комплементарный матрицах
- Глава вторая. Материалы и методы исследования
- 2. 1. Исходные материалы
- 2. 2. Общие методы исследования
- Глава третья. Комплементарно-адресованное алкилирование в комплексах олигонуклеотид-олигонуклеотид
- Глава. четвертая. Кинетические характеристики алкили-рования производными олигонуклеотидов в прочных комплементарных комплексах
- Глава II. ятая. Некоторые исследования протекания реакций алкилирования бензилиденовыми производными неионных аналогов олигонуклеотидов в комплементарных комплексах
- Выводы
- Литература
- Список принятых сокращений
Для обозначения нуклеиновых кислот, олигонуклеотидов, нук-леотидов, оснований и их производных в диссертации приняты сокращения, рекомендуемые комиссией по номенклатуре 1иРАС-эив, а также следующие сокращения: НК — нуклеиновая кислота
ЦМЭ-карбодиимид- ъ-толуолсульфонат-Ы -циклогексил-N '-р -(4-метилморфолиний)этил-карбодиимид (Np)nN>CHRC? — 23−0--2-хлорэтил-N -метиламино) бензилиден] олигонуклеотиды
N7−0CHRGua -7-[р -(N -метил-N -4-формилфениламино)этил]гуанин Ns-0CHRAde -N6-[j* -(N -метил-N -4-формилфениламино)этил] аденин N3- OCHRAde -3- [ f> -(N -метил- N -4-формилфениламино) этил") аденин N7- OCHRAde — N5-формил- N — [? -(N -4-формилфенил- N -метиламино)этил]
4,5,б-триаминопиримидин N3- OCHRCyt -3-[> -(N -метил-N -4-формилфениламино)этил] цитозин OCHROH -4(N -2-OKCH3Tmi-N -метиламино)-бензальдегид Jmp^pN)^ -5-имидазолиды моно-(п. =0) и олигонуклеотидов (п*1) (Np)nNpJm -3-имидазолиды олигонуклеотидов ОЕ — оптические единицы Трис — трис (оксиэтил)аминометан
Исследование комплементарно-адресованного алкилирования в комплексах синтетических олигонуклеотидов и их производных (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
Для химического воздействия на одноцепочечные нуклеиновые кислоты в определенных точках Н. И. Гриневой с сотрудниками был предложен и разработан метод комплементарно-адресованной модификации, основанный на внутрикомплексной реакции полинуклеотида и реакционноспособного производного адресующего олигонуклеотида, комплементарного определенному участку модифицируемого полинуклеотида [I]. Метод был широко исследован на примере комплементар' но-адресованного алкилирования нуклеиновых кислот. Для этой цели были получены специальные «адресующие» реагенты — производные олигои полинуклеотидов, несущие алкилирующую группу либо на 3'-, либо на 5-конце олигонуклеотидного фрагмента: 2', 3−0-[4-(N—2-хлорзтил-N-метиламино)бензилиден]олигои полинуклеотиды [2−4] и 4-(N -2-хлорэтил-Nметиламино)бензил-5-фосфамиды олиго-нуклеотидов [5,6].
Процесс алкилирования в комплементарных комплексах реагентами такого типа был исследован на примере модификации высокополимерных РНК и ДНК производными гомоолигорибонуклеотидов или стати' стических смесей изоплит рибоолигонуклеотидов [7−10], а также дрожжевой TPHK-Jпроизводным pd (CG)rA [IItI2].
С помощью данного метода была осуществлена комплементарно-адресованная фрагментация одноцепочечных и денатурированных ДНК [13]. Модифицированный вариант метода комплементарно-адресованного алкилирования был применен Салгаником и др. [14] для проведения направленного мутагенеза определенных генов фага Т7 in vitro.
В последние годы метод нашел применение для осуществления комплементарно-адресованной модификации нуклеиновых кислот в клетке [15−17]. Для этого было предложено использовать бензили-деновые производные неионных аналогов олигонуклеотидов — олигонуклеотидов, этерифицированных по межнуклеотидным фосфатам [15], поскольку было известно, что замена межнуклеотидных фосфодиэфир-ных групп на триэфирные не приводит к потере способности олиго-нуклеотидов к комплементарным взаимодействиям [18,19]. В то же время такие производные становятся достаточно гидрофобными для прохождения через клеточную мембрану и приобретают устойчивость к нуклеазам [20].
Одним из основных вопросов, стоящих при разработке метода, было выяснение локализации точек, по которым происходит алкили-рование в комплементарном комплексе реагент-нуклеиновая кислота. Это могло быть сделано только на объекте с известной первичной структурой. Однако в силу того, что до последнего времени синтетические олигонуклеотиды были малодоступны, первое исследование этого вопроса было проведено на достаточно сложном объекте, дрожжевой валиновой тРНК, обладающей, к тому же, уникальной третичной структурой. Было установлено, что алкилирование дрожжевой валиновой tPHKj 2343-[4-(N -2-хлорэтил-N-метиламино)] -бензилиденовым производным pd (CG)rA протекает по четвертому в сторону 5-^конца нуклеотиду, считая от (CG) -фрагмента тРНК [п]. В силу специфичной третичной структуры тРНК, малого размера олигонуклеотидной части реагента и, тем самым, малой прочности комплекса, представлялось необходимым исследовать вопрос о локализации точек модификации на более простой модели с прочным комплексообразованием, лишенной специфической пространственной структуры. С этой целью в настоящей работе было проведено исследование внутрикомплексно-го алкилирования синтетических додекадезоксирибонуклеотидов общей структуры pd (xxccTGTTTGCC) (гдеX = G (1), х =а (П), х = с (Ш), X = Т (Д|) 2, ЗЧЗ-[ 4-(N -2-хлорэтил-№ -метиламино)] -бензилидено-вым производным нонануклеотида d (TGCCAAAC)rA.
Для выяснения некоторых закономерностей алкилирования нуклеиновых кислот бензилиденовыми производными неионных аналогов оли-гонуклеотидов было исследовано алкилирование полиадениловой кислоты 23—0—[СN-2-хпорэтил-N-метиламино)] -бензилиденовым производный нонатимидилилуридина, этилированного по мекнуклеотидным фосфатам — [Tp (6t)]grU.
Впервые на модельных дезоксирибоолигонуклеотидах с известной первичной структурой — pd (xxcCTGTTTGGC) показано, что внутри-комплексное алкилирование происходит по фрагменту рхрх независимо от природы модифицируемого основания, а на примере алкилирования олигонуклеотида I показано, что алкилированию подвергается остаток гуанина G-2. Обнаружено, что реакции алкилирования данных олигонуклеотидов в прочном комплементарном комплексе протекают со скоростью, на Ь порядка превосходящей скорость образования этилениммоний катиона, через который, как правило, протекают реакции алкилирования ароматическими 2-хлорзтиламинами.
Найдено, что при алкилировании поли (А) реагентами, полученными из разных фракций диастереоизомеров нонатимидилилуридина, этилированного по межнуклеотидным фосфатам, степень модификации и направленность алкилирования зависят от набора диастереоизомеров данных реагентов.
ВЫВОДЫ.
I. Изучено комплементарно-адресованное алкилирование в комплексах общей структуры pd (X-X-C-C-T-G-T-T-T-G-G-C) (X-G (l), X=A (h), X=COh), X=T (Iv)) CeRCH<- 2,3−0-(4-N-2-хлорэтил-N-метиламино бензилиден)-) Показано, что: а) в случае олигонуклеотида I происходит внутрикомплексное алкилирование, причем модификации подвергается остаток гуанина, вто/ рой от 5-конца олигонуклеотида I, т. е. являющийся третьим нуклеоти дом по направлению к 5-концу олигонуклеотида I, считая от участка связывания адресаб) при алкилировании олигонуклеотида П реагентом ХУ1 продуктами модификации являлась смесь алкиладениновв) при алкилировании олигонуклеотида III единственным продуктом модификации являлсяМЗ-алкилцитозинг) при алкилировании олигонуклеотида 1У были обнаружены продукты, идентичные продуктам, образующимся при алкилировании (Тр)^Т с помощью альдегида [" ^С]- OCHRCe.
Таким образом, алкилирование происходит по фрагменту Х-Х независимо от природы оснований;
2. Изучена кинетика внутрикомплексного алкилирования олигонуклеотидов 1−1У реагентом ХУ1. Показано, что во всех случаях реакция алкилирования протекает быстро, а. константы скорости при 0°.составляют (9,9+0,1)' 10″ 3 с" 1 для I, (6,2±I, 7)-I0~3 с" 1 для П, (7,5±0,2). Ю" 3 с" 1 для Ш и (2,7±-0,2)-Ю~5 с" 1 для 1У. Полученные константы на 4- порядка превосходят константу скорости ионизации С-СЕсвязи в бензилиденовых производных олигонуклеотидов. При алкилировании. / / поли (А) 2,3−0-(4-N-2-хлорэтил-N-метиламино) бензилиденовым производным (Tp)grU реакция заканчивается уже за 2 минуты при 0 °C. Таким образом, при образовании прочных комплементарных комплексов наблюдается быстрое внутрикомплексное алкилирование с изменением механизма алкилирования. /.
3. Исследовано алкилирование поли (А) 2,3−0~(4-М-2-хлорэтил-Мметиламино) бензилиденовым производным нонатимидилиуридина, этилированного по межнуклеотидным фосфатам (ХУШ). Показано, что: а) реакция внутрикомплексного алкилирования в данном случае прос т исходит с константой скорости, равной (3,5±0,5)-10 с и близка константе скорости ионизации хлора в бензилиденовых производных олигонуклеотидов, что означает протекание реакции по двустадийному механизмуб) при использовании реагентов, синтезированных из фракций диастереоизомеров олигонуклеотида Х1У, полученных ступенчатой элюцией его с поли (А)-сефарозы при 10°, 20° и 30 °C, наблюдаемая степенъ~мо-дификации поли (А) возрастает с увеличением прочности комплексовс увеличением прочности комплексов растет доля реакции по Nl-положению аденина.
Список литературы
- Belikova A.M., Zarytova V.P., Grineva N.1. Synthesis of ribo-nucleosides and dirihonucleoside phosphates containing 2-chlo-roethylamine and nitrogen mustard residues. — Tetrahedron Lett, 1967, N°37,. p.3557−3562.
- Гринева Н.И., Зарытова В. Ф., Кнорре Д. Г. Алкилирующие производные компонентов нуклеиновых кислот. П. Синтез уридилил- (З'-Й2,3−0-4-(N-2-хлорэтил- N-метиламино)-бензилиден-уридина. Изв. Сиб.Отд. АН СССР, 1968, № 12, сер.хим.н., вып.5, с.118−124.
- Гринева Н.И., Карпова Г. Г. 2,3−0-р-(хлорэтилметиламино)бензили-ден.тРНК адресующий реагент с алкилирующей группировкой на акцепторном конце тРНК. — Изв. АН СССР, 1972, № 5, сер.хим., с. 1219 -1220.
- Гринева Н.И., Ломакина Т. С. Алкилирующие производные компонентов нуклеиновых кислот. Х1У. Синтез 5-^фосфамидов олигонуклеотидов, производных 4- (N-2-хлорэтил-N -метиламино)бензиламина. Ж. общ. химии, 1972, т. ХШС1У), с. 1630−1634.
- Гимаутдинова О.И., Гринева Н. И., Карпова Г. Г., Ломакина Т. С., Шелпакова Е. Л. Получение 4-(N -2-хлорэтил-N -метиламино)бензил-5-фосфамидов рибоолигоаденилатов и их взаимодействие с рРНК и ДНКcofci. Биоорган. Ьшия, 1978, т.4, № 7, с.917−927.
- Гринева Н.И., Карпова Г. Г. Комплементарно-адресованное алкилирование рибосомальной РНК 2', 3−0-4-(хлорэтилметиламино)бензилиден. гексааденилатом. Изв. АН СССР, 1972, № 10, сер.хим., с.2377−2378.- 97 -.
- Гринева Н.И., Карпова Г. Г., Мызина С. Д., Чемасова А. Н. Комплементарно -адресованное алкилирование ДНК производным гексааде-нилата. Биоорган. химия, 1975, т.1, № 12, с.1707−1714.
- Гимаутдинова О.И., Карпова Г. Г., Ломакина Т. О., Шелпакова Е. Л. Чемасова А.Н., Гринева Н. И. Алкилирование ДОК в комплементарных комплексах с 4-(N -2-хлорэтил-N -метиламино)-бензил-5-фосфами-дами олигонуклеотидов. Биоорган. химия, 1980, т.6, № 1, с.70−80.
- Гринева Н.И. Комплементарно-адресованная фрагментация ДНК и аспекты ее применения в генетической инженерии. Вестн. АМН СССР, 1981, № 2, с.83−94.
- Зарытова В.Ф., Карпова Г. Г., Кнорре Д. Г., Попова B.C., Стефанович Л. Е., Шешесова Е. А. Алкилирующие производные этиловых эфиров олигонуклеотидов проникающие в клетки комплементарно-адресованные реагенты. — Докл. АН СССР, 1980, т.225, № 1, с. II0-II3.
- Karpova G.G., Knorre D.G., Ryte A.S., Stephanovich L.E. Selective alkylation of poly (A) tracts of RNA inside the cell with derivative of ethyl ester of oligothymidilate bearing 2-chlo-roethylamino group. FEBS Lett., 1980, v.122, N°1, p.21−24.
- Miller P. S., Barrett J.G., Tso P.O.P. Synthesis of oligodeoxy-ribonucleotide ethyl phosphotriesters and their specific complex formation with transfer ribonucleic acids. Biochemistry, 1974, v.13, U°24, p.4887−4896.
- Miller P. S., Braitermann L.T., Tsfo P.O.P. Effect of a trinucleotide ethyl phosphotriester, Gmp (Et)Gmp (Et)U on mammalian cells in culture. Biochemistry, 1977, v., 16, № 9, p.1988−1966.
- Haylor R., Gilham P.T. Studies of some interaction and oligonucleotides in aqueous solution. Biochemistry, 1966, v.5, 1T°8, p.2722−2728.
- Sulston J., Lohrmann R., Orgel L. E, Miles’T. Honenzymatic synthesis of oligoadenylates on a polyuridilic acid template. Proc.Nat.Acad.Sci. USA, 1968, v.59, № 3, p.726−733.
- Бадашкеева А.Г., Кабашева Г. Н., Кнорре Д. Г., Шамовский Г. Г., Шубина Т. Н. Конденсация тридезоксиаденилата с помощью водорастворимого карбодиимида в присутствии полиуридиловой кислоты. Докл. АН СССР, 1972, т.206, № 4, с.870−873.
- Кнорре Д.Г., Меламед Н. В., Попов С. Г., Шамовский Г. Г., Шубина Т. Н. О нерегулярной взаимной ориентации олигомеров в трехтя-жевом комплексе тридезоксиаденилата с полиуридиловой кислотой. Докл. АН СССР, 1974, т.218, № 1, с. ИЗ-Пб.
- Беккер Ж.М., Молин Ю. Н., Гиршович А. С., Грачев М. А., Кнорре Д. Г. Изучение межмолекулярного взаимодействия N -циклогексил, N'-ji-(4-метилморфолиний) этилкарбодиимида с тРНК методом ЯМР. Молекул.биол., 1969, т. З, вып. З, с.366−374.
- Бадашкеева А.Г., Горбунов Н. П., Шамовский Г. Г., Шубина Т. Н. Конденсация дидезоксигуанилата с помощью водорастворимого карбодиимида в присутствии полирибоцитидиловой кислоты. -Изв.Сиб.Отд. АН СССР, 1974, № 2, сер.хим.н., вып.1, с.96−102.
- Попов С.Г., Шамовский Г. Г. Комплексообразование диолигодезок-сиаденилил-5^ 5-пирофосфатов с полирибоуридиловой кислотой. -Молекул.биол., 1976, т.10, вып. З, с.576−583.
- Попов С.Г., Шамовский Г. Г. Индуцируемая водорастворимым карбодиимидом конденсация гексатимидилата в двуспиральном комплексе с полирибоадениловой кислотой. Изв.Сиб.Отд. АН СССР, 1976, № 7, сер.хим.н., вып. З, с.14−19.
- Долинная Н.Г., Шабарова З. А. Матричная химическая конденсация гетерогенных олигонуклеотидов. Биоорган. химия, 1980, т. 6,№ 2, с.209−216.
- Shabarova Z.A., Dolinnaya 2T.G., Turkin S.I., Gromova E.S. DlIA-like duplexes with repetitions*.!.Properties of concate-mer duplexes fdrraed by d (T-G-C-A-C-A-T-G). Nucl. Acids Res., 1980, v.8, N°11, p.2413−2429.
- Shabarova Z.A., Dolinnaya H.G., Drutsa V.L., Melnikova N.P., Purmal A.A. DFA-like duplexes with repetitions.III. Efficient template-guided chemical polymerization of d (TGGCCAAGCTp). -Nucl.Acids Res., 1981, v.9, N°21, p.5747−5761. .
- Kyogoku Y., Lord R.C., Rich A. An infrared stttdy of hydrogen bonding between adenine and uracil derivatives in chloroform solution. J.Amer.Chem.Soc., 1967, v.89, N°3,P"496−504.
- Lohrmann R., Orgel L.E. Template-directed synthesis of high molecular weight polynucleotide analogues. Nature, 1976, v.261, Ж°5556, p.342−344.
- Lohrmann R., Orgel L.E. Template-directed reactions of aminonucleosides. J.Mol.Evol., 1977, v.9, N°4, p.323−328.t
- Mnio J., Orgel L.E. Heteropolynucleotides as templates for non-enzymatic polymerizations. J.Mol.Evol., 1978, v.12, Я°2, p.91−99.
- Lohrmann R., Orgel L.E. Self-condensation of activated dinuc-leotides on polynucleotide templates with alternating sequences. J.Mol.Evol., 1979, v.14, N°4, p.243−250.
- Lohrmann R., Orgel L.E. Studies of oligoadenylate formation on a poly (U) template. J.Mol.Evol., 1979, v.12, U°3, p.237−257. .
- Ивановскеш М.Г., Готтих М.Б.,. Шабарова. З.А. ДНК-подобные дуплексы, содержащие, повторы. 1У. Матрично-направленная полимеризация имидазолида декадезоксирибонуклеотида. Биоорган, химия, 1982, т.8, № 7, с.940−944.
- Zn ion. J.Amer.Chem.Soc., 1975, v.97, N 12, p.3532−3533.57"Sawai H. Catalysis of internucleotide bond ftirmation by divalent metal ions. J.Amer.Chem.Soc., 1976, v.98, N°22, p. 7037−7039.
- Sleeper H.L., Orgel L.E. The catalysis of nucleotide polymerization by compounds of divalent lead. J.Mol.Evol., 1979, v. 12, № 4, p.357−364.
- Sleeper H.L., Lohrmann R., Orgel L.E. Template-directed syn2+thesis of oligoadenylates catalyzed by Pb ions. J.Mol. Evol., 1979, v.13, U°3, p.203−214.
- Lohrmann R., Bridson P.K., Orgel L.E. Efficient metal-ion catalyzed template-directed oligonucleotide synthesis. Science, 1980, v.208, N°4451, p.1464−1465.
- Lohrmann R., Orgel L.E. Efficient catalysis of polyc? tidylic2+acid-directed oligoguanylate formation by Pb. J.Mol.Biol., 1980, v.142, U°4, p.555−567.
- Bridson P.K., Orgel L.E. Catalysis of accurate poly (C)-direct 1 2+ted synthesis of 3 -5 -linked oligoguanylates by Zn. J.
- Sawai H. Template-directed synthesis of oligoadenylate. Temp- 104 late effect of oligouridylates and catalytic activity of Pb^+ ion. Nucl. Acids Res., 1980, Symp.Ser., U°8, p.577−579.
- Sawai H. Oligoadenylates formation on an oligouridylate template in the presence of a lead catalyst. J.Mol.Evol., 1981, v.17, p.48−51.
- Davidson D.K. Replication and the biosynthesis of DHA. In: The biochemistry of nucleic acids, New York: Acad. Press, 1972, p.233−290.70# Амбарцумян H.C., Киселев Л. Л. Энзимология обратной транскрипции. Молекул.биол., 1980, т.14, вып.5, с.965−985.
- Lohrmann R., Orgel L.E., Preferential formation of (2−5)-linked internucleotide bonds in non-enzymatic reactions. -Tetrahedron, 1978, v.34, N°7, p.853−855.
- Inoue Т., Orgel L.E. Substituent control of the poly (C)-di-rected oligomerization of guanosine-5*-phosphorimidazolide. J.Amer.Chem.Soc., 1981, v.103, H°25, p.7666−7667.
- Inoue Т., Orgel L.E. Oligomerization of (guanosine-5*-phosphor) -2-methylimidazolide on poly (C>. J.Mol.Biol., 1982, v.162, U°1, p.201−217.
- Uesugi S., Ikehara M. Synthesis and template-directed polymerization of adenylyl (3*-5*)adenosine cyclic 2~-3'-phosphate. Biochemistry, 1977, v.16, № 3, p.493−498.
- Renz M., Lohrmann R., Orgel L.E. Catalyst for the polymerization of adenosine cyclic 2*3*-phosphate on a poly (U-)template. Biochem. et Biophys. Acta, 1971, v.240, N°4, p.463−471.
- Shabarova Z.A., Prokofiev M.A. A model of enzymatic synthesis of the internucleotide bond between oligodeoxynucleotides. FEBS Lett., 1970, v.11, N°4, p.237−240,
- Недбай В.К., Соколова Н. И., Шабарова З. А., Прокофьев М. А. Химический матричный синтез олигонуклеотидов в водных раствора*. Докл. АН ССС$Г205, № 5, с.1114−1116.
- Гатинская Л.Г., Соколова Н. И., Шабарова 3.А.^Прокофьев М. А. Конденсация амидов олигодезоксиаденилатов в присутствии по-полиуридиловой кислоты. Изв. АН СССР, 1974, № 1, сер.хим., с.221−223.
- Chung U.M., Lohrmann R., Orgel L.E. Template catalysis of acetyl transfer reactions. Biochem. et Biophys. Acta, 1971, v.228, H°2, p.536−543.
- Fresco J.R., Massoulie J. Polynucleotides. V. Helix-coil transition of polyriboguanylic acid. J.Amer.ChemsSoc., 1963, v.85, H°9, p.1352−1353.
- V/alder J.A., Walder R.Y., Heller M.J., Preier S.M., Letsinger RiL., Klotz I.M. Complementary carrier peptide synthesis: general strategy and implications for prebiotic origin of peptide synthesis. Proc.Hat.Acad.Sci. USA., 1979, v.76, N°1, p.51−55.
- Chang S.K., Copsey D.B., Scott A.I. Template-directed organic synthesis. A model for the peptidil transfer reaction of. protein biosynthesis. Bioorg.Chem., 1978, v.7, N°2, p. 303−312. .
- Weber A.L., Orgel L.E. Poly (U)-directed peptide-bond formation from the 21(3')-glycyl esters of adenosine derivatives. J.Mol.Evol., 1980 V.16, N°1, p.1−10.
- Weber A.L., Orgel L.E. The formation of peptides from the1 / 1 ч
- C3) glycyl ester of a nucleotide. J.Mol.Evol., 1979, v. 13, И°3, p.185−192″
- Weber A.L., Orgel L.E. The efftict of poly© on the formati- 107 on of peptide bonds from 2'(3')-glycyl ester of a guanosi-ne nucleoside. J.Mql.Evol., 1981, v.17, K°3, p.190−191.
- Гринева Н.И. Химическое алкилирование в специфичных комплексах как метод исследования структуры и функции нуклеиновых кислот и нуклеопротеидов. Биохимия, 1977, т.42, вып.2, с. 370−374.
- Кнорре Д.Г. Афинная модификация белков, нуклеиновых кислот и их комплексов. Молекул.биол., 1977, т. II, вып. б, с. I304-I3I0.
- Власов В.В., Грачев М. А., Лаврик О. И. и др. Афинная модификация биополимеров. Новосибирск: Наука, 1983, с.187−212.
- Гринева Н.И., Сайкович Е. Г. Метоксисульфонилфенилэтиловые эфиры олигонуклеотидов новые реагенты для метилирования нуклеиновых кислот в комплементарном комплексе. — Биоорган, химия, 1979, т.5, № 4, с.563−567.
- Барам Г. И., Будкер В. Г., Гринева Н. И., Кнорре Д. Г., Козоро-вицкий А.Я., Шамовский Г. Г. Комплементарные взаимодействия бвнзилиденовых производных олигоаденилатов. Докл. АН СССР, 1971, т.201, № 1, с.95−98.
- Гринева Н.И., Карпова Г. Г., Шамовский Г. Г. Комплементация пентааденилиладенозина и алкилирующих производных олигоаде-нилиладенозинов с рибосомальной РНК, Молекул.биол., 1974, т.8, вып. З, с.358−371.
- Карпова Г. Г., Шелпакова Е. Д., Гринева Н. И. Исследование ком-плексообразования 4-(N -2-хлорэтил-N-метиламино)-бензил 5-фосфамидов олигоаденилатов с ДНК методом равновесного диализа. Молекул.биол., 1979, $.13, вып.4, с.955−959.
- Беликова A.M., Вахрушева Т. Е., Власов В. В., Гринева Н. И., Кнорре Д. Г., Курбатов В. А. Взаимодействие 4-(N -2-хлорэтил-N -метиламино)бензальдегида с транспортной РНК. Молекул.биол., 1969, т.вып.2, с.210−219. .
- Власов В.В., Гринева Н. И., Кнорре Д. Г. Алкилируняцие производные компонент нуклеиновых кислот. У1. Ионизация 4-(N -2-хлорэтил- N-метиламино)-бензальдегида и его ацеталей. -Изв.Сиб.Отд. АН СССР, 1969, #2, сер.хим.н., вып.1, с.104−109.
- Власов В.В., Гринева Н. И., Зарытова В. Ф., Кнорре Д. Г. Эффективность ацеталей 4-(N -хлорэтил-N-метиламино)-бензальде-гида, производных олигонуклеотидов, при алкилирования транспортной РНК. Молекул.биол., 1970, т.4, вып.2, с.201−204.
- Ю2.Веньяминова А. Г., Гринева Н. И. Алкилирующие цроизводные компонентов нуклеиновых кислот. X. Синтез и превращения 2-хлорэтиламинобензилиденовых производных 5-нуклеотидов. -Изв.Сиб.Отд. АН СССР, 1971, № 9, сер.хим.н., вып.4, с. III-118.
- Гринева Н.И., Ломакина Т. С., Тигеева Н. Г., Чимитова Т. А. Кинетика ионизации C-CI-связи в 4-(N-2-хлорэтил-N-метил-амино)бензил-5-фосфамидах нуклеозидов и олигонуклеотидов. -Биоорган.химия, 1977, т. З, № 2,с.210−214.
- Юб.Карпова Г. Г., Пичко Н. П., Чимитова Т. А., Гринева Н. И. Комплементарно адресованное алкилирование рибосомных РНК. scherjcfua coll в. комплексах особой конформации. Молекул, биол., 1979, т.13, вып.5, с.1012−1020.
- Юб.Гринева Н. И., Карпова Г. Г. Комплементарно. адресованное алки-лирование рибосомной РНК алкилирующими производными олигонуклеотидов. Молекул.биол., 1974, т.8, вып. б, с.832−840.
- Ю7.Кнорре Д. Г., Чимитова Т. А. Изотермы химической модификации биополимеров для аффинных реагентов, образующих активные промежуточные частицы. Молекул.биол., 1978, т.12, вып.1, с.814−821.
- Горшкова И.И., Кнорре Д. Г. Начальная скорость аффинной модификации реагентами, образующими активные промежуточные частицы. Биоорган. химия, 1980, т.6, № 2, с.230−241.
- Knorre d.g., Chimitova Т.А. Equation of the kinetic curves of affinity labelling of biopolymers with the reagents consumed in parallel reactions in solution. PEBS Lett., 1981, v.131, N°2, p.249−252.
- НО.Власов B.B., КнорреД.Г. Реакционная способность некоторых1. Vatостатков гуанозина дрожжевой tPHKj, ее половин и их комплекса. Молекул.биол., 1974, т.8, вып.2, с.234−243.
- Бенимецкая Л.2., Карпова Г. Г., Гринева Н. И. Алкилированные основания, образующиеся при 5-комплементарно^дресованной модификации ДНК, и кинетика их элиминирования в условиях алкилилирования. Биоорган. химия, 1978, т.4, № 10, с.1372−1381.
- Беликова A.M., Гринева Н. И. Получение, свойства и продукты кислотного гидролиза тРНК, алкилированной 4-(N-2-хлорэтил-N -метиламино)-бензальдегидом. Молекул.биол., 1970, т.4, вып.5, с.697−706.
- Гринева Е^й., Кнорре Д. Г., Курбатов В. А. О специфичности алкилирования транспортной РНК 4-(N -2-хлорэтил-N -метил-амино)-бензальдегидом. Молекул.биол., 1970, т.4, вып.6, с.814−820.
- Гринева Н.И., Ломакина Т. С., Мызина С. Д., Ноговицына Г. К. Алкилирование нуклеиновых кислот и их компонентов. Х1У. Алкилирование ДНК хлорэтилариламинами. Изв.Сиб.Отд. АН СССР, 1974, № 14, сер.хим.н., вып.6, с.125−134.
- Беликова A.M., Гринева Н. И. Алкилирование нуклеиновых кислот и их компонентов. УШ. Реакция 2,3−0-4-(N-2-хлорэтил- N-метиламино)бензилиден.уридина и -аденозина с тРНК. Изв.Сиб. Отд. АН СССР, 1971, № 12, сер.хим.н., вып.5, с.119−127.
- Богачев B.C., Гринева Н. И., Ломакина Т. С. Алкилирование нуклеиновых кислот и их компонентов. ХШ. Алкилирование гуанози-на и тРНК 4-(Ы-2-хлорэтил-М г метиламино) бензиламином и 54.(N-2-хлорэтил-N-метиламино)бензил. фосфамидом уридина. — Ill -.
- Изв.Сиб.Отд.АН СССР, 1973, № 9,сер.хим.н., вып.4, с.97−104.
- Дианов Г. Л., Бондарь Т. С., Салганик Р. И. Исследование комплементарного взаимодействия множественно алкилированных по-лирибонуклеотидов. Молекул.биол., 1979, т.13, вып.2, с. 383−387.
- Дианов Г. Л., Мазин A.B., Зайцев Б. И., Вавилин В. И., Салганик Р. И. Направленная модификация ранней области ДНК бактериофага Т7 путем алкилирования в R -петле, образованной модифицированным транскриптом. Молекул.биол., 1980, т.14, вып.2, с.216−264.
- Summerton J., Bartlett P.A. Sequence-specific crosslinking agents for nucleic acids. J.Mol.Biol., 1978, v.122, N°1, p.145−162.
- Власов В.В., Казаков С. А. Комплементарно адресованная модификация робу (I) цис-гидроксодиамминоплатиновыми производными олигоцитидилатов. Биоорган. химия, 1982, т.8, № 4, с. 499−506.
- Vlassov V.V., Gorn V.V., Ivanova Б.М., Kazakov S.A., Mama-ev S.V. Complementary addressed modification of oligonucleotide d (pGpGpCpGpGpA) with platinum derivative of oligonucleotide dCpTpfpCpGpCpCpTpTpT). FEBS Lett., 1983, v.162, N°2, p.286−289.
- Caradonna J.P., Lippard S.J., Gait M.J., Singh M. The Antitumor drug cis- ptCNH^gClg. %orms an intrastrand d (GpG) cross-link upon reaction with jd (ApGpGpCpCpT)] g* ~ J.Amer. Chem.Soc., 1982, v.104, H°21, p, 5793−5795.
- Johnson N.P., Macquet J.P., Wiebers I.L., Monsarrat B. Structures of the adducts formed between pt (dien)Cl.oi and DNA in vitro. Uucl. Acids Res., 1982, v.10, U°17, p. 5255−5271.
- Зарытова В.Ф., Иванова Е. М., Кутявин И. В. Синтез олигодезоксирибонуклеотидовСбССТСПТСбСи T(pT)j^ триэфирным методом с использованием 5-n-хлорфениловых эфиров соответствующих олигонуклеотидных блоков. Биоорган. химия, 1982, т. из 8, № 2, с.224−230. .
- Потапов В.К., Потемкин Г. А., Горн В. В., Зарытова В. Ш., Средин Ю. Г., Шабарова З. А., Кнорре Д. Г. Полуавтоматический твердофазный синтез олигодезоксирибонуклеотидов. Докл. АН СССР, 1982, т.263, № 6, с.1386−1389.
- Беликова A.M., Гринева Н. И. Алкилирующие производные rv -ами-нобензилиденуридина. Изв.Сиб.Отд. АН СССР, 1966, Ml, сер. хим.н., вып. З, с.79−83.
- Гринева Н.И., Зарытова В. Ф., Кнорре Д. Г. Алкилирующие производные компонент нуклеиновых кислот. УП. Метиловый эфир 2,3−0-4-(N -2 -хлорэтил- N -метиламино) бензилиден. уридин-5-фосфата. Ж.общ.химии, 1970, т. ХКСП), вып.1, с.215−222.
- Wagner A.F., Bugianesi R.L., Shen T.Y. Preparation of sepha-rose-bound poly (rI:rC). Biochem. and Biophys.Res.Commun., 1971, v.45, N°1, p.184−189.
- Ш. Древич В. Ф., Кнорре Д. Г., Малыгин Э. Г., Салганик Р. И. Выделение денатурированных участков ДНК при помощи модификации водорастворимым карбодиимидом и последующего ферментативного гидролиза. Молекул.биол., 1967, т.1, вып.2, с. 249.256.
- Jensen D.E., Reed D. J., Reaction of D1TA with, alkylation agents. Quantitation of alkylation by ethylnitrosourea of oxygen and nitrogen sites on poly dA-dT including phospho-triester formation. Biochemistry, 1978, v.17, N°24,p.5098,
- Drevitch V.P., Salganik R.I., Knorre D.G., Malygin E.G. The reaction of ША with water-soluble carbodiimide and enzyme sensitiyyty of modified MA. Biochim. et Biophys. Acta, 1966, v.123, N°1, p.207−209.
- August i-Toe с о G., Brown G.L. Reaction of lT-cyclohexyl, U'-^-(4-methylmorpholinium)ethyl carbodiimide iodide with nucleic acids and polynucleotides. Hature, 1965, v.206, 1T°4985, p.683−685.
- Бенимецкая Л.З., Герасимова Л. М., Гринева Н. И., Карпова Г. Г. Комплементарно адресованное алкилирование и фрагментация ДНК фага Т7 вблизи олиготимидиловых последовательностей. Молекул.биол., 1978, т.12, вып.5, с.988−1001.
- Беликова A.M., Гринева Н. И., Зарытова В. Ф., Кабашева Г. Н., Кнорре Д. Г. Конфигурация и некоторые особенности конформа-ции бензилиденовых производных нуклеозидов и нуклеотидов. -Докл. АН СССР, 1970, т.195, № 6, с.1337−1340.
- Гринева Н.И., Зарытова В. Ф., Кабашева Г. Н., Кнорре Д. Г., Козоровицкий А.Я, 0 конформации 2,3−0-бензилиденовых производных олигонуклеотидов. Докл. АН СССР., 1971, т.198, № 3, с.582−584.
- Parmer Р.В., Poster А.В., Jarman М., Tisdale M.J. The altkylation of 2 -deoxyguanosine and of thymidine with diazo-alkanes. Biochem.J., 1973, v.135, H°1, p.203−213.
- Price C.G., Gaucher G.M., Koneru P., Shibakowa R., Sowa J. R., Yamaguehi M. Relative reactivities for monofunctional nitrogen mustard alkylation of nucleic acid components. -Biochim. et Biophys. Acta, 1968, v.166, Ж°2, p.327−359.
- Bannon P., Verly W., Alkylation of phosphates and stability of phosphate triesters in DHA. Eur.J.Biochem., 1972, v. 31, N°1, p.103−111.
- Kusmierek J.Т., Singer B. Reaction of diazoalkanes with2 3 41. substitution of 0, H, and 0 -alkyl products. Nucl. Acids Res., 1976, v.3, N°4, p.989−1000.
- Phaese H.-J., Preese E. Chemical analysis of ША alterac-tions. IV. Reactions of oligodeoxynucleotides wi*fch monofunctional alkylating agents leading to backbone breakage.
- Biochim. et Biophys. Acta, 1969, v.190, U°2, p.418−433.
- Crathorn A.R., Shooter K, V. The alkaline hydrolysis ofphosphotriesters in alkylated mammalian DHA. Biochim. et Biophys. Acta, 1982, v.697, N°2, p.259−261.
- Гринева Н.И., Кнорре Д. Г., Курбатов В. А. Алкилирование ти- 116 мидилата ароматическими 2-хлорэтиламинами. Изв.Сиб.Отд. АН СССР, 1971, М, сер.хим.н., вып.2, с.107−111.
- Brosius J, Dull T.J., Sleeter D. D, Holler H.P. Gene organization and primary structure of a ribosomal ШТА operon from Escherichia coli. J.Mol.Biol., 1981, v.148, N°2, p.107−127.
- Miller P. S., Dreon IT., Pulford S.M., McParland K.B. Olygo-thymidylate analogues having stereoregular, alternating me-thylphosphonate/phosphodiester backbones. J.Biol.Chem., 1980, v.255, N°20, p.9659−9665.
- Беликова A.M., Гринева Г. Г., Карпова Г. Г. Алкилирование нуклеиновых кислот и их компонентов. ХП. Реакционная способность нуклеозидов при алкилировании ароматическими 2-хлорэтилами-налм. Изв.Сиб.Отд. АН СССР, 1972, № 9, сер.хим.н., вып.4, C. II0-II6.