Дипломы, курсовые, рефераты, контрольные...
Срочная помощь в учёбе

Анализ изменчивости митохондриальных ДНК тубаларов Горного Алтая и эвенов Восточной Сибири

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

На протяжении многих лет лаборатория молекулярной генетики человека исследует антропологические изоляты Сибири, с целью изучения характера изменчивости мтДНК и поиска «следов» филогенетических линий (А2, В2, С1, Dl, D2, D3, D10, Х2а), которые заселили Новый Свет (Torroni et al., 1993; Сукерник и др., 1996; Schurr et al., 1999; Starikovskaya et al., 1998, 2005; Derbeneva et al., 2002a… Читать ещё >

Содержание

  • СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ И ТЕРМИНОЛОГИЯ
  • Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Митохондриальная ДНК человека
    • 1. 2. Номенклатура митохондриальных гаплогрупп
    • 1. 3. Молекулярные методы для идентификации мтДНК гаплогрупп
    • 1. 4. Филогеографический подход к изучению разнообразия мтДНК и концепция молекулярных часов
    • 1. 5. Хронология эволюционных событий
    • 1. 6. Эволюционная история митохондриального генома человека
    • 1. 7. Особенности применения мтДНК при изучении расселения человека
    • 1. 8. Причины территориально-специфического разнообразия мтДНК человека
    • 1. 9. Структура генетических изолятов
    • 1. 10. Краткая этническая история популяций
      • 1. 10. 1. Тубалары горного Алтая
      • 1. 10. 2. Эвены Нижней Индигирки и Приохотья

Анализ изменчивости митохондриальных ДНК тубаларов Горного Алтая и эвенов Восточной Сибири (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Актуальность. В результате анализа изменчивости митохондриальной ДНК (мтДНК) человека современного вида (ЧСВ) было установлено, что большая часть гаплогрупп, обнаруживаемых в современных популяциях Евразии, была привнесена на континент на протяжении последних 70 тыс. лет в результате ряда последовательных миграций с территории Ближнего Востока и Африки (Mellars, 2006; Pope, Terrell, 2008; Soares et al., 2009; Stanyon et al., 2009). Археологические данные свидетельствуют в пользу заселения южных широт континентальной Сибири популяциями ЧСВ около 43 тыс. лет назад, в эпоху раннего палеолита, однако продвижение вглубь Сибирской Арктики было задержано, вероятно, вследствие резкого похолодания, по данным палеоклиматологии, примерно 32 тыс. лет назад (Pitulko et al., 2004; Goebel et al., 2008; Kuzmin, 2008; Graf, 2009). Относительная изоляция от остальной части Азиатского материка превращает вопросы первоначального заселения Сибири в вопросы первостепенной важности для понимания процессов адаптации человека к суровым условиям, а также установления путей миграции в Северо-Восточной Евразии в период последнего оледенения в направлении Нового Света (Derevianko, Shunkov, 2004; Kuzmin, 2008).

На протяжении многих лет лаборатория молекулярной генетики человека исследует антропологические изоляты Сибири, с целью изучения характера изменчивости мтДНК и поиска «следов» филогенетических линий (А2, В2, С1, Dl, D2, D3, D10, Х2а), которые заселили Новый Свет (Torroni et al., 1993; Сукерник и др., 1996; Schurr et al., 1999; Starikovskaya et al., 1998, 2005; Derbeneva et al., 2002a, 2002bMishmar et al., 2003; Volodko et al., 2008). Однако отсутствие до недавнего времени достаточного количества полных нуклеотидных последовательностей мтДНК коренных жителей Сибири являлось препятствием для использования современных филогеографических подходов. Филогенетические реконструкции, выполненные на основе полных последовательностей, и анализ изменчивости на уровне последовательностей гипервариабельного сегмента мтДНК (ГВС) и ИДРФ-анализа мтДНК послужили основой для уточнения временных рамок и направлений путей миграции отдельных гаплогрупп (Derbeneva et al., 2002; Starikovskaya et al., 2005; Derenko et al., 2007; Yolodko et al., 2008).

В настоящей работе проведено исследование разнообразия митохондриальных геномов популяций, населяющих территории горного Алтая (тубалары) на юго-западе Сибири и Приохотья (эвены) на северо-востоке Сибири. Интерес к коренному населению этих областей обусловлен особым интересом к истории заселения северо-восточной Евразии вэпоху палеолита и неолита. Изучение характера изменчивости мтДНК этнически гетерогенного населения северного Алтая, позволит лучшепонять региональную историюпоскольку Алтай- «впитал» несколько волн миграций из центральной Азии (Gomas et al., 2004; Lalueza-Fox et al., 2004) — С другой? стороны, известно, что эвены на. протяжении длительногопериода времени контактировалис юкагирами, а также русскими старожиламш-^осЬекощ. 1910;: Eevihj Potapov, 1964; Бахтин и др., 2004). Своевременный молекулярно-генетический анализпопуляций ту бал аров и эвенов, связанных генетической непрерывностью' и культурной преемственностью > с автохтоннымнаселениемданных территорий, крайне необходим^ поскольку внастоящее время наблюдается^ размывание и исчезновение их уникальных генофондов;

Цель и задачи исследования

Целью работы было проведение сравнительного анализауникального митохондриального генофонда коренных популяций Сибири, разобщенных территориально — тубаларов горного Алтая и эвенов Нижней. Индигирки и Приохотья. Для достижения цели ставилисьследующие задачи: (1) выяснить состав и происхождение филетических материнских линий у тубаларов и эвенов- (2) оценить возможный* вклад протоевразийских популяций в генетическое разнообразие коренного населения Сибири.

Научная новизна и практическая ценность. В настоящем исследовании впервые получены фундаментальные данные по изменчивости мтДНК популяций тубаларов горного Алтая и эвенов Нижней Индигирки и Приохотья. Статистический и филогенетический анализ позволил уточнить генетическую историю их происхождения и внести существенный вклад в реконструкцию эволюционной истории Сибири.

Положения, выносимые на защиту. Митохондриальный геном тубаларов и эвенов содержит уникальный набор гаплотипов, связанных с процессами первоначального заселения Северо-Восточной Евразии человеком современного вида (ЧСВ).

Апробация работы. Результаты работы были доложены на XX международном конгрессе по генетике «Генетика — понимание живых систем» (Берлин, Германия) в июле 2008 г.- на ежегодном съезде Американского общества генетики (Филадельфия, Пенсильвания, США) в ноябре 2008 г.- на Общеевропейской конференции по генетике человека (Вена, Австрия) в мае 2009 г.

Вклад автора. Автор выполнил экспедиционные сборы у тубалар Горного Алтая (родословные и пробы крови). Экспедиционные сборы среди эвенов Нижней Индигирки и Приохотья выполнены Р. И. Сукерником и Е. Б. Стариковской. Молекулярно-генетический анализ мтДНК выполнен автором. По мере интерпретации результатов и выполнении филогеографического анализа автору помогали Е. Б. Стариковская, Р. И. Сукерник, Н. В. Володько и Н. П. Ельцов.

Структура и объем диссертации

Работа состоит из введения, обзора литературы, методов, результатов, обсуждения, выводов, списка цитированной литературы, содержащего 119 ссылок, из которых 19 на русском языке, а также.

ВЫВОДЫ.

1. Впервые с применением полного секвенирования мтДНК был описан митохондриальный генофонд тубаларов горного Алтая и эвенов восточной Сибири. Первый включает как западно- (НУ, И, X), так и восточно- (А, В, С, Э, О, Z, И9/У) евразийские гаплогруппы. В то же время генофонд эвенов представлен исключительно восточноевразийскими гаплогруппами (С, Б, в, г).

2. Гаплогруппа ШЬ, филогенетический возраст которой составляет около 22 тыс. лет, обнаружена у тубаларов с частотой 14,7%, и, очевидно, представляет собой остатки ранней Верхнепалеолитической экспансии ЧСВ.

3. Гаплогруппа Х2е, обнаруженная у тубаларов, очевидно, представляет собою отдельную ветвь возрастом не более 3,1 тыс. лет и является-частью генного потока в направлении юго-западной Сибири в эпоху позднего Неолита.

4. Гаплогруппа Zla имеет возраст около 16,4 тыс. лет, что может свидетельствовать о реколонизации высоких широт Евразии её носителями в раннем Голоцене.

5. У эвенов выявлены редкие, практически исчезнувшие линиджи D2Ъ и 02с, с частотой 3,5% и 1,2%, соответственно.

6. Генетические связи между популяциями Алтае-Саянского нагорья и американскими индейцами демонстрирует кластер Б3а2а1, обнаруженный исключительно у тубаларов и эскимосов (включая американских).

1.11.

Заключение

.

Сибирь занимает особое положение в эволюции истории человека как вида. К приходу первых русских в Сибирь в XVI в. лишь некоторые популяции охотничье-собирательского типа сохранились в виде антропологических изолятов, которые в настоящее время переживают стадию полного распада и ассимиляции (Долгих, I960- Rogers, 1986). В связи с этим остатки их уникальных генофондов представляют собой бесценный источник генетической информации, важный не только для анализа популяционной истории Сибири, но и для реконструкции эволюционной истории человека как вида.

Структура и происхождение мтДНК-гаплогрупп у аборигенов Горного Алтая, тубалар, а также жителей Приохотья, эвенов, остаются малоизученными. Применение ПДРФ-анализа в сочетании с секвенированием гипервариабельного сегмента мтДНК и выборочного полного секвенирования лишь немногих образцов (в силу недостаточного развития методов молекулярной генетики в то время) при описании изменчивости мтДНК этих популяций (Starikovskaya et al., 2005) являются недостаточно информативными для проверки существующих эколого-археологических и лингвистических моделей первоначального заселения Сибири человеком.

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

2.1. Величина и состав выборки.

Образцы крови были собраны в результате экспедиций, выполненных в 2005;2008 годы Р. И. Сукерником, Е. Б. Стариковской и И. О. Мазуниным. До начала взятия проб крови выясняли семейную историю, включая место рождения бабушки по материнской линии, а также язык, на котором она говорила. В итоге кровь брали у индивидов, не родственных как минимум до третьего поколения. Общая выборка составила 143 тубалара и 87 эвена. Информированные согласия получали от каждого донора индивидуально.

Образцы крови тубалар были собраны предпочтительно у лиц старшей возрастной группы, проживающих в следующих селениях: Урлу-Аспак, Паспаул, Умень, Кара-Кокша, Инырга, Салганда, Туньжа, Санькин-Аил, Кебезень, Артыбаш, Пыжа, Усть-Пыжа (Чойский и Турочакский район, Алтайская Республика). Всего было предпринято 5 экспедиций. За редким исключением, представители данной выборки были уверены в своем тубаларском происхождении по материнской линии. В ходе сбора образцов избегали индивидуумов, имеющих русское происхождение.

Образцы крови эвенов были собраны в одинадцати поселках: Чокурдах, Русское устье, Казачье, Хаир, Юкагир (Аллаиховский район, Республика Саха), Нелькан и Джигда на реке Майя (Аяно-Майский район), Тором, Уда, Чумикан и Тугур (Тугуро-Чумиканский район, Хабаровский край). Всего было предпринято 4 экспедиции. Основное количество образцов было взято у лиц, знавших о своем тунгусском происхождении, однако некоторые индивиды из Чокурдаха сомневались в выборе между эвенами и юкагирамидругие, с реки Мая, между эвенами и эвенками. В ходе сбора образцов избегали индивидуумов, имеющих якутское происхождение.

2.2.1. Выделение и очистка ДНК.

Пробы крови общим объемом 6 мл брали из локтевой вены, с использованием вакуумной системы забора крови Vacutest с антикоагулянтом (КЗ-ЭДТА). В течение двух-трех дней кровь пассивно фракционировалась при +4°С, после чего отбирали лейкоцитарно-тромбоцитарный слой для последующего выделения ДНК.

ДНК выделяли, используя QIAamp DNA Blood Kit for DNA purification, QIAGEN Inc., согласно протоколу производителя. Для визуализации полученную ДНК разгоняли в 1% агарозном геле, содержащем GelStar Nucleic Acid Gel Stain, LONZA.

2.2.2. Гаплотипирование образцов.

Для определения митохондриального гаплотипа использовали ПДРФ-анализ, включающий 14 рестриктаз (Alui, Ddel, Haelll, Hhal, Iiinil, Hpal, Rsal, Taql, НаеII, Hindi, Accl, MseI, Avril, Tsp5Q9l) кроме того, проводили секвенирование первого гипервариабельного сегмента (ГВС-I), занимающего положение 16 024−16 383 п.н., а также секвенирование выборочных сайтов, не поддающихся рестрикционному анализу. Для сравнения использовали кембриджскую последовательность (Andrews et al., 1999). Принадлежность гаплотипа к филетической линии определяли по совокупности специфических полиморфных замен в нуклеотидной последовательности кодирующего и контрольного районов согласно постоянно обновляемой классификации (Achilli et al., 2004, 2005; Herrnstadt et al., 2002; Starikovskaya et al., 2005; Volodko et al., 2008).

ПДРФ-анализ. мтДНК каждого образца была амплифицирована на ПЦР-амплификаторе «MJ Mini Personal Thermal Cycler» (BIO-RAD) с двадцатью двумя парами специально подобранных праймеров (табл. 2). В результате амплификации получали пересекающиеся последовательности длинной в среднем, около тысячи пар нуклеотидов.

Показать весь текст

Список литературы

  1. Н.И. Филогеография: итоги, проблемы, перспективы //
  2. Вестник ВОГиС. 2007. Т. 11. № 2. С. 307−331.
  3. . Семь дочерей Евы // М.: Рипол Классик. 2003. С. 37−38.
  4. Богораз ВТ. Древние переселения народов в Северной Евразии и в
  5. Америке // Ленинград: Сборник Музея антропологии и этнографии Академии Наук СССР. 1926. Т. VI. С. 37−62.
  6. Н.Б., Головко Е. В., Швайтцер П. Русские старожилы Сибири:
  7. Социальные и символические аспекты самосознания // Москва: Новое издательство. 2004. С. 47−71.
  8. В. Алтайцы // Томские Губернские Ведомости. 1870. С. 12.
  9. Н.В. Анализ изменчивости мтДНК юкагиров коренныхжителей полярной Сибири: Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук, Новосибирск, 2009. 99.
  10. КС. Этническая история Северо-Востока Сибири // М.: Наука.1966. стр. 24−39.
  11. Дербенева О. А. Анализ изменчивости мтДНК коренных жителей
  12. Нижней Оби и. Енисея (манси- кеты и энцы/нганасаны): Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук, Новосибирск, 2002. 99.
  13. . Родовой и племенной состав народов Сибири1 в 17 веке //
  14. Москва: Труды Института этнографии АН СССР. 1960. Т. 55. С. 3−23.
  15. П.Н., Володъко Н. В., Стариковская Е. Б., Мазунин И. О., Сукерник Р. И. Роль естественного отбора в эволюции митохондриальных гаплогрупп Северо-Восточной Евразии // Генетика. 2010. Т.46. № 9. С. 1247−1249.
  16. В. Новое секвенирование ДНК // Труды семинара, Институттеоретической и экспериментальной биофизики РАН (Пущино) от 11 июня, 2009.
  17. B.B. Молекулярная эволюция и филогенетический анализ // БИНОМ. Лаборатория знаний. 2009. С. 168−185.
  18. П. 454-секвенирование (высокопроизводительноепиросеквенирование ДНК) // Биомолекула. 2008. http://biomolecula.ni/content/214
  19. Потапов ЛИ Очерки по истории алтайцев // М. — Л. 1953. С. 173.
  20. Л.П. Тубалары Горного Алтая // Этническая история народов Азии. 1972. С. 52−66.
  21. Р.И., Шур Т.Г., Стариковская Е. Б., Уоллес Д. К. Изменчивость митохондриальных ДНК у коренных жителей Сибири в связи с реконструкцией эволюционной истории американских индейцев. Рестрикционный полиморфизм // Генетика. 1996. Т.32. С.432−439.
  22. Е.Б. Изменчивость митохондриальных ДНК коренных жителей Чукотки в связи с генетической историей древней Берингии: Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук, Новосибирск, 1999. 85.
  23. В.А. Тунгусы (эвенки и эвены) Средней и Западной Сибири //М.: Наука. 1985. С. 139−183.
  24. Л., Парсон П. Генетика поведения и эволюция // Пер. с англ. -М.: Мир, 1984. С. 54−97.
  25. Achilli A., Rengo С., Battaglia К, Pala М., Olivieri A., Fornarino S., Magri
  26. С., Scozzari R., Babudri N., Santachiara-Benerecetti A.S., Bandelt HJ., Semino O., Torroni A. Saami and Berbers—an unexpected mitochondrial DNA link // Am. J. Hum. Genet. 2005. V. 76. № 5. P. 883−886.
  27. Achilli A., Rengo С., Magri С., Battaglia V., Olivieri A., Scozzari R.,
  28. Alvarez-Iglesias V., Jaime J.C., Carracedo A., Salas A. Coding regionmitochondrial DNA SNPs: targeting East Asian and Native American haplogroups // Forensic Sei Int Genet. 2007. V. 1. № 1. P. 44−55.
  29. Andrews R.M., Kubacka L, Chinnery P.F., Lightowlers R.N., Turnbull
  30. D.M., Howell N. Reanalysis and revision of the Cambridge reference sequence for human mitochondrial DNA I I Nat. Genet. 1999. V. 23. P. 147.
  31. Avise J.C. Phylogeography. The history and formation of species // Harvard
  32. University Press. Cambridge. 20 001
  33. Avise J.C., Arnold J., Ball R.M., Bermingham E., Lamb T., Neigel J.E., Reeb C.A., Saunders N.C. Interaspecific phylogeography: the mitochondrial DNA bridge between population genetics and systematics // Annu. Rev. Ecol. Syst. 1987. V. 18. P. 489−522.
  34. Behar D.M., Villems R., Soodyall H., Blue-Smith J., Pereira L., Metspalu
  35. E., Scozzari R., Makkan TL, Tzur S., Comas D., Bertranpetit J., Quintana-Murci L., Tyler-Smith C., Wells R.S., Rosset S., Genographic Consortium. The dawn of human matrilineal diversity // Am. J. Hum. Genet. 2008. V. 82. P. 1130−1140.
  36. Benoist J. Saint-Bartelemy: physical anthropology of an isolate // Am. J. Phys. Ant. 1964. V. 22. P. 473−487.
  37. Bradley B., Stanford D. The North Atlantic ice-edge corridor: a possible Palaeolithic route to the New World // World Archaeology. 2004. V. 36. P. 459−478.
  38. Bradley B., Stanford D. The Solutrean-Clovis connection: reply to Straus, Meitzer and Goebel. // World Archaeology. 2006. V. 38. P. 704−714.
  39. Cann R.L., Stoneking M., Wilson A.C. Mitochondrial DNA and human evolution //Nature. 1987. V. 325. № 6099. P. 31−36.
  40. Choi S.Y., Kim Y.E., Ahn D.B., Kim T.H., Choi J.H., Lee H.R., Hwang S.J., Kim U.K., Lee S.H. Construction of a DNA Chip for Screening of Genetic Hearing Loss // Clin. Exp. Otorhinolaryngology. 2009. V. 2. № 1. P. 44−47.
  41. Comas D., Plaza S., Wells R.S., Yuldaseva N., Lao O., Calafell F.,
  42. Betranpetit J. Admixture, migrations, and dispersals in Central Asia: evidence from maternal DNA lineages // Eur. J. Hum. Genet. 2004. V. 12. P. 495−504.
  43. Cummins J.M. Fertilization and elimination of the paternal mitochondrial genome // Hum. Reprod. 2000. P. 152. P. 92−101.
  44. Dahlberg G. Inbreeding in man // Genetics. 1929. V. 14. P. 421−454.
  45. Derbeneva O.A., Starikovskaia E.B., Volod’ko N.V., Wallace D.C., Sukernik R.I. Mitochondrial DNA variation in Kets and Nganasans and the earlypeoples of Northern Eurasia. // Genetika. 2002a. V. 38. № 11. P. 15 541 560.
  46. Derbeneva O.A., Starikovskaya E.B., Wallace D.C., Hosseini S.H., Lott M.T., Wallace D.C. Traces of early Eurasians in the Mansi of northwest Siberia revealed by mitochondrial DNA analysis // Am. J. Hum. Genet. 2002b. V. 70. № 4. P. 1009−1014.
  47. Derbeneva O.A., Sukernik R.I., Volodko N.V., Hosseini S.H., Lott M.T.,
  48. Wallace D.C. Analysis of mtDNA diversity in the Aleut of the Commanders and its implication for the genetic history of Beringia // Am. J. Hum. Genet. 2002c. V. 71. P. 415−421.
  49. Derevianko A, Shimkin D. The paleolithic of Siberia // University of Illinois Press, Urbana and Chicago. 1998.
  50. Derevianko A., Shunkov M. Formation of the Upper Palaelothic traditions in
  51. Altai // Archelogya, Ethnographiya and Anthropologiya of Eurasia. 2004. V. 3. P. 12−40.
  52. DiMauro S., Schon E.A. Mitochondrial disorders in the nervous system // Annu. Rev. Neurosci. 2008. V. 31. P. 91−123.
  53. Els on J.L., Andrews R.M., Chinnery P.F., Lightowlers R.N., Turnbull D.M., Howell N. Analysis of European mtDNAs for recombination // Am. J. Hum. Genet. 2001. V. 68. P. 145−153.
  54. Forster P. Ice Ages and the mitochondrial DNA chronology of humandispersals: a review // Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 2004. V. 359. № 1442. P. 255−264- discussion 264.
  55. Giles R.E., Blanc H., Cann H.M., Wallace D.C. Maternal inheritance of human mitochondrial DNA // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1980. V. 77. P. 6715−6719.
  56. Goebel T., Waters M.R., O’Rourke D.H. The late Pleistocene dispersal ofmodern humans in the Americans // Science. 2008. V. 319. P. 1497−1502.
  57. Gonder M.K., Mortensen H.M., Reed F.A., de Sousa A., Tishkoff S.A. Whole-mtDNA genome sequence analysis of ancient African lineages // Mol. Biol. Evol. 2007. V. 24. P. 757−768.
  58. K. «The Good, the Bad, and the Ugly»: evaluating the radiocarbon chronology of the middle and' late Upper Paleolithic in the Enisei River valley, south-central" Siberia // J. of Archeology. Science. 2009. V. 36 P. 694−707.
  59. Harpending H.C., Batzer M.A., GurvenM., JordeL. Bl, Rogers A. Rl, Sherry S. T. Genetic traces of ancient demography // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. V. 95. Pf 1961−1967.
  60. Hartmann A., Thieme M., Nanduri L.K., Stempfl T., Moehle C., Kivisild T.,
  61. Oefner P.J. Validation of Mircoarray-Based Resequencing of 93 Worldwide Mitochondrial’Genomes // Hum. Mut. 2009. V. 30. P. 115−122.
  62. Herrnstadt C., Elson J.L., Fahy E., Preston G., Turnbull D.M., Anderson
  63. Hewitt G.M. The structure of biodiversity insights from molecular phylogeography // Front Zool. 2004. V. 1. № 1. P. 4.
  64. Ingman M., Gyllensten U. Rate variation between mitochondrial domainsand adaptive evolution in humans // Hum. Mol. Genet. 2007. V. 16. № 19. P. 2281−2287.
  65. Janhunen J. Manchuria: An Ethnic History // Finno-Ugrian Society, Helsinki. 1996.
  66. Jiang Y., Hall T.A., Hofstadler S.A., Naviaux R.K. Mitochondrial DNA mutation detection by electrospray mass spectrometry // Clin. Chem. 2007. V. 53. № 2. P. 195−203.
  67. Jobling M.A., Tyler-Smith C. The human Y chromosome: an evolutionary marker comes of age // Nat. Rev. Genet. 2003. V. 4. № 8. P. 598−612.
  68. Johelson W. The Yukaghir and the Yukaghirized Tungus. The Jesup North
  69. Pacific Expedition //New York: Leiden. 1910. V. I-III. 61 .Kerr R.A. Paleoclimatology. Looking way back for the world’s climate future // Science. 2006. V. 312. P. 1456−1457.
  70. Kmiec B., Woloszynska M., Janska H. Heteroplasmy as a common state of mitochondrial genetic information in plants and animals // Curr. Genet. 2006. V. 50. P. 149−159:
  71. M. 1988. Many tongues-ancient tales. Peoples of the Amur and maritime regions. In: Crossroads of continents: cultures of Siberia and Alaska // (eds.W.W. Fitzhugh & A. Crowell). Smithsonian Institution Press, Washington, DC, 1988. P. 145−150.
  72. Kuzmin Y. Siberia at the Last Glacial Maximum: environment andarchaeology // J. Arch. Res. 2008. V. 16. P. 163−221.
  73. Lalueza-Fox C., Sampietro M.L., Gilbert M.T., Castri L., Facchini F.,
  74. Pettener D., Bertanpetit J. Unravelling migrations in the steppe: mitochondrial DNA sequences from ancient central Asians // Proc. Biol. Sei. 2004. V. 271. P. 941−947.
  75. Larsson N-G., Clayton D.A. Molecular genetic aspects of human mitochondrial disorders // Annu. Rev. Genetics. 1995. V. 29. P. 151−178.
  76. Levin M., Potapov L. The People of Siberia // University of Chicago Press.1964. Chicago. IL.
  77. Lum J.K., Cann R.L. mtDNA lineage analyses: origins and migrations of Micronesians and Polynesians // Am. J. Phys. Anthropol. 2000. V. 113. P. 51−68.
  78. Maca-Meyer N., Gonzalez A.M., Larruga J.M., Flores C., Cabrera V.M. Major genomic mitochondrial lineages delineate early human expansions // BMC. Genet. 2001. V. 2. P. 13.
  79. Malyarchuk B., Grzybowski T., Derenko M., Perkova M., Vanecek T., Lazur J., Gomolcak P., Tsybovsky I. Mitochondrial DNA phylogeny in Eastern and Western Slavs // Mol. Biol. Evol. 2008. V. 25. № 8. P. 1651−1658.
  80. Mellars P. Going east: new genetic and archaeological perspective on themodern human colonization of Eurasia // Science. 2006. V. 313. P. 796 800.
  81. Morral N., Bertranpetit J., EstivillX., Nunes V., Casals T., Gimenez J., Reis A., Varon-Mateeva R., Macek M.Jr., Kalaydjieva L. The origin of the major cystic fibrosis mutation (delta F508) in European populations // Nat. Genet. 1994. V. 2. P. 169−175.
  82. Neel J. V. The population structure of an Amerindiane tribe, the Yanomano // Ann. Rev. Genet. 1978. V. 12. P. 365−413.
  83. Pakendorf B., Stoneking M. Mitochondrial DNA and Human Evolution // Annu. Rev. Genomics. Hum. Genet. 2005. V. 6. P. 165−183.
  84. Pitulko V. V., Nikolsky P.A., Girya E. Y, Basilyan A.E., Tumskoy V.E.,
  85. Koulakov S.A., Astakhov S.N., Pavlova E.Y., Anisimov M.A. The Yana RHS site: humans in the Arctic before the last glacial maximum // Science. 2004. V. 303. P. 52−56.
  86. Pope K., Terrell J. Environmental setting of human migration in the circum
  87. Pacific region // J. Biogeog. 2008. V. 35. P. 1−21.
  88. RadloffW. Aus Sibirien // Leipzig. 1883. P. 213.
  89. Rajkumar R., Banerjee J., Gunturi H.B., Trivedi R., Kashyap V.K. Phylogeny and antiquity of M macrohaplogroup inferred from complete mt DNA sequence of Indian specific lineages // BMC. Evol. Biol. 2005. V. 5. P. 26.
  90. Redd A.J., Stoneking M. Peopling of Sahul: mtDNA variation in aboriginal Australian and Papua New Guinean populations // Am. J. Hum. Genet. 1999. V. 65. P. 808−828.
  91. Roberts D.F. Disscussion. In: The genetics of migrant and* isolate populations // E. Goldschmidt, edi New. York. 1963.
  92. Roberts D.F. Genetic studies of isolates // Modern trends in human genetics.1975. V. 2. P: 221−269.
  93. Robin E. D, Wong R. Mitochondrial^DNA molecules and- virtual" number of mitochondria per cell in mammalian cells // J. Cell. PhysioK 1988. V. 136: № 3.P. 507−513.
  94. Saitou N., Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees // Mol. Biol. Evol. 1987. V.4. P. 406−425.
  95. SchejflerI.E. Mitochondria// Wiley-Liss. 2008. P. 96−141.
  96. Schurr T.G., SukernikR.I., Starikovskaya Y.B., Wallace D.C. Mitochondrial DNA variation in Koryaks and Itel’men: population replacement in the Okhotsk Sea-Bering Sea region during the Neolithic // Am. J. Phys. Anthropol. 1999. V. 108. № 1. P. 1−39.
  97. Schwartz M., Vissing J. No evidence for paternal, inheritance of mtDNA in patients with sporadic mtDNA mutations // J. Neurol. Sci. 2004. V. 218. P. 99−101.
  98. Shlush L.I., Behar D.M., Yudkovsky G., Templeton A., Hadid, Y., Basis F., Hammer M., Itzkovitz S., Skorecki K. The Druze: a population genetic refugium of the Near East. 2008. PLoS ONE. 3: e2105.
  99. Smith D., Lewis D. Dendrochronology // DENDROCHRONOLOGY. 2007. P: 459−465:
  100. Soares P., ErminvL., Thomson N., Mormina M, Rito T., Rohl A., Salas A., Oppenheimer S., Macaulay V., Richards M.B. Correcting for purifying selection: an improved human mitochondrial* molecular clock // Am. J. Hum. Genet. 2009. V. 84. № 6. P. 740−759.
  101. Wallace D.C. Mitochondrial DNA diversity in indigenous populations of the southern extent of Siberia, and the origins of Native American haplogroups // Ann. Hum. Genet. 2005. V. 69. P. 67−89.
  102. Starikovskaya Y.B., Sukernik R.I., Schurr T.G., Kogelnik A.M., Wallace
  103. D.C. mtDNA diversity in Chukchi and Siberian Eskimos: implications for the genetic history of Ancient Beringia and the peopling of the New World // Am. J. Hum. Genet. 1998. V. 63. № 5. P. 1473−1491.
  104. Stringer C.B., Andrews P. Genetic and fossil evidence for the «origin of modern humans // Science. 1988. V. 239. P. 1263−1268.
  105. Suomalainen A., Ciafaloni E., Koga Y., Peltonen L., DiMauro S., Schon
  106. E.A. Use of single strand conformation polymorphism analysis to detect point mutations in human mitochondrial DNA // J. Neurol. Sci. 1992. V. 111. № 2. P. 222−226.
  107. Takezaki N., Nei M. Genetic distances and reconstruction of phylogenetic trees from microsatellite DNA // Genetics. 1996. V. 144. № 1. P. 389−399.
  108. Tanaka M., Cabrera V.M., Gonzalez A.M., Larruga J.M., Takeyasu T., Fuku N., Guo L.J., Hirose R., Fujita Y., Kurata M., Shinoda K., Umetsu K., Yamada Y.,.Oshida Y, Sato Y, Hattori N., Mizuno Y, Arai Y., Hirose N.,
  109. Ohta S., Ogawa O., Tanaka Y., Kawamori R., Shamoto-Nagai M., Maruyama W., Shimokata H., Suzuki R., Shimodaira H. Mitochondrial genome variation in eastern Asia and the peopling of Japan // Genome Res. 2004. V. 14. № 10A. P. 1832−1850.
  110. Torroni A., Achilli A., Macaulay V., Richards M., Bandelt H.J. Harvesting the fruit of the human mtDNA tree // Trends. Genet. 2006. V. 22. P. 339 345.
  111. Torroni A., Neel J.V., Barrantes R., Schurr T.G., Wallace D.C. Mitochondrial DNA «clock» for the Amerinds and its implications for timing their entry into North America // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1994. V.91.P. 1158−1162.
  112. Wallace D.C. Why do we still have a maternally inherited mitochondrial DNA? Insights from evolutionary medicine // Annu. Rev. Biochem. 2007. V. 76. P. 781−821.
  113. Wallace D.C., Ye J.H., Neckelmann SM, Singh G., Webster K.A., Greenberg B.D. Sequence analysis of cDNAs for the human and bovine
  114. ATP synthase beta subunit: mitochondrial DNA genes sustain seventeen times more mutations // Curr. Genet. 1987. V. 12. P. 81−90.
  115. Watanabe G., Umetsu K., Yuasa I., Sato M., Sakabe M., Naito E., Yamanouchi H, Suzuki T. A novel technique for detecting single nucleotide polymorphisms by analyzing consumed allele-speciflc primers // Electrophoresis. 2001. V. 22. № 3. P. 418−420.
  116. Watson E., Forster P., Richards M., Bandelt H.J. Mitochondrial footprints of human expansions in Africa // Am. J. Hum. Genet. 1997. V. 61. P. 691 704.
  117. Wong L.J., Chen T.J., Tan D.J. Detection of mitochondrial DNA mutation using temporal temperature gradient gel electrophoresis // Electrophoresis. 2004. № 25. P. 2602−2610.
  118. Zuckerkandl E., Pauling L. Molecules as documents of evolutionary history // J. Theor. Biol. 1965. V. 8. № 2. P. 357−366.
Заполнить форму текущей работой